Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsPr106_07g0025860 | OGI:07060020 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr07:28320776-28342305 | ||||||||
Gene Symbol | BLE2, OsBLE2 | ||||||||||
DNA seq | atgggagacatcaccggcggcggcggagagcttcgagtccagatagcagccaactccggcgggcaaggtggcaaggtcgtcggcgccgccgcgccggagaagtgtctgaatcgcttcgtccgcatggtggcgctgatggagaggacgggcaacgcgctcggcacgctggccttcaactgggctgccatcatcctgctcggcggctacccctcggtgctccgacccgataaagatttcctttatgcgaccaccataatcttcgtagaagctgcaaggtacgcaacactacgtttcgtctcatctctctatacaacacaacagaaatacagaacatgcgtagaatcagactttactcgtgcttcTtttttctgtatgcttacagttgtagctagcaaccctcttggtagtacagatggtttacaaaaccaaaccggtctttttgagaaaacagggagccccatcggttggtctaataagccgatacaaaagttaaaatttaaatttttaaacttgattttgaagttgattttaaaatatttttaacataacttttttagttttgaatttcgaatcgctacgaaaaatatataaaagttttgctcataaattaatttttatttcctaataagccaaaaatataggcaaccgatgaggctttgggactttccgggctggctagctccagaccacaacccgcttggttttccagttaagttcaaaagttgattcaaactggatttttaaaaagttataaaattttgacagattttaccgggagtcaacagttttagtgAaaactgaaaaaatcgcgctggtttgggttttatgagtgattcagtttttTTAttatgcatcttagttatacagtagtcgatagtggttttagataattatattattttgatgtaattgttgataagtttcgtttatccttaaaaaaagtatcatggtggcagtgagaaaacaatctatatagtaaaaatatagaaattgttttactaggtggatcacaaattttctttaaggacttcaaaatgttgaagtgattgttcctctctataactcttaaacatatcataataatataaatttggacaagatatatatgccacatcatactaaattaacatattatgagacaggggagtataagttgtatctcgtcagaatgcggtacgtagcctcactccctatttatatggccacatacgatgcggtatgtagcctcacttcctgtttatatggccacatacggtagtcttcccacgtagtagtagtggaatcacatcattgcgcttatacttatgtttatttgcaataaaaaataaTttatgagcacgacttttatatacatatccttagtgattcaaaagcaaatgttgtaaaataacgatAaaaaaactaaaaaatcaacttcaaaatgaagttttaaaatttaaatttccttataaaacgataagcgaaaagatgggatgtagccatagtatttgtatcggaatcctggtagtactctaatgctgattggcttaggattagatcatcacTTTttttttgtgtgttaatcgcactagcatatatCatacaggatgttcagccgcaacaacagactcgattaccagttgttcttccgcacgagaggtgctttcaacccttctgctggctggaatgaattgatcgtggttgcgtgcatatccaatgctctgctctgcacggcttattggggcgatattatgatattaacagacccgttttggtatgttatggtgatattactactagctattatccaatttttacgttcagcagcttcaaaactgctcacatggaatccaatgcgacgtgctatatcattattgagccccatggttgcaatcctactgctaggtccctttctactaggattctatattaattccgaccagtcaaagaagaaaatggctaaatggatggtagcgtacgtagtgctgcttgtattgatgctcctgctgacgatcagcaggctccagttcccaagtataatcaaactactaaatggtactcttggcagcaaacaagaattttggtgtcaatttactctgaagttgtgcataattgcttcgatcataatgcctgtgcttattgtgcctggtacaaacaatcgatatgttgtcatcatactggaagcgcttgctttagtgttagtattatttggcaacttacagattccagcagcgactgtccgtgtcgctcttgcactgttgcgccttgtaccacaggattacaacagtgagaacaagaatgacaaaaaggaagacccctctaggacaaatctagctgaatctcttaacatcttctatgggatggtgcttggccaaggtattctctacattgcagcctgtatctttgaggtcttctcatttatccctcggagatctctaatccgccatggtggatttggaggtcagtggggggtagcatctatcaatttgtattacgcatacgccttcgagaaatacatggaaggaggtgtacttgctccaaagaagatcagtctcatcacctttgcaatggattccctcaactcagactcacccaagatgcagctctatagcgtccagatgctgcatatctttctgcaaagggAACCaaccaaggaacggctcatagcaaagctcatcacctctaccaagaccatggccaggttaatcagcatgttgggttggactggcagaaatgaccacacaactatcaggctgtatgctgccaaggtctctgccgagcttgcaaagagcctccgagttgtaactatccctgagacattgcagcttgcatctacgcttctggatactgatggaaagccaaaaagaggacacccacttctggatgtagatgatggtcgagatcctgttgttgatacagcagaaagacaagagaacagacaagatgcaattggtgatcaagggcaaagacaagggtcaattggggacactgatagcctgctggaaacaccaacacgatcgatgcagatcaacgaccaaagatacatacctagtatttggcagaaaatactaggctactggtcaattcccaaggagaagccattgacagacGATgatcttctccctgcactaggcatgtcaatcatttatagccttgctggttgtgatcaaaataactgtgtggaaatcgtcaaagtaactgacctgatcccaaaaatcattggattcacaagcttcagaagtgcaacattaaattccgaagcacaacagaaggttctcttaaagtcatcactgcaggtgctgcagaggcttacaagcattgaaggggaaatcggcataacactgcggtacaagatatcaaaacatcccttcctgttgagaaaccttgcagagatcttggaagacgacaacaacaatcaagaactaaggaagctcgtggcaggaatcctcagaaaccttgccattgacacagaaacaaggcaggagattggacaaatgcaagtgctcattaccaggctggtcaaagcattcctcgataccaatggaccatctagttcaaatgttgattgcttgctgccaaaagtcgctgggcaagcactggtaatgctgtcattagaaaattcacataactgcttcgctatattgaaggaaccagagttcattaataaactaaaaaatatgatactaatccatgatgataaatacatatatgtggcagcgagcctgatgcgtaatatgtgcctgcatgctcaacccgagctcacagaattagacctaaaggaactatctcacaccttgcgagaggtgagctctgctaatccatactacaagtgcaatatagaggtgtatagcatgttgtaacatttgtgcatttgctgtatattagtttttgcaaagttttgtcatttaccagcaaactatatgagtataactatagtttgtacaactatgtttgtcatgctacatgacattgttggttccactacaggtgctggaaagaataatggacgctgaaggggcagaactagaaatcctcattggccttagttcacagatatgcaaactcattcctgaagaatttgcccaagagctggagcatggacagattaagcgaagattcattaagaggctagtaaatgcactgaatgcaaacatgaaaccaagtacttactgtcctgggattaggagggcgatacttgagcaatccatatacatgatggagtgcaattctcgctatgccgattgtttcaatgaataccggatgatggatgcactgtcgatggtagaaaaaacaccctcaagggctgagaggtacatggttttcttgggtgaagcaggcttcatggaatgcagcacacctctatttgctctagtggacagggcaaaagaactgatgggtcgtcagtggttgcattacatcaacagtgcgaactgaaaaaaaatgtaagatgattttgcatttacattcagaagaccatgcatattgttagtacagggtaaaaaagtgattgtgcatatgacatttctagaaagaacatggattttcctttgagatgagcaaaggctatttgtatatgtacctcattagacatgcaccgtaatctatttgctattgccaattatcatttgttatggacaatgcttaattgaTtaaagatgcttgacgtaattgcaattcctacgcgacatactagcgtgttccagttttggcatcgattattttcgtaaaatttgttgtttatttgacgcctgaaaaatgagtttcctgCcctagtaattagcccaattcaacactatggctgaggaattcagaccatgacaatgcgcaacttatggaaacaatgttcctctctcttgttttttgcacagagagAaaaaatgctaattaatgggagctcaactgttatgcaagtctcatgcccatgtcaatgcattatgcatgccatgcttcctgaTttttgttaggcacatgattctcaaattcacacgcacgtcccttgtattgagaccacaactgcggactatggtgcattgagtttctgcaactcacattgcgattaaccagtaataaactactccctccgtcctataatatagcaaactaggatgggacccatcctacgataatgtatctggacatggcaatgtatctggacatgagacatgtccagatacattgtcctggttgctatattctgggacagagggagtagtaattgaagaatactcccaactcccaagtttccacatccctaatcttctctcttctttctaacataagtataaccatgactagaactgaatcgaatcaccaaagcaacggaaagaaaaggctaatccgtttgagtttccttgccaagcgaagaggaccctagaagggattcggAAaaaaaaaataagggggagacagatcacccgttgaggaatggcctagagggtttcctctccctttaggtctctagctatgaacaagaatttgccttgcagcgacaacagatgtgtatacaactgtctacttcttatgttcaaaaatcaacaaatttcaggtgatttctactctaggtctctagttacctgcctcaaagcggcatcacacagttctggtgcgaattggtatagtaaaacaatacccgacacctcattgtcacccacggtcattgtaattggctacaaaacacttaaaaaccagtactaaatcccaagatcccagcgaggaaattaaagtcgagtagaagcactaagttgcaaaccctagacgtgggcagccaagcctctaccagtggtgccgcaggccggcgctccgaggacttccagggtgggcaagtccagcggcggagcaaggaacgcgggaagagatgggaggcgagaaggtaaatgggtaatggtaccttctggctgctgcactgcactccaggggggtaggGGGAgggAGGGGGGGTGAGGCCGAGCTGCTCGTCGCCCTGCTCCGAAGCGGCTCCTTCGCGcgcggtcgccgccggccggtttccggcctctgcccgccgccgttggggacggggcgccacgacaaccctacccgcctcattttctcctctcttctcccgcagttttcgcacggccacatcagcccagcccatgcggcccatttgacggtccaaatgatagcccacacggcccaagccacgcagcgccgtgcgcgatgtcgtcccctcgggcccaattgggagagcatgccgtcgacacttcgacagtaccctaaatatattcgtgaatgcatttatttatgtgattcatatatgtgtacaaatttatatgaatattctagatgagagagttgaagaaaccaaaacattttataatatagaacggagaaaatatgttattgtagttgatctatggttgctagagaacggacaacataacatgaactaacatcaacacaaaatataaaaatgatggtgaaacttagtggcttttgcacttgtccatgtgtctatggagatcaggccgccggactaggtcatcaagaccattgataagaagcgtcgcgtcttcttgtggtagggtatggactcggtccaggacggacggtgtctcatctcttggaggaatgtttgtcgtcccagagcgtacgacgggttgggaatctttgacctgaggacagcggggtgcgctcttcgtctttgctggctctggcttcagcgctcagaccacacttattgggctaacctgaaggctCccatagagtggagcgtctccaacatgtttgcgtgtatccacctttttcttgccaggtgacagcacgtcaactcttttctggatggacctgtggattgagggccattctgtggcctccttagcaacaaaccttctcctcgcagtgccgccgcgtctttgggcatcacgctcgatagcttctaccctcgctgacaactcctagttgacagacatccgagacgccctcactatccctgtcatctcctagttcttggttgtgtgggatgtgatgcttcctgtccagctctctccggctcgacgaattagctcgtctggtgttggacaagtgaccaacgttactcggtcagctcggcctaccaggccttcttccttgttcaatagatttttgcttgcgctgatctactttggtaggtcaaaggtcctgctaaatgcaaactctttctctggcttgcattccaacaatgtttttggacgaccaatctactacaaaagcgtggaattaatagtcactcggcttgtcctttttgcacccaaaagcttgagacgatgaaccacatcctaattgactgtgtgtttgctcgccaggttttgcaccatgtcctctccccacctggttggcctgaccttgccccctcccgcggctgctctcttcaagtttggtgaccaaTttctcgagctcacctaccggagcatctacgcaagagctttaactccttagtcctcttgatcgcctagcagttgtggaaagagcggaacgctagggtgtttgattactctattctgtcggtctcgatggtcctagagtccattctttaggaaggttgtacgtggtctgctgatggtgccgtgggttttggggggcttgttgggagattagggcggtccgttgtttcctccctccttaaaggagcagctcttcgctagcagtttttttCcccctttttttcctttttctttgtactttttttccctttcccactgataatggccttctggccggtctgctaaatcttgcttctttctaatataatgatgtgtaaTatttctaatataaaaattcctaaaagtaaaatgcgttcatggcttgaccgtttcgagtggcgacgacaaatggtgagctttggatgaattgctgtagatcgactggacaacatggcaaactattagcacaaaataaacagtagtatgatggtgaaacctgatgacttttgcgcttgttgactgacaaatgatgagacgtgagatcgtcagatcgatgtcgctgtgctgtgaaggaagagcaggaagtggctttcacatgctagacgcagccatttttcggcttagaaaaaagtcgaatagtccaaccaattcatttcagataattcgaaactggttcaatagtccaaccaaaacttcctgccattttgtgattatgtgaaggcagcgatggatcgatcgaacgagacaattactgagagtgagttgagcagcaactagcgaatttggtttagaaataatattattttaatgaaaaatcactgagggagttgagcagcaagtagtcctcttacggtgtgttcttttctcctAaaaataaaaataaagatgaagttgaagTtttttacgtaaaacgaggtggtattaacatatgattgattgagtattaattattagagtaaatttcactttgggctacctttattaaccaaaattttgtaatggactaggggtaagcctaactttccacttaacaccatctattattactatttttgcactttggactagggttcaaaatttgggccttcatccctttttcagatgagcactgtgctgagtttttcttttgaaactgggcatcacacaggtaaaaagatcgtagggcagcaaccaaaaacacaaaagtgcaatgaattgttcttgcagttgggtgtttcagaaaagtctgaggtcaaaaaagagagaataatttggtattttggtattcagtgacacgggctttggttgtggtgagtctcacaagtcgaccgctgtgacttatgccaacaaaaatgcaaactttgtagcacaatctacgttcattcttagaccaaagccatggtagctcaaagttctctaaccctggtccaaagtgcaacagatggtaaacatatgtggtgttaaatgaaaaaatggacttgtccctaatccattatggaactttagtaaataaaggtagcctaatgtgaaatttactcttattattataaacttgAaaaatagattaatatgatattttagagcaaTTtttatatagaaagttttcgcacgaaactcaccgtttagcagtttaaaaagcgtgccacaaaaaTCttaatcttcatccaactcaatcatcagctgctcctcccgacgttctctaatacttgtcgccgaacactaattaaaagttttaaaccaaaccTttgacaacaaaactgccggttaatggtgactggtactctggaatgtagcggtttatctgaatcgaccaatcaaattcataataccccatacctaactgaatcacggaaagagacgacacttatatcatacaatatacatatataggctatgtttagtttttgaaatgggggagaagtttgagaaaagttgttagtttagaaaaaaagttgagagttaatgtgagtaggaaagttttggatgtgatgtgatgtgatggaaagttaggagtttaggggaagtttgatgtaaactaaacagagccatagtcgatctatgctgactattcattccagtggactcgtcggccgacatgctgctagctgataacattgcagacggcacttcagctccagttactatataggagtatcggcttgcttgggttggttttgtgtacgaagctcgatcgggttagcaagttagattgaATGatgatggccgacggcgccgagcaccggatacagatgccagacgccgccgctacctcgaaggcggccgccgcgccggagaagtggctgaattacttcgtccgcttgctggcggtgatcgagagcgtgggcaacgccttcggcacgctggccttcacctgggctacagtcgtcctcctcggcggctaccccaccgtgctcggctcgcacgacgatttttggttcgccacagccatcgtcttcctagaagccgtcaggtatatctgcaactgcgaaactactggccatgaattcgtgtatatctgcaactttcaacagttttgttttttttgtgtgtgtggaaatctttcagatataactataactagtatggtggcccgcataaattacacggctagcatcgttatattttttctcatataatagcttaaatattattatacttttatatttaaactattatatgattaaatattaaagtatgataatataaaaaaaatcaagtttaaaaatagcaacacaattttgaattttttatcgtattgatagctattaattattttctaatttcgaattttacttatttctaaattgtattcctatatggactttagactattctcctaatcttgcttattttttaaaatttgaattttatttatttataaattgtatttctaaattctacttctaaTtttttaaatttttcagttagttctaaattactatatgaaccatatattcttcttccaatattcttatttttaattctaaatttctgttattataaattatattcctatatggactctaagttttttctaatatttattatttttaattccaaaataaatTAtattcatatatggactctagactcttctgccaatatttcttatcttttaattttaaaattttagttatttctaaattgtatttctatatagactctaaactctacttttttttcttaatttcgactttcaatttgttctaaattcgtatatggatcgtatactcttctttcaatattcctatttttttaattccgaatttccattgTttctatctgtatttctatatagattctaaactcatcttttaatattctttatttttatattccgtatgggctatagaatcttcttccaataTttctttttttattccaattttagttattttaaaattatatttctatagggactctgacttctacttttagttttcttatgttttaattcaaaATttcaattagctctaaattgtatacttatatgaactctagTCtcctcttactatatttcatatttttaattccgatttttttatttttaaattgtatttctacatgaattctacttttcttttttcccgattaatgtgaaaatttttagaccgtgagagcgaacgtggaggttcctttttctattcctttaataagttaatagataacatatgacataattgtagtgtaatttgcagtatagcctcccattttctttaattaatatacaccggatgtacgtgtacctcaggatgttcagcagccgcaacaatagatccgattaccaattgttcttccggacaagaggtgctttcagattccttggcggcaaaggactgatcgtgctcatatgcttttgggatgtaatggcaacgctgacgatgactgttgcgaactggaaactcaggctaggtatattagttgcaatcacagtaatgttaatacttgcagctggccagTttttatgtcctcgaggagctcaaagaccacggacctgtaactggccataccgtgcgatctctctatggagtcccgtggttgcaatcctattgctggctttcccaatacttcgatattacaaccggcacatgcacaaaatcattttcagaaactcatttaccgtgtggataccgtacattcttctttctgtgactgtgctcctactgacaatcagccggctgcagttcccaattatagctaacctagtgcacggtgctctgggcagcaagcacgtattctggcgtcagtttattctgaactcatgcatgtttcttgcactagtgatactggttgtcatgtctgatccaggccttcggtctgcgatgatcttcatcgatgtatgtgctgtactcatactgtcatttggcaacttacatattccagcagcgctcgtgcgtgtcgtactcgctttgatacgccttataccacataactattttggtgatggtaacatgacgaatcttggcccatctctgagtatcttctatgggatggtgcttggccaaggaatactttacattgtggatggcatactggaggtcttctcattcatccctcggagatccctcatccgaaatggtggatttgcaggtcagtggggagtagaatctgtcaatctgtactacgtatatgcctttgacaaatacatggaaggaggtctgtttgcttcaaagaggatcagcctcagtaactttgccattgattctctgaattcggacttatccaagaatcagctatacggggtacggatgatgcacacatttctgcaaagtgatctgaccagggcacggttgctggagaaactcaccacttcaacgcaaacgatggccaggttaatcagcatgttggactggagtagtaggcaccattgtacaaCtatcagattatatgctgccaaggtcactgctgagctcgcaaagaacctgcgagttgtaacagtccctggtacattgcagcttgtatctatgcttctggatgctgatggaaagccgaaaagaggacacccactcctggatgcagatgatgatcattttgttgatatattagatagacaagataaaaaacatgatatagctggtgaccaagagccgattgaggacaccgataacctgctggaaacaccaacccgatcaatgcacatcaatgaccaaagatgcatacctagaatttggcagaggatattggcgtactggtcgattcccaaggagcagccattgacagacgatgatttcctCcctgcacttggcatgtcaatcatttatagccttgctggttgtgatcaaaataactgcgtggaaatcgacaaagtaacttacctgatccccaaaatcattggattcacaagctacagaagtgcaatggtaaattctgaagcacaacaaaaggttctcttaaagtcatcactgaaggtgctgcagagactcacaagcattgaaggggaaattggcataacactgcgctacaagatatcaaaacatcccttccTGTtgagaaaccttgcagagatcttgggagacagcagcagtagcaatcaagaactaaggaggatcgtggcaggaatcctcagaaaccttgcaattgacagagACatgaggcaggagattggacgaatgcaaatactcattaccacgctgatgaaggcattcctcgattttaaaggattatatagttcagatgttgattgcttgctgccaaaggtcgccgggcaagcactggtaatgctgtcatcagaaaattcgcataactgctttgttatgttgaaggaaccagacttcattcataaactaaaaaaTatgatcctaatccatgatgataaatacacatatgtggcagcgagtctattgcggaatatgtgcctgcacgctcaacatgagctcacagaatcagacctaaaggaactatctcacaccttgcgagaggtgagccctgctcatacatactacaagtgcaatatagaggtgtatagcatgccatatcatttttgcattcactgtctattaatttgtctttgttttgtcatttttggtaaaaagaaGggggcatttatttaccaatgaagtatataagtataactacagtttgtacaactatatttatcatgctacatgaaattgctggttccactacaggtgttggaaagaacaatggacgctgaaggggcagaactagaaatcctcattggccttagttcacagatatgcaaacttattcctgaagaattttcccaagagctagagcatggacagattaagcggagattcattaagaggctagtggacacactgaatgcaaatatgaacccaacttctcaatgccctgggatcaggagggtggtacttgagcaatccatatacatgatggagtacaattctcgctgtgccaattgtttcaatgaataccagatgatggatgcactgtcgtttgtagaattgacaccctcaagggctgagaattacatggttttcttgggtgacgcaggtttcatggaatgtaacacacctctctctgccctagtggacagggcaaaagaactgatgggtcgtcagtggctgcaaggtatcaacagtgccaactgaaaaaaaTataaaacgattttgcatatatacagtcagaagaccttgcatattgttagtgcagggtagacaaagtgattctgcatttactgtcagaagacaacgcatgttgctagaaagaacatatatttacctttaagatgagcaaagggtattgtatctgtacctcattaatcttgcactgtaatctgtgtgctattgatgatttatccaattagcattagttggagtggccatattgcaactcctatcccacgttctagcgtgTttaagTtttggcaccgcttatttccataaaatatgtggtttgttcgacaccagaaaattgggttttctaacctagtgattaaccccattcaacacaagttactatggctgagaaattcagaccatgacaatgcccaacttatggagtacaatgttccactttcttgttctgtgcacaaagcaacaatgttgattaatgtgagctcgactcTAtttaagtcatggcccatgtcaatgcagtatgatgccaatatcaatgtgccacggtgcctgatttttgtggagcacagggttctcagattcacatatacgtctctcatattgagaccaaaactacggtgcattgaatttcagcaacccgggtaaccactataataataataaactagtaatcgaacaacactccccaagtttccacatccctaagcacaacagtcgattccagcataaccatgatgctctctattttcttcaacgAaaatataaccatgattagaactcaaccgaattaccaaagcaacgagaaatgaaaaaacatcagtttcattgccaagcgaagaggatcctatttgggattcggaaaaaagtgggggaggggagcaaacgttggggaatggcatggatggttccctctccctcgcggcgtcggcttcccctggcccgccgcccagccggcaccgtcgcgacgagctggtcgcctcgcctcgccttgccgcgccgccgcccgtcgccctcgttgttagtcggtggaggcagcccgcaggcagaggcatttgcccggaccgtacgaagtagacagaggtaagtgccaggccatgggccatggctagtgtacatagtagatgggcctaccaggtaattgggctggttccgaacaatggaaatagggactatctaaacttccatacaccacaatttttttttaaaaaaaaaagccttccaaatgtagctatatttgtaatataattctaccataactattctataaatacaatagattacaactttctacataagttatatagatgttacaattagtttattagttacagtgtaattacaatatactccctctatctatttttgatagttatatttctaaatttgaaaattttaTttttgataggcatatttcaatctatcctcttaatgactttctcggatttaatgcgtgactctctattcttctacacaagattggctgcatggatatcgagaaatgtaaatattaatgaatcgcttgtttacgaagaataactagtagcatgtttaaatggatgataagtagaattacttatccttggtctgtgtgccaagatgaaatataactatcaaaagtagatggatggagtatatagttagagtACactatactgcagttacatctaaaagtattttaccgaaaaaacctatggcattttttaagaaattCccacgaaatattagagtgaatgtttggaccagttttaaattgggaatggaaagaaacagatgaaaacttcaacatacaaaaacagatgttttgaggtaaacaatgatatatgatgatctttttccttcatgtgtactcaaattttataattccaactacaagaaaaaagttaacctcttggacaaaaaaaaaccactttacaagaaataataatcgatattatgccatttttgaaatatttcttctgttggtgagctttatctatcttttgccaataatcattttctccatgctcatgcgcacagcgagcttgaacaatagtgcaaaacacaaggactcttcgaatagcatgaatggaaaaacgaaggaataaaaaaaactataattgtaatatgaatgcaagtgtaaaataaatggttgaaaaacacatgaataattgtttgattgaacagcagaaaaacacacaggaatcggatgagagagctcaaagaatttttttcaagaggttggacatattgctaactttcatccaaaatcattacttatttcataggagttttaaaggatattatatgatccaatcccttgtttcaaagggctttatatgaattttttcataggattataatctcaaTttttttatatatttttcctacaaaccaaggggttctctgaggaggcggtgtaccgtggctttgaccttcttgacttcgcatggcctgggttcgatcagtggtggcgcgtcgccgacgttggcataaCccaccatgaCGgagaaagagaacaaggctgggtattttcgttagccgcaaagaaaaacaagacaaaattcattttgattgagaaaaaatggcattgtaacaacttgcccctagttgaaaataaaattttaacgaaaccacttttgagagtgacattccagtgaaaccttattttggcaatggtaaaatgtcaattttctcggactcgattgtcgcggccggcattgagctagctagctgttaattaacgatttaacgttacaggtaacccttcaactccctcccgcgcctctaacttgagaagatacgcaaaacgtggtgagctattagcgcatgattaattgagtattaattattttaaaaataaattaatatgattttttaaagcaacttgcaaaaaaacgtaccgtttagtagtttgggtagcatgcgcacgaagatcgaggtgcTttctctcccaatcaaccagcaacgaacggagctgtacatccatctcttacgtcggcttcctgagttgtcgaaaccgacagaccgatcttgctgcggcactgatacagtgcagtagacgacgacacacttgacacttgcgagctgtggatgtggtttaccgcgtcgatcttctgtttccatacaccgattgattgtgctcttctcgactgggcctacaaatgtcttctctaggcgtcatgtttttggtacatatacaggagtatcggcttagcttgtttgggttgctctacaaatgcgctgaggctagcctgtggttcttgcaggctcgctaattacctagttaattagcatgatggccgccgacggcagcgttgtcgcggagcaccggatacaggtgtcggagtcgggagaagctgatcataaggcggtcgccgcggcgccggagaagtggctgaattacttcgttcgcttgctcgcggggatcgaaagcgcgggcaacgccttgggcacgctggccttcacctggggcaccgtcgtcctgctgggtggctacccgtccaatctcgagggcgattttggttttgcgactgcgatatttttccaagaaaccacgaggtacgtatatatatgcaacgtctcctcgtgggaattgttttaatcgcccaaatgcacgtccacccgtttatttcatatcatctaaatagttatgaaaattttttgaaatgatagttcaatatgtaataatatcttactccacaaacatacaagttaaaattcaattttttaaaatctatctatctattaattaaattaaagcaatagaaaaagatgcatccatgttcgctctcatgatttagaaattcacattaatcggtaaaaagaaaaaactaagaccatataggaatacaatttaaaaatagttgaaattcagaattaaaaataaagaatatagaaagagaagactagagtccataccggtatacaataatactaacggagattcagaattaaaaaataaaaaaattaaaaatagaggttagagtccatatagaaatacaatttagaaataataaaaattcaaaaataaaaaagtaaggtatattggaagaaaatatagagttcatatagaaatacaattgaaaaacaactgaaatttagaattaaaagaaagaaatattgaaatataagtttagagtccatacagaaatacaatttagaaataatagaaattatgaattaaaataaggaatattggaataacaatatagaatccatataggaatttagaattaattaaaataaactttgacgaaaaaacccccaaagtcaactctaaatctaaggttgaaaatttaaattttagctgataagtataagtataagcgaaaagatgagactgcaaagttgttcggtaagatttcgagcgtttcaaacttttaaggtaaaactaacttttgataatcgaataattggctcctatgggcctttttgtttgtatggtatgtatctttcaagggcattgttatggtaccttctactactaggtgcagtagtatatattttcatttgtatataaaatattttctttgaaactttagtaaaatatatttaccaattcatctattttaatatggaatatgatacacgaatttattgcaatgctatatatattatttctaattttacccctatataatttctattacactactaccgggtgtagtacaataaaaacaaatccattgaatccgaagcgattaaaggctcacaatcatttgagggtaccttaaaaatccgtctttcaattcccttctgtttaatgattaaacgatacgtctactttcaggatattcacccgcaacaatatgctggattatcaactgttcttccggacgagaggtgcctttagaccactgggctggaacgggctgatggtaatcgcaggcttctccgtttctatggtgtccacggttgtttggaacgtactctgggcacgtatagcgtttgaaattatggtagtattgtttgcggctggccagtttctatgtgctggagttgtaagactgcgcctacgcatcaacagttggctacgccgtcagatatcgctgtggagccctgtggtttcaattctactgttgggtccctctgatttcagaatctttcttttttctggaatacgcgggcgcgtttcacataccatgtgcatgtggatagtaatagtatatggtgtgctccttggggttgtgctcctagtgactattagcaggctgcagtccccaattataatcaaccgagtacaaggtgctttgggtcgcaaatacatattttggcgcccatttatcctatactcgtgcatgctcgctgcaattgtgctgtcgatgttcatggttgataaattctataggcctgggatcatcggactccagatatatgccttggtcattgtgtcattcggcaacttacagattccagcagcaatcgcgcgtgccgtgctcgcagggctgtgccttcatccaaagggctacgacggccaaggtggcaccacaaatattgtcctatctctaaaaatccactacggaatggtgcttggccaaggaatactttacattgtggccggcatgctggagatcttctcgttcatccctcgaagatCcctcatccgaaatggtggatttacaggtcagtggggagtagaatctgtcaatctgtactacgcatatgcctacgacaaatacatggaaggaggtctgtttgcttcaaagaggatcagcctcagtaactttgccattgattctctgaattcggacctgtccaagaatcagctgtatgggatacggatgacgcatatatttttgaaaagagatctgaccagggcaaggttgctggagaaactcgctagttcaacgcagacgattgccaggttaatcagcatgttggactggagtagtagacatcatcgtgcaactatcaggttatatgccgccaaggtcactgccgagcttgcaaagaacctccgagttgaaactgtccctgggacattgcagcttgtatctatgctcctggatgctgatggaaagccgaaaagaggacacccactcctagttgcagatgatgatgaagatcattttgttgatatattagatagacaagataaaaaacatgatatagctggtgaccaagagccgattgaggacaccgataacctgctggaagcaccaacccgatcaacgcacatcaacgaccaaagatacatacctagaatttggcagaggattctggagtactggtcgattcccaaggaacagccattgacagacgatgatctcctccctgcactaggcatgtcaatcatatatagccttgctggttgtgatcaaaataactgcgtggaaatcgacaaagtaactgacctgatccccaaaatcattggattcacaagcttcagaagtgcaatggtaaattccgaagcccaacggaaggttctcttgaagtcatcgttgaaggtgctgcagaggctcacaagcattgaaggggaaattggcataacattgaggtacaggatatcacaacatcccttcttactgagaaaccttgcagagatcttgggagacagcagcagcagcaatcaagaactaaggaggctcgtggcaggaatcctcagaaaccttgcaattgacagagacacgaggcaggagattggacaaatgaaaatgctgattaccaggctaatgaaggcattcctcgattctaacggatcatttagttcagatgttgaatgcttgctgccaaaggtcgccgggcaagcactggtaatgctgtcatcagaaaatccgcacaactgcttcgttatgttgaaggaaccagatttcgttcataaactaaaaaatatgatcctgatccatgatgacaaatacatatatgtggcagctaatcttttgcgtaatatgtgcctgcacgctcaacatgagctcacagaatcagacctaaaggaattatctcacaccttgcgagaggtgagcctgctaatacatactgcaagtgcaatatagaggtgtgtagcatgccatatcatttgtgcatttgctgtctattaatttttgtcatttttggtaaaaagaaggggcgtttatttaccaatgaactatataagtataacttagtttgtataactatattatcatgctacacgacattgctggttccactacaggtgttggaaagaataatggacgctgaaggggcagaactagaaatcctcattggccttagttcacagatatgcaaactcattcctgaagaattttcccaagagctagagcacgggcagatcaagcgGAgattcaTtaagAggctagtggacgcactgaatgcaaacatgaaaccaaatcctcattgccctgggatccggagggtgatacttgagcaatgcatatacatgatggagtgcaattcttgctatgccaattgtttcaatgaattccgaatgatggatgcagtgtcgatggtcgaagagacaccctcaagggctgagaagtacatgtttttcttgggtgacatgggcttcatggaatgtaacacacctctctctgccctagtggagagggcaaaagaactggtgagtcgccagtggctgcatggcatcaacagtgccaacttgagaaaaaaactgtaa
More
|
||||||||||
CDS seq | atggccgacggcgccgagcaccggatacagatgccagacgccgccgctacctcgaaggcggccgccgcgccggagaagtggctgaattacttcgtccgcttgctggcggtgatcgagagcgtgggcaacgccttcggcacgctggccttcacctgggctacagtcgtcctcctcggcggctaccccaccgtgctcggctcgcacgacgatttttggttcgccacagccatcgtcttcctagaagccgtcagattccttggcggcaaaggactgatcgtgctcatatgcttttgggatgtaatggcaacgctgacgatgactgttgcgaactggaaactcaggctaggtatattagttgcaatcacagtaatgttaatacttgcagctggccagTttttatgtcctcgaggagctcaaagaccacggacctgtaactggccataccgtgcgatctctctatggagtcccgtggttgcaatcctattgctggctttcccaatacttcgatattacaaccggcacatgcacaaaatcattttcagaaactcatttaccgtgtggataccgtacattcttctttctgtgactgtgctcctactgacaatcagccggctgcagttcccaattatagctaacctagtgcacggtgctctgggcagcaagcacgtattctggcgtcagtttattctgaactcatgcatgtttcttgcactagtgatactggttgtcatgtctgatccaggccttcggtctgcgatgatcttcatcgatgtatgtgctgtactcatactgtcatttggcaacttacatattccagcagcgctcgtgcgtgtcgtactcgctttgatacgccttataccacataactattttggtgatggtaacatgacgaatcttggcccatctctgagtatcttctatgggatggtgcttggccaaggaatactttacattgtggatggcatactggaggtcttctcattcatccctcggagatccctcatccgaaatggtggatttgcaggtcagtggggagtagaatctgtcaatctgtactacgtatatgcctttgacaaatacatggaaggaggtctgtttgcttcaaagaggatcagcctcagtaactttgccattgattctctgaattcggacttatccaagaatcagctatacggggtacggatgatgcacacatttctgcaaagtgatctgaccagggcacggttgctggagaaactcaccacttcaacgcaaacgatggccaggttaatcagcatgttggactggagtagtaggcaccattgtacaaCtatcagattatatgctgccaaggtcactgctgagctcgcaaagaacctgcgagttgtaacagtccctggtacattgcagcttgtatctatgcttctggatgctgatggaaagccgaaaagaggacacccactcctggatgcagatgatgatcattttgttgatatattagatagacaagataaaaaacatgatatagctggtgaccaagagccgattgaggacaccgataacctgctggaaacaccaacccgatcaatgcacatcaatgaccaaagatgcatacctagaatttggcagaggatattggcgtactggtcgattcccaaggagcagccattgacagacgatgatttcctCcctgcacttggcatgtcaatcatttatagccttgctggttgtgatcaaaataactgcgtggaaatcgacaaagtaacttacctgatccccaaaatcattggattcacaagctacagaagtgcaatggtaaattctgaagcacaacaaaaggttctcttaaagtcatcactgaaggtgctgcagagactcacaagcattgaaggggaaattggcataacactgcgctacaagatatcaaaacatcccttccTGTtgagaaaccttgcagagatcttgggagacagcagcagtagcaatcaagaactaaggaggatcgtggcaggaatcctcagaaaccttgcaattgacagagACatgaggcaggagattggacgaatgcaaatactcattaccacgctgatgaaggcattcctcgattttaaaggattatatagttcagatgttgattgcttgctgccaaaggtcgccgggcaagcactggaaccagacttcattcataaactaaaaaaTatgatcctaatccatgatgataaatacacatatgtggcagcgagtctattgcggaatatgtgcctgcacgctcaacatgagctcacagaatcagacctaaaggaactatctcacaccttgcgagaggtgttggaaagaacaatggacgctgaaggggcagaactagaaatcctcattggccttagttcacagatatgcaaacttattcctgaagaattttcccaagagctagagcatggacagattaagcggagattcattaagaggctagtggacacactgaatgcaaatatgaacccaacttctcaatgccctgggatcaggagggtggtacttgagcaatccatatacatgatggagtacaattctcgctgtgccaattgtttcaatgaataccagatgatggatgcactgtcgtttgtagaattgacaccctcaagggctgagaattacatggttttcttgggtgacgcaggtttcatggaatgtaacacacctctctctgccctagtggacagggcaaaagaactgatgggtcgtcacatgatggccgccgacggcagcgttgtcgcggagcaccggatacaggtgtcggagtcgggagaagctgatcataaggcggtcgccgcggcgccggagaagtggctgaattacttcgttcgcttgctcgcggggatcgaaagcgcgggcaacgccttgggcacgctggccttcacctggggcaccgtcgtcctgctgggtggctacccgatattcacccgcaacaatatgctggattatcaactgttcttccggacgagaggtgcctttagaccactgggctggaacgggctgatgtttctatgtgctggagttgtaagactgcgcctacgcatcaacagttggctacgccgtcagatatcgctgtggagccctgtggtttcaattctactgttgggtccctctgatttcagaatctttcttttttctggaatacgcgggcgcgtttcacataccatgtgcatgtggatagtaatagtatatggtgtgctccttggggttgtgctcctagtgactattagcaggctgcagtccccaattataatcaaccgagtacaaggtgctttgggtcgcaaatacatattttggcgcccatttatcctatactcgtgcatgctcgctgcaattgtgctgtcgatgttcatggttgataaattctataggcctgggatcatcggactccagatatatgccttggtcattgtgtcattcggcaacttacagattccagcagcaatcgcgcgtgccgtgctcgcagggctgtgccttcatccaaagggctacgacggccaaggtggcaccacaaatattgtcctatctctaaaaatccactacggaatggtgcttggccaaggaatactttacattgtggccggcatgctggagatcttctcgttcatccctcgaagatCcctcatccgaaatggtggatttacaggtcagtggggagtagaatctgtcaatctgtactacgcatatgcctacgacaaatacatggaaggaggtctgtttgcttcaaagaggatcagcctcagtaactttgccattgattctctgaattcggacctgtccaagaatcagctgtatgggatacggatgacgcatatatttttgaaaagagatctgaccagggcaaggttgctggagaaactcgctagttcaacgcagacgattgccaggttaatcagcatgttggactggagtagtagacatcatcgtgcaactatcaggttatatgccgccaaggtcactgccgagcttgcaaagaacctccgagttgaaactgtccctgggacattgcagcttgtatctatgctcctggatgctgatggaaagccgaaaagaggacacccactcctagttgcagatgatgatgaagatcattttgttgatatattagatagacaagataaaaaacatgatatagctggtgaccaagagccgattgaggacaccgataacctgctggaagcaccaacccgatcaacgcacatcaacgaccaaagatacatacctagaatttggcagaggattctggagtactggtcgattcccaaggaacagccattgacagacgatgatctcctccctgcactaggcatgtcaatcatatatagccttgctggttgtgatcaaaataactgcgtggaaatcgacaaagtaactgacctgatccccaaaatcattggattcacaagcttcagaagtgcaatggtaaattccgaagcccaacggaaggttctcttgaagtcatcgttgaaggtgctgcagaggctcacaagcattgaaggggaaattggcataacattgaggtacaggatatcacaacatcccttcttactgagaaaccttgcagagatcttgggagacagcagcagcagcaatcaagaactaaggaggctcgtggcaggaatcctcagaaaccttgcaattgacagagacacgaggcaggagattggacaaatgaaaatgctgattaccaggctaatgaaggcattcctcgattctaacggatcatttagttcagatgttgaatgcttgctgccaaaggtcgccgggcaagcactggtaatgctgtcatcagaaaatccgcacaactgcttcgttatgttgaaggaaccagatttcgttcataaactaaaaaatatgatcctgatccatgatgacaaatacatatatgtggcagctaatcttttgcgtaatatgtgcctgcacgctcaacatgagctcacagaatcagacctaaaggaattatctcacaccttgcgagaggtgttggaaagaataatggacgctgaaggggcagaactagaaatcctcattggccttagttcacagatatgcaaactcattcctgaagaattttcccaagagctagagcacgggcagatcaagcgGAgattcaTtaagAggctagtggacgcactgaatgcaaacatgaaaccaaatcctcattgccctgggatccggagggtgatacttgagcaatgcatatacatgatggagtgcaattcttgctatgccaattgtttcaatgaattccgaatgatggatgcagtgtcgatggtcgaagagacaccctcaagggctgagaagtacatgtttttcttgggtgacatgggcttcatggaatgtaacacacctctctctgccctagtggagagggcaaaagaactggtgagtcgccagtggctgcatggcatcaacagtgccaacttgagaaaaaaactgtaa
More
|
||||||||||
Protein seq | MADGAEHRIQMPDAAATSKAAAAPEKWLNYFVRLLAVIESVGNAFGTLAFTWATVVLLGGYPTVLGSHDDFWFATAIVFLEAVRFLGGKGLIVLICFWDVMATLTMTVANWKLRLGILVAITVMLILAAGQFLCPRGAQRPRTCNWPYRAISLWSPVVAILLLAFPILRYYNRHMHKIIFRNSFTVWIPYILLSVTVLLLTISRLQFPIIANLVHGALGSKHVFWRQFILNSCMFLALVILVVMSDPGLRSAMIFIDVCAVLILSFGNLHIPAALVRVVLALIRLIPHNYFGDGNMTNLGPSLSIFYGMVLGQGILYIVDGILEVFSFIPRRSLIRNGGFAGQWGVESVNLYYVYAFDKYMEGGLFASKRISLSNFAIDSLNSDLSKNQLYGVRMMHTFLQSDLTRARLLEKLTTSTQTMARLISMLDWSSRHHCTTIRLYAAKVTAELAKNLRVVTVPGTLQLVSMLLDADGKPKRGHPLLDADDDHFVDILDRQDKKHDIAGDQEPIEDTDNLLETPTRSMHINDQRCIPRIWQRILAYWSIPKEQPLTDDDFLPALGMSIIYSLAGCDQNNCVEIDKVTYLIPKIIGFTSYRSAMVNSEAQQKVLLKSSLKVLQRLTSIEGEIGITLRYKISKHPFLLRNLAEILGDSSSSNQELRRIVAGILRNLAIDRDMRQEIGRMQILITTLMKAFLDFKGLYSSDVDCLLPKVAGQALEPDFIHKLKNMILIHDDKYTYVAASLLRNMCLHAQHELTESDLKELSHTLREVLERTMDAEGAELEILIGLSSQICKLIPEEFSQELEHGQIKRRFIKRLVDTLNANMNPTSQCPGIRRVVLEQSIYMMEYNSRCANCFNEYQMMDALSFVELTPSRAENYMVFLGDAGFMECNTPLSALVDRAKELMGRHMMAADGSVVAEHRIQVSESGEADHKAVAAAPEKWLNYFVRLLAGIESAGNALGTLAFTWGTVVLLGGYPIFTRNNMLDYQLFFRTRGAFRPLGWNGLMFLCAGVVRLRLRINSWLRRQISLWSPVVSILLLGPSDFRIFLFSGIRGRVSHTMCMWIVIVYGVLLGVVLLVTISRLQSPIIINRVQGALGRKYIFWRPFILYSCMLAAIVLSMFMVDKFYRPGIIGLQIYALVIVSFGNLQIPAAIARAVLAGLCLHPKGYDGQGGTTNIVLSLKIHYGMVLGQGILYIVAGMLEIFSFIPRRSLIRNGGFTGQWGVESVNLYYAYAYDKYMEGGLFASKRISLSNFAIDSLNSDLSKNQLYGIRMTHIFLKRDLTRARLLEKLASSTQTIARLISMLDWSSRHHRATIRLYAAKVTAELAKNLRVETVPGTLQLVSMLLDADGKPKRGHPLLVADDDEDHFVDILDRQDKKHDIAGDQEPIEDTDNLLEAPTRSTHINDQRYIPRIWQRILEYWSIPKEQPLTDDDLLPALGMSIIYSLAGCDQNNCVEIDKVTDLIPKIIGFTSFRSAMVNSEAQRKVLLKSSLKVLQRLTSIEGEIGITLRYRISQHPFLLRNLAEILGDSSSSNQELRRLVAGILRNLAIDRDTRQEIGQMKMLITRLMKAFLDSNGSFSSDVECLLPKVAGQALVMLSSENPHNCFVMLKEPDFVHKLKNMILIHDDKYIYVAANLLRNMCLHAQHELTESDLKELSHTLREVLERIMDAEGAELEILIGLSSQICKLIPEEFSQELEHGQIKRRFIKRLVDALNANMKPNPHCPGIRRVILEQCIYMMECNSCYANCFNEFRMMDAVSMVEETPSRAEKYMFFLGDMGFMECNTPLSALVERAKELVSRQWLHGINSANLRKKL |
||||||||||
Function | - |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_07g0025860 | OsPr106_07g0025860.02 | Chr07 | 28330371 | 28342305 | + | NAM | ||
CDS seq | atggccgacggcgccgagcaccggatacagatgccagacgccgccgctacctcgaaggcggccgccgcgccggagaagtggctgaattacttcgtccgcttgctggcggtgatcgagagcgtgggcaacgccttcggcacgctggccttcacctgggctacagtcgtcctcctcggcggctaccccaccgtgctcggctcgcacgacgatttttggttcgccacagccatcgtcttcctagaagccgtcagattccttggcggcaaaggactgatcgtgctcatatgcttttgggatgtaatggcaacgctgacgatgactgttgcgaactggaaactcaggctaggtatattagttgcaatcacagtaatgttaatacttgcagctggccagTttttatgtcctcgaggagctcaaagaccacggacctgtaactggccataccgtgcgatctctctatggagtcccgtggttgcaatcctattgctggctttcccaatacttcgatattacaaccggcacatgcacaaaatcattttcagaaactcatttaccgtgtggataccgtacattcttctttctgtgactgtgctcctactgacaatcagccggctgcagttcccaattatagctaacctagtgcacggtgctctgggcagcaagcacgtattctggcgtcagtttattctgaactcatgcatgtttcttgcactagtgatactggttgtcatgtctgatccaggccttcggtctgcgatgatcttcatcgatgtatgtgctgtactcatactgtcatttggcaacttacatattccagcagcgctcgtgcgtgtcgtactcgctttgatacgccttataccacataactattttggtgatggtaacatgacgaatcttggcccatctctgagtatcttctatgggatggtgcttggccaaggaatactttacattgtggatggcatactggaggtcttctcattcatccctcggagatccctcatccgaaatggtggatttgcaggtcagtggggagtagaatctgtcaatctgtactacgtatatgcctttgacaaatacatggaaggaggtctgtttgcttcaaagaggatcagcctcagtaactttgccattgattctctgaattcggacttatccaagaatcagctatacggggtacggatgatgcacacatttctgcaaagtgatctgaccagggcacggttgctggagaaactcaccacttcaacgcaaacgatggccaggttaatcagcatgttggactggagtagtaggcaccattgtacaaCtatcagattatatgctgccaaggtcactgctgagctcgcaaagaacctgcgagttgtaacagtccctggtacattgcagcttgtatctatgcttctggatgctgatggaaagccgaaaagaggacacccactcctggatgcagatgatgatcattttgttgatatattagatagacaagataaaaaacatgatatagctggtgaccaagagccgattgaggacaccgataacctgctggaaacaccaacccgatcaatgcacatcaatgaccaaagatgcatacctagaatttggcagaggatattggcgtactggtcgattcccaaggagcagccattgacagacgatgatttcctCcctgcacttggcatgtcaatcatttatagccttgctggttgtgatcaaaataactgcgtggaaatcgacaaagtaacttacctgatccccaaaatcattggattcacaagctacagaagtgcaatggtaaattctgaagcacaacaaaaggttctcttaaagtcatcactgaaggtgctgcagagactcacaagcattgaaggggaaattggcataacactgcgctacaagatatcaaaacatcccttccTGTtgagaaaccttgcagagatcttgggagacagcagcagtagcaatcaagaactaaggaggatcgtggcaggaatcctcagaaaccttgcaattgacagagACatgaggcaggagattggacgaatgcaaatactcattaccacgctgatgaaggcattcctcgattttaaaggattatatagttcagatgttgattgcttgctgccaaaggtcgccgggcaagcactggaaccagacttcattcataaactaaaaaaTatgatcctaatccatgatgataaatacacatatgtggcagcgagtctattgcggaatatgtgcctgcacgctcaacatgagctcacagaatcagacctaaaggaactatctcacaccttgcgagaggtgttggaaagaacaatggacgctgaaggggcagaactagaaatcctcattggccttagttcacagatatgcaaacttattcctgaagaattttcccaagagctagagcatggacagattaagcggagattcattaagaggctagtggacacactgaatgcaaatatgaacccaacttctcaatgccctgggatcaggagggtggtacttgagcaatccatatacatgatggagtacaattctcgctgtgccaattgtttcaatgaataccagatgatggatgcactgtcgtttgtagaattgacaccctcaagggctgagaattacatggttttcttgggtgacgcaggtttcatggaatgtaacacacctctctctgccctagtggacagggcaaaagaactgatgggtcgtcacatgatggccgccgacggcagcgttgtcgcggagcaccggatacaggtgtcggagtcgggagaagctgatcataaggcggtcgccgcggcgccggagaagtggctgaattacttcgttcgcttgctcgcggggatcgaaagcgcgggcaacgccttgggcacgctggccttcacctggggcaccgtcgtcctgctgggtggctacccgatattcacccgcaacaatatgctggattatcaactgttcttccggacgagaggtgcctttagaccactgggctggaacgggctgatgtttctatgtgctggagttgtaagactgcgcctacgcatcaacagttggctacgccgtcagatatcgctgtggagccctgtggtttcaattctactgttgggtccctctgatttcagaatctttcttttttctggaatacgcgggcgcgtttcacataccatgtgcatgtggatagtaatagtatatggtgtgctccttggggttgtgctcctagtgactattagcaggctgcagtccccaattataatcaaccgagtacaaggtgctttgggtcgcaaatacatattttggcgcccatttatcctatactcgtgcatgctcgctgcaattgtgctgtcgatgttcatggttgataaattctataggcctgggatcatcggactccagatatatgccttggtcattgtgtcattcggcaacttacagattccagcagcaatcgcgcgtgccgtgctcgcagggctgtgccttcatccaaagggctacgacggccaaggtggcaccacaaatattgtcctatctctaaaaatccactacggaatggtgcttggccaaggaatactttacattgtggccggcatgctggagatcttctcgttcatccctcgaagatCcctcatccgaaatggtggatttacaggtcagtggggagtagaatctgtcaatctgtactacgcatatgcctacgacaaatacatggaaggaggtctgtttgcttcaaagaggatcagcctcagtaactttgccattgattctctgaattcggacctgtccaagaatcagctgtatgggatacggatgacgcatatatttttgaaaagagatctgaccagggcaaggttgctggagaaactcgctagttcaacgcagacgattgccaggttaatcagcatgttggactggagtagtagacatcatcgtgcaactatcaggttatatgccgccaaggtcactgccgagcttgcaaagaacctccgagttgaaactgtccctgggacattgcagcttgtatctatgctcctggatgctgatggaaagccgaaaagaggacacccactcctagttgcagatgatgatgaagatcattttgttgatatattagatagacaagataaaaaacatgatatagctggtgaccaagagccgattgaggacaccgataacctgctggaagcaccaacccgatcaacgcacatcaacgaccaaagatacatacctagaatttggcagaggattctggagtactggtcgattcccaaggaacagccattgacagacgatgatctcctccctgcactaggcatgtcaatcatatatagccttgctggttgtgatcaaaataactgcgtggaaatcgacaaagtaactgacctgatccccaaaatcattggattcacaagcttcagaagtgcaatggtaaattccgaagcccaacggaaggttctcttgaagtcatcgttgaaggtgctgcagaggctcacaagcattgaaggggaaattggcataacattgaggtacaggatatcacaacatcccttcttactgagaaaccttgcagagatcttgggagacagcagcagcagcaatcaagaactaaggaggctcgtggcaggaatcctcagaaaccttgcaattgacagagacacgaggcaggagattggacaaatgaaaatgctgattaccaggctaatgaaggcattcctcgattctaacggatcatttagttcagatgttgaatgcttgctgccaaaggtcgccgggcaagcactggtaatgctgtcatcagaaaatccgcacaactgcttcgttatgttgaaggaaccagatttcgttcataaactaaaaaatatgatcctgatccatgatgacaaatacatatatgtggcagctaatcttttgcgtaatatgtgcctgcacgctcaacatgagctcacagaatcagacctaaaggaattatctcacaccttgcgagaggtgttggaaagaataatggacgctgaaggggcagaactagaaatcctcattggccttagttcacagatatgcaaactcattcctgaagaattttcccaagagctagagcacgggcagatcaagcgGAgattcaTtaagAggctagtggacgcactgaatgcaaacatgaaaccaaatcctcattgccctgggatccggagggtgatacttgagcaatgcatatacatgatggagtgcaattcttgctatgccaattgtttcaatgaattccgaatgatggatgcagtgtcgatggtcgaagagacaccctcaagggctgagaagtacatgtttttcttgggtgacatgggcttcatggaatgtaacacacctctctctgccctagtggagagggcaaaagaactggtgagtcgccagtggctgcatggcatcaacagtgccaacttgagaaaaaaactgtaa
More
|
|||||||
Protein seq | MADGAEHRIQMPDAAATSKAAAAPEKWLNYFVRLLAVIESVGNAFGTLAFTWATVVLLGGYPTVLGSHDDFWFATAIVFLEAVRFLGGKGLIVLICFWDVMATLTMTVANWKLRLGILVAITVMLILAAGQFLCPRGAQRPRTCNWPYRAISLWSPVVAILLLAFPILRYYNRHMHKIIFRNSFTVWIPYILLSVTVLLLTISRLQFPIIANLVHGALGSKHVFWRQFILNSCMFLALVILVVMSDPGLRSAMIFIDVCAVLILSFGNLHIPAALVRVVLALIRLIPHNYFGDGNMTNLGPSLSIFYGMVLGQGILYIVDGILEVFSFIPRRSLIRNGGFAGQWGVESVNLYYVYAFDKYMEGGLFASKRISLSNFAIDSLNSDLSKNQLYGVRMMHTFLQSDLTRARLLEKLTTSTQTMARLISMLDWSSRHHCTTIRLYAAKVTAELAKNLRVVTVPGTLQLVSMLLDADGKPKRGHPLLDADDDHFVDILDRQDKKHDIAGDQEPIEDTDNLLETPTRSMHINDQRCIPRIWQRILAYWSIPKEQPLTDDDFLPALGMSIIYSLAGCDQNNCVEIDKVTYLIPKIIGFTSYRSAMVNSEAQQKVLLKSSLKVLQRLTSIEGEIGITLRYKISKHPFLLRNLAEILGDSSSSNQELRRIVAGILRNLAIDRDMRQEIGRMQILITTLMKAFLDFKGLYSSDVDCLLPKVAGQALEPDFIHKLKNMILIHDDKYTYVAASLLRNMCLHAQHELTESDLKELSHTLREVLERTMDAEGAELEILIGLSSQICKLIPEEFSQELEHGQIKRRFIKRLVDTLNANMNPTSQCPGIRRVVLEQSIYMMEYNSRCANCFNEYQMMDALSFVELTPSRAENYMVFLGDAGFMECNTPLSALVDRAKELMGRHMMAADGSVVAEHRIQVSESGEADHKAVAAAPEKWLNYFVRLLAGIESAGNALGTLAFTWGTVVLLGGYPIFTRNNMLDYQLFFRTRGAFRPLGWNGLMFLCAGVVRLRLRINSWLRRQISLWSPVVSILLLGPSDFRIFLFSGIRGRVSHTMCMWIVIVYGVLLGVVLLVTISRLQSPIIINRVQGALGRKYIFWRPFILYSCMLAAIVLSMFMVDKFYRPGIIGLQIYALVIVSFGNLQIPAAIARAVLAGLCLHPKGYDGQGGTTNIVLSLKIHYGMVLGQGILYIVAGMLEIFSFIPRRSLIRNGGFTGQWGVESVNLYYAYAYDKYMEGGLFASKRISLSNFAIDSLNSDLSKNQLYGIRMTHIFLKRDLTRARLLEKLASSTQTIARLISMLDWSSRHHRATIRLYAAKVTAELAKNLRVETVPGTLQLVSMLLDADGKPKRGHPLLVADDDEDHFVDILDRQDKKHDIAGDQEPIEDTDNLLEAPTRSTHINDQRYIPRIWQRILEYWSIPKEQPLTDDDLLPALGMSIIYSLAGCDQNNCVEIDKVTDLIPKIIGFTSFRSAMVNSEAQRKVLLKSSLKVLQRLTSIEGEIGITLRYRISQHPFLLRNLAEILGDSSSSNQELRRLVAGILRNLAIDRDTRQEIGQMKMLITRLMKAFLDSNGSFSSDVECLLPKVAGQALVMLSSENPHNCFVMLKEPDFVHKLKNMILIHDDKYIYVAANLLRNMCLHAQHELTESDLKELSHTLREVLERIMDAEGAELEILIGLSSQICKLIPEEFSQELEHGQIKRRFIKRLVDALNANMKPNPHCPGIRRVILEQCIYMMECNSCYANCFNEFRMMDAVSMVEETPSRAEKYMFFLGDMGFMECNTPLSALVERAKELVSRQWLHGINSANLRKKL
More
|
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_07g0025860 | OsPr106_07g0025860.01 | Chr07 | 28320776 | 28330368 | + | NAM | ||
CDS seq | atgggagacatcaccggcggcggcggagagcttcgagtccagatagcagccaactccggcgggcaaggtggcaaggtcgtcggcgccgccgcgccggagaagtgtctgaatcgcttcgtccgcatggtggcgctgatggagaggacgggcaacgcgctcggcacgctggccttcaactgggctgccatcatcctgctcggcggctacccctcggtgctccgacccgataaagatttcctttatgcgaccaccataatcttcgtagaagctgcaaggatgttcagccgcaacaacagactcgattaccagttgttcttccgcacgagaggtgctttcaacccttctgctggctggaatgaattgatcgtggttgcgtgcatatccaatgctctgctctgcacggcttattggggcgatattatgatattaacagacccgttttggtatgttatggtgatattactactagctattatccaatttttacgttcagcagcttcaaaactgctcacatggaatccaatgcgacgtgctatatcattattgagccccatggttgcaatcctactgctaggtccctttctactaggattctatattaattccgaccagtcaaagaagaaaatggctaaatggatggtagcgtacgtagtgctgcttgtattgatgctcctgctgacgatcagcaggctccagttcccaagtataatcaaactactaaatggtactcttggcagcaaacaagaattttggtgtcaatttactctgaagttgtgcataattgcttcgatcataatgcctgtgcttattgtgcctggtacaaacaatcgatatgttgtcatcatactggaagcgcttgctttagtgttagtattatttggcaacttacagattccagcagcgactgtccgtgtcgctcttgcactgttgcgccttgtaccacaggattacaacagtgagaacaagaatgacaaaaaggaagacccctctaggacaaatctagctgaatctcttaacatcttctatgggatggtgcttggccaaggtattctctacattgcagcctgtatctttgaggtcttctcatttatccctcggagatctctaatccgccatggtggatttggaggtcagtggggggtagcatctatcaatttgtattacgcatacgccttcgagaaatacatggaaggaggtgtacttgctccaaagaagatcagtctcatcacctttgcaatggattccctcaactcagactcacccaagatgcagctctatagcgtccagatgctgcatatctttctgcaaagggAACCaaccaaggaacggctcatagcaaagctcatcacctctaccaagaccatggccaggttaatcagcatgttgggttggactggcagaaatgaccacacaactatcaggctgtatgctgccaaggtctctgccgagcttgcaaagagcctccgagttgtaactatccctgagacattgcagcttgcatctacgcttctggatactgatggaaagccaaaaagaggacacccacttctggatgtagatgatggtcgagatcctgttgttgatacagcagaaagacaagagaacagacaagatgcaattggtgatcaagggcaaagacaagggtcaattggggacactgatagcctgctggaaacaccaacacgatcgatgcagatcaacgaccaaagatacatacctagtatttggcagaaaatactaggctactggtcaattcccaaggagaagccattgacagacGATgatcttctccctgcactaggcatgtcaatcatttatagccttgctggttgtgatcaaaataactgtgtggaaatcgtcaaagtaactgacctgatcccaaaaatcattggattcacaagcttcagaagtgcaacattaaattccgaagcacaacagaaggttctcttaaagtcatcactgcaggtgctgcagaggcttacaagcattgaaggggaaatcggcataacactgcggtacaagatatcaaaacatcccttcctgttgagaaaccttgcagagatcttggaagacgacaacaacaatcaagaactaaggaagctcgtggcaggaatcctcagaaaccttgccattgacacagaaacaaggcaggagattggacaaatgcaagtgctcattaccaggctggtcaaagcattcctcgataccaatggaccatctagttcaaatgttgattgcttgctgccaaaagtcgctgggcaagcactggtaatgctgtcattagaaaattcacataactgcttcgctatattgaaggaaccagagttcattaataaactaaaaaatatgatactaatccatgatgataaatacatatatgtggcagcgagcctgatgcgtaatatgtgcctgcatgctcaacccgagctcacagaattagacctaaaggaactatctcacaccttgcgagaggtgctggaaagaataatggacgctgaaggggcagaactagaaatcctcattggccttagttcacagatatgcaaactcattcctgaagaatttgcccaagagctggagcatggacagattaagcgaagattcattaagaggctagtaaatgcactgaatgcaaacatgaaaccaagtacttactgtcctgggattaggagggcgatacttgagcaatccatatacatgatggagtgcaattctcgctatgccgattgtttcaatgaataccggatgatggatgcactgtcgatggtagaaaaaacaccctcaagggctgagaggcttcatggaatgcagcacacctctatttgctctagtggacagggcaaaagaactgatgggtcgtcagtggttgcattacatcaacagtgcgaactgaaaaaaaatattgaATGa
More
|
|||||||
Protein seq | MGDITGGGGELRVQIAANSGGQGGKVVGAAAPEKCLNRFVRMVALMERTGNALGTLAFNWAAIILLGGYPSVLRPDKDFLYATTIIFVEAARMFSRNNRLDYQLFFRTRGAFNPSAGWNELIVVACISNALLCTAYWGDIMILTDPFWYVMVILLLAIIQFLRSAASKLLTWNPMRRAISLLSPMVAILLLGPFLLGFYINSDQSKKKMAKWMVAYVVLLVLMLLLTISRLQFPSIIKLLNGTLGSKQEFWCQFTLKLCIIASIIMPVLIVPGTNNRYVVIILEALALVLVLFGNLQIPAATVRVALALLRLVPQDYNSENKNDKKEDPSRTNLAESLNIFYGMVLGQGILYIAACIFEVFSFIPRRSLIRHGGFGGQWGVASINLYYAYAFEKYMEGGVLAPKKISLITFAMDSLNSDSPKMQLYSVQMLHIFLQREPTKERLIAKLITSTKTMARLISMLGWTGRNDHTTIRLYAAKVSAELAKSLRVVTIPETLQLASTLLDTDGKPKRGHPLLDVDDGRDPVVDTAERQENRQDAIGDQGQRQGSIGDTDSLLETPTRSMQINDQRYIPSIWQKILGYWSIPKEKPLTDDDLLPALGMSIIYSLAGCDQNNCVEIVKVTDLIPKIIGFTSFRSATLNSEAQQKVLLKSSLQVLQRLTSIEGEIGITLRYKISKHPFLLRNLAEILEDDNNNQELRKLVAGILRNLAIDTETRQEIGQMQVLITRLVKAFLDTNGPSSSNVDCLLPKVAGQALVMLSLENSHNCFAILKEPEFINKLKNMILIHDDKYIYVAASLMRNMCLHAQPELTELDLKELSHTLREVLERIMDAEGAELEILIGLSSQICKLIPEEFAQELEHGQIKRRFIKRLVNALNANMKPSTYCPGIRRAILEQSIYMMECNSRYADCFNEYRMMDALSMVEKTPSRAERLHGMQHTSICSSGQGKRTDGSSVVALHQQCELKKNIE
More
|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 1.233862 | 0.0 | 3.784645 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_07g0650600 | RBH | 13.083922 | 12.544655 | 15.036459 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g45570 | RBH | 3.671329 | 3.787482 | 1.686198 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0655201 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0025790 | RBH | 1.142522 | 3.499882 | 1.437020 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0025870 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0025700 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0025640 | RBH | 0.016138 | 0.021481 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_07g0025900 | RBH | 0.692038 | 5.127905 | 3.575799 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_07G0447800 | RBH | 1.2988435 | 1.6336255 | 0.185993 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_07g0026350 | RBH | 0.064252 | 0.039168 | 0.444145 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0460100 | RBH | 1.4689905 | 0.3985925 | 2.356267 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_07g0025630 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0026050 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_07g0025700 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_07g0026120 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_07g0025650 | RBH | 0.043011 | 0.394089 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_07G025760 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0025560 | RBH | 0.0 | 0.0 | 1.755012 |