Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsPr106_08g0020970 | OGI:08071080 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr08:26170424-26194011 | ||||||||
Gene Symbol | RLCK254, OsRLCK254, WAK73, OsWAK73 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Wall-associated receptor kinase 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMN8] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_08g0020970 | OsPr106_08g0020970.01 | Chr08 | 26170424 | 26194011 | - | NAM | ||
CDS seq | atggcggcggagctagtgggtgaaggagacggtggacgacgccggcggtcaggggtagaggccgccggatccaacggttggcggtgcggtggaggaggctgccgctggatcgggcaagcggcggtggggtggcggaggaggaggcgactggtggtcgggggagaggcgccagatctgcgtcccccaaacgtgttgaggctggcggtcgttaggcaggagaggcggcggcggctggcgatcgggacacggaggaggaagtggccgacgcagcagctgcaggcgggagcagcagcagcagcagctgcaggcgggatcagcatcgagtacccgttctgcgtggagcctggctgctaccacccaggcttcaacctcacctgcaaccactcctacagcccgcccaggctattcctcggcgacggcacggtgcaggtgctcgagatcgccatcccccaagccaccgtgcgcatcaacagcggccgcatggtgttcaattctactggcaatcatgccgtcaacagatcattattggatcaggtgggaaggccgtacttcgtggcagcttcaaacaggatagctttgctaagctgcaacgcccgggttgacgtccgcgcggctgggagaaacaacaacaaaactagtactaagttgctcagttcctgcactgccatctgcccaacagacgatggaggtggtgctaccactatcctcgatattggtccagagggtccatgctcagggattggctgctgtgaaacaagcatgctactagcaggaagctcgactgctgcctacagcatccaggtccagaacttgcaggagcaggccgtcgtgctaaatcgaacggatgatctggtgtacttggtagatgagagatttaactataccttggacatgtctttcggctacagcagtcctgaagagctcccagcacggctagactggtacataaatagttcatcagcgtgtccgttgcccgcgtccgcccccgaatgtcgcagcgcgcacagctattgcgacagtacttacgacaacaaggcgtacatctgccgctgctccgaaggttacgaaggaaatccctacgttcctgatggatgccatgatacggatgaatgcagttctggatactgcagttacggcgagtgcaggaacacaccaggatcgttcatttgcaactgccctcgtggctacgagggcaatccatcgccaaaagatggatgcaaagcacgagatttaggtctacgcatcgggcttggggttggtggtggcacaattcttttgctcctcgcactaagtgctccctttatatcaagcaaaatgaagctgcgcaagatgaaaagaatgaaagagacttttttcaggcaaaaccatggcttgctattaggacgattggtatcacaaaacgcagatattggtcaaaggatgatcatgactttacaagagctagagaaggccacagacaattttgataaatctcgtgaaattggtggtggaggacatggcgtcgtgtataagggaattttagacctgcaagttgttgccattaagaaatcaaggattgtcgtaaaaagagaaatcgatgactttataaatgaagttgcaattctttctcaagtcaatcatagaaacgtggtgaagcttctaggatgttgtcttgagacagaagttccattgttggttTatgagttcatttcaaatggatctctagatcaccatcttcatgttgatggaccaatttcgctaccatgggatgatcgaataaggattgctcttgaagttgctagagccttgacttatctacattcagctactacaataccaatattccatagggatattaaggcatgcaacatacttctcgatgaaaatttaatatcaaagaattgctcactcgaaaaaggcccatgtataggactgatcacggtgaaagtcttgtgttatattttgcctcgcttcatagacaagatgagctacaaagctactagaaatcgaatgccaaagcctgaaggtgagatcaaagcaaccaacctcagagcattcaacagctcatcagtagaaatcccctctggagcagacttcgaattagggaacacaaccaccggcacggtgtcatcatcattaccttgggatgatcgattaaggatagcttttgaagttgttagagctctttcatatctacattcagctgcatcaatgccaatatttcacagagatattaaatattcgaatatacttcttgatgacagcctaacagcaaagttacttactcggaagaaaccaattggtggtacatttgataatggcgatggtcttgtttcacatttcgtctcacttgtctcaaaaggtaacctttatgacataatagattctcaagttagggaagaggaagatggagaagtccaggaagtagcaacactagccgcaacatgtactaaatttaaaggagaagagcggcctacgatgagggaagtagagatgggaaaagagacatttgcgcctttgtttcctcgtaccgctactaaaatcaagagctgcaccaccagctgcggtaacatcagcatcgagtacccgttcggggtggagcccggctgctaccacacagtcggcttcaacctcacctgcgaccactcataccacccgcccaggctgttcctcggtgatggcacggtgcaggtgctcgacatctccatccccaatggaaccgtgcgcatcaacagcggccgaatcaatctggagtacgatggccgtggaagcgcaaacgggacatggggcggtggcctcccagatggcgggccgttcttcctgtcgaagtcggggagtagcctagtgttgatgggccacgatagccaggtcgacgtctgggggctgggaggggacaacccgatcgcctcctgcagtgtcatctgcccaaggatcccatcagcaattttcgggataagtgcgtgctcgggcatttgttgttgtcaaacaaacatcattttaggctactcatcctatctcatccagattcacggtgatgcaaactttttaaatatctacatggtggaccagggattcaactataccaatttcattaattccaatgtcgatctcattatttttgattccgacagagatccgcaagcactcccagccttgctggaatgggtaatcagtaattcgacaagttattgtcctagaaattcatctgcccccgagtgtcgcagtgcccatagctcttgccaagacactgatgcttgggcaaacaacgggtatcggtgcaagtactcttatggttatcaaggcaatccatacatcattgatggatgcaaagggctaagcatagctctaatagtttctggtggatcaattgttcttattctggtacttgctactcccctagtagcacgtgtggtcaagcaacgcagggagaaaaaactgaaagaaaagttctttaagcaaaatcatggattgctactgcagcagttaatatcaagaaacacagattttggtgagcgaatgataattaccttagaggagctccaaaaggccacaaacaattttgatagatcttgccaagtcggagatggagggcatggagtcgtgttcaaggggattctagacctgaatgttgtggccataaaaaaatcaaagattatagttcaaagagaaatagcttcttcaatgccaatttatcatagagatattaagtcctccaatatacttcttgatgatagtttaacagcgaaggtatcagattttggggcttcaaagtacaccccgatagatcgatctgaaataactacaactgttcaaggaacaattggctacttagatcccatgtactattatattggtcgactaactgacaagagcgatgtttttagttttggagttcttcttgtggagttgcttactcgaaagaaacctgttgttgacacgttcgatggtgatggccttgtttcacattttattttgctgctctcagaaggaaaccttattaacataatagatcctcaagtcaaggaggagGaAGAtggagaagtccatgaagtagctgcactgtgtactaaattgaaaggaggagaacggccttcaatgagagaagtagagatggcactggaaaacatattatcaaaaaagggccccttccataagggaaatagggaatcaagtagacccagtaaaaatcaaatttcagcactatacatgtcaattgaaggagttgccacagaagcaagtagtcaatccatggaagaggaaatgctatcgtttcctcgataa
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.000000 | 1.175692 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_08g0501088 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os08g39170 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.000000 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os08g0501088 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_08g0021100 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_08g0021000 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_08g0020890 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_08g0021100 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0014530 | SBH | 0.627824 | 0.0 | 0.000000 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_08G0394800 | RBH | 0.069682 | 0.5907 | 0.7766015 |
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LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_08g0021160 | RBH | 0.0 | 0.056039 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_08g0020510 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_08G020660 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.367741 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_08g0020830 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.706948 |