Basic Info |
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| CDS seq | ATGGCTAGGGGCATCAATATGTCTAAGAGGAAAGTACTTGAACAGGGAACTAGCAATGTCTTTGACCGTCCTCAGTATCCATTTGCTAATCCTGAAATTTCTGATGGTTCAAATGAAAATTTTAGAGAAGATGACACAGAATCAGATGATGATTTTGACATGGATTATGTCATGCTTGAGTTGTACAGGAAGACAATTGTGCAAAGCATGAAAAGAAAGATGAAGAAGAATTCTAATATTCTTCTAGAGAATCAAAAGATGAAGAAACAAACTTGTCTTACTAAGGCCAACTCTTCATTCTCAAGATTTTCAGCAAAGTATTTTTCTGAAATTTATCTGGTCCTCAAGAGGTTTATCATTGAGAAATATGGGTTTGCAAATTTGCTTCTGTTTGATGTTAAGTCTGCACCTAAGAAGCTTGCGTCATGGGTTGCCAAGAGATTTGATTTGAGCTCATCTGAAATCATTCTTAGAGACAAAGTTATTCCAGTCACAGAGCATAGTGTTACTGTCGTGCTTGGTTTGCCAACTAGACGAAGAGATTTTGGGAAGAATTTCGATATTGGGAAAGAAATAATTCTCTCAAGATTTGGTTTGTCTGTACTTCCTTCTGTGAAATTTTTTGGTGATCTTTTGAAGCATAATAAAGACATGGCTAAAGACAAAGTGATTACTTGTTTCTTGATTGTTGCGCTTGCTTGTTTCTTGTGTCCCAATTCATCATTAGTCCCAAGTGTGAAGTATCTTACCATCTTTGAAGATATTAAAGCTTTGGATTCTTATAATTGGTCAAAGTTTGTGTATTGGCTCTTGATTCATATCAAAAAGTTCCAAAAGTCAAAGAACTTGGGTGGTTGCTTACATATTTGGGCTATTTTGTACCTTGATTTTGTTGATTTTGGTCAGAGAAGTGTTCCTAAAGGAATCCCTCGTATCTCAGCCTGGAACGATGATTTGATTGCTACGTTTTCTGATTTAGACAAAATTGATGACACCACTTATGGACTTAGGCCATTGAAGGATATTAGTTGCACTAGTTACTTTGAGATGTTGCATGACTCTAGTTCATCTGAAACAGTTCAACTTGACAGTCATAATATTGCACACACAGCTACAGCCAATGCTTCATTTCAAACTGATAAGCTACATGTTGGATTTAACAATCACTCATTTCAATTTAATGAAAAGCGAACTCCTCACAATGCTGAACATTCTGTTGGAAACCACCCATTGTCAACTGAAGATTTTGCTCCTATGTATCATACTCCTGAAGTTGGATTAATTAAAAACAAGAAAGTTTGCCTGGATGAATCATTCAATGCTTCAGCTGCTACAGCAGCTATTGATGCTGTTAAAGATGTTGCAAAGAAAATTAGGTCAAGAATGGCTCATCTTAAATCTAGAGAGAAGATGAATAGGATTTTTTATGGCACTAAATCTTTCCTTGAGATTCTTGATTCCGAAGATTCTGGAGATTGTGACAGTGATGATTGCTTGCCTCATATTGTGGATTCTGAGGCAGATTTCAATGAAAATGAGTCACCTATTGATGCAAGGCCCTTGTCCTCTCAAATTGCTCTCAATTCTAACTCTTTCCACCCAAATGTGAGAACATATAACAATTTGAAGACTCTGAGCAATAACAAGGATAAAGGAAAATTTGATGCTGAATTTGTCCGGAAAAGGGCATTCCAAGATCTCACAAATTCACCTGATGTTGTTTGTCTTGGGTCCAATACATGTTCTAACAAGACGAAAAATATGTGCATTAAATCTGAGCATATTTACAACAAGAGCAATCAATTTGATTCCAATTACAAAGTATTTGGCTCTGGTTTCAATAATTCTGGAGCAAGCTCTTCAGGTGGCAGATTGCCCCCACATGGTCCAAGAAGACCTCTTAAGCCATCTAGACATGCAAGTGATCCTTTTGTACCAGTTAGACGGCGCTTTCCAGTTTCTGAACAAGAAAACAAGTACTTCACTGCAATTTGTTGTCTCGCTCATACTAGATGGCAAAGCTTGTTTGCAGTAAATATTGACAATGTTCGTATCACATTTTCCAATTTTAGAAATTCTTTGAGGATTGGTGGTGATGTTTCAAACTATGTGATATCTGCCTTTTGTCGACTGATGTTCCACAACAACCATCCATCTAAATCAAAGAAGAATTATTTCTTTTCTTCCATTGGGTATCAACTTTTGAAGGAGATTGAATGCATTGAAATGGTCAAAATAAAGAAATGTTTTGATGGTGCTGCTAGTGCTAGAAAATTACATCTTTGCGATATGCTTTTTTTCCCCATTAATCATCTTGACCACTGGTTCCTATTCGTCGTTGATATAAAGGACCGAATGCTTGTTTTCCTTGATTCATTGCATCATAAAAGTGATCCATACTTTGATCCAATTATTCCTATGTTGATCAAGAATATTCAGACATTGTGGGATAAATTTGAGGGCACTGCCATAGATTTCAGCAAGTTTAGAGAAGAATTCCAATATGAAGGTGAAGTTGCCACGGACTAA
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| Protein seq | MARGINMSKRKVLEQGTSNVFDRPQYPFANPEISDGSNENFREDDTESDDDFDMDYVMLELYRKTIVQSMKRKMKKNSNILLENQKMKKQTCLTKANSSFSRFSAKYFSEIYLVLKRFIIEKYGFANLLLFDVKSAPKKLASWVAKRFDLSSSEIILRDKVIPVTEHSVTVVLGLPTRRRDFGKNFDIGKEIILSRFGLSVLPSVKFFGDLLKHNKDMAKDKVITCFLIVALACFLCPNSSLVPSVKYLTIFEDIKALDSYNWSKFVYWLLIHIKKFQKSKNLGGCLHIWAILYLDFVDFGQRSVPKGIPRISAWNDDLIATFSDLDKIDDTTYGLRPLKDISCTSYFEMLHDSSSSETVQLDSHNIAHTATANASFQTDKLHVGFNNHSFQFNEKRTPHNAEHSVGNHPLSTEDFAPMYHTPEVGLIKNKKVCLDESFNASAATAAIDAVKDVAKKIRSRMAHLKSREKMNRIFYGTKSFLEILDSEDSGDCDSDDCLPHIVDSEADFNENESPIDARPLSSQIALNSNSFHPNVRTYNNLKTLSNNKDKGKFDAEFVRKRAFQDLTNSPDVVCLGSNTCSNKTKNMCIKSEHIYNKSNQFDSNYKVFGSGFNNSGASSSGGRLPPHGPRRPLKPSRHASDPFVPVRRRFPVSEQENKYFTAICCLAHTRWQSLFAVNIDNVRITFSNFRNSLRIGGDVSNYVISAFCRLMFHNNHPSKSKKNYFFSSIGYQLLKEIECIEMVKIKKCFDGAASARKLHLCDMLFFPINHLDHWFLFVVDIKDRMLVFLDSLHHKSDPYFDPIIPMLIKNIQTLWDKFEGTAIDFSKFREEFQYEGEVATD
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0 | 0 | 0.0043675 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g11380 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.042624 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | NA | NA | NA | NA | NA |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0004060 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0000490 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0004010 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0004160 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0111700 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_09g0004170 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0004120 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0004120 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0004130 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0004040 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0004080 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G004230 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0004120 | RBH | 0.000000 | 1.287621 | 0.108651 |
