Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsNip_04g0369100 | OGI:04058570 | 15/16 | Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:17929442-17940263 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK145, OsRLCK145 | ||||||||||
| DNA seq | ATGCCAACTGATCTACCGGTACATTTTCTAGAAGATATTACGAAAAAATTCTCCGATCACCAAATAGTTGGTAGTGGTGGCTATGGTCAGGTTTACAAGGTTTGTGAGATATGATACTCATATCTTTGTTTCAAGTGGTATCAATAATGAACTCCGATAACCCACTTACGGCGTACCCTTGTAGTAATACATATTAATGAAATAATGAGATCGAAATACAACTGCAACAGGGAGTGCTGACAAATGGGACAGAGATTGCCGTGAAGAAGCTATATGACTTGCGAGGACTTGATGATGTGCAATTTAGCAATGAATTCAGCAACCTTATGAGGGTGCAACATAAAAATATCGTACGATTTATAGGCTATTGCAATGAAGCAAGACATGAACTCATGGAGGTTAATGGGGAAGATGTACTTTGTAAAATGATATACAAAGTTCTATGCTTTGAATATCTGCCGCGTGGAAGCCTGGAGAATTATCTGCATGGTGAGTATGGTGGTAATTTGCGAACTCTATCCAATTATTTAACATGTAAACAAAAAAAAGTAATCCTCACATTTCAAGAATATTTTTTGCCACTTTAACAGAAGAGTCTCGCGGGCTTGATTGGTGCACACGCTACAAAATAATTATGGGGATTTGTGAAGGTCTTAGTTACCTTCATGGAGGATTGGAAGAACCAATTTTGCATCTGGACCTGAAACCGGCCAATATACTTCTAGATAATAACATGGTGCCAAAAATAGCAGATTTTGGGGTATCAAGGCCCTTCGGTGGCTCGCATACACATACCACTAAAGTTTGCGTAGGTTCAGAGTAAGTAGAGAGGACGTCAAGAGATATGTCCTCTTTCTTTCTTATTAGTACTAACCGAATGATATGGTGTTTGTTTAACATCACTGATGATATGATGCAGGTACTACATGGCACCAGAATACTTGGCACAACGTAAAATATCAAATAAGAATGATATATTCAGCTTAGGTATTATAATCATCCAGATAATGGTGGGACATAAAGGCTACTCAAAATATGGCGAAATGTCATCAACCCAACAATTCGTCGATCTCGTAAGAAATTACCCCCTCTATTCTTGTTTATTTATCATTTTTTACAACAAAATTTGTTTGCAATTTTTTTCATATTATTACCCCTTATCTAATAATAATTTCACCTCCACCAACCCATCAATGTATTCACTCTGTCCCAAAATATAACAAATTTTAGATATGAATCTAGCCAAACAGTTTTCCTTGTTCAGATTAGTAGCTAAAAGTTACTCCCCCATCTATTTTTGATAGTCATATTTCTTCTTGTCACAATGACCAAGGATAAGTAATTCTACTTATCATCCATTTAAATATGCTACTAGTTATTCATCGTAAACAAGCAATTCATTATATTTACATTTCTCGATGCTCATATAACCAATCTTAAGTGGAAGAATGGAGAGCAACGCATTAAATACGAGAAAGTCATTAAGATGGTAGGTGGTTAGATTGAAATATGCCTATCAAAAGTAGTTTTTTTAATTTAAAAAAATACCTATAAAAAATAAATGGAGTAAGTACTATATATTTTAGGATCCAGGGAGTACTAGTTTAAATAATCATATCAATGCCGAAACTAGCATATTGTGCAAAAGTTATGATTACCTAGTTATTTGTGCCTAGTCAAAAGTGACCAATAAAAAAAAGGCATAACAAGCACGGGTCTTTTGTAGCTGGAGAACTTTCCTTTCAAAGAGAGATGTCGTCCATCCCAAGTAAAAAAGAAGTGCATGGCTAGCGGAACTTGTCTATTCGTAGGTTGTGTTCTTCCCCTGCTTTTCCAACTCACAACTCTTGTATTTTACACGCAAATTTTTTAAATTGCTAAATTGTATTTTGAAAAAAAATTCTATGTGAAAGTTGTTTTAAAAAATCTTATTAATTCTATTTAAAAAAATAGTTAATGCTTAATTAATCATGCAATAATATATGCTTTGTTTTGCGTAACGGGGAGGATAGGTTGCCAACCCCTCTCGTAGCTTTAGGGTAGTCTCAACCCATAGTGTCCATAAGTAGTGTCTATGGTGCCATGTCAATAAGACATCACAATAGAAACTACACTTCATAACCCGTAATTTCTTAAAATGGGCCATTAATAAATACATCATCTCTCTTCTTTATCAATCATATTTATTCTTCATCTATTATGAAGACACTATTATCTCCCAATACAAAACTTGATAGTGTCTAGTGCATAGGTTCTCGTGTTGAAGCTGTATCTTGCATGAGACCCAGTTTCTTTCTTTTTTCACTCTCTCTCTTAATTAATATAGTGCCACATAAGTTAAAAGTCCTACATGCCAATGTAGTTAATACCATAGACACCATCCTAGGTGGAGGGTTGGGACTGCCCTTAGAGCACCCGCAATGGTAAAGTAAGGTGCTCTCTATAAAACATGTGCATCTCAGCAATAGACTAGATTAATAGTAAACCACCTCAATAGTATGTCTACATGGGTATCTATAGCTTTCTAATGCATTGCCTCGTTTTTCTCTATAGACTATCTCCAGGTTAGTAGATAGTTTTGCTCTCTCTCTTCATTTAATCTCTTCCATGTAGGAAAATATACTAACATGGATATCTTGTAGAGAGCCCATTGCGGGTGCCCTTAGAAGAACAAGTTCAGTTTTCATCTAAGCAGACACCATGCATGCATGGCGGAACCATGTCTATGTGTACTCAATCAACAAATGTATTGCTCATATTTTGATTCGTAGGTTGCAAATAATTGGAGGAATAGGATCGGGGACACATCAATGCACGCGAAAGAAGAGTGCCAGCAAGTGAAAAAATGCGTTGAAATAGCTGTACGCTGCGTCGAGGTTGATAGACACAGCAGACCTGCTATAAATGACATTATCCATGAGTTGAAACAGACAGAAATTTATACTAGAGCCGTGTCGTCATCACAGGACCAGGTATGATAAATTCATAATTATGACGATGATTGAGATGTATGTATATGTTAGCTTTGCGGGAGGCGGGAGATAATAAATACTCAATTCCATTTCTAATTGATCCACACATTTTATAGAAGTACATGAAAATCAAGAAAAGCCAATAACTCTCCATACTATATTTAATTTGGTAACAACTCGATCAATGCAGTGCACTAACAGACCAAGATATTTATTATTCTCACACAGAGATATTGAATAAACTTAGTGAATGAATACTAATATGATCATCATTTGAAAATAACATAAAAATATATGATGATCAATTGGGAATATTAGAGGAAGTAGTTATTTAATGCCACATATATAAAGTCAGTGAAACTATTTCCACAATCATAAAAGTCAGTGAATGCAAAAAAAAAATTCACTCAGAAATATAATACATACTCTACTTGCCATGATTGAAATCCTTATGTTTACAAATACGTATGTGTACATCCTTGGTGAAATGCCAGAAATATTATACCTACTTTGTACAAAAAAGAACCATAAAAACTAATTTTGGTGGTAAGTACTATCGCATAAGGGTGAAAATGATACATATATTTCTGACCATACCGATACCATTTCATAAAACTAATGTAAAAATGATATCATTTCCGATCGTTTTCATTTCTAGCCATATATAAAATTTAGATTTTTTTCTAACTTTTATCAACATCATATCGAAGTTGATGCTAAATAGTTAAATTCATGAATACCAAAAATTTACGACCATACCATGACCGATTCCATAAAAGTAATAAAATAATGACATCGTTTCTGATCATTTTCATCCCTACTACTGCATGAATTGATTACATTTCACAATTGTGGACTTGCATTCACCATTGCATAGGGTGAAAATGGACGGGTATTTCCAGATAGCTTGCCCGATCTGAGACTCGCGGGAAGAATATGGAAGAGAAAATAAGGATTCCCGATACTATCCAAGTTTGAATTCGAATCCTAAAAAAAATGGGTTATGATACAAGAAGACTTGTATCCACTCATATGTCCCATATTATAGAACACATATGAAAATCTATTACAAGTCCACCTACGGACATGCATGATAAAAGGATTGGTTAATCACTATTTTACGAGCTCACGTGCAATATTGTATAATTTTCCCGTAATTTATCTCTTTTGACACTATAATTGGTTCGTTATATTTAATATTTATGAATTAGAGATGCAAATAGATATCCGTACCCGAAGCCGATTCGAAGGAAGTAATATTGGATAGGATACGGGATGAGTGATATATTGTCCGACACTACCCATTTCAGGTTCCAAATTTAAAGTAAAATATAGGTTAGGATATCCGAATGCTATAATCCAATCGTACCTGCCCATTTTCACCACTACAATTGCACACTAAATTTCCCTTTTTATAATGATTGATAAGTGTTAAATTCCTATGGCAAACAGGCATGGGTATGTTATTCTATCGTTTATTTAGGATATGAGATCAAGTGGTCTATATAGATGGGTCCTACAACAGGTGATATTAGTTGTGGTACATACCCAACAATGGTATGAACTTGTTAGGAAATAAGGTGGGCCCCACAGATATAAAAATATCACCTAATGCTAGCATGTAGGAGAGAGTTTTGAGCAAGCAAGGTTGTCAGTATCGGGATACTTGTTAGTATCGTTTTGCTCAAAGTAATATCGTATCATAGGATCGTATCGTAGTATCGGGATACTATGAGATTTTCTTTTTTTAAGTTTAATTAATATTTATATTAATTATATGTAGCCATTCTATATAAAAAAATGTAGTAATGGTATATGTCATGCAAATATAGGCATTTATTAAGAGAAACCAAGTTGGTTTTGATATATTTAACTGATTTTTATATAAATTTAAGCATATTTATTTATATTATTTTCATACCATGTTATTTTAAATAATATTTTGTAGTATCGTAGGGATCGTAGAATCGGGATACCACCTAAGATTTCGTAGGATCGTGTACTAATGAATAGTAGGATCGAGATACTATGAAAATTAGGATACTAGGTGGGATCGGTATCGTTTCGGCTTGGTAGGATCGTAGTATCGTAAGATACTAGGATACGTATCGGGATACTGACAACCTTGTGAGCAAGTGAGCAGGAGAGAGAACAGAGATGAATTATTTATTCCTTATGGGTGGTCCTTATACCTAATGCTAGCTCATCATAAGGTCATCTATAAAGATTAATTTCATAATGTATACTACCCACCCTAAAGCCTTAATTGGTTAAGACCCCCTTATGGCATACATTGTGGATGTTTTTAGAATAATCCTTGTGTAACTCGGTCCCCTTAGCAAGCTATTGGCCTGGTTTAGTTCCTAACTTTTTCTTCAAACTTTCAACTTTTCCATTACATTAAAACTTTCCTACACATGCCGTGTTTAGTTCCAAACATTTTTTTCAAACTTCCAACTTTTCCATCACATCAAAACTTTCCTACACACACAAACTTCCAACTTTTCCATCACATTGTTCCAATTTCAACCAAACTTCCAATTTTGGCGTGAACTAAACACACCCACACACAAACTTCCAATTTTGGCGTGAACTAAACACACCCATTGTTTATTATATTAATAGTTACCAATAGTATCTTTGTGAACTATGCATGCGTCCATATGACATTACCATTTTTCTTTTGAAAGCCTTCTCTTCTCAGCTACTACATACACCCCTTATTGTTTGCACTAACCAACGTCAAAGCTAGAAAAAAAGGGAGGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGGACACTCATATGGGGCACCATGGTGCCCGGGCACCATGGTTTCAAATGCACAAAATCACTCAAATTTTTCAAAATTTTCAAATTGTGAGTATATACCTAGTTATAAGAATTCGATTCATACCTATACCTATCAACAAAACAACTCAAATTTAACTTTATTTCACAATCCATGATTACATACCTAACTAATTATATGTATGGATGCTATATACCTAGAATCAAAATCTAACAAAAACAAGTTCAAATTCAGTTCAAACTTGCTTTCAACTAGTTAGTAAAGTAGTTAATATTAATACCTAAATAATTGAAAAAGTTTCATGCTCATTTGAATTGGGTATATACTTAATTTCAACAATGGTGCCCGGGCACCATGGAGCACCAAACAAATTTACTCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGGACCGGGATCAAAATTCTTAGCCCTACTGTTGATTGCTCTAGGATTTCCTTTTCCCCCTAAATCTTCCCCTAGCTGAAAGTTGAGGCGTTATGATAGAAGTACTCTTATATTTTACACTTCTAGTAGTTCATTTACACACGAAGAACAACTTTTTTACTAACCAACCGAGAACGAATCAGTGAAGGAAGTAATTTTGTTGTTCTCTTGTAATGGGACATTTATCTACGGGACAGTCAAATAATTCTAAGGTAAAACCCTGCGCTGTTACGGGAATTTATTATGATAACAATAACTAAAAATAATGTAAAAATAATGTGTAAGATAACTTAAATAACATAAGCTTATATAAACATGATTTTATATAAGTTGATGCGATTTAAATTTAAATAGTATGTAGAATAAAGATTCAAATGTAAAAGTAAGATGATATGGTTTGATGAGAGAAGAAAAGAAGAGAGACAATTTGAACCATTGATGTGATATGACTTAATAAGATAAAAGAAAAATGACATGAACTAAGTGAGGATGAACTATATATAGTATATAGGATGTTATAAAAAAATAATGGAGAGATATATTGAAATATTATGATTATGTGGGATGATTTAACATGCTTACATTTAAAATCTTTAAAATTTAATAAATTATTAAATTATAGACAATATAGCATGTTTGTATGATGCTTAAATGTAATAATTGTTAGTGAATAATGATGTGTCATCTTTGCATGTATTCTTGAGGAAGCAGTGGGTTATAACTTTGTAGTAACAGATGATTGGTCTGCACGACACCATTAACAAAATTACCAATAAATAATTCCTTTAAATATTTATATACATAACTTCTATTTTCATATTTGGTGTTCACAATGTGTTTTTTTCCCCTTGATGGCTTAACACATAGGCTAAGGTAGCCAAGATTGGGCTGTGGGGTGGAGCTGGTGGTTCCAGTCACTATGACATTGAGGTGGCACCCCGCCGGTTGGAAAGCTTGATAATTTCTAGCGGTGAGGTCATCTACTCACTTGAGTTCTCATACATTGACCACAGTGGGCAGCAGCACACATCAGGCACATGGGGCGGCTATGGCCCAAATAAAGGGAACAAACGTACTAAGGTGACTATGAATCTTATTATTCAATTCTTGCATTTTTCTTTTAGATAAAATGATTGGTATACATTCATTATCTCTGCACACAACTAGTGAAATTTATAATAGGTTTACTAGTAGTATTATGTTATTTTGAAACTTTTCTTGCAGATTCAGCTTGGTCTTATAGAGTATGTAACGGAAGTTTCTGGGACAATCGGACCATTTGATAGGGCACCCGCTGGTGTTATTACATCGCTTACGTTTATCACTAATAAGGGAAGCTACGGACCTTTTGGAGAAGTAAGAGGAACTCCTTTCCACATCCCAGTGCAGGACAATGGCAGCATTGTTGGCTTTTTTGCACGTGCTGGGTGGTACGTGGACGCTTTTGGTATCTATGTTAACCCTAAGCAGAAAACAGTAGAAGACGATGATGATGAGGTGATCAATATATATATAACTTCTAAAATGAGAAGTTGTTTCCATCTATCTATATGTGATTTTATTTTTTTTCTCACTTTTATCGAATGTTTATATACTCGTTAGGATTCCCTCGCGAAGATTGGGCCATGGGGTTGGAACGGAGGGAGTCATCGGGACATCAAGGTGGCACCACGGCGTTTGGAAAGCGTGACGATTCATAGTGGCAATGTCATCGATTCACTTGAGTTCTCCTACAGTGATCGTGATGGGCAGAAGCATTCGATAGGCCCGTGGGGCGGTCTTGGTGGAACCGCTTATACGGTGAGCACTCCATTTGTCAAAAAACAAAAAAAGATCGGATGTGACGTCACCTAGTACAAAAAATCTAACCACGTACTTCCTTCGCTAAAAAAAAACAAACCTAATTAAGATTGGATGTGACATAACCTAATACAATGAATCTAGATAGATTGTATAGATTCGGGAGTACATGCTTAACTCATTAAAATGTATTTTACCAAGCCCACCAAGTTCTAGTCCATTTTTCCTATTGCTGGATTAGTATTTTCTTTAAAAAAAAAGAAACTTGTCACCTTATACTCCCTCCAATCTACGATTTTAGAGTGTTTGTAAATGCTTGATAAACTTTTATAAAAAGAAGTATTAACATCTATCACTTCAAATAATAAACTATAAAAATGATACATATCTCATATCAAATAATATAGTTCTCTTTATAAATTTAGTCAAAGTTAGGATATGCGTTAAAAGAGTGTTTCGTATGTGCTCATAGAGTTAGGATATGCGTGTGAGTTAATAGAGATAACTATGTATGCGTTGTGAGCGTCTATATTTATTTTATTCTGTGTTTCTAAAAGAATAATCTAGGGACGGAGGACGATTTAAATTTATCTTCCACGAGACTCGACGTAGAGCAAGCCTGATGCAATTTTATTTCTTACAATTTTTTTTGTCCATGCAGATAGAGCTTGGCCCTTTGGAGTTTCTAACTGGGATATGCGGGACCATGGGCCCATTTAACGAGGCACCGGATAGGGATGTCGTCACATCACTCACGCTGATCACCAACGCCCGTAGGCGCGGTCCATTCGGACGAGGCGGAGGAAGTCCTTTCCAGATCCCGATGCGCGGCAACGGCAGCATCGTCGGCTTCTTCGGCTGCGCGGACTCCTTCGTCCATGCCATTGGCGTCTATGCCAACCCCCACCTGCAGGAAGCACCGGCACCACAGGTACAAATGACAGAAAGGATCGGGCCCGACGACCCGACTCAGGGCACAGGGTTTGGTTCAGTCTAGATATGGCACGGCTCGACTGGTGTCCAAAGCCTCATGCCGGCCCGGTCAGATTGTTAGGCCGTGACTAGGCCTCTGTCTCGGCATGCTGAGCTGGCTCGGCACGGCACAGCCCAAAATAGACTTATTTTAGCCTTATAAGGCACGGCCCGAAGATATAAAGGATGCAAGAATATACTTATTCCAGGTATATAAGATACGGCCCAAAGAGATGAGGGAGAAAATAGATTTATACCGAGGAGCACTGCAGTCTTCTGTGCATTCGTGCCGGCCCGGTACAACCCGAGTCTTATTGGGTCGTGTCTGAGCCGTTGGTGGGCCTAGACTGATGTTTAGGTCAGATTGTGCTGGCCCAACTGATCTCGGGTCAGAGCCTGGTCGTGCATTGGCTGGGCGGGGCCAGACAGCCTATTTGGCCATCAATAACAAGAAGTATAGGCATGACTAGCACTACAATTTGACATTCTGAACATAGCTATTTTTACCATTATTCTTTAGAAAAATAGAAGGAGTGTCACAATTTTCAGTATTAAACTTATAACTTGTTTGGTAACTCGAGGGAAGGGGATTGGGAGTTTACACGAGGGAATTGATGATGAGATTAAGATGTGAATTTGATTCTTAATCCCAATATCTTGTTTGGTAGAGGTGATGGAAATTAATAGGGAGTTTAGTTGAAGATTAAGTCATTATTAAAAACGGATGGATGAGATTTGCTTAGAAAAAGTAAAGGAGGAATTCCCTCCCAATTACCTGCCCCTACCCAGGTATTGAAAAGGAGGGAGTTCCTTTCTCAATTCCCAATCTCCATCCCATCAAAATTCCCATGTCTCCCAACCAAACAAAACACTTAATAGTCTCATCCCTCTAAACTCCCAATCCCTCCTAAAAATTCTCTCCAACCAAACGGCCGTTAATATAGCAATGCATGTGATACCTAGAGATATAAGTAGCGTAAAATTTTGCTGTTCCTATCTATCTCATTCCTCTGTGCTCACACACTAATCCTTCGTTTTTCTTCATTTTTGGTAAATTAGACTGGGCTTACCAGGATTGGGCCATGGGGTAGAAGTGGAGGTGAGTCCCACTACGTCGATGCACCGGAGCCACATCGTCTAGTGAGTGTGACTATCCGTAGTGGTGACGTCATCGATTCTATTGAGTTCTCATATGCCGACCATGACGGAAGTGAGCAAGTTGTTGGTCCATGGGGTGGTCCTGGTGGCAATGCGTATAAGGTTAGTGGACGAATATATATATTTTTTCAATCGGTCTGTCATCGATATATACTCTCTCTGTTCCTAGATATTTGACGTCGTTGATTTTTTTAAACATGTTTATTAAATCTTATTCAAAAGTTTCTGAATAAGAAAAACGGTTAAACATGTTTAAATAGTCAACGGCGTCGAGGGATAGAGAGAGTATATACATTTATCTTGGGGTAGAATGTAACGTACCCCATTGCATTGTCTCTCGCAGATTGAACTGATGCCTCTGGAATCACTTCAGGGGATCACCGGAACGTTCGGTCCCTTGGATGCAGCGTCACCTGACACAGTCGTCATTACCTCGCTCACGTTCTCCACGAACCAATGCCTCAGCTACGGGCCGTTTGGGCAAGGCGCCGGAGGCGGAGGGACTCCATTCACGGCTCCGGGGGAGAGCGACGGGTGCATTGTCGGCTTCTTCGCCCGCGCGGGGTGTTACCTCGATGCGCTCGGGGTGTACACTCGCACGGACGCCCAACTTTACTAG
More
|
||||||||||
| CDS seq | ATGCCAACTGATCTACCGGTACATTTTCTAGAAGATATTACGAAAAAATTCTCCGATCACCAAATAGTTGGTAGTGGTGGCTATGGTCAGGTTTACAAGGTTGCAAATAATTGGAGGAATAGGATCGGGGACACATCAATGCACGCGAAAGAAGAGTGCCAGCAAGTGAAAAAATGCGTTGAAATAGCTGTACGCTGCGTCGAGGTTGATAGACACAGCAGACCTGCTATAAATGACATTATCCATGAGTTGAAACAGACAGAAATTTATACTAGAGCCGTGTCGTCATCACAGGACCAGGCTAAGGTAGCCAAGATTGGGCTGTGGGGTGGAGCTGGTGGTTCCAGTCACTATGACATTGAGGTGGCACCCCGCCGGTTGGAAAGCTTGATAATTTCTAGCGGTGAGGTCATCTACTCACTTGAGTTCTCATACATTGACCACAGTGGGCAGCAGCACACATCAGGCACATGGGGCGGCTATGGCCCAAATAAAGGGAACAAACGTACTAAGATTCAGCTTGGTCTTATAGAGTATGTAACGGAAGTTTCTGGGACAATCGGACCATTTGATAGGGCACCCGCTGGTGTTATTACATCGCTTACGTTTATCACTAATAAGGGAAGCTACGGACCTTTTGGAGAAGTAAGAGGAACTCCTTTCCACATCCCAGTGCAGGACAATGGCAGCATTGTTGGCTTTTTTGCACGTGCTGGGTGGTACGTGGACGCTTTTGGTATCTATGTTAACCCTAAGCAGAAAACAGTAGAAGACGATGATGATGAGGATTCCCTCGCGAAGATTGGGCCATGGGGTTGGAACGGAGGGAGTCATCGGGACATCAAGGTGGCACCACGGCGTTTGGAAAGCGTGACGATTCATAGTGGCAATGTCATCGATTCACTTGAGTTCTCCTACAGTGATCGTGATGGGCAGAAGCATTCGATAGGCCCGTGGGGCGGTCTTGGTGGAACCGCTTATACGATAGAGCTTGGCCCTTTGGAGTTTCTAACTGGGATATGCGGGACCATGGGCCCATTTAACGAGGCACCGGATAGGGATGTCGTCACATCACTCACGCTGATCACCAACGCCCGTAGGCGCGGTCCATTCGGACGAGGCGGAGGAAGTCCTTTCCAGATCCCGATGCGCGGCAACGGCAGCATCGTCGGCTTCTTCGGCTGCGCGGACTCCTTCGTCCATGCCATTGGCGTCTATGCCAACCCCCACCTGCAGGAAGCACCGGCACCACAGACTGGGCTTACCAGGATTGGGCCATGGGGTAGAAGTGGAGGTGAGTCCCACTACGTCGATGCACCGGAGCCACATCGTCTAGTGAGTGTGACTATCCGTAGTGGTGACGTCATCGATTCTATTGAGTTCTCATATGCCGACCATGACGGAAGTGAGCAAGTTGTTGGTCCATGGGGTGGTCCTGGTGGCAATGCGTATAAGATTGAACTGATGCCTCTGGAATCACTTCAGGGGATCACCGGAACGTTCGGTCCCTTGGATGCAGCGTCACCTGACACAGTCGTCATTACCTCGCTCACGTTCTCCACGAACCAATGCCTCAGCTACGGGCCGTTTGGGCAAGGCGCCGGAGGCGGAGGGACTCCATTCACGGCTCCGGGGGAGAGCGACGGGTGCATTGTCGGCTTCTTCGCCCGCGCGGGGTGTTACCTCGATGCGCTCGGGGTGTACACTCGCACGGACGCCCAACTTTACTAG
More
|
||||||||||
| Protein seq | MPTDLPVHFLEDITKKFSDHQIVGSGGYGQVYKVANNWRNRIGDTSMHAKEECQQVKKCVEIAVRCVEVDRHSRPAINDIIHELKQTEIYTRAVSSSQDQAKVAKIGLWGGAGGSSHYDIEVAPRRLESLIISSGEVIYSLEFSYIDHSGQQHTSGTWGGYGPNKGNKRTKIQLGLIEYVTEVSGTIGPFDRAPAGVITSLTFITNKGSYGPFGEVRGTPFHIPVQDNGSIVGFFARAGWYVDAFGIYVNPKQKTVEDDDDEDSLAKIGPWGWNGGSHRDIKVAPRRLESVTIHSGNVIDSLEFSYSDRDGQKHSIGPWGGLGGTAYTIELGPLEFLTGICGTMGPFNEAPDRDVVTSLTLITNARRRGPFGRGGGSPFQIPMRGNGSIVGFFGCADSFVHAIGVYANPHLQEAPAPQTGLTRIGPWGRSGGESHYVDAPEPHRLVSVTIRSGDVIDSIEFSYADHDGSEQVVGPWGGPGGNAYKIELMPLESLQGITGTFGPLDAASPDTVVITSLTFSTNQCLSYGPFGQGAGGGGTPFTAPGESDGCIVGFFARAGCYLDALGVYTRTDAQLY |
||||||||||
| Function | Mannose/glucose-specific lectin (Fragment) [UniProtKB/Swiss-Prot:P83304] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsNip_04g0369100 | OsNip_04t0369100-00 | Chr04 | 17929442 | 17940263 | + | RAP2018-11-26 | ||
| CDS seq | ATGCCAACTGATCTACCGGTACATTTTCTAGAAGATATTACGAAAAAATTCTCCGATCACCAAATAGTTGGTAGTGGTGGCTATGGTCAGGTTTACAAGGTTGCAAATAATTGGAGGAATAGGATCGGGGACACATCAATGCACGCGAAAGAAGAGTGCCAGCAAGTGAAAAAATGCGTTGAAATAGCTGTACGCTGCGTCGAGGTTGATAGACACAGCAGACCTGCTATAAATGACATTATCCATGAGTTGAAACAGACAGAAATTTATACTAGAGCCGTGTCGTCATCACAGGACCAGGCTAAGGTAGCCAAGATTGGGCTGTGGGGTGGAGCTGGTGGTTCCAGTCACTATGACATTGAGGTGGCACCCCGCCGGTTGGAAAGCTTGATAATTTCTAGCGGTGAGGTCATCTACTCACTTGAGTTCTCATACATTGACCACAGTGGGCAGCAGCACACATCAGGCACATGGGGCGGCTATGGCCCAAATAAAGGGAACAAACGTACTAAGATTCAGCTTGGTCTTATAGAGTATGTAACGGAAGTTTCTGGGACAATCGGACCATTTGATAGGGCACCCGCTGGTGTTATTACATCGCTTACGTTTATCACTAATAAGGGAAGCTACGGACCTTTTGGAGAAGTAAGAGGAACTCCTTTCCACATCCCAGTGCAGGACAATGGCAGCATTGTTGGCTTTTTTGCACGTGCTGGGTGGTACGTGGACGCTTTTGGTATCTATGTTAACCCTAAGCAGAAAACAGTAGAAGACGATGATGATGAGGATTCCCTCGCGAAGATTGGGCCATGGGGTTGGAACGGAGGGAGTCATCGGGACATCAAGGTGGCACCACGGCGTTTGGAAAGCGTGACGATTCATAGTGGCAATGTCATCGATTCACTTGAGTTCTCCTACAGTGATCGTGATGGGCAGAAGCATTCGATAGGCCCGTGGGGCGGTCTTGGTGGAACCGCTTATACGATAGAGCTTGGCCCTTTGGAGTTTCTAACTGGGATATGCGGGACCATGGGCCCATTTAACGAGGCACCGGATAGGGATGTCGTCACATCACTCACGCTGATCACCAACGCCCGTAGGCGCGGTCCATTCGGACGAGGCGGAGGAAGTCCTTTCCAGATCCCGATGCGCGGCAACGGCAGCATCGTCGGCTTCTTCGGCTGCGCGGACTCCTTCGTCCATGCCATTGGCGTCTATGCCAACCCCCACCTGCAGGAAGCACCGGCACCACAGACTGGGCTTACCAGGATTGGGCCATGGGGTAGAAGTGGAGGTGAGTCCCACTACGTCGATGCACCGGAGCCACATCGTCTAGTGAGTGTGACTATCCGTAGTGGTGACGTCATCGATTCTATTGAGTTCTCATATGCCGACCATGACGGAAGTGAGCAAGTTGTTGGTCCATGGGGTGGTCCTGGTGGCAATGCGTATAAGATTGAACTGATGCCTCTGGAATCACTTCAGGGGATCACCGGAACGTTCGGTCCCTTGGATGCAGCGTCACCTGACACAGTCGTCATTACCTCGCTCACGTTCTCCACGAACCAATGCCTCAGCTACGGGCCGTTTGGGCAAGGCGCCGGAGGCGGAGGGACTCCATTCACGGCTCCGGGGGAGAGCGACGGGTGCATTGTCGGCTTCTTCGCCCGCGCGGGGTGTTACCTCGATGCGCTCGGGGTGTACACTCGCACGGACGCCCAACTTTACTAG
More
|
|||||||
| Protein seq | MPTDLPVHFLEDITKKFSDHQIVGSGGYGQVYKVANNWRNRIGDTSMHAKEECQQVKKCVEIAVRCVEVDRHSRPAINDIIHELKQTEIYTRAVSSSQDQAKVAKIGLWGGAGGSSHYDIEVAPRRLESLIISSGEVIYSLEFSYIDHSGQQHTSGTWGGYGPNKGNKRTKIQLGLIEYVTEVSGTIGPFDRAPAGVITSLTFITNKGSYGPFGEVRGTPFHIPVQDNGSIVGFFARAGWYVDAFGIYVNPKQKTVEDDDDEDSLAKIGPWGWNGGSHRDIKVAPRRLESVTIHSGNVIDSLEFSYSDRDGQKHSIGPWGGLGGTAYTIELGPLEFLTGICGTMGPFNEAPDRDVVTSLTLITNARRRGPFGRGGGSPFQIPMRGNGSIVGFFGCADSFVHAIGVYANPHLQEAPAPQTGLTRIGPWGRSGGESHYVDAPEPHRLVSVTIRSGDVIDSIEFSYADHDGSEQVVGPWGGPGGNAYKIELMPLESLQGITGTFGPLDAASPDTVVITSLTFSTNQCLSYGPFGQGAGGGGTPFTAPGESDGCIVGFFARAGCYLDALGVYTRTDAQLY
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0369066 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.328228 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g30040 | RBH | 0.068822 | 0.070195 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0369100 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0009970 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0010730 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0010520 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0010130 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0010360 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0293900 | RBH | 0.002862 | 0 | 0.004476 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0009990 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0281400 | RBH | 0.0234395 | 0 | 0.020942 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0010180 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0010230 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0010730 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0010290 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G009430 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0009460 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.459822 |
