Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_01g0006340 OGI:01014270 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:4708924-4724598
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Ankyrin-2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8C8R3]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_01g0006340 OsPr106_01g0006340.02 Chr01 4708924 4724598 - NAM
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OsPr106_01g0006340 OsPr106_01g0006340.03 Chr01 4712814 4724598 - NAM
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OsPr106_01g0006340 OsPr106_01g0006340.01 Chr01 4708924 4724598 - NAM
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr01 4723691 4724331 - OsPr106_01g0006340.01,OsPr106_01g0006340.02 OsPr106_01g0006340.01,OsPr106_01g0006340.03,OsPr106_01g0006340.02 All
A3 Chr01 4718629 4718855 - OsPr106_01g0006340.02,OsPr106_01g0006340.03 OsPr106_01g0006340.01,OsPr106_01g0006340.03,OsPr106_01g0006340.02 All
MX Chr01 4709244 4709911 - OsPr106_01g0006340.01 OsPr106_01g0006340.01,OsPr106_01g0006340.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 4.914152 0.758275 11.617171

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0175400 RBH 0.0 0.000000 1.467392
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g08000 RBH 0.0 0.000000 0.498499
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0188900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0005520 RBH 0.000000 0.0 4.821747
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0005220 RBH 0.0 0.0 2.209015
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0006630 SBH 0.433991 0.0 9.708139
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0005120 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0081000 RBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0006290 RBH 1.312307 0.000000 3.131359
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0081500 RBH 0.0017335 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0005090 RBH 0.000000 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0005280 RBH 0.0 1.926212 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0005340 RBH 4.514821 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0005270 RBH 0.0 0.000000 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0005270 RBH 0.000000 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G006300 RBH 0.000000 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0006200 RBH 0.0 0.0 0.0
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