Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsPr106_12g0014330 | OGI:12052770 | 15/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr12:18515586-18540443 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MVEAAAIAFAKSSAIFVGKKVAEAVISYVVNKALDRLPLENEDLKTKLKSKLSKTQAMLYGITLQEIQDNQGLVEWLWQFRDAIQEAEDALDELDFFDLEKVCNRKAESSSSLVPKFMRLQLSVSSNNSNSSRKNLKNALMRLESVFDDAANFRVVTGHGLHTSPQRNEGRIQDTTNRNETTRVLATPVFGRQKEKDEIIEWLGVEAPGRDSKLSVCAIVGGGGMGKTSLAQLVCQDKKVQDHFGDMIIWVHVPKRFEPLVLVARMLESINRNRATASSLDILQLDLTKELVTKRFLLVLDDAWEDGENELWGQFLSPLRNIIAPMGGRILLTTRMGSVADAVKRQMPSNEYKCVVLGGLDHRDIMQILNHHVPPNEDLELRSVAEWIVHNLEGCPFVAKVIGQYLRDNTDHSNWNDFLNKKVCHLDDIAPRVMEMLRLSYEDLTSEVQLCFQYCSIFPSHYKFRMEELTEMWVSSGLILQSTKGNSGQEKIAREHFNILLKKSFFSLIPRELHPDPSTDYYVMHDLIYELSCLVSSEEFSTFKVTKCNTADVSERVRHLYIEGINSEAINVISKSKYLRTLIIANEEWPLKAGLADNLKKAMKGITSLRLLKFDGHGWFDINDAIAELKHLRYICMSATNKSNLNKLFKLFHLEVLKLLTIEGEEQASVSDLCNLANLQKLYLPKTALSRVPHIGRLTNLRELNGLSVKREDGHKISELKDLKNLRKVFVFDVENVSNCSEASSAELSNKNDMELLSLEWSNQHNRINEQILDTLVPYKRIRHLRISGYKGFLPPLWIQRKVLTKLVHLKIVGCPKWDKLPSLASLSSLKHVLLEDLPNLKYIGGPDGDGLPPFLVTLVVKDCLDLLNLPHLPYSLKHLGINKVGIPCLPASNHMALQNVSTVDPQLCSLHVDSCPNLCSFGSCIVEEQHYKALTSLKVVGCSMLQKLPSEEHFRRISTMESIEILQCQSLSTLGGLGALASLKILKIQQCTHLTATSSGIPVAPAMQSSLVLDTLEIDNHLLLLQNPFRNFCLTRRLVSNGSEMLELPQEWLLQNSSQLEHIEINNANLLRSLPSTMDTLHSLRSLVLCNAPLLETLPAMPPNLWALQISGCCTRLKVGCKTNGSEWEKILPIHKDSMNWAAAHSMSLLDRAFSYIDGVDNQVRKEKLFQVLSVLRTAYGYPRSLFGAAEPRRREFMDVVSRLEDAIDDVECRKLEEVRNPAFRNFSKLLFMPSVVRRTAILETAVREFEDVVLRLKHEVPSYQSSYHVESFDRYGNHKVLFGRDREQQQIVQWLIQEEPQPVIRGHTVSIFAIVGIAGMGKTELARFAYGDSRVRMNFDSFAWVSLSGNFRAQAVTRVIVESIYNKLLLVLDDAWEDNNLEEWKSLADSLKDCKPGSRILLTTQMQSVADIAEEGIGVEVKCLKLGELDEFNNLELLKSCLHSSGHPADLELIAEQIAKQIGGCPLVTIRVASQLNRMDPKHWYSVLKGSWRYEMGMNFLFTSYNRLPTELQNCFRYCSIFPKGHRFDKLELVNMWIGSGLIPLSSSGKNDVDLGEQYFAALAKKSFFCSMLETESSNGDHKEYYVLHSLMHDLAQFVSRGECARVDNDDFRNVMPTTRHLSVVHCGSLNQISRLKNLRTLIIQSESYLDEEAEYALQDVLMMSVRLRLLYLYVPSLSHALHKLGTLTHLRYLFLFSCDRYLIILVHRLYHLKVLKINYFTDKEEYFSCIPNLRSLHCLHAPENIMSSKILNTRMLTRLQQLHVFSIAENDGQRLMALRNLTALRQLSLRNLQNVKNSKESEAIKIKGKQHMRFLSLSWNQYLNDPENLDHRIIDSLEPNKEIEQLHIHGYSGVQPPIWIENSSLIHLVSLELECCMNWKTVPSFQKLSSLKYLKLEHLLQLECIGTVTREQFQSNEPENVLPPFLNTLIIRWCPSLKNLPSIPCTLQQLIVKHVGFAVLPMIHQRYTGTRESSFPSSSVKSCLAVLHIECCEHLTTLDEGILEQQQYLQSLETLVVRNCENLSHLPAMGLTELHHLTSLEIVACPMLRNVKTEDSLWPISLKKLDMNPCGHMEDSVLMSLQDLTSLRSFTLFSCSNIEKLPSEEVFRTLKNLNDVSIARCKNLLSLGGLGAVPSLRVLSILCCDKIHHSYSEQAGCSFKLHKLKVDREAILLVEPIRSLRYTMELHIGDDHVMESLPEEWLLQNASSLHLIELGVAKNLQTLPSQMKKLKSLQSLHIERAPAIKFLPQLPVSLNKLTIWGCDPRFWKRYETNVGSEWVKIKHIAHVDMKAYSEDSSDDDDKIQYFDDSTTNPSRRFVRRLFDPHPLPAKSLRGMAEAAAVFVGKAVVQPAISYLVKKILDRIPDGDLCKRLQQKLPFVEAILYAVDQQQTLSNPSLSEVVWQLRDAIQEAEDALDSLEFLDLKSSANNRSKVSLSSLLSSISRKFHVADSSRATENLKDALKNLDAVLDNAGRSLPAIYPSSCSHGKAHIQDSASIQEVTKELRTTIFGRLKEKDAIIDWLGVLTPNIRDQKLSLCAIVGAGGMGKTTLAQFVCQDKKVQDHFANKIIWADVSKIFDPKVLVRKISGSFNRYKASADGLDTIMTDKFLLVLDDARDDAQSEQWQQFLDLIRKNAPMGGKILLTTQIRPVANAVEGQMSPDTYKCLELGGLDQENTLKLFNHHAFGDLSPSDCFELQLIGEQIARKLKGCPLLARTIGRHLQGNTDHARWNTILNHDIHKVDDVATEIKKVLRLSYESLSNEVQVCFRYCSIFPPHYKFKMEEMVEMWVSSGLILQREDGINNREDIAIQYFNTLWQKSFFSLVPRELNVDTSEDYYVLHDGMHEFSCTVSIGECSRLKATDHGIGIPLTVRHLYVEGINAETINVISKFKYLRTLVVENKENSIQEEHANALKNSIEGRTSLRLLKLYGNGWFCMNDTIAGLEHLRYIYLSATKESNLSKLFKLCHLEVLQILKIEKENESRSISINLPHLQKLHLPKTTVSRIAQIGSLTTLRELNGFSVKRTDGHKITELKDLRKLQKVIVLDVQNVIDHTEASDAELDKKSDLKNCLGLSELPSLPFSLRYLDIDRVGMSSLPTMCTHMGRRRVSLVESQLSILNVESCNLLVSLNGFLQEEHCRVLTVLSLVCCHMLISLPDASDFKRMSKLESIRIIECNRLSSLGGLEALSYLKVLRIEHCANLVTTSSRLPPASDESTYLKLETLEIDDHQLLAISPIRNLCLTKKLIILEREKMAELPLEWLLQNRSHLEHIEISNAELLKSLPNMHEWHTLRSMLLHNTPLLQSLPLMPPNLWVLDINGCCNELHGECQSGAFSKNNRIYPQTLATGCSPPSHRVAIAPPTPHALRSVLVPTRESPSCLVVACPSPVTTDVVRPLPILRCPSLCRHCSTSIPRIVGKGECRGKDGGAQIRRPPSSEVAAARGSGGLCPLERLGAGGKDGGVRIHHLPSSGATARRRIDLVASVTGNGLAGAGAPAARGSACFHPRERWRNK |
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| Function | Putative disease resistance RPP13-like protein 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LRR4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_12g0014330 | OsPr106_12g0014330.01 | Chr12 | 18515586 | 18540443 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 1.816516 | 3.163459 | 3.415550 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os12g0511500 | RBH | None | None | None |
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| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_12g0015080 | RBH | 0.111656 | 1.398868 | 0.555821 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_12g0015030 | RBH | 0.0 | 6.478322 | 0.000000 |
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| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_12g0014830 | RBH | 1.629682 | 5.231374 | None |
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| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_12g0014920 | RBH | 0.000000 | 3.252288 | None |
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| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_12g0014600 | RBH | 0.000000 | 1.087796 | 0.067310 |
