Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsNip_08g045169A | OGI:08056220 | 3/16 | Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | Chr08:22060046-22065153 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | ATCATGAATGAAAAGGAAGAAAACTAATCCTCCCCCAAACTTTCTCTGTTCTCTCCTCTGTTCTTCCTATCCCCTTCTGTTCTTCCCAAAATCCCCATCTATTTCTGAAATCATCGCTGCGAATATTACAGTGGTATCAGATTCAGGTCGTTCGTGGTCGATTTAGGCTCATATTCTCTCGATCCGGCTGGTAAAATTCCTATGCTCAGGTAGGCGGCTACCCTTGGGTGCGGCTGCTGTAAATCCGGTTCTGGTTCGGCTGGATTTGGAGGAGTCTTTCACCACGGCGCCGATCAAACTCTCCGCTCCCTTGCGCCAATCTCTCGACGCCATGGAGGCTAAGCTTCTCGAGAAGCTGGACTCCCTCACGCTGTGTATGGAGGCTTTGGACGACAAGTTAACCAAGCAGAGCGGCCGAATTGATCAAGTCGCTACCAAGGTGGATCTCGCCATGGATGCTGTGGCCGCTTTGCAGAAGGAGCAAGTGCAGGCGGCGCAGCTGCACAAGCAAGCCATGGCTTCAGAACCGGTGAGTATTTTGGGTTCCCCGTCTTCTCTATCAGTGGCAAGTCTGGGCACAACAACACCACCACCACCACCACCTCCTCCTCCTCCACCGCTGGTTTTTTCTAAGTCAATATCTCGTTGGGGGAATGGTGAATCTAGTGCGGGTTGTGATGGGGGGTTGCGCGCTAAGAGTTGTCTTCCGAAGATGGATTTTCCACGTTTTGATGGGGCTGATGTGAGAGTCTGGATTGATATGTGTGAGACATTTTGAGATGTACCAGATTCCTCCTGTATTTCAAGTTTCAGCAGCTGTTCTTCACATGTCGGGGAATGCTGCCCAGTGGTATCAATCGTTTAAGCTCGTGGAGGAAGTTGCTAATTGGTCTCAGTTTCGACATGCTGTTGTTTGTGAGTTTGAGAGCACCTCGCAACGTGAGAAGATTCAGGCTCTGCAAACTTTAAGACAGGCAGGTTCTGTGGCTGAATATAAGCATCAATTTGATTCTCTTGTCTATCAGATCCGTGTATTTGATCCATCAGTGGGAGGTTTGATGCTGGTGTATCGTTTTTATGTTGGGGCTTAAGGAGGACATTCGTGCAGCAGTGATGGTTCAGTTGCCTACCACAGTTCAGCAAGCTGCTGCTGTGGCATTGATGCAAGAGAGTGTTCTACTTGAATTGAGTACTAAGCAATCTAAGCGATTGATGTATAAACCATTGCCTACCAAAGGGGAGTTGCCTCAGGGTGGTACTGATACTCCTGCTATTAAGCCTGAACGAGCAGAACTATGGAAGGCTCGACAGTTAAGGGATTATCGAAGAGCCAATGGTCTTTGTTTCAAATGTGGGGATAAATATTCTCCTGAGCACCAGTGTGCGCTGGGTGGTCAGATTAAAGCTATGCAAGTTACTGAAGTGATTCCGGATGATCTTTTGAATGCAGTGACTGCTGAAGAAGACTCTGACCAGGATGAGAATTGTCATATTTCACTCAATTCCCTGTCTGGTGCTAGTCATGTGAACACTATCAGACTCCGAGCTTTGGTCCAGAATAAGGTGTTGCTCTTACTGGTCGACTCTGGCAGTTCTCATAGTTTCTTGGACTATAACTTTGCTCAACTCTTGGGATTGCAGTTGCAGCCCATTGCTCCCTCCCTGGTTAAAGTAGCTAATGGTGATTGTATACACTGTCAGTTTATGGTTCCTCAGTTTACTTGGTGGTTTCAAGGGCGTACTTTCACTTATGATATGAGAGTTGTTCCTTTGGGTGGACATGATGCTATTTTGGGGATGGACTGGTTGGCACAGTGGGGTGATATGTCTTGCAATTGGGCCAACAAAACTTTGAAGTTTATGTATCAGGGTACTTGGGTTGAACTTCAGGGAGTCCCTGATTCTCCTCCCCAAACTGAGTTGAGTGCTATGTCTTTGTCTCAGGTTCTTAAGTGTCAAAAAGGGTGTGATATATGGGCAGCTGCACTGCTGGAAACAGCTGACTTCCCTTCTGCTGATTCAGTTCCACCTGCTGTTTCTCAGTTAGTGCATGAGTTTGCTGATGTTTTTCAAGATCCACACAGTTTACCACCTCACAGAGTTTATGATCACGCTATTACTCTTTTCCCTGGTTCAGCTCCTGTGAATAGCAAACCTTATCGGTATTCTCCTTTGCAAAAAGATGAGATTGAAAGTCAGGTCAAGGACATGATTGATTCTGGGTTGATCACTCCCAGTATGAGCCCTTTTGCTTCTCCTGTTTTATTGGTTAAAAAGAAGGATGGCACGTGGCGTTTTTGTGTGGATTATCGCAAACTCAACTCTATTACTGTGAAAAGTAAGTTTCCTATGCCTATTGTTGATGAATTGCTTGATGAGCTTGCTGGTACTCGTTTCTTCTCTAAACTTGACTTGAAAGCTGGCTATCATCAAATATGGATGGTGGAGGATGATGAATATAAAACTGCTTTTAAAACACACCATGGTCAATTTCAATTCCATGTGATGCCGTTTGGGTTGACCAATGCCCCTTCTACTTTTCAATGTGTGATGAATTCAGTGTTTGCACCCTTAATCAGGAAGTATGTTTTGGTGTTTATGGATGATATTCTAGTGTACAGTCCTGATTTACCGTCTCATCTCACACACTTGAAACAAGTTTTTGAACTGCTGAGACAACACAAGTTATATGCCAAAAGGTCCAAGTGTTCTTTTGCCTGTTCTCAATTGGAGTATTTGGGACACATAATTTCAGATCAAGGAGTCAGTACTGATCCTACTAAGACTGCAGCTATGTTGGCTTGGCCAGTCCCTGCCAATGTGACAGAACTCAGAGGGTTTTTGGGGCTTACAGGGTATTATAGAAAGTTTGTTAAAAATTATAGTATCCTGGCAAAACCTTTAACTGTCTTACTACAGAAGAAAGCGTTCCAGTGGTCTGATGATGCTCAGCAGGCTTTTCAGAAGCTGAAACTTGCTATGAGTTCAACTCCTGTACTGGCTTTGCCCGATTTCTCCCAACCTTTTATTTTGGAAACTGATGCTTGTGCGTTTGGAGTGGGAGCTGTCCTCAGTCAGCATAATCATCCTATTGCATATTATAGCAAGACATTGGGAGTGGCTAATCAGAAGCTTTCTATATATGAAAAAGAGTTCCTGGTGATTATGATGGCTGTGGATAAGTGGCGTTGTTATTTGTAACGATGCCCTTTTATCATTCGCACTGATCACAAAAGTCTTTGTCATCTCAATATCAGGTTCTGGGGACTGATTTACAGCAAAAGGCAATGACTAAATTGATGGGGTTACAATATACTTTCCAGTATAAGAAAGGAGTGGAGAACGTGGTAGCTGATGCTTTGTCTCGAGTGCCTCCTCAGTCTCACTTATCTGCTCTGTCAGTGGCTAGCCCCATTTGGTTGCAGGAAGTGTTAAACTCGTATGCTGTGGATACTCAGGCTCAGAAGTTATTGGTAGAATTGGCAGTCCATTCTCCTAATGATCAGGGTTATTCTTTGACTGATGGTCTCATTCGTCATCATGGTCGCATTTGGATAGGAGCTAATCTGGGTTTGCAGACTAAGTTAATCACTGCTTTTCATTCCTCTCCAATTGGTGGTCACTCGGGCACTATGGCCACTTATCACCGGCTCAAAAAGTTGTTCTCTTGGGTTGGTCTGAAAACTGCAGTATTCAACTTTGTTAAACAGTGTCAAATCTGCCAACAAGCTAAACATGAGCATTGTCGATTGCCTGGGTTGTTAGTTCCTTTACCAGTACCGAAAGAAGCTTGGATCGACATCTCGATGGATTTTATTGAAGGTTTGCCCAAATCTGATGGTTACACTGTTATACTTGTTGTGGTGGATCGTTTCACTAAATTTGCTAGTTTCATTCCTTTGAGACACCCTTATACTGCTTCACAAGTAGCGGTCACAGTGGATAAATTTGTGTTTAAGACCCATGGCTTACCACAGTCAATTGTGTCGGATCATGACAAAGTGTTCACTAGTCGTTTTTGGGGTGATTTGTTTAAAGTATGGAACACTCAATTGAACATGAGTACGGCATATCATCCTCAAACCGACGGGCAAACCGAAAGAGTGAATCAGTGTCTCGAGATGTATTTGAGGTGCATGATTCAAGCTACTCCCACCAAATGGAACAGTTGGCTGCATTTGGCTGAGTACTGGTATAATACATCTTTTCATACATCTTTGGGTTGTTCCCCTCACAAAGCTTTGTTTGGAGTGGAACCTCATATCAGTCAAGTGCCGGTGCTGCTGTCCTCAGTTCATCATTCTGTGGTGGACTTAATTTCTGAACGCAATCAGTTGTCTGTCTTTTTACAGCAACAGTTACAACGAGCACAATTGCGTATGAAGCATAAGGCTGATAAAGGGCGATCTGAGCGTTCCTTTTCTGTTGGTGATCATGTCTTTCTTCGCTTGCAACCTTATGCTCAGTCTTCGGTGGTGAATCGCCCATATCCCAAACTGGCATTCAAGTTCTTTGGACCATTTCAAATCTTGGAGAAAGTTGGGTCGGCAGCTTATCGTCTGGCTTTACCTGAAGGCAGTGCGGTCCATCCTGTGTTTCATGTGTCTCAACTCAAAGCTCATGTGCCAGATCACACTCCAGTGTTTACTTCTCTACCCACACCGGTTGTACTGGATGCTGCCGATGTGTGGCCTGAACTGATTCTGGACAGGCGTCTGGTAAAAAAGGGGAATGCAGCTCATGTTCAGGTGCTTATCAAGTGGTCATCTCTGTCTGCTGATGATGCCACCTGGGAGGATTATGATGTGTTGAAGACACGATTCCCTTCTGCGCCAGCTTGGGGACAAGCTGCATCTTTGGCGGGCGGTACTGTCACAGCTGATGGTATTCAGTGCGACGCGCCACAGTAGTCGTGATGGACAGCTACAGTAGCGTTCCAGGAATAGAGTGAAATGGGCCTGCGCGCTCACATGAGTTATGTTGGGTTGTTGGGCCTGCGAGCTCATGCTGTTGCTTAGCTGTAAGGTCTATAAGACAAGGGACCACTCGGTGGGGAAGACATCATGAATGAAAAGGAAGAAAACTAATCCTCCCCCAAACTTTCTCTG
More
|
||||||||||
| CDS seq | ATGTTGGGGCTTAAGGAGGACATTCGTGCAGCAGTGATGGTTCAGTTGCCTACCACAGTTCAGCAAGCTGCTGCTGTGGCATTGATGCAAGAGAGTGTTCTACTTGAATTGAGTACTAAGCAATCTAAGCGATTGATGTATAAACCATTGCCTACCAAAGGGGAGTTGCCTCAGGGTGGTACTGATACTCCTGCTATTAAGCCTGAACGAGCAGAACTATGGAAGGCTCGACAGTTAAGGGATTATCGAAGAGCCAATGGTCTTTGTTTCAAATGTGGGGATAAATATTCTCCTGAGCACCAGTGTGCGCTGGGTGGTCAGATTAAAGCTATGCAAGTTACTGAAGTGATTCCGGATGATCTTTTGAATGCAGTGACTGCTGAAGAAGACTCTGACCAGGATGAGAATTGTCATATTTCACTCAATTCCCTGTCTGGTGCTAGTCATGTGAACACTATCAGACTCCGAGCTTTGGTCCAGAATAAGGTGTTGCTCTTACTGGTCGACTCTGGCAGTTCTCATAGTTTCTTGGACTATAACTTTGCTCAACTCTTGGGATTGCAGTTGCAGCCCATTGCTCCCTCCCTGGTTAAAGTAGCTAATGGTGATTGTATACACTGTCAGTTTATGGTTCCTCAGTTTACTTGGTGGTTTCAAGGGCGTACTTTCACTTATGATATGAGAGTTGTTCCTTTGGGTGGACATGATGCTATTTTGGGGATGGACTGGTTGGCACAGTGGGGTGATATGTCTTGCAATTGGGCCAACAAAACTTTGAAGTTTATGTATCAGGGTACTTGGGTTGAACTTCAGGGAGTCCCTGATTCTCCTCCCCAAACTGAGTTGAGTGCTATGTCTTTGTCTCAGGTTCTTAAGTGTCAAAAAGGGTGTGATATATGGGCAGCTGCACTGCTGGAAACAGCTGACTTCCCTTCTGCTGATTCAGTTCCACCTGCTGTTTCTCAGTTAGTGCATGAGTTTGCTGATGTTTTTCAAGATCCACACAGTTTACCACCTCACAGAGTTTATGATCACGCTATTACTCTTTTCCCTGGTTCAGCTCCTGTGAATAGCAAACCTTATCGGTATTCTCCTTTGCAAAAAGATGAGATTGAAAGTCAGGTCAAGGACATGATTGATTCTGGGTTGATCACTCCCAGTATGAGCCCTTTTGCTTCTCCTGTTTTATTGGTTAAAAAGAAGGATGGCACGTGGCGTTTTTGTGTGGATTATCGCAAACTCAACTCTATTACTGTGAAAAGTAAGTTTCCTATGCCTATTGTTGATGAATTGCTTGATGAGCTTGCTGGTACTCGTTTCTTCTCTAAACTTGACTTGAAAGCTGGCTATCATCAAATATGGATGGTGGAGGATGATGAATATAAAACTGCTTTTAAAACACACCATGGTCAATTTCAATTCCATGTGATGCCGTTTGGGTTGACCAATGCCCCTTCTACTTTTCAATGTGTGATGAATTCAGTGTTTGCACCCTTAATCAGGAAGTATGTTTTGGTGTTTATGGATGATATTCTAGTGTACAGTCCTGATTTACCGTCTCATCTCACACACTTGAAACAAGTTTTTGAACTGCTGAGACAACACAAGTTATATGCCAAAAGGTCCAAGTGTTCTTTTGCCTGTTCTCAATTGGAGTATTTGGGACACATAATTTCAGATCAAGGAGTCAGTACTGATCCTACTAAGACTGCAGCTATGTTGGCTTGGCCAGTCCCTGCCAATGTGACAGAACTCAGAGGGTTTTTGGGGCTTACAGGGTATTATAGAAAGTTTGTTAAAAATTATAGTATCCTGGCAAAACCTTTAACTGTCTTACTACAGAAGAAAGCGTTCCAGTGGTCTGATGATGCTCAGCAGGCTTTTCAGAAGCTGAAACTTGCTATGAGTTCAACTCCTGTACTGGCTTTGCCCGATTTCTCCCAACCTTTTATTTTGGAAACTGATGCTTGTGCGTTTGGAGTGGGAGCTGTCCTCAGTCAGCATAATCATCCTATTGCATATTATAGCAAGACATTGGGAGTGGCTAATCAGAAGCTTTCTATATATGAAAAAGAGTTCCTGGTGATTATGATGGCTGTGGATAAGTGGCGTTGTTAT
More
|
||||||||||
| Protein seq | MLGLKEDIRAAVMVQLPTTVQQAAAVALMQESVLLELSTKQSKRLMYKPLPTKGELPQGGTDTPAIKPERAELWKARQLRDYRRANGLCFKCGDKYSPEHQCALGGQIKAMQVTEVIPDDLLNAVTAEEDSDQDENCHISLNSLSGASHVNTIRLRALVQNKVLLLLVDSGSSHSFLDYNFAQLLGLQLQPIAPSLVKVANGDCIHCQFMVPQFTWWFQGRTFTYDMRVVPLGGHDAILGMDWLAQWGDMSCNWANKTLKFMYQGTWVELQGVPDSPPQTELSAMSLSQVLKCQKGCDIWAAALLETADFPSADSVPPAVSQLVHEFADVFQDPHSLPPHRVYDHAITLFPGSAPVNSKPYRYSPLQKDEIESQVKDMIDSGLITPSMSPFASPVLLVKKKDGTWRFCVDYRKLNSITVKSKFPMPIVDELLDELAGTRFFSKLDLKAGYHQIWMVEDDEYKTAFKTHHGQFQFHVMPFGLTNAPSTFQCVMNSVFAPLIRKYVLVFMDDILVYSPDLPSHLTHLKQVFELLRQHKLYAKRSKCSFACSQLEYLGHIISDQGVSTDPTKTAAMLAWPVPANVTELRGFLGLTGYYRKFVKNYSILAKPLTVLLQKKAFQWSDDAQQAFQKLKLAMSSTPVLALPDFSQPFILETDACAFGVGAVLSQHNHPIAYYSKTLGVANQKLSIYEKEFLVIMMAVDKWRCY |
||||||||||
| Function | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 [UniProtKB/Swiss-Prot:P20825] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsNip_08g045169A | OsNip_08t045169A-01 | Chr08 | 22060046 | 22065153 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGTTGGGGCTTAAGGAGGACATTCGTGCAGCAGTGATGGTTCAGTTGCCTACCACAGTTCAGCAAGCTGCTGCTGTGGCATTGATGCAAGAGAGTGTTCTACTTGAATTGAGTACTAAGCAATCTAAGCGATTGATGTATAAACCATTGCCTACCAAAGGGGAGTTGCCTCAGGGTGGTACTGATACTCCTGCTATTAAGCCTGAACGAGCAGAACTATGGAAGGCTCGACAGTTAAGGGATTATCGAAGAGCCAATGGTCTTTGTTTCAAATGTGGGGATAAATATTCTCCTGAGCACCAGTGTGCGCTGGGTGGTCAGATTAAAGCTATGCAAGTTACTGAAGTGATTCCGGATGATCTTTTGAATGCAGTGACTGCTGAAGAAGACTCTGACCAGGATGAGAATTGTCATATTTCACTCAATTCCCTGTCTGGTGCTAGTCATGTGAACACTATCAGACTCCGAGCTTTGGTCCAGAATAAGGTGTTGCTCTTACTGGTCGACTCTGGCAGTTCTCATAGTTTCTTGGACTATAACTTTGCTCAACTCTTGGGATTGCAGTTGCAGCCCATTGCTCCCTCCCTGGTTAAAGTAGCTAATGGTGATTGTATACACTGTCAGTTTATGGTTCCTCAGTTTACTTGGTGGTTTCAAGGGCGTACTTTCACTTATGATATGAGAGTTGTTCCTTTGGGTGGACATGATGCTATTTTGGGGATGGACTGGTTGGCACAGTGGGGTGATATGTCTTGCAATTGGGCCAACAAAACTTTGAAGTTTATGTATCAGGGTACTTGGGTTGAACTTCAGGGAGTCCCTGATTCTCCTCCCCAAACTGAGTTGAGTGCTATGTCTTTGTCTCAGGTTCTTAAGTGTCAAAAAGGGTGTGATATATGGGCAGCTGCACTGCTGGAAACAGCTGACTTCCCTTCTGCTGATTCAGTTCCACCTGCTGTTTCTCAGTTAGTGCATGAGTTTGCTGATGTTTTTCAAGATCCACACAGTTTACCACCTCACAGAGTTTATGATCACGCTATTACTCTTTTCCCTGGTTCAGCTCCTGTGAATAGCAAACCTTATCGGTATTCTCCTTTGCAAAAAGATGAGATTGAAAGTCAGGTCAAGGACATGATTGATTCTGGGTTGATCACTCCCAGTATGAGCCCTTTTGCTTCTCCTGTTTTATTGGTTAAAAAGAAGGATGGCACGTGGCGTTTTTGTGTGGATTATCGCAAACTCAACTCTATTACTGTGAAAAGTAAGTTTCCTATGCCTATTGTTGATGAATTGCTTGATGAGCTTGCTGGTACTCGTTTCTTCTCTAAACTTGACTTGAAAGCTGGCTATCATCAAATATGGATGGTGGAGGATGATGAATATAAAACTGCTTTTAAAACACACCATGGTCAATTTCAATTCCATGTGATGCCGTTTGGGTTGACCAATGCCCCTTCTACTTTTCAATGTGTGATGAATTCAGTGTTTGCACCCTTAATCAGGAAGTATGTTTTGGTGTTTATGGATGATATTCTAGTGTACAGTCCTGATTTACCGTCTCATCTCACACACTTGAAACAAGTTTTTGAACTGCTGAGACAACACAAGTTATATGCCAAAAGGTCCAAGTGTTCTTTTGCCTGTTCTCAATTGGAGTATTTGGGACACATAATTTCAGATCAAGGAGTCAGTACTGATCCTACTAAGACTGCAGCTATGTTGGCTTGGCCAGTCCCTGCCAATGTGACAGAACTCAGAGGGTTTTTGGGGCTTACAGGGTATTATAGAAAGTTTGTTAAAAATTATAGTATCCTGGCAAAACCTTTAACTGTCTTACTACAGAAGAAAGCGTTCCAGTGGTCTGATGATGCTCAGCAGGCTTTTCAGAAGCTGAAACTTGCTATGAGTTCAACTCCTGTACTGGCTTTGCCCGATTTCTCCCAACCTTTTATTTTGGAAACTGATGCTTGTGCGTTTGGAGTGGGAGCTGTCCTCAGTCAGCATAATCATCCTATTGCATATTATAGCAAGACATTGGGAGTGGCTAATCAGAAGCTTTCTATATATGAAAAAGAGTTCCTGGTGATTATGATGGCTGTGGATAAGTGGCGTTGTTAT
More
|
|||||||
| Protein seq | MLGLKEDIRAAVMVQLPTTVQQAAAVALMQESVLLELSTKQSKRLMYKPLPTKGELPQGGTDTPAIKPERAELWKARQLRDYRRANGLCFKCGDKYSPEHQCALGGQIKAMQVTEVIPDDLLNAVTAEEDSDQDENCHISLNSLSGASHVNTIRLRALVQNKVLLLLVDSGSSHSFLDYNFAQLLGLQLQPIAPSLVKVANGDCIHCQFMVPQFTWWFQGRTFTYDMRVVPLGGHDAILGMDWLAQWGDMSCNWANKTLKFMYQGTWVELQGVPDSPPQTELSAMSLSQVLKCQKGCDIWAAALLETADFPSADSVPPAVSQLVHEFADVFQDPHSLPPHRVYDHAITLFPGSAPVNSKPYRYSPLQKDEIESQVKDMIDSGLITPSMSPFASPVLLVKKKDGTWRFCVDYRKLNSITVKSKFPMPIVDELLDELAGTRFFSKLDLKAGYHQIWMVEDDEYKTAFKTHHGQFQFHVMPFGLTNAPSTFQCVMNSVFAPLIRKYVLVFMDDILVYSPDLPSHLTHLKQVFELLRQHKLYAKRSKCSFACSQLEYLGHIISDQGVSTDPTKTAAMLAWPVPANVTELRGFLGLTGYYRKFVKNYSILAKPLTVLLQKKAFQWSDDAQQAFQKLKLAMSSTPVLALPDFSQPFILETDACAFGVGAVLSQHNHPIAYYSKTLGVANQKLSIYEKEFLVIMMAVDKWRCY
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 1.407460 | 1.039893 | 2.375470 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os08g35020 | RBH | 0.953477 | 0.700649 | 0.612572 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os08g0273000 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_08G0451000 | RBH | 0.2478885 | 1.1469415 | 0.596724 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_08G0325000 | RBH | 0.003674 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
