Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsZS97_08G0086000 OGI:08015640 | 2/16 Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU Chr08:5546939-5552670
Gene Symbol -
DNA seq

TCAAACCATGCCAAAAGGATGAATGACGCCCAATTCACCATGAAGAAAAGCAAAGCGATTAGAATCCAATGGTTTAGTGAAAATATCAGCAATTTGCAACTTTGTGTCCAAAAACTGCAACTCAACATCTCCTTTCTCAACATGATCCCTCAAAAAGTGAAAACGAATATCAATGTGCTTTGTGCGTGAGTGTTGAACAGGATTCTTAGCAATATTGATAGCACTAGTATTATCACAAAAGAGAGGTACTTTTTCAAAAGTAAGACCATAACTTTTTAAAGTAGATAAAAGCCAAAGAATCTGTGAACAACAACTAGCAGCAGCAACATATTCAGATTCAGCAGTTGATTGAGCAACACTAGATTGTTTCCTAGAAGACCATGCAATCAATGATGTACCAAGAAAATGACATGTTCCACTAGTACTTTTCCTATCAATTCTACAACCTCCAAAATTAGCATCTGAATATCCACTTAAGCATATAGAAGATGAAGTAGAATACCAAATTCCAAACTCAAGTGTATGATTCAAATACCTCATTATTCGCTTGACCGCTTGACGATGTGAAGCACGAGGAGAAGCTTGAAAGCGTGCACACAAACACATAGCAAATTGTATGTCTGGCCTAGAAGCAGTTAGATACAATAAAGATCCAATCATACTTCTATATTCCTTTTGATCAACAGCTTCACCATCTTCATCAGGATCCAACATAGCTGTAGAACCAATTGGTGTTGAAATTGGCTTGCAATTCTCCATCTTGAAACGTCGCAAAAGATACTTCGTATACTTCGTTTGATGCACAAAAGTACCTTGAGGTGTTTGCTTAATTTGCAATCCCAAAAAGTACGATAACTCACCCATCATGCTCATCTCAAATTCCCTGCGCATGCTCTGATACCACTTGTAGGATCGAATCACAAGAACTAAGACAACCAGAGCGTGAGTCGAACAACCAAAGATAATATCATCCACATAAATCTGAACGGAAAGTTGATTGTCACCATGCTTAAGAACAAAAAGCGTTTTATCAACCTTTCCCATTGTAAAACCTTTCGCAAGCAAAAAGTTCTTAAGCCTATCATACCATGCCCTAGGAGCTTGTTTCAAACCATACAAAGCTTTAGACAATTTAAAAACATGGTTGGGAAAATCAGGATTTTCAAAACCCGGTGGTTGTTTGACATAAACTTCCTCCTGTATAAAACCATTTAGAAAAGCACTTTTCACATCCATTTGATACAATTTAAAACCTTTTGAAGCAGCAAAAGCCAACAAAAGTCTAATTGCCTCAATTCTAGCAACAGGAGCAAAAGTTTCATCAAAATCCAAACCCTCAACTTGAGTAAAACCTTGAGCAACAAGTCTAGCTTTATTTCTCACAATCAAACCATCCTCATTTTGTTTATTTTTGAAAACCCACTTGGTTCCAATAACATTATGTCCAGAAGGTGGTTCAACTAAAGTCCAAACTTTGTTTCTCTCAAAATTTTCAAGTTCTTCATGCATGGCGTTAATCCACGATTCATCAGTTAATGCATGTGACACATCTTTGGGTTCAAAAGAAGCAACAAATGCAGAATTTGCACAAACATCATGAATCGTTACCTTAGACCTTGTAGTCCGCTCACCTATATTACCAATAATTTGTTTCGGCGGATGTCGTCGTTGAATGTGCAAAGGAGCAGCGACTTCCGAAGTTAATCCACGTTCTGTTTCAGTACTGGTCGAAGTTGAATTCTCTGGAGGACCATCTCGATCAGCATCAACAGTACCCGAACCCGACGAACTTGGCCGGTCTGACCGCTCCTCATGGGTCGGTCTGACCAAAGGTGTGCCGGCGGTCTGACCGGCCTGGTGCCCGGTCTGACCGGCCGAGCCAACCTCGTCATCGTCGTCGTAGTCGCTCTCGTCTTCAAAAATACGACCATCCTCCCCCTGAAACTGTGATAGTGTACCTGCAATATCGGGTCTAGTACCAGGACTAGCCTCATCAAAGGAAACTTCGCAAGTCTCAACAATTTTTTTAGTCCCTAAAATAAGTACACGATAGCCACGAGTGTGTGCGGGGTAACCAAGAAACAATCCATCGGTAAAGCGTGCCTCAAACTTATCCAAATTTCCAGATTTCAAGACAAAACACTTGCAACCAAAAACACGCAAATGTGAAACTTTGGGTTGATGACCAAATCGAAGTTCATAAGAAGTTTTTCCAAGTTTAGAACGCAAGAAAACTCGATTTGAAATATAGCAAGCAGTGTTAATCGCCTCAGCCCAAAATTTTCTAGGAGTTTTGTATTCATCCAACATCGTTCTAGCCATCTCAACCAAAACACGATTTTTCCTTTCAACAACACCGTTTTATTGAGGAACACGAGGAGAAGAAAATTCATGTTCAAGACCTCTTTCGTTGCAAAATTGTTCAAACGAAGCATTTTTAAACTCTCCACCATTATCACTTCGAATTCTTTTCAAAGAAGCAGGAAATTCAAGCTTCAATCGAAGAAACAAACCACGAAAGTGTTGAAAAGCTTCGTCCTTAGTTGCCATAAAGAAAACCCAAGAATATCGAGAAAAATCGTCAACAATAACCAACACATACCACTTTCCTCCAACAGATTACACTCCAGCTGGACCAACAGTGTCCATATATAATAGTTGTCCCGGTACATCCGTCATCACAGAAACAATAGGAGCATGTGAAGTAGAAACCATCTTAGCATGACGACACGGTGTACAAACCAAATCAAGATCTTTCTTAAGTTTAGGCAAACCACGAACAAGATCCAAACCACTTAGCCTAGTGAGATGATCAAAACCAACATGTCCAAGTCTACGATGCCAAAACATCACATCTTTATCAAACTTAGCAACCAAACATGTTATCACAGGTGAAACAGAATTTTCAAAATCAGCTTTAAACACTCTTCCATAACGAGAAATATTCAGCACAGAATCACCACAAGAATCAAAAACTTTACTTCCAGTTTGTTTAAAGTGAACCTCAAAATTTTCATCAACAATTTGTGAAACTGAAAGCAAATTGTACTTTAAATCCTTAACCAAAGTTACATTCTTCAATTCAAATTTTTCATTTACCTTAACCAAACCTGTAGCGACAACGGCACTAGTAGAAGCATCAGCAAAGACAATTGATTCAGTCTTGGATGCCTTTTTGAGGGAGCAGAACCAATTTTTATCACTGGTCATGTGCCGCGAATAACCGGAATCCACGATCCACACGTTCTCCTTCCTTGCCACAAAAGCCTACACACAAGCAGAAGTCGAAGCCTCAGTACTGGGGTTAGATAATAAAAATTTAGGAATCCAGTACTGAGACACACGACCAGAAGATCCAATAGGCATATATCCACGTGCAAAATCAATTTTAGAATTTTCAGAAAAATTCCTCTGAAGCCGGTCTGACCGAGGTACAGTAGCCGGTTTGACCGGGGGCCGGTCTGACCGCCTCTGTACCGCCGGTCTGACCGGTGCCCGGTCTGACCGAGGTTGTTCAGCCGGTCTGACCGGTCGCCGGTCTGACCGCGGGACCCACTGCGGTCTGACCGATTTCCTCGAGGGAAAACCCGATTTTTGCCACTTTGATTTTGCAAAAGCAATTTCTCTCTCCTTTTTCTGTTTGTGAGCTAATCTGAAACAAAATTCAACAATATGTCCATCTTTTCCACAAAAAGAACAAGTATATTTTTCACATTGTTTAGACACATTGTTAGAGCAAGAAGATTTAGCAACACAAGCAGAAACAGGAGGTTTTGCACGCACAACATTGGATTTTGAAGAAGATGCACTTATAGTAGACATGATACCAGCAGATTTAAACACAGTTTTATTTATATCAGGTTTAATCAAAATCTCACCTCTTCTAGCACCAACACCTAACACAACAGGAGGATGTCTAGAATTATGAGCATAAGGATCAAAACCTTAACCACGGTTATTTGTGCTAACCTTTGATTGATCCAAAATCATGTTGAGGTTCTTTTTAGCATCAGAAAATCTTAGCAAAGAATTTTTCAAATAAGAAACCTCTTTTTCCAAATTAGCACAATTTTCACAATCTACCATGACACCTTTGCTTTTACGGCATTTGGGGCAAGAAAGCACTTCATTGTTTTTCACAATATCTTCCATGTACTCAACACGACCTAAAGTATCTTTTAGTTTCATCTTATTCAAATTACATGTTGAGCAATCCAAAACATCATGAGGTTGTTTTAACTTTTTAGCAGAAATCATGTTAAACATCAAAACTAGCATGAAAAGCAATTTGATATTTTTGCAATAACTTTTTAGTTAAAAACAACTCATCCAAAATGCGTGTGTGCAAAGCAAAACAACAAGCAAGAGAAGATCTATTTTTCAAATCTTGTGCAGCATTAACATCTCTAATTTTTGAAATCTCATTCATTAAAACCTCACAATTTTCACAATCATCATCATTAGGAATAAGAGATTTTAACCTATCAATTTCAGATTTAAGAGATTCAATGATAAATTCCTGTTTTTTATACATCTTCTCACACTTTTTATTTTTTTGCACTCAAAATATTAATAGCTTCCTCAAAAGCACTCACCTCATTGTCTTCATACTCTGTGTCAGATTCACCACGCGCCATGAAGCAAACATCGGAGACGTTCTTTCCCTTGTCATCATCTCCACTTTCACCATCTACATCACTTAGTGGCTCGAAAGCGGCGCAAACTTGTTGAAAAGCCTTCCTAAGATTCTCCATCTTCCTCCCTTGGTTAGAACCCTTTGACTTGTTGTAGTTGTTGGGCTTGTTGTTGTTGGTCTTCTCACCATCTTTGTCTTCTCTTTTTCCTCTCCCAAGCTTAGGACAATGCGAACGAAGATGATCAATTGAACCACATTCAAAGAAACGATTTGGACCACCTCTTTTCCTGTTCCTGGCATTATTCATAGCTCGAGTAATTCGGTTAGCAACCAAAGCCAAATCCTCCTCCTCGATTTGTTCGAGTTGATCATCGGATGTGGCATTAAAAGCAGCAAGAAAAGAAGGCATAGATGAAGAAGCATCAACAACCAAAGAAGAAGAAGAAGAAACCAAAGCACTCGATTTAGAATCAACTTTGCGAGAAAGAATATTCATCTCATGTGTTTTCAATTTAGTATAAAGTGAATCCAAAGTCAAAGTAGACATGTTAACAGACTCCTGAATAGATGTAACTTTCATCTCCCAAATAGACATGTCGAGACCATTCAAAAAATGACGAGAAATCTCAGATTGTGGATAATTAGCATCATAAGAAGAATCAACAGATCTAAGATCACTCAAAATTTTATTAAACCTAGAAAGATAGTCATCCAAAGCTTCTCCAGGTTTCATCTCAAATTTAATGTATTCCTTTTTAAAAAGATCTCGACGAAGCTCTTTAATATTATTTGTTCCTTGATGAAAATTCTTTAAAGCGTTCCAAATCTCATGAGCAGTTTCAAGATGTGCAACACGATCATAGTCAGAACGAGAAATCTCACTCAAAAGAATATTACGAGCTTTGCAATTATTTTCAAACTCAGTTTTTAAAGCATCAGTATTAATGGCTTCAGGAATCACATAAGGATGAGAAACTTTCCTCCAAATATCATAATTTTCAGCCATAATGTAAGATTGCATCTTACTACACCAATGAGGAAAATCAGTTCCATCGAAAATATGAGGCTTAGTTGAAAACCTAGCGGGAGTAGCCAT

More
CDS seq

ATGGCTACTCCCGCTAGGTTTTCAACTAAGCCTCATATTTTCGATGGAACTGATTTTCCTCATTGGTGTAGTAAGATGCAATCTTACATTATGGCTGAAAATTATGATATTTGGAGGAAAGTTTCTCATCCTTATGTGATTCCTGAAGCCATTAATACTGATGCTTTAAAAACTGAGTTTGAAAATAATTGCAAAGCTCGTAATATTCTTTTGAGTGAGATTTCTCGTTCTGACTATGATCGTGTTGCACATCTTGAAACTGCTCATGAGATTTGGAACGCTTTAAAGAATTTTCATCAAGGAACAAATAATATTAAAGAGCTTCGTCGAGATCTTTTTAAAAAGGAATACATTAAATTTGAGATGAAACCTGGAGAAGCTTTGGATGACTATCTTTCTAGGTTTAATAAAATTTTGAGTGATCTTAGATCTGTTGATTCTTCTTATGATGCTAATTATCCACAATCTGAGATTTCTCGTCATTTTTTGAATGGTCTCGACATGTCTATTTGGGAGATGAAAGTTACATCTATTCAGGAGTCTGTTAACATGTCTACTTTGACTTTGGATTCACTTTATACTAAATTGAAAACACATGAGATGAATATTCTTTCTCGCAAAGTTGATTCTAAATCGAGTGCTTTGGTTTCTTCTTCTTCTTCTTTGGTTGTTGATGCTTCTTCATCTATGCCTTCTTTTCTTGCTGCTTTTAATGCCACATCCGATGATCAACTCGAACAAATCGAGGAGGAGGATTTGGCTTTGGTTGCTAACCGAATTACTCGAGCTATGAATAATGCCAGGAACAGGAAAAGAGGTGGTCCAAATCGTTTCTTTGAATGTGGTTCAATTGATCATCTTCGTTCGCATTGTCCTAAGCTTGGGAGAGGAAAAAGAGAAGACAAAGATGGTGAGAAGACCAACAACAACAAGCCCAACAACTACAACAAGTCAAAGGGTTCTAACCAAGGGAGGAAGATGGAGAATCTTAGGAAGGCTTTTCAACAAGTTTGCGCCGCTTTCGAGCCACTAAGTGATGTAGATGGTGAAAGTGGAGATGATGACAAGGGAAAGAACGTCTCCGATGTTTGCTTCATGGCGCGTGGTGAATCTGACACAGAGTATGAAGACAATGAGTTAAAACAACCTCATGATGTTTTGGATTGCTCAACATGTAATTTGAATAAGATGAAACTAAAAGATACTTTAGGTCGTGTTGAGTACATGGAAGATATTGTGAAAAACAATGAAGTGCTTTCTTGCCCCAAATGCCGTAAAAGCAAAGGTGTCATGGTAGATTGTGAAAATTGTGCTAATTTGGAAAAAGAGGTTTCTTATTTGAAAAATTCTTTGCTAAGATTTTCTGATGCTAAAAAGAACCTCAACATGATTTTGGATCAATCAAAGGCTTTTGTGGCAAGGAAGGAGAACGTGTGGATCGTGGATTCCGGTTATTCGCGGCACATGACCAGTGATAAAAATTGGTTCTGCTCCCTCAAAAAGGCATCCAAGACTGAATCAATTGTCTTTGCTGATGCTTCTACTAGTGCCGTTGTCGCTACAGGTTTGGTTAAGGTAAATGAAAAATTTGAATTGAAGAATGTAACTTTGGTTAAGGATTTAAAGTACAATTTGCTTTCAGTTTCACAAATTGTTGATGAAAATTTTGAGGTTCACTTTAAACAAACTGGAAGTAAAGTTTTTGATTCTTGTGGTGATTCTGTGCTGAATATTTCTCGTTATGGAAGAGTGTTTAAAGCTGATTTTGAAAATTCTGTTTCACCTGTGATAACATGTTTGGTTGCTAAGTTTGATAAAGATGTGATGTTTTGGCATCGTAGACTTGGACATGTTGGTTTTGATCATCTCACTAGGCTAAGTGGTTTGGATCTTGTTCGTGGTTTGCCTAAACTTAAGAAAGATCTTGATTTGGTTTGTACACCGTGTCGTCATGCTAAGATGGTTTCTACTTCACATGCTCCTATTGTTTCTGTGATGACGGATGTACCGGGACAACTATTATATATGGACACTGTTGGTCCAGCTGGATGGTATGTGTTGGTTATTGTTGACGATTTTTCTCGATATTCTTGGGTTTTCTTTATGGCAACTAAGGACGAAGCTTTTCAACACTTTCGTGGTTTGTTTCTTCGATTGAAGCTTGAATTTCCTGCTTCTTTGAAAAGAATTCGAAGTGATAATGGTGGAGAGTTTAAAAATGCTTCGTTTGAACAATTTTGCAACGAAAGAGTTTTCTTGCGTTCTAAACTTGGAAAAACTTCTTATGAACTTCGATTTGGTCATCAACCCAAAGTTTCACATTTGCGTGTTTTTGGTTGTACACTATCACAGTTTCAGGGGGAGGATGGTCGTATTTTTGAAGACGAGAGCGACTACGACGACGATGACGAGGTTGGCTCGGCCGGTCAGACCGGGCACCAGGCCGGTCAGACCGCCGGCACACCTTTGGTCAGACCGACCCATGAGGAGCGGTCAGACCGGCCAAGTTCGTCGGGTTCGGGTACTGTTGATGCTGATCGAGATGGTCCTCCAGAGAATTCAACTTCGACCAGTACTGAAACAGAACGTGGATTAACTTCGGAAGTCGCTGCTCCTTTGCACATTCAACGACGACATCCGCCGAAACAAATTATTGGTAATATAGATGTGTCACATGCATTAACTGATGAATCGTGGATTAACGCCATGCATGAAGAACTTGAAAATTTTGAGAGAAACAAAGTTTGGACTTTAGTTGAACCACCTTCTGGACATAATGTTATTGGAACCAAGTGGGTTTTCAAAAATAAACAAAATGAGGATGGTTTGATTGTGAGAAATAAAGCTAGACTTGTTGCTCAAGGTTTTACTCAAGTTGAGGGTTTGGATTTTGATGAAACTTTTGCTCCTGTTGCTAGAATTGAGGCAATTAGACTTTTGTTGGCTTTTGCTGCTTCAAAAGGTTTTAAATTGTATCAAATGGATGTGAAAAGTGCTTTTCTAAATGGTTTTATACAGGAGGAAGTTTATGTCAAACAACCACCGGGTTTTGAAAATCCTGATTTTCCCAACCATGTTTTTAAATTGTCTAAAGCTTTGTATGGTTTGAAACAAGCTCCTAGGGCATGGTATGATAGGCTTAAGAACTTTTTGCTTGCGAAAGGTTTTACAATGGGAAAGGTTGATAAAACGCTTTTTGTTCTTAAGCATGGTGACAATCAACTTTCCGTTCAGATTTATGTGGATGATATTATCTTTGGTTGTTCGACTCACGCTCTGGTTGTCTTAGTTCTTGTGATTCGATCCTACAAGTGGTATCAGAGCATGCGCAGGGAATTTGAGATGAGCATGATGGGTGAGTTATCGTACTTTTTGGGATTGCAAATTAAGCAAACACCTCAAGGTACTTTTGTGCATCAAACGAAGTATACGAAGTATCTTTTGCGACGTTTCAAGATGGAGAATTGCAAGCCAATTTCAACACCAATTGGTTCTACAGCTATGTTGGATCCTGATGAAGATGGTGAAGCTGTTGATCAAAAGGAATATAGAAGTATGATTGGATCTTTATTGTATCTAACTGCTTCTAGGCCAGACATACAATTTGCTATGTGTTTGTGTGCACGCTTTCAAGCTTCTCCTCGTGCTTCACATCGTCAAGCGGTCAAGCGAATAATGAGGTATTTGAATCATACACTTGAGTTTGGAATTTGGTATTCTACTTCATCTTCTATATGCTTAAGTGGATATTCAGATGCTAATTTTGGAGGTTGTAGAATTGATAGGAAAAGTACTAGTGGAACATGTCATTTTCTTGGTACATCATTGATTGCATGGTCTTCTAGGAAACAATCTAGTGTTGCTCAATCAACTGCTGAATCTGAATATGTTGCTGCTGCTAGTTGTTGTTCACAGATTCTTTGGCTTTTATCTACTTTAAAAAGTTATGGTCTTACTTTTGAAAAAGTACCTCTCTTTTGTGATAATACTAGTGCTATCAATATTGCTAAGAATCCTGTTCAACACTCACGCACAAAGCACATTGATATTCGTTTTCACTTTTTGAGGGATCATGTTGAGAAAGGAGATGTTGAGTTGCAGTTTTTGGACACAAAGTTGCAAATTGCTGATATTTTCACTAAACCATTGGATTCTAATCGCTTTGCTTTTCTTCATGGTGAATTGGGCGTCATTCATCCTTTTGGCATGGTTTGA

More
Protein seq

MATPARFSTKPHIFDGTDFPHWCSKMQSYIMAENYDIWRKVSHPYVIPEAINTDALKTEFENNCKARNILLSEISRSDYDRVAHLETAHEIWNALKNFHQGTNNIKELRRDLFKKEYIKFEMKPGEALDDYLSRFNKILSDLRSVDSSYDANYPQSEISRHFLNGLDMSIWEMKVTSIQESVNMSTLTLDSLYTKLKTHEMNILSRKVDSKSSALVSSSSSLVVDASSSMPSFLAAFNATSDDQLEQIEEEDLALVANRITRAMNNARNRKRGGPNRFFECGSIDHLRSHCPKLGRGKREDKDGEKTNNNKPNNYNKSKGSNQGRKMENLRKAFQQVCAAFEPLSDVDGESGDDDKGKNVSDVCFMARGESDTEYEDNELKQPHDVLDCSTCNLNKMKLKDTLGRVEYMEDIVKNNEVLSCPKCRKSKGVMVDCENCANLEKEVSYLKNSLLRFSDAKKNLNMILDQSKAFVARKENVWIVDSGYSRHMTSDKNWFCSLKKASKTESIVFADASTSAVVATGLVKVNEKFELKNVTLVKDLKYNLLSVSQIVDENFEVHFKQTGSKVFDSCGDSVLNISRYGRVFKADFENSVSPVITCLVAKFDKDVMFWHRRLGHVGFDHLTRLSGLDLVRGLPKLKKDLDLVCTPCRHAKMVSTSHAPIVSVMTDVPGQLLYMDTVGPAGWYVLVIVDDFSRYSWVFFMATKDEAFQHFRGLFLRLKLEFPASLKRIRSDNGGEFKNASFEQFCNERVFLRSKLGKTSYELRFGHQPKVSHLRVFGCTLSQFQGEDGRIFEDESDYDDDDEVGSAGQTGHQAGQTAGTPLVRPTHEERSDRPSSSGSGTVDADRDGPPENSTSTSTETERGLTSEVAAPLHIQRRHPPKQIIGNIDVSHALTDESWINAMHEELENFERNKVWTLVEPPSGHNVIGTKWVFKNKQNEDGLIVRNKARLVAQGFTQVEGLDFDETFAPVARIEAIRLLLAFAASKGFKLYQMDVKSAFLNGFIQEEVYVKQPPGFENPDFPNHVFKLSKALYGLKQAPRAWYDRLKNFLLAKGFTMGKVDKTLFVLKHGDNQLSVQIYVDDIIFGCSTHALVVLVLVIRSYKWYQSMRREFEMSMMGELSYFLGLQIKQTPQGTFVHQTKYTKYLLRRFKMENCKPISTPIGSTAMLDPDEDGEAVDQKEYRSMIGSLLYLTASRPDIQFAMCLCARFQASPRASHRQAVKRIMRYLNHTLEFGIWYSTSSSICLSGYSDANFGGCRIDRKSTSGTCHFLGTSLIAWSSRKQSSVAQSTAESEYVAAASCCSQILWLLSTLKSYGLTFEKVPLFCDNTSAINIAKNPVQHSRTKHIDIRFHFLRDHVEKGDVELQFLDTKLQIADIFTKPLDSNRFAFLHGELGVIHPFGMV

Function Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q94HW2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_08G0086000 OsZS97_08T0086000.1 Chr08 5546939 5552670 - makerRMon
CDS seq

ATGGCTACTCCCGCTAGGTTTTCAACTAAGCCTCATATTTTCGATGGAACTGATTTTCCTCATTGGTGTAGTAAGATGCAATCTTACATTATGGCTGAAAATTATGATATTTGGAGGAAAGTTTCTCATCCTTATGTGATTCCTGAAGCCATTAATACTGATGCTTTAAAAACTGAGTTTGAAAATAATTGCAAAGCTCGTAATATTCTTTTGAGTGAGATTTCTCGTTCTGACTATGATCGTGTTGCACATCTTGAAACTGCTCATGAGATTTGGAACGCTTTAAAGAATTTTCATCAAGGAACAAATAATATTAAAGAGCTTCGTCGAGATCTTTTTAAAAAGGAATACATTAAATTTGAGATGAAACCTGGAGAAGCTTTGGATGACTATCTTTCTAGGTTTAATAAAATTTTGAGTGATCTTAGATCTGTTGATTCTTCTTATGATGCTAATTATCCACAATCTGAGATTTCTCGTCATTTTTTGAATGGTCTCGACATGTCTATTTGGGAGATGAAAGTTACATCTATTCAGGAGTCTGTTAACATGTCTACTTTGACTTTGGATTCACTTTATACTAAATTGAAAACACATGAGATGAATATTCTTTCTCGCAAAGTTGATTCTAAATCGAGTGCTTTGGTTTCTTCTTCTTCTTCTTTGGTTGTTGATGCTTCTTCATCTATGCCTTCTTTTCTTGCTGCTTTTAATGCCACATCCGATGATCAACTCGAACAAATCGAGGAGGAGGATTTGGCTTTGGTTGCTAACCGAATTACTCGAGCTATGAATAATGCCAGGAACAGGAAAAGAGGTGGTCCAAATCGTTTCTTTGAATGTGGTTCAATTGATCATCTTCGTTCGCATTGTCCTAAGCTTGGGAGAGGAAAAAGAGAAGACAAAGATGGTGAGAAGACCAACAACAACAAGCCCAACAACTACAACAAGTCAAAGGGTTCTAACCAAGGGAGGAAGATGGAGAATCTTAGGAAGGCTTTTCAACAAGTTTGCGCCGCTTTCGAGCCACTAAGTGATGTAGATGGTGAAAGTGGAGATGATGACAAGGGAAAGAACGTCTCCGATGTTTGCTTCATGGCGCGTGGTGAATCTGACACAGAGTATGAAGACAATGAGTTAAAACAACCTCATGATGTTTTGGATTGCTCAACATGTAATTTGAATAAGATGAAACTAAAAGATACTTTAGGTCGTGTTGAGTACATGGAAGATATTGTGAAAAACAATGAAGTGCTTTCTTGCCCCAAATGCCGTAAAAGCAAAGGTGTCATGGTAGATTGTGAAAATTGTGCTAATTTGGAAAAAGAGGTTTCTTATTTGAAAAATTCTTTGCTAAGATTTTCTGATGCTAAAAAGAACCTCAACATGATTTTGGATCAATCAAAGGCTTTTGTGGCAAGGAAGGAGAACGTGTGGATCGTGGATTCCGGTTATTCGCGGCACATGACCAGTGATAAAAATTGGTTCTGCTCCCTCAAAAAGGCATCCAAGACTGAATCAATTGTCTTTGCTGATGCTTCTACTAGTGCCGTTGTCGCTACAGGTTTGGTTAAGGTAAATGAAAAATTTGAATTGAAGAATGTAACTTTGGTTAAGGATTTAAAGTACAATTTGCTTTCAGTTTCACAAATTGTTGATGAAAATTTTGAGGTTCACTTTAAACAAACTGGAAGTAAAGTTTTTGATTCTTGTGGTGATTCTGTGCTGAATATTTCTCGTTATGGAAGAGTGTTTAAAGCTGATTTTGAAAATTCTGTTTCACCTGTGATAACATGTTTGGTTGCTAAGTTTGATAAAGATGTGATGTTTTGGCATCGTAGACTTGGACATGTTGGTTTTGATCATCTCACTAGGCTAAGTGGTTTGGATCTTGTTCGTGGTTTGCCTAAACTTAAGAAAGATCTTGATTTGGTTTGTACACCGTGTCGTCATGCTAAGATGGTTTCTACTTCACATGCTCCTATTGTTTCTGTGATGACGGATGTACCGGGACAACTATTATATATGGACACTGTTGGTCCAGCTGGATGGTATGTGTTGGTTATTGTTGACGATTTTTCTCGATATTCTTGGGTTTTCTTTATGGCAACTAAGGACGAAGCTTTTCAACACTTTCGTGGTTTGTTTCTTCGATTGAAGCTTGAATTTCCTGCTTCTTTGAAAAGAATTCGAAGTGATAATGGTGGAGAGTTTAAAAATGCTTCGTTTGAACAATTTTGCAACGAAAGAGTTTTCTTGCGTTCTAAACTTGGAAAAACTTCTTATGAACTTCGATTTGGTCATCAACCCAAAGTTTCACATTTGCGTGTTTTTGGTTGTACACTATCACAGTTTCAGGGGGAGGATGGTCGTATTTTTGAAGACGAGAGCGACTACGACGACGATGACGAGGTTGGCTCGGCCGGTCAGACCGGGCACCAGGCCGGTCAGACCGCCGGCACACCTTTGGTCAGACCGACCCATGAGGAGCGGTCAGACCGGCCAAGTTCGTCGGGTTCGGGTACTGTTGATGCTGATCGAGATGGTCCTCCAGAGAATTCAACTTCGACCAGTACTGAAACAGAACGTGGATTAACTTCGGAAGTCGCTGCTCCTTTGCACATTCAACGACGACATCCGCCGAAACAAATTATTGGTAATATAGATGTGTCACATGCATTAACTGATGAATCGTGGATTAACGCCATGCATGAAGAACTTGAAAATTTTGAGAGAAACAAAGTTTGGACTTTAGTTGAACCACCTTCTGGACATAATGTTATTGGAACCAAGTGGGTTTTCAAAAATAAACAAAATGAGGATGGTTTGATTGTGAGAAATAAAGCTAGACTTGTTGCTCAAGGTTTTACTCAAGTTGAGGGTTTGGATTTTGATGAAACTTTTGCTCCTGTTGCTAGAATTGAGGCAATTAGACTTTTGTTGGCTTTTGCTGCTTCAAAAGGTTTTAAATTGTATCAAATGGATGTGAAAAGTGCTTTTCTAAATGGTTTTATACAGGAGGAAGTTTATGTCAAACAACCACCGGGTTTTGAAAATCCTGATTTTCCCAACCATGTTTTTAAATTGTCTAAAGCTTTGTATGGTTTGAAACAAGCTCCTAGGGCATGGTATGATAGGCTTAAGAACTTTTTGCTTGCGAAAGGTTTTACAATGGGAAAGGTTGATAAAACGCTTTTTGTTCTTAAGCATGGTGACAATCAACTTTCCGTTCAGATTTATGTGGATGATATTATCTTTGGTTGTTCGACTCACGCTCTGGTTGTCTTAGTTCTTGTGATTCGATCCTACAAGTGGTATCAGAGCATGCGCAGGGAATTTGAGATGAGCATGATGGGTGAGTTATCGTACTTTTTGGGATTGCAAATTAAGCAAACACCTCAAGGTACTTTTGTGCATCAAACGAAGTATACGAAGTATCTTTTGCGACGTTTCAAGATGGAGAATTGCAAGCCAATTTCAACACCAATTGGTTCTACAGCTATGTTGGATCCTGATGAAGATGGTGAAGCTGTTGATCAAAAGGAATATAGAAGTATGATTGGATCTTTATTGTATCTAACTGCTTCTAGGCCAGACATACAATTTGCTATGTGTTTGTGTGCACGCTTTCAAGCTTCTCCTCGTGCTTCACATCGTCAAGCGGTCAAGCGAATAATGAGGTATTTGAATCATACACTTGAGTTTGGAATTTGGTATTCTACTTCATCTTCTATATGCTTAAGTGGATATTCAGATGCTAATTTTGGAGGTTGTAGAATTGATAGGAAAAGTACTAGTGGAACATGTCATTTTCTTGGTACATCATTGATTGCATGGTCTTCTAGGAAACAATCTAGTGTTGCTCAATCAACTGCTGAATCTGAATATGTTGCTGCTGCTAGTTGTTGTTCACAGATTCTTTGGCTTTTATCTACTTTAAAAAGTTATGGTCTTACTTTTGAAAAAGTACCTCTCTTTTGTGATAATACTAGTGCTATCAATATTGCTAAGAATCCTGTTCAACACTCACGCACAAAGCACATTGATATTCGTTTTCACTTTTTGAGGGATCATGTTGAGAAAGGAGATGTTGAGTTGCAGTTTTTGGACACAAAGTTGCAAATTGCTGATATTTTCACTAAACCATTGGATTCTAATCGCTTTGCTTTTCTTCATGGTGAATTGGGCGTCATTCATCCTTTTGGCATGGTTTGA

More
Protein seq

MATPARFSTKPHIFDGTDFPHWCSKMQSYIMAENYDIWRKVSHPYVIPEAINTDALKTEFENNCKARNILLSEISRSDYDRVAHLETAHEIWNALKNFHQGTNNIKELRRDLFKKEYIKFEMKPGEALDDYLSRFNKILSDLRSVDSSYDANYPQSEISRHFLNGLDMSIWEMKVTSIQESVNMSTLTLDSLYTKLKTHEMNILSRKVDSKSSALVSSSSSLVVDASSSMPSFLAAFNATSDDQLEQIEEEDLALVANRITRAMNNARNRKRGGPNRFFECGSIDHLRSHCPKLGRGKREDKDGEKTNNNKPNNYNKSKGSNQGRKMENLRKAFQQVCAAFEPLSDVDGESGDDDKGKNVSDVCFMARGESDTEYEDNELKQPHDVLDCSTCNLNKMKLKDTLGRVEYMEDIVKNNEVLSCPKCRKSKGVMVDCENCANLEKEVSYLKNSLLRFSDAKKNLNMILDQSKAFVARKENVWIVDSGYSRHMTSDKNWFCSLKKASKTESIVFADASTSAVVATGLVKVNEKFELKNVTLVKDLKYNLLSVSQIVDENFEVHFKQTGSKVFDSCGDSVLNISRYGRVFKADFENSVSPVITCLVAKFDKDVMFWHRRLGHVGFDHLTRLSGLDLVRGLPKLKKDLDLVCTPCRHAKMVSTSHAPIVSVMTDVPGQLLYMDTVGPAGWYVLVIVDDFSRYSWVFFMATKDEAFQHFRGLFLRLKLEFPASLKRIRSDNGGEFKNASFEQFCNERVFLRSKLGKTSYELRFGHQPKVSHLRVFGCTLSQFQGEDGRIFEDESDYDDDDEVGSAGQTGHQAGQTAGTPLVRPTHEERSDRPSSSGSGTVDADRDGPPENSTSTSTETERGLTSEVAAPLHIQRRHPPKQIIGNIDVSHALTDESWINAMHEELENFERNKVWTLVEPPSGHNVIGTKWVFKNKQNEDGLIVRNKARLVAQGFTQVEGLDFDETFAPVARIEAIRLLLAFAASKGFKLYQMDVKSAFLNGFIQEEVYVKQPPGFENPDFPNHVFKLSKALYGLKQAPRAWYDRLKNFLLAKGFTMGKVDKTLFVLKHGDNQLSVQIYVDDIIFGCSTHALVVLVLVIRSYKWYQSMRREFEMSMMGELSYFLGLQIKQTPQGTFVHQTKYTKYLLRRFKMENCKPISTPIGSTAMLDPDEDGEAVDQKEYRSMIGSLLYLTASRPDIQFAMCLCARFQASPRASHRQAVKRIMRYLNHTLEFGIWYSTSSSICLSGYSDANFGGCRIDRKSTSGTCHFLGTSLIAWSSRKQSSVAQSTAESEYVAAASCCSQILWLLSTLKSYGLTFEKVPLFCDNTSAINIAKNPVQHSRTKHIDIRFHFLRDHVEKGDVELQFLDTKLQIADIFTKPLDSNRFAFLHGELGVIHPFGMV

More
Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0 0 0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g10200 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_08G0082800 RBH 0.0031975 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_08G0263300 SBH 0 0.044973 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Powered by

© 2021- Rice Gene Index @Zhang Lab. All Rights Reserved.

National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement

Huazhong Agricultural University

Any comments and suggestions, please contact us.