Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_11g0020710 OGI:11055640 | 12/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:26981298-26985018
Gene Symbol -
DNA seq

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CDS seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_11g0020710 OsPr106_11g0020710.01 Chr11 26981298 26985018 - NAM
CDS seq

atgcctgtagcagcagcagcccagaaagcattattggcacaacctgttctgatacttatcatcctcatcgtcagctcatgtccttgtgtaagttcattagcaccatccagaacccataacacatcagaagccgaccggcaagccctcctttgtctcagatcacagttctctgatcctttgggagccctggactcatggagaaaagagtcacttgcattctgtgattggcatggggtgacatgcagcaaccagggtgcagctcgcgtcgtcgctcttcaccttgaatcactgaacctcactggccaaatacccccttgcattgccgacctgagcttccttacaacaatttacatgccggataaccaaatcagtggccacatacctcctgagattggccgcttaacccagctcaggaacctaagcctaggcatgaattccatcacagggatgattccggataccatatcatcgtgtacccaccttgaggtcattgacatgtggagcaacaacatcgaaggtgagatcccatcaaaccttgctaattgttcacttcttcaagaaattactctcagccataacaacctcaatggaacaatccctcctgggatcggttcactgcctaatcttaaatatctttttcttgctaataacaaccttgtgggtagtattcctagatctttgggaagtagaacatcattgtccatggttgtccttgcacataacagcctaactggtagtattccacctatcttagcgaattgctcatcactcatataccttgacctgtcacaaaataaacttggtggggtaatcccttctgccctcttcaacagctcatctcttctttccttagatctctcaagtaataacttcattagatggtcaatcccctctgccccactgatatccgcaccgattctgcgtgtcatccttacaaacaacacaatctttggaggtattccagctgcattgggaaatctgagttccctatcttccttgttagttgctcaaaacaacctacaaggaaatatcccagatagcataaccaaaattccatatttacaagaattagacttggcttataacaatttgaccggcacagttccaccatctctttacacaatctcgactttgacttatcttggcctaggggtaaacaacctttttgggagaattccaaccaacattggatacactcttccaaacattgaaacattgatcctagaagaaaatcattttgatggtccactgccaacctctttagttaatgccttgaaccttcaagtgctagaggtccgtgataacacattcactggtgttgttccttctttctgggctttgcaaaacttgacccagttggaccttggtgccaacctatttgaatctgtagactggacatccttgtcctcaaaaataaactctaccaaactggtggcaatatatttggataacaacaggattcatggaatcttacctagttccattggcaatctcccaggaagcttgcaaacattatatatgaccaacaacagaattgcagggaccataccttcagagataggaaacctcaataacctcactcttcttcatctagcagaaaacttaatctcaggggacattcctgaaacacttagtaaccttgtaaacttgtttgtcctagggttacatcgcaataatctttctgggaaaatcccacaatcaattggaaaacttgaaaaattaggtgagctttatctccaagagaacaactttagtggggccataccttcaagcataggaaggtgcaaaaatttggtaatgctgaacctctcatgtaataccttcaatggaatcattccacccgagctcttgtcgatctcctcactttcaaaaggcctagatttgtcttacaatggatttagtggacccatcccatctgagattggtagtttaattaaccttgactctattaacatttccaacaaccaattatctggagagattccgcatacacttggtgagtgccttcacttggagtccctacaattagaagtgaattttctaaatgggagtatcccggactccttcacgagtttaagaggcatcaatgagatggatctctcacagaataacttgtctggtgaaatcccaaaattttttgagacattcagctctttgcagctcctcaacttatccttcaacaatctcgagggaatggttcctacatatgggaatagggaattatgcacagggtcttcaatgctgcaattaccactttgcacatcaacatcatccaaaacaaacaagaaatcctatatcatcccaatagttgtcccacttgctagtgctgctacattcctaatgatatgtgttgccacatttctttacaagaagcgaaataacctgggaaagcaaattgatcagtcttctaaggagtggaagttcacatatgctgagattgccaaagctaccaatgaattttcatcagacaacttggttggttccggggcatttggggtggtctacataggtagattcaaaattgatgcagagccagttgccattaaggtattcaaacttgacgaaatcggagcatcaaataacttcttggctgaatgcaaggtgctaaggaacactcggcaccgaaatctcatgcatgtgattagtctatgttcctccttcgatccaatgggaaaagagtttaaagctctaattttggagtacatggctaatggtaacctagaaagttggcttcatccaaaagtacaaaaacatcgacaaagaagaccattaggtctaggatcaattatacagatagcaacggacattgctgctgccttggattatctccataactggtgcacacctccgcttgttcactgtgatttgaagccaagtaatgtacttttggatgaggacatggttgctcatgttagtgactttgggttagcaaaatttatctgtaaccattcttcagcagggcttaacagtttatcaagcatagcaggaccaagagggtcagttggatatattgcaccagaatatgggatgggttgccaaatatcaactgcaggcgatgtctatagctacggagttattctgctagaaatgctcacaggaaagcatccaactgatgacatgttcaaggatgggctaaacattcacaaattagtggactgtgcatatccacataatgttgttgagattttggaggccagtatcattccatggtatacacatgaaggaaggaaccatgatttagataatgacgttgatgaaatgagcataatgaagagatgtatcacacagatgctgaaaattggtctagaatgctctttggagtcacctggagatcgtccattaatccaagatgtttatgctgaaatcaccaaaatcaaagaaacattttcagcattggacagttga

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 1.998485 1.195034

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0628000 SBH 0.072616 0.552695 0.699903
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g40840 RBH 0.635079 0.583366 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0628000 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0020820 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0020840 RBH 0.000000 1.182089 0.537312
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0020650 RBH 0.000000 0.000000 0.189930
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0020180 RBH 0.070491 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0020740 SBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0366300 RBH 0.229073 2.623287 0.4163425
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0021190 RBH 0.000000 0.000000 0.069075
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0385600 RBH 0.8535745 2.3089455 0.7634285
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0020980 RBH 0.000000 0.064609 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0021140 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0020840 RBH 0.0 1.802488 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0020430 RBH 0.053605 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0020560 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G020500 RBH 0.044975 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0020910 RBH 0.0 3.386914 0.0
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