Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsZS97_01G0585200 | OGI:01106270 | 3/16 | Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | Chr01:37121415-37126189 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | ATGTCGAACGAGGTGAACCATGTAGGGAAGGCTCCCATGTTTAATGGCACAAACTACTCCACTTGGAAAATTAAAATGTCTACTCACCTCAAAGCTATGAGCTTCCATATTTGGAGTATTGTGGATGTAGGCTTTGCTATCACCGGCACACCCTTGACGGAGATTGATCACCGTAACCTCCAACTCAATGCCCAAGCCATGAATTCCTTGTTCAACTCTTTGAGCCAAGAGGAGTTCGATAGAGTGAGCAACCTTGAGACCGCATATGAGATTTGGAACAAGTTGGCAGAGATCCATGAGGGTACAAGTGAGTACAAGAATGCCAAGCTTCATTTCCTCAAGAGCCAATATGAGACATTCTCCATGTTGCCTCATGAGAGTGTGAATGACATGTATGGGAGGCTCAATGTCATTGTGAATGATCTCAAGGGGCTTGGGGCAAACTACACCGATCTTGAGGTTGCCCAAAAGATGCTTAGAGCCCTACCAGAGAAGTATGAGACCCTTGTCACCATGCTCATCAACTCCGACATGTCAAGAATGACACCCGCAAGCCTCTTGGGGAAGATCAACACCAATGACATGTACAAGTTGAAGAAGAAGGAGATGGAGGAAGCCTCACCCTCCAAGAAGTGCATTGCTCTCCAAGCCGAAGTTGAAGACAAGAGCAAGAGCAAGGTGAATGAAGTCAATGAGGACTTGTAGGAAGAGATGGTCCTTCTTGCTAGAAAGTTTAATGATCTCTTGGGAAGGAGAAAGGAGAGAGGAAGGGGCTCCAACTCAAATAGGAGAAGAAATAGAAGACCCAACAAGACTCTCTCCAACTTGAGGTGTTTTGAGTGTGGTGAGAAGGGACACTTTGCTTCCAAGTGCCCTTCCAAGGATGATGATGGAGACAAGTCATCCAAGAAGAAGAGTGGAGGCTACAAGCTCATGAAGAAGCTTAAGAAGGAAGGGAAGAAGATTGAGGCTTTCATCGGGGAATGGGACTCAAATAAGGAGAGCTCCGCCTCATCCGGGTCCGAGGAAGAAGGTGGTGATGATGCAAGCTCCAAGAAGAAGAAGATGGCCGTTGTTGCCATCAAGGAGGCTCCATCACTCTTCGCTCCACTTTGTCTCATGGCAAAGGGCTCCTCTAAGGTAACATCCCTTAGTGATAGTGAGAGTGATGATGATTGTGATGATGTTTCCTATGATGAGCTTGTGAGTATGTTTGAGGAGCTCCATGCTTATAGTGAGAAGGAGATTGTCAAGTTCAAGGCCCTAAAGAAGGATCATGCTTTTTTGGAGGTCTTGTATGAGGAGTTAAAGACCTCTCATGAGAGACTCACCATTTCTCATGAAAAGCTTAAGGAAGCTCATGATAACCTCCTTTCCACTACTCAACATGGAGCTCACATTGATGTTGGCATATCTTGTGATTTGCTTGATGATAGTGCTACTTGCCATATTGCTCATGTTGCATCATCTAGCATTTCTACCTCTTGTGATGATCTTATGGATATGCCTAGCCCTAGCTCTAGCTCTAGCTCTTGTGTTTCTATTTGTGATGCCTCACTTATTGTTGAGAACAATGAGCTTAAGGAGCAAGTGGCTAAGCTCAACAAGAGTTTGGAGAGATGCTTCAAGGGTAAGAACACTCTTGACAAGATTTTGCGTGAGCAACGGTGCATCCTTAACAAGGAGGGACTTGGATTCACTCCAAAGAAGGGTAAGAAACCTTCTCACCATGCCACTCATTTTGTCAAGAGCAATGGTAAGTATTGCTCCAAGTGTCGTGAGGTTGGGCATTTGGTGAGTGATTGCCCCGGTGGTAAGCCTCCTAAGACATGTATGTTCGATTCTCATTATATGCTTAGGAAGGCTTATGATGGTAGTATTGTTGCTAGATATGTGGGTTCCCTTATACTCGGTGGTAAAAAGAATGCCATTTGGGTGCCCAAAGCTTTGGTCTCTAACCTCTAAGGACCCAAACAAGTTTGGGTACCTAAAAGAGCTTGATCTTCTTTTGTAGGTGAACTACCGCACCAGTGGGAGCCATTGGGTGCTTGATAGTGGATGCACTCAACACATGACCGGTGATAGGGCTATGTTCACCACATTTGAAGTAGGAGGGAATGAACAAGAGAAAGTGACATTTGGAGACAATAGCAAAGGAAAGGTAATTGGGTTAGGTAAAATTGCTATCTCCAATGATTTGTCAATTGAAAATGTCTCTCTTGTTAAATCTCTAAATTTCAATTTGCTTTCGGTTGCTCAAATTTGTGATCTTGGCTTGTCATGTGCCTTCTTCCCACAAGAAGTTATTGTTTCTAGCTTTCTTGACAAGTCTTGTGTGTTCAAAGGTTTTAGATATGGAAATCTTTATTTGGTTGATTTCAATTCTAGTGAAGCAAATTTGAAAACTTGTTTAGTTGCAAAAACTTCATTGGGTTGGCTTTGGCATAGGAGGCTAGCTCATGTTGGCATGAATCAATTGAGCAAACTTTCAAAACATGATCTAGTTGTGGGCTTGAAAGATGTGAAGTTTGAGAAAGATAAGCTTTGTAGTGCTTGTCAAGCCGGCAAGCAAGTTGTATGTTCTCATTCTACTAAGAGTATCATGTCCACATCTAGACCATTGGAGCTCTTGCATATGGATTTGTTTGGCCCGACAACCTATAAGAGCATTGGTGGTAATAGTCATTGTCTTGTGATTGTTGATGATTATTCTCGCTATACTTGGGTGTTCTTTTTGCATGATAAGTCTATTGTTGCCGAGCTTTTCAAAAAGTTTGCAAAAAGGGCCCAAAATGAATTTAGTTGCACTCTTGTGAAAATTAGAAGTGACAATGGTTCCGAATTTAAGAATACCAATATCGAGGACTATTGTGATGATCTTGGTATCAAACACGAACTTTCCGCTACCTACTCACCTCAACAAAATGGTGTAGTGGAAAGGAAAAATCGTACATTGATTGAGATGGCAAGGACTATGCTAGATGAATATGGTGTTTCCGATTCCTTTTGGGCGGAAGCCATAAACACCGCTTGCCATGCAACCAATAGGCTTTATTTGCATCATCTCTTGAAAAAGACTTCTTATGAGCTAATTGTTGGGAGGAAGCCAAATGTCGCCTATTTTCGAGTTTTTGGTTGCAAGTGTTATATTTACCGAAAGGGTGTTAGACTAACCAAATTTGAAAGTCGGTGTGATGAAGGGTTTCTTCTAGGTTATGCCTCAAATAGCAAGGCATACCGGGTCTACAACAAGAACAAAGGTATTGTGGAAGAAACCGCCGATGTTCAATTTGATGAGACTAATGGCTCTCAAGAGGGGCACGTGAATTTGGATGATGTAGGTGATGAATGCTTGATGAGAGCTATGAAGAACATGTCTATTGGAGATGTCAAGCCTATTGAAGTGGAAGACAAGCCATCCACCTCCACTCAAGATGAGCCATCTACTTCCGCTTCGCCAAGTCAAGCTCAAGTTGAAGTGGAGGAGGAGAAGGCACAAGATCCACCTATGCCTCCAAGAATACACACCGCTCTTTCCAAGGATCACCCAATTGACCAAGTGTTGGGTGACATTAGTAAGGGTGTTCAAACTCGATCTCGTGTCGCTTCGATTTGTGAACATTACTCGTTTGTTTCTTGTCTTGAGCCAAAACATGTAGATGAAGCTCTTTGTGATCCGGATTGGATGAATGCTATGCATGAAGAGCTCAACAACTTTGCAAGAAACAAGGTGTGGACTTTGGTTGAAAGACCTAGAGACCACAATGTCATAGGGACAAAGTGGATCTTTAGGAACAAACAAGATGGGAACGGATTGGTGGTGAGAAACAAGGCAAGGTTGGTGGCGCAAGGTTTCACACAAGTTGAAGGAATTTGGTGATATGATGTCTAGGGAATTTGAGATGTCCATGATTGGAGAGTTGAGCTTCTTCCTTGGACATCAAATCAAGCAACTCAAGGATGGGACGTTCGTGAGCCAAACCAAGTACATCAAGGATCTACTCAAGAGGTTTGGCTTGGAGGATGCGAAGCCCATCAAGACACCTATGGCAACCAACGGGCATCTCGACATTGATGAGGGAGGTAAACCGGTAGATTTAAAGCTTTATCATTCTATGATTGGTAGCTTGCTTTACCTTACCGCATCTAGGCCGGATATCATGTTTAGTGTTTGCATGTGTGCACGGTTTCAAGCCGCTCCTAAGGAGTGTCACTTAGTGGCCGTGAAAAGGATTCTAAGATATTTAAAGCATTCCTATACTATTGGCTTGTGGTACCCAAAAGGTGCTAAATTTAAGCTTGTTGGCTATTCCGATTCGGATTATGCCGGTTGCAAAGTGGATAGAAAGATCACATCCGGTAGTTGCCAAATGCTTGGTAGATCCCTTGTGTCATGGTCATCCAAGAAACAAAACTCCATAGCCCTCTCTACCGCCGAGGCGGAATATGTTTCGGCGGGTAGTTGTTGTGCCCAATTGCTTTGGATGAAACAAACCTTGTTGGACTATGGCATATCCTTCACCAAAACCCCACTCCTATGTGACAATGATAGTGCCATAAAAATAGCCAATAACCCGGTCCAACATTCTAGAACCAAGCATATTGACATTCGCCATCACTTCCTAAGAGACCATGTTGCCATGTGTGACATAGTCATTAGCCACATAAGAACCGAGGACCAACTAGCCGACATCTTTATCAAGCCTCTTGATGAAACCCGCTTTTGTAAGTTGAGGAATGAGTTAAATGTCATAGATTTCTCTAATGTGGTTTGA
More
|
||||||||||
| CDS seq | ATGTCGAACGAGGTGAACCATGTAGGGAAGGCTCCCATGTTTAATGGCACAAACTACTCCACTTGGAAAATTAAAATGTCTACTCACCTCAAAGCTATGAGCTTCCATATTTGGAGTATTGTGGATGTAGGCTTTGCTATCACCGGCACACCCTTGACGGAGATTGATCACCGTAACCTCCAACTCAATGCCCAAGCCATGAATTCCTTGTTCAACTCTTTGAGCCAAGAGGAGTTCGATAGAGTGAGCAACCTTGAGACCGCATATGAGATTTGGAACAAGTTGGCAGAGATCCATGAGGGTACAAGTGAGTACAAGAATGCCAAGCTTCATTTCCTCAAGAGCCAATATGAGACATTCTCCATGTTGCCTCATGAGAGTGTGAATGACATGTATGGGAGGCTCAATGTCATTGTGAATGATCTCAAGGGGCTTGGGGCAAACTACACCGATCTTGAGGTTGCCCAAAAGATGCTTAGAGCCCTACCAGAGAAGTATGAGACCCTTGTCACCATGCTCATCAACTCCGACATGTCAAGAATGACACCCGCAAGCCTCTTGGGGAAGATCAACACCAATGACATGTACAAGTTGAAGAAGAAGGAGATGGAGGAAGCCTCACCCTCCAAGAAGTGCATTGCTCTCCAAGCCGAAGTTGAAGACAAGAGCAAGAGCAAGGAAGAGATGGTCCTTCTTGCTAGAAAGTTTAATGATCTCTTGGGAAGGAGAAAGGAGAGAGGAAGGGGCTCCAACTCAAATAGGAGAAGAAATAGAAGACCCAACAAGACTCTCTCCAACTTGAGGTGTTTTGAGTGTGGTGAGAAGGGACACTTTGCTTCCAAGTGCCCTTCCAAGGATGATGATGGAGACAAGTCATCCAAGAAGAAGAGTGGAGGCTACAAGCTCATGAAGAAGCTTAAGAAGGAAGGGAAGAAGATTGAGGCTTTCATCGGGGAATGGGACTCAAATAAGGAGAGCTCCGCCTCATCCGGGTCCGAGGAAGAAGGTGGTGATGATGCAAGCTCCAAGAAGAAGAAGATGGCCGTTGTTGCCATCAAGGAGGCTCCATCACTCTTCGCTCCACTTTGTCTCATGGCAAAGGGCTCCTCTAAGGTAACATCCCTTAGTGATAGTGAGAGTGATGATGATTGTGATGATGTTTCCTATGATGAGCTTGTGAGTATGTTTGAGGAGCTCCATGCTTATAGTGAGAAGGAGATTGTCAAGTTCAAGGCCCTAAAGAAGGATCATGCTTTTTTGGAGGTCTTGTATGAGGAGTTAAAGACCTCTCATGAGAGACTCACCATTTCTCATGAAAAGCTTAAGGAAGCTCATGATAACCTCCTTTCCACTACTCAACATGGAGCTCACATTGATGTTGGCATATCTTGTGATTTGCTTGATGATAGTGCTACTTGCCATATTGCTCATGTTGCATCATCTAGCATTTCTACCTCTTGTGATGATCTTATGGATATGCCTAGCCCTAGCTCTAGCTCTAGCTCTTGTGTTTCTATTTGTGATGCCTCACTTATTGTTGAGAACAATGAGCTTAAGGAGCAAGTGGCTAAGCTCAACAAGAGTTTGGAGAGATGCTTCAAGGGTAAGAACACTCTTGACAAGATTTTGCGTGAGCAACGGTGCATCCTTAACAAGGAGGGACTTGGATTCACTCCAAAGAAGGGTAAGAAACCTTCTCACCATGCCACTCATTTTGTCAAGAGCAATGGTAAGTATTGCTCCAAGTGTCGTGAGGTTGGGCATTTGGTGAACTACCGCACCAGTGGGAGCCATTGGGTGCTTGATAGTGGATGCACTCAACACATGACCGGTGATAGGGCTATGTTCACCACATTTGAAGTAGGAGGGAATGAACAAGAGAAAGTGACATTTGGAGACAATAGCAAAGGAAAGGTAATTGGGTTAGGTAAAATTGCTATCTCCAATGATTTGTCAATTGAAAATGTCTCTCTTGTTAAATCTCTAAATTTCAATTTGCTTTCGGTTGCTCAAATTTGTGATCTTGGCTTGTCATGTGCCTTCTTCCCACAAGAAGTTATTGTTTCTAGCTTTCTTGACAAGTCTTGTGTGTTCAAAGGTTTTAGATATGGAAATCTTTATTTGGTTGATTTCAATTCTAGTGAAGCAAATTTGAAAACTTGTTTAGTTGCAAAAACTTCATTGGGTTGGCTTTGGCATAGGAGGCTAGCTCATGTTGGCATGAATCAATTGAGCAAACTTTCAAAACATGATCTAGTTGTGGGCTTGAAAGATGTGAAGTTTGAGAAAGATAAGCTTTGTAGTGCTTGTCAAGCCGGCAAGCAAGTTGTATGTTCTCATTCTACTAAGAGTATCATGTCCACATCTAGACCATTGGAGCTCTTGCATATGGATTTGTTTGGCCCGACAACCTATAAGAGCATTGGTGGTAATAGTCATTGTCTTGTGATTGTTGATGATTATTCTCGCTATACTTGGGTGTTCTTTTTGCATGATAAGTCTATTGTTGCCGAGCTTTTCAAAAAGTTTGCAAAAAGGGCCCAAAATGAATTTAGTTGCACTCTTGTGAAAATTAGAAGTGACAATGGTTCCGAATTTAAGAATACCAATATCGAGGACTATTGTGATGATCTTGGTATCAAACACGAACTTTCCGCTACCTACTCACCTCAACAAAATGGTGTAGTGGAAAGGAAAAATCGTACATTGATTGAGATGGCAAGGACTATGCTAGATGAATATGGTGTTTCCGATTCCTTTTGGGCGGAAGCCATAAACACCGCTTGCCATGCAACCAATAGGCTTTATTTGCATCATCTCTTGAAAAAGACTTCTTATGAGCTAATTGTTGGGAGGAAGCCAAATGTCGCCTATTTTCGAGTTTTTGGTTGCAAGTGTTATATTTACCGAAAGGGTGTTAGACTAACCAAATTTGAAAGTCGGTGTGATGAAGGGTTTCTTCTAGGTTATGCCTCAAATAGCAAGGCATACCGGGTCTACAACAAGAACAAAGGTATTGTGGAAGAAACCGCCGATGTTCAATTTGATGAGACTAATGGCTCTCAAGAGGGGCACGTGAATTTGGATGATGTAGGTGATGAATGCTTGATGAGAGCTATGAAGAACATGTCTATTGGAGATGTCAAGCCTATTGAAGTGGAAGACAAGCCATCCACCTCCACTCAAGATGAGCCATCTACTTCCGCTTCGCCAAGTCAAGCTCAAGTTGAAGTGGAGGAGGAGAAGGCACAAGATCCACCTATGCCTCCAAGAATACACACCGCTCTTTCCAAGGATCACCCAATTGACCAAGTGTTGGGTGACATTAGTAAGGGTGTTCAAACTCGATCTCGTGTCGCTTCGATTTGTGAACATTACTCGTTTGTTTCTTGTCTTGAGCCAAAACATGTAGATGAAGCTCTTTGTGATCCGGATTGGATGAATGCTATGCATGAAGAGCTCAACAACTTTGCAAGAAACAAGGTGTGGACTTTGGTTGAAAGACCTAGAGACCACAATGTCATAGGGACAAAGTGGATCTTTAGGAACAAACAAGATGGGAACGGATTGGTGGTGAGAAACAAGGCAAGGGAATTTGAGATGTCCATGATTGGAGAGTTGAGCTTCTTCCTTGGACATCAAATCAAGCAACTCAAGGATGGGACGTTCGTGAGCCAAACCAAGTACATCAAGGATCTACTCAAGAGGTTTGGCTTGGAGGATGCGAAGCCCATCAAGACACCTATGGCAACCAACGGGCATCTCGACATTGATGAGGGAGCCGCTCCTAAGGAGTGTCACTTAGTGGCCGTGAAAAGGATTCTAAGATATTTAAAGCATTCCTATACTATTGGCTTGTGGTACCCAAAAGGTGCTAAATTTAAGCTTGTTGGCTATTCCGATTCGGATTATGCCGGTTGCAAAGTGGATAGAAAGATCACATCCGGTAGTTGCCAAATGCTTGGTAGATCCCTTGTGTCATGGTCATCCAAGAAACAAAACTCCATAGCCCTCTCTACCGCCGAGGCGGAATATGTTTCGGCGGGTAGTTGTTGTGCCCAATTGCTTTGGATGAAACAAACCTTGTTGGACTATGGCATATCCTTCACCAAAACCCCACTCCTATGTGACAATGATAGTGCCATAAAAATAGCCAATAACCCGGTCCAACATTCTAGAACCAAGCATATTGACATTCGCCATCACTTCCTAAGAGACCATGTTGCCATGTGTGACATAGTCATTAGCCACATAAGAACCGAGGACCAACTAGCCGACATCTTTATCAAGCCTCTTGATGAAACCCGCTTTTGTAAGTTGAGGAATGAGTTAAATGTCATAGATTTCTCTAATGTGGTTTGA
More
|
||||||||||
| Protein seq | MSNEVNHVGKAPMFNGTNYSTWKIKMSTHLKAMSFHIWSIVDVGFAITGTPLTEIDHRNLQLNAQAMNSLFNSLSQEEFDRVSNLETAYEIWNKLAEIHEGTSEYKNAKLHFLKSQYETFSMLPHESVNDMYGRLNVIVNDLKGLGANYTDLEVAQKMLRALPEKYETLVTMLINSDMSRMTPASLLGKINTNDMYKLKKKEMEEASPSKKCIALQAEVEDKSKSKEEMVLLARKFNDLLGRRKERGRGSNSNRRRNRRPNKTLSNLRCFECGEKGHFASKCPSKDDDGDKSSKKKSGGYKLMKKLKKEGKKIEAFIGEWDSNKESSASSGSEEEGGDDASSKKKKMAVVAIKEAPSLFAPLCLMAKGSSKVTSLSDSESDDDCDDVSYDELVSMFEELHAYSEKEIVKFKALKKDHAFLEVLYEELKTSHERLTISHEKLKEAHDNLLSTTQHGAHIDVGISCDLLDDSATCHIAHVASSSISTSCDDLMDMPSPSSSSSSCVSICDASLIVENNELKEQVAKLNKSLERCFKGKNTLDKILREQRCILNKEGLGFTPKKGKKPSHHATHFVKSNGKYCSKCREVGHLVNYRTSGSHWVLDSGCTQHMTGDRAMFTTFEVGGNEQEKVTFGDNSKGKVIGLGKIAISNDLSIENVSLVKSLNFNLLSVAQICDLGLSCAFFPQEVIVSSFLDKSCVFKGFRYGNLYLVDFNSSEANLKTCLVAKTSLGWLWHRRLAHVGMNQLSKLSKHDLVVGLKDVKFEKDKLCSACQAGKQVVCSHSTKSIMSTSRPLELLHMDLFGPTTYKSIGGNSHCLVIVDDYSRYTWVFFLHDKSIVAELFKKFAKRAQNEFSCTLVKIRSDNGSEFKNTNIEDYCDDLGIKHELSATYSPQQNGVVERKNRTLIEMARTMLDEYGVSDSFWAEAINTACHATNRLYLHHLLKKTSYELIVGRKPNVAYFRVFGCKCYIYRKGVRLTKFESRCDEGFLLGYASNSKAYRVYNKNKGIVEETADVQFDETNGSQEGHVNLDDVGDECLMRAMKNMSIGDVKPIEVEDKPSTSTQDEPSTSASPSQAQVEVEEEKAQDPPMPPRIHTALSKDHPIDQVLGDISKGVQTRSRVASICEHYSFVSCLEPKHVDEALCDPDWMNAMHEELNNFARNKVWTLVERPRDHNVIGTKWIFRNKQDGNGLVVRNKAREFEMSMIGELSFFLGHQIKQLKDGTFVSQTKYIKDLLKRFGLEDAKPIKTPMATNGHLDIDEGAAPKECHLVAVKRILRYLKHSYTIGLWYPKGAKFKLVGYSDSDYAGCKVDRKITSGSCQMLGRSLVSWSSKKQNSIALSTAEAEYVSAGSCCAQLLWMKQTLLDYGISFTKTPLLCDNDSAIKIANNPVQHSRTKHIDIRHHFLRDHVAMCDIVISHIRTEDQLADIFIKPLDETRFCKLRNELNVIDFSNVV |
||||||||||
| Function | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [UniProtKB/Swiss-Prot:P10978] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsZS97_01G0585200 | OsZS97_01T0585200.1 | Chr01 | 37121415 | 37126189 | + | makerRMon | ||
| CDS seq | ATGTCGAACGAGGTGAACCATGTAGGGAAGGCTCCCATGTTTAATGGCACAAACTACTCCACTTGGAAAATTAAAATGTCTACTCACCTCAAAGCTATGAGCTTCCATATTTGGAGTATTGTGGATGTAGGCTTTGCTATCACCGGCACACCCTTGACGGAGATTGATCACCGTAACCTCCAACTCAATGCCCAAGCCATGAATTCCTTGTTCAACTCTTTGAGCCAAGAGGAGTTCGATAGAGTGAGCAACCTTGAGACCGCATATGAGATTTGGAACAAGTTGGCAGAGATCCATGAGGGTACAAGTGAGTACAAGAATGCCAAGCTTCATTTCCTCAAGAGCCAATATGAGACATTCTCCATGTTGCCTCATGAGAGTGTGAATGACATGTATGGGAGGCTCAATGTCATTGTGAATGATCTCAAGGGGCTTGGGGCAAACTACACCGATCTTGAGGTTGCCCAAAAGATGCTTAGAGCCCTACCAGAGAAGTATGAGACCCTTGTCACCATGCTCATCAACTCCGACATGTCAAGAATGACACCCGCAAGCCTCTTGGGGAAGATCAACACCAATGACATGTACAAGTTGAAGAAGAAGGAGATGGAGGAAGCCTCACCCTCCAAGAAGTGCATTGCTCTCCAAGCCGAAGTTGAAGACAAGAGCAAGAGCAAGGAAGAGATGGTCCTTCTTGCTAGAAAGTTTAATGATCTCTTGGGAAGGAGAAAGGAGAGAGGAAGGGGCTCCAACTCAAATAGGAGAAGAAATAGAAGACCCAACAAGACTCTCTCCAACTTGAGGTGTTTTGAGTGTGGTGAGAAGGGACACTTTGCTTCCAAGTGCCCTTCCAAGGATGATGATGGAGACAAGTCATCCAAGAAGAAGAGTGGAGGCTACAAGCTCATGAAGAAGCTTAAGAAGGAAGGGAAGAAGATTGAGGCTTTCATCGGGGAATGGGACTCAAATAAGGAGAGCTCCGCCTCATCCGGGTCCGAGGAAGAAGGTGGTGATGATGCAAGCTCCAAGAAGAAGAAGATGGCCGTTGTTGCCATCAAGGAGGCTCCATCACTCTTCGCTCCACTTTGTCTCATGGCAAAGGGCTCCTCTAAGGTAACATCCCTTAGTGATAGTGAGAGTGATGATGATTGTGATGATGTTTCCTATGATGAGCTTGTGAGTATGTTTGAGGAGCTCCATGCTTATAGTGAGAAGGAGATTGTCAAGTTCAAGGCCCTAAAGAAGGATCATGCTTTTTTGGAGGTCTTGTATGAGGAGTTAAAGACCTCTCATGAGAGACTCACCATTTCTCATGAAAAGCTTAAGGAAGCTCATGATAACCTCCTTTCCACTACTCAACATGGAGCTCACATTGATGTTGGCATATCTTGTGATTTGCTTGATGATAGTGCTACTTGCCATATTGCTCATGTTGCATCATCTAGCATTTCTACCTCTTGTGATGATCTTATGGATATGCCTAGCCCTAGCTCTAGCTCTAGCTCTTGTGTTTCTATTTGTGATGCCTCACTTATTGTTGAGAACAATGAGCTTAAGGAGCAAGTGGCTAAGCTCAACAAGAGTTTGGAGAGATGCTTCAAGGGTAAGAACACTCTTGACAAGATTTTGCGTGAGCAACGGTGCATCCTTAACAAGGAGGGACTTGGATTCACTCCAAAGAAGGGTAAGAAACCTTCTCACCATGCCACTCATTTTGTCAAGAGCAATGGTAAGTATTGCTCCAAGTGTCGTGAGGTTGGGCATTTGGTGAACTACCGCACCAGTGGGAGCCATTGGGTGCTTGATAGTGGATGCACTCAACACATGACCGGTGATAGGGCTATGTTCACCACATTTGAAGTAGGAGGGAATGAACAAGAGAAAGTGACATTTGGAGACAATAGCAAAGGAAAGGTAATTGGGTTAGGTAAAATTGCTATCTCCAATGATTTGTCAATTGAAAATGTCTCTCTTGTTAAATCTCTAAATTTCAATTTGCTTTCGGTTGCTCAAATTTGTGATCTTGGCTTGTCATGTGCCTTCTTCCCACAAGAAGTTATTGTTTCTAGCTTTCTTGACAAGTCTTGTGTGTTCAAAGGTTTTAGATATGGAAATCTTTATTTGGTTGATTTCAATTCTAGTGAAGCAAATTTGAAAACTTGTTTAGTTGCAAAAACTTCATTGGGTTGGCTTTGGCATAGGAGGCTAGCTCATGTTGGCATGAATCAATTGAGCAAACTTTCAAAACATGATCTAGTTGTGGGCTTGAAAGATGTGAAGTTTGAGAAAGATAAGCTTTGTAGTGCTTGTCAAGCCGGCAAGCAAGTTGTATGTTCTCATTCTACTAAGAGTATCATGTCCACATCTAGACCATTGGAGCTCTTGCATATGGATTTGTTTGGCCCGACAACCTATAAGAGCATTGGTGGTAATAGTCATTGTCTTGTGATTGTTGATGATTATTCTCGCTATACTTGGGTGTTCTTTTTGCATGATAAGTCTATTGTTGCCGAGCTTTTCAAAAAGTTTGCAAAAAGGGCCCAAAATGAATTTAGTTGCACTCTTGTGAAAATTAGAAGTGACAATGGTTCCGAATTTAAGAATACCAATATCGAGGACTATTGTGATGATCTTGGTATCAAACACGAACTTTCCGCTACCTACTCACCTCAACAAAATGGTGTAGTGGAAAGGAAAAATCGTACATTGATTGAGATGGCAAGGACTATGCTAGATGAATATGGTGTTTCCGATTCCTTTTGGGCGGAAGCCATAAACACCGCTTGCCATGCAACCAATAGGCTTTATTTGCATCATCTCTTGAAAAAGACTTCTTATGAGCTAATTGTTGGGAGGAAGCCAAATGTCGCCTATTTTCGAGTTTTTGGTTGCAAGTGTTATATTTACCGAAAGGGTGTTAGACTAACCAAATTTGAAAGTCGGTGTGATGAAGGGTTTCTTCTAGGTTATGCCTCAAATAGCAAGGCATACCGGGTCTACAACAAGAACAAAGGTATTGTGGAAGAAACCGCCGATGTTCAATTTGATGAGACTAATGGCTCTCAAGAGGGGCACGTGAATTTGGATGATGTAGGTGATGAATGCTTGATGAGAGCTATGAAGAACATGTCTATTGGAGATGTCAAGCCTATTGAAGTGGAAGACAAGCCATCCACCTCCACTCAAGATGAGCCATCTACTTCCGCTTCGCCAAGTCAAGCTCAAGTTGAAGTGGAGGAGGAGAAGGCACAAGATCCACCTATGCCTCCAAGAATACACACCGCTCTTTCCAAGGATCACCCAATTGACCAAGTGTTGGGTGACATTAGTAAGGGTGTTCAAACTCGATCTCGTGTCGCTTCGATTTGTGAACATTACTCGTTTGTTTCTTGTCTTGAGCCAAAACATGTAGATGAAGCTCTTTGTGATCCGGATTGGATGAATGCTATGCATGAAGAGCTCAACAACTTTGCAAGAAACAAGGTGTGGACTTTGGTTGAAAGACCTAGAGACCACAATGTCATAGGGACAAAGTGGATCTTTAGGAACAAACAAGATGGGAACGGATTGGTGGTGAGAAACAAGGCAAGGGAATTTGAGATGTCCATGATTGGAGAGTTGAGCTTCTTCCTTGGACATCAAATCAAGCAACTCAAGGATGGGACGTTCGTGAGCCAAACCAAGTACATCAAGGATCTACTCAAGAGGTTTGGCTTGGAGGATGCGAAGCCCATCAAGACACCTATGGCAACCAACGGGCATCTCGACATTGATGAGGGAGCCGCTCCTAAGGAGTGTCACTTAGTGGCCGTGAAAAGGATTCTAAGATATTTAAAGCATTCCTATACTATTGGCTTGTGGTACCCAAAAGGTGCTAAATTTAAGCTTGTTGGCTATTCCGATTCGGATTATGCCGGTTGCAAAGTGGATAGAAAGATCACATCCGGTAGTTGCCAAATGCTTGGTAGATCCCTTGTGTCATGGTCATCCAAGAAACAAAACTCCATAGCCCTCTCTACCGCCGAGGCGGAATATGTTTCGGCGGGTAGTTGTTGTGCCCAATTGCTTTGGATGAAACAAACCTTGTTGGACTATGGCATATCCTTCACCAAAACCCCACTCCTATGTGACAATGATAGTGCCATAAAAATAGCCAATAACCCGGTCCAACATTCTAGAACCAAGCATATTGACATTCGCCATCACTTCCTAAGAGACCATGTTGCCATGTGTGACATAGTCATTAGCCACATAAGAACCGAGGACCAACTAGCCGACATCTTTATCAAGCCTCTTGATGAAACCCGCTTTTGTAAGTTGAGGAATGAGTTAAATGTCATAGATTTCTCTAATGTGGTTTGA
More
|
|||||||
| Protein seq | MSNEVNHVGKAPMFNGTNYSTWKIKMSTHLKAMSFHIWSIVDVGFAITGTPLTEIDHRNLQLNAQAMNSLFNSLSQEEFDRVSNLETAYEIWNKLAEIHEGTSEYKNAKLHFLKSQYETFSMLPHESVNDMYGRLNVIVNDLKGLGANYTDLEVAQKMLRALPEKYETLVTMLINSDMSRMTPASLLGKINTNDMYKLKKKEMEEASPSKKCIALQAEVEDKSKSKEEMVLLARKFNDLLGRRKERGRGSNSNRRRNRRPNKTLSNLRCFECGEKGHFASKCPSKDDDGDKSSKKKSGGYKLMKKLKKEGKKIEAFIGEWDSNKESSASSGSEEEGGDDASSKKKKMAVVAIKEAPSLFAPLCLMAKGSSKVTSLSDSESDDDCDDVSYDELVSMFEELHAYSEKEIVKFKALKKDHAFLEVLYEELKTSHERLTISHEKLKEAHDNLLSTTQHGAHIDVGISCDLLDDSATCHIAHVASSSISTSCDDLMDMPSPSSSSSSCVSICDASLIVENNELKEQVAKLNKSLERCFKGKNTLDKILREQRCILNKEGLGFTPKKGKKPSHHATHFVKSNGKYCSKCREVGHLVNYRTSGSHWVLDSGCTQHMTGDRAMFTTFEVGGNEQEKVTFGDNSKGKVIGLGKIAISNDLSIENVSLVKSLNFNLLSVAQICDLGLSCAFFPQEVIVSSFLDKSCVFKGFRYGNLYLVDFNSSEANLKTCLVAKTSLGWLWHRRLAHVGMNQLSKLSKHDLVVGLKDVKFEKDKLCSACQAGKQVVCSHSTKSIMSTSRPLELLHMDLFGPTTYKSIGGNSHCLVIVDDYSRYTWVFFLHDKSIVAELFKKFAKRAQNEFSCTLVKIRSDNGSEFKNTNIEDYCDDLGIKHELSATYSPQQNGVVERKNRTLIEMARTMLDEYGVSDSFWAEAINTACHATNRLYLHHLLKKTSYELIVGRKPNVAYFRVFGCKCYIYRKGVRLTKFESRCDEGFLLGYASNSKAYRVYNKNKGIVEETADVQFDETNGSQEGHVNLDDVGDECLMRAMKNMSIGDVKPIEVEDKPSTSTQDEPSTSASPSQAQVEVEEEKAQDPPMPPRIHTALSKDHPIDQVLGDISKGVQTRSRVASICEHYSFVSCLEPKHVDEALCDPDWMNAMHEELNNFARNKVWTLVERPRDHNVIGTKWIFRNKQDGNGLVVRNKAREFEMSMIGELSFFLGHQIKQLKDGTFVSQTKYIKDLLKRFGLEDAKPIKTPMATNGHLDIDEGAAPKECHLVAVKRILRYLKHSYTIGLWYPKGAKFKLVGYSDSDYAGCKVDRKITSGSCQMLGRSLVSWSSKKQNSIALSTAEAEYVSAGSCCAQLLWMKQTLLDYGISFTKTPLLCDNDSAIKIANNPVQHSRTKHIDIRHHFLRDHVAMCDIVISHIRTEDQLADIFIKPLDETRFCKLRNELNVIDFSNVV
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0 | 0 | 0.015545 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0909600 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g61490 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0909600 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0588300 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_05G0348400 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
