Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_12g0004700 OGI:12009050 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr12:3476811-3482651
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Disease resistance protein Piks-2 [UniProtKB/Swiss-Prot:P0DO10]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_12g0004700 OsPr106_12g0004700.01 Chr12 3476811 3482651 + NAM
CDS seq

atggagagcgcggcgcagagcctcgtaagcaatgtggggacactggtggggcaggagttcaaccagctgcgcggcgtcggcgtggaggtggctcgccttcggaacgagctggccaccatccacgccctcctccggatgcagtcggaggccgacgaggccgccgtggaccacttcgcccgcgagtggctgaagcagctgcgcgaggtggcctacgacgccgaggactgcgtccacctctaccacttccgcatccggtgccgctccggccagctatccgtctggaccaattgcaagcgcctcctcaccaccctcctcgctcgccgccagctcgccggcgacatcagggcgctccgtgcgctcgcctcctccatcaacgagcagcattgcagctacgggttcagcctcgactcgctgcggcgcagcacggccgatgcagcagctttaggcaccatgccggcatcggcgcgtgtcgtcgtcgtcgacgccgatgatcatgatgagttcgtcgacaacaatggccaagctacggagctagccaacaaggtgagtgcactaagagagggagttgacgatgacaagaagcgcagggtgttctccatcgtggggttcggagggctcgggaagacgatgctggcgagggaggtgtgtcggcggctggagacggtgtttcacttccaagcgcaggtggccgtgtcgcagacattcagcggcaaggaccttcagggattgctcaggcgcgttcttcggcagatcacgcagcctatcgtcgaccgagagactgtagacgacgcagagatcacccagctgcaagcggctgcggctagctcgcagcctaatgttaatatcgacaccatggatgtcgacgacctggcaaccgagctcaaaaagaggctcgacaacaagagcatagcagcttgggatgcgatccggtccaagttaccagtcacagacagcaattgcggcagcagaatcatagttaccactcgtatacataccgtggcaaaagcatgcagtgctgctagtgattacatccatcatatgaagaagctagacgatacagaatccaagcagttgttcatcagcaaagcatttggctctaaaagtccttgccctgatgatttgaaagatgcaatggaaagtatcctaaaaaaatgtagtgggctaccattggccattgttagcgttgccagcctattggcaaactataaacctccagaaggcaaagaaatgtgggaaacaattaagaactcaattggttcacagatggaaaacaaccctaccctcgaggggatgaggcaaatactcacactgagttataaccacctacctcatcacctcaaggcttgcatgatgtatcttagcattttcccggaggattatatgatcgccaaggatcgactgttgaagagatggatctccgaaggattgattgttgagaagcggggattgtgccagatggatcttgcggaaggctactttaatgagctagtgagtaggaatatggttgacatggtgatcagtaaggccacttttaatttgcatcaagggatcagagaagaccagttccgagtgcatgatatgatgcttgagatactggtgtccaaatccctagagtctaactttgttagcctagtaggcgagttcaccctgctaagggtacttgatctagaagactgcactggcctaacaaacaagcatatgagttgtatctgccggatgtaccttctaaggttcttgagcttgagaggtacagatgtcaaggtgatgccatcaagaattggtgatctcgagcatttgcagatgcttgatgtacgtcaaacacagctcaaggatctgccaaaatcagttacaaagctagagaagctggagcacctgctattctttgaccagggtgattctggttggatgctgccccaagggatcaacaaaatgaaggcactacgccagttaaaaaaagcagctgtggtatttgatgccaaggtcgctgaggagattggtgaactgggtcaattgcaagagctagctatctttgtcgacacgggaaagaaaatgaacaatggtgtcgtcaaaaagcttgccagctccttgagcaagatgtactccctgagatggctcgacatcggcaatcttgatgccggtaaatggccttttgctccaataatggaatttctacatgatatagagccaccaccacaactgctccggtaccttaggatctgtgggcacatggacaggttgcctgactgggtagagtcactccatgatcttgttgaattgcagttacggtggacgcacgttgatggtttccaactattcaacgtcctctgtaagttgcccaacctgaagaggctattcctgggaagttactttattcacggaaaacatatggttgtgcacagtagccagcactttcgggagctcaaggaactgattctgggttatactcctagtagttgtgatgtctacgaatttgaggaaggatccatgccaaatgtggagaggctagttgtgtatttcggcgaccaaactaaaaaaattgttggcattgagcacttcaagaaacttaaagaggttgaatatattggttcgaaagacaatttgagacctgtactagagccggtagagcagatgaataacaagcgagacgtgtcccaacggataacaattaaagtgaggtatgactggtaa

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 9.429421 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0166600 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g06920 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0166600 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0004450 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0004680 RBH 0.0 1.462488 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0004680 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0004520 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0001970 RBH 0.0 3.506722 0.334742
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0057900 RBH 0.055363 0.263519 0.057076
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_12g0004680 RBH 0.0 0.119146 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0061900 RBH 0.055758 0.031471 0.055464
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0004460 RBH 0.0 0.229193 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_12g0004710 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0004700 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0004640 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0004600 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G004510 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0004710 RBH 0.0 0.0 0.0
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