Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsZS97_10G0155600 OGI:10019220 | 2/16 Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU Chr10:10106642-10134654
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

MASTGRMRDVQCHRCKGFGHVQRDCPSKRVLVVKNDGEYSSASDFDDDTLALLAADHADNEPPEEHIGAAFADHYESLIVQRVLSAQMEKAEQNQRHTLFQTKCVVKERCCRMIIDGGSCNNLASSEMVEKLALSTKPHPHPYYIQWLNNSGKAKVTKLVHINFAIGNYHDVVECDVVPMQACNILLGRPWQFDRDSMHHGRSNQYSFLYHDKKIVLHPMSPEDILRDDVAKAAKSKCESDKKAQSDGKKPETINLKPKCLLATKSDINELIASPSVAYALEYSDVFPKEVPPGLPPIRMKLGDEWKTAFKTKFGLYEWLVMPFGLTNAPSTFMRLMNEVLRPFIGKFVVVYFDDILIYSKSMGEHFNHLRAVFNALRDARLFGNLEKCTFCTDRVSFLGYVVTPQGIEVDQAKVEAIQSWPTPKTVSQVRSFLGLAGFYRRFVQDFSTIAAPLNALTKKGVPFTWGTSQENAFHMLKDKLTHAPLLQLPDFNKTFELECDASGIGLGGVLLQEGKPVAYFSEKLSGPVLNYSTYDKELYALEAHGGGLMGHFGAKKTHDILASHFFWPQMRRDVGRAVLKKNIKMWEECLPHIEFAYNRSLHSTTKMCPFQIVYGLLPRAPIDLMPLPSSEKLNFDAKQRAELMLKLHETTKENIERMNAKYKFAGDKDFGVSPTFNVADLKPYLGEEDELESRTTQMQEGEDDEDINTIDTSTSPHIQHDGPITRARARQLNYQDECPRGRVDAHHKFAATIGDGVSVAKAQRLWTVVVGP

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_10G0155600 OsZS97_10T0155600-mRNA-3 Chr10 10134043 10134654 - makerRMon
CDS seq

ATGGAGAGCCCAAGTTGTTATTTTGAGGGCGTCGTGGAGGGTTCAATTGTCTACACCAAGGACACAGTAGATGATCTCGATGACAAGCAAGGACATGGTTTCATGTCGGCTGATGATTCGAAAGAAATTGATATAGGTCCAGGGGTTAGACCACACCAACAGCCTCCGAGAAGATGCAAAGCAGATATGCTCGAACCTGTCAAGGCTGAGATTAAACGTTTGTATGATGCTGGTTTTATTCGTCCTTGTTGGTATGCTGAATGGGTTTCTAGCATAGTTCTTGTTATCAAGAAAAACGGCAAAGTCAGGGTGTGCATCGATTTCAGAGATTTGAATAAAGCTACCCCAAAGGACGAATATCCAATGCCGGTAGCCGATCAACCGGTTGATGCTGCTTCAGGACATAAGATATTAAGTTTCATGGATGGTAATGTAGGTTACAATTAG

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Protein seq

MESPSCYFEGVVEGSIVYTKDTVDDLDDKQGHGFMSADDSKEIDIGPGVRPHQQPPRRCKADMLEPVKAEIKRLYDAGFIRPCWYAEWVSSIVLVIKKNGKVRVCIDFRDLNKATPKDEYPMPVADQPVDAASGHKILSFMDGNVGYN

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.002758 0.0159325 0.012635

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_10g0181900 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os10g08090 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os10g0181900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_10G0143700 SBH 0 0.0037445 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_10G0155500 SBH 0 0.030603 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
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