Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsPr106_06g0012200 | OGI:06027190 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr06:10630829-10645075 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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Function | - |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_06g0012200 | OsPr106_06g0012200.02 | Chr06 | 10643299 | 10643907 | - | IsoSeq | ||
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Protein seq | MATRSGIMEIHISSFSCTTARMRMRMMTTMDKANAAAL |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.548556 | 0.000000 | 2.070420 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_06g0295500 | RBH | 0.651286 | 0.386702 | 1.563368 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os06g19160 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.072731 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os06g0295500 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_06g0012150 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_06g0012050 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_06g0012050 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_06g0012100 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_06g0012240 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_06G0178700 | SBH | 1.817232 | 11.724913 | 8.931669 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_06g0011680 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.413102 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_06G0174100 | RBH | 0.637118 | 1.8965265 | 2.7064695 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_06g0012250 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_06g0012100 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_06g0011960 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_06g0012330 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_06g0012000 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_06G011850 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.250925 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |