Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_08g0006090 OGI:08014790 | 3/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr08:5621393-5637157
Gene Symbol OsFBX270, OsKIX_5, OsFbox419, Os_F0547, OsEnS-118, OsFbox420, Os_F0206, Os_F0199, OsFbox421, Os_F0249
DNA seq

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Function Putative F-box protein At5g38390 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FF23]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_08g0006090 OsPr106_08g0006090.01 Chr08 5621393 5637157 + NAM
CDS seq

atggacgagttagggatcatcgagcaaggagtcgactggaggactcgccttggccaagacattcgcgattgcatgataaatgatatattgttcagcctgcaaacgaaattgcaaagtacttctacaacattgattgatctccagaaggttgctgccagaatagaggagaggatccatacgatagctagtgactatggtgattatctacggaggatttgtctgacgagaggtgatttggactcatatgatgtattgttgaacgattgtcaacgtcagcaagcttcaatccgttcatccatcttgctccatcaggagaataagcaaggtgatcaaattgtccaggcaaaaagaaatactatggggacatcatctagcagtgtgctatctaatcaagtagccctaaatgaccacaaggagcactcacacccctacgaaaaagatatgatcagcaaactccctaacgatttggtccaacatattatgtcattcttgtcaatgcgagaggctgtgcgcaccagtgttttgtcccattggtgggtcaaccagtggaccttcttgaagtccattcagcttaatatatattggtttcatatggacagagaaaaattcagtagttttcttgacaaactattgctaagccgtgtccaagctgatgctcccatggacacattcgagctaaaatcttttgcaattgaccgcgccaattgttggattaatcatgcaatcaagcacaatgctaaagtgcttaaatttgctgaatatggaaaatgggaacctttctacttggatccaaatcttgtggagttaagttctcggtatctagaaactttggagctgactaatgttgctctagatgcgacgatattcagtcagttggccaattcatgcccagcattgcaaaatatgctgctgacagactgcttactggaggtagaagaaatttcatcaagctcattgaagaatctggatataattgactgctatattctcaaggacctgagcatttgtactcctagtttggtttcattgtgcatcaagaatgaacgaacagacaattcttcgttcagAaactcttacctaatattcgcaacggtcattatcattgatgcttcaagtgtcagtagcatggagttgttagctatggatagacagctggattggaagtcccatctcacgaaggaacatcaggagatgctgatcagcattcgtgatcgtcgtggcctgattctttatatcgattgctccacaacctccacctctttcaccgacaagctgaccagcaagttccgcggattttgtcgtgctgacttcctccgcctcgacaaggccgtatcaaccagctaccgcactccacgggtgcccttcgatgggatggcgataggaggcaacctgttcgacggaatgcagcagggagcggcggggcaggctgggccgtcgggtggcggtggaggcggtggcggtggcgcggaccgcctcagcgcgctccccgacgcggtgctcttccggatcgtgtcgcacctgggggcgcggcaggcggtgcgcacgagcgtgctctccaagcggtggcgccacgtgtgggcgtccgcgccgcgcgtcgacgtccgccacccctgcgcctgcgacgagcgcgccgaccaggagaggttccacggcttcgtcaccaccatgctcctcaggcgccgcccgttcgcccccatcaaggcgctccggctgtgctggagccacgacggcgacgccaacaactggatcgctcatgctgtcaggcgtggggccgaagaaatcgatttctccgcgaggcatcaccaagatgatccgaaaccggagctagagtacacgagcttcatttctcacaagatcaagatcttgaagctgacgcgtgtccggatgggcatcaagtttatcacgcagatctgctataggtgcacttttttggaagaattagagctcaagaatgttaacccacttgaagggcagattcaatcgacctcgctgaagcgcttgtctatcatcaactgctttatctctgatggatttttggttgatgctccgaaccttatctcgctctgcttcttcagacctctcagcggtaagagcacggagggagccaatcactcgtctgataataggagttggccattctcagcgtcagtgtgggagtttgatgacgatggatctgatcatgatgatgatttctttgcaattgctagtggtggtgaacactttgatgataagagagacaatgaatctgatcaagacaatggctctagtgatgaagactcagatgataagagagaccatgaatctgatcatgatgatgatgttccctcttccccatattctgattctaaggactcctgtgatggcaatgacagtgaatgcgagtcttatgagtccggtgataaggagggtgatgatcttgaagattgctacagcaatgatatgttggaaaacttgatcaaggtagctaagggcttgacagcttatcatggagaggtgcttctgaggaggcaattggaaaatttccccatgttcaataacctgaaaactctgtcccttggtgaatggtgtatggttcctgacttcagtgctttgtcaaccatacttaagaaatcacctaaggtagaaaggctttatcttcaccttgacatgatccacagaggaagaggggacatcgatccaagtggaggatcatttgcttgcaacaacctgaagaaggttaagatcacatgttgtaaagatgatgaaatggtccatatgctgaaacaattcctccaacgcaacctgttcgacggaatgcatcagggagcggcgcggcaggcggggccgtccggcggtggcggtggcggtggcgcggaccgcctgagcgcgctcccggacgcggctctcttccggatcgtgtcgcacctgacggcgcggcaggcggtgcgcacgagcgtgctctccaagcggtggcgccacgtgtgggcttccgcgccgcgcgtcgacatccgccacccctgcgcctgcgacgagcgcgccgaccaggagagattcggcgacttcgtcaccaccatgctcctcaaccgccgcccatttgcgcccatcaaggcgctccggctgtggtggagccacgacggcgacgccgagacgtggatcgctcatgctgtcaggcgtggggccgaagaaatcgatttctccgcgaggcatcaccaagatgatccgaagccggagctagagtacacaagcttcatttctcccaagatcaagatcttgaagctgacgactttcgggatggacatcaaggccatcacgcatatctgttctaggtgcacttctctggaagagttagagctcaaggattttcgacgacttgatggacagattcgatcggcctcgctgaagcggttgtctatcatcaactgctttatctctgttgcctttctggttgatgctccgaaccttatctcgctctgcttcatcagacctctcagctttgagagaaccaaggaatccatttgctcgtctgataatcgtaggtggccagccccagtatggaaggatgacaacgatggatttgatcatgatgatatctttgcaattgctagtggcgaacactttgatgataagagagagaatgaatctgatcaagactatggttttggtgatggctctgatgataacatagccagtgaatctgatcatgatgatgatggtcccccttccccatattctgtttcctacgatggtgacaatgaatgcgagtcttatgagccccgtgataaggaggagtctgatcgtacagtggCctatggtgagattgcagatgagtactccagtaatggtgatcccagtgatgaatatcggggaaattatgtgagccatgattctgcgaattacggtagagctaataagtttggaaatttgaaattcccagtgaagtcaattgtggatgcgtcagctcatgaaggagagctgcttctgaggaggctattggaaaatttccccatgttcaataacctggatactctgtcccttggtgaatggtgtatggttcctgacttcagtgctttgtcaaccatacttacgaaatcacctaatgcaaaaaggctttatcttcacctcgacgtgattcacagaagaagaaggagcatcgatcccagtggaggatcattttcttgcaacaacctggagaaggttaagatcacatgttgtaaagatgatgtaatggtccatatgctggctcaattcctccaagataacggtgtatcgcctgagaagatttttgttcgtcgcacttccagcccacataatggcaaggaaggcagaggcagtaactccagtgcgaaacggaaggcgcaaggcgaagttgcgaggctagcagtgaaacagaggagggcgcgaaacagtagaagcccggagtga

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_08g0006090 OsPr106_08g0006090.02 Chr08 5629448 5632904 + IsoSeq
CDS seq

cttcgaagcaggcccgccctcgattcgccaaaaaagcaagtccccaatctctccgtgagttctcttctcccacctcgatcgcctgctccggcaacctgttcgacggaatgcagcagggagcggcggggcaggctgggccgtcgggtggcggtggaggcggtggcggtggcgcggaccgcctcagcgcgctccccgacgcggtgctcttccggatcgtgtcgcacctgggggcgcggcaggcggtgcgcacgagcgtgctctccaagcggtggcgccacgtgtgggcgtccgcgccgcgcgtcgacgtccgccacccctgcgcctgcgacgagcgcgccgaccaggagaggttccacggcttcgtcaccaccatgctcctcaggcgccgcccgttcgcccccatcaaggcgctccggctgtgctggagccacgacggcgacgccaacaactggatcgctcatgctgtcaggcgtggggccgaagaaatcgatttctccgcgaggcatcaccaagatgatccgaaaccgg

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Protein seq

LRSRPALDSPKKQVPNLSVSSLLPPRSPAPATCSTECSRERRGRLGRRVAVEAVAVARTASARSPTRCSSGSCRTWGRGRRCARACSPSGGATCGRPRRASTSATPAPATSAPTRRGSTASSPPCSSGAARSPPSRRSGCAGATTATPTTGSLMLSGVGPKKSISPRGITKMIRNR

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.718941 1.735899

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_08g0197050 RBH 0.0 0.0 0.369713
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g09710 RBH 0.000000 0.0 0.645889
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os08g0197050 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0006250 SBH 0.040147 0.000000 0.134026
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0006230 RBH 0.137691 0.280193 0.512362
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0006310 SBH 0.0 0.469582 0.169964
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0006270 RBH 0.000000 0.012700 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_08g0006100 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_08G0085700 RBH 0.431686 0.41799 1.558346
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0005930 SBH 0.000000 0.033896 0.045819
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_08G0088800 SBH 0.231635 0.34843 2.241141
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_08g0005930 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0006020 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0005890 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_08g0006150 RBH 0.0 0.000000 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_08g0005980 SBH 0.047904 1.130805 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_08G005970 SBH 0.0 0.0 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0005860 SBH 0.0 0.900052 0.0
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