Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsNip_03g0658800 OGI:03073400 | 16/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) Chr03:25746127-25760738
Gene Symbol CYP87C2, OsCYP87C2
DNA seq

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Function Cytochrome P450 87A3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XU38]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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OsNip_03g0658800 OsNip_03t0658800-03 Chr03 25746145 25760690 - RAP2018-11-26
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNip_03g0658800 OsNip_03t0658800-02 Chr03 25759890 25760692 - RAP2018-11-26
CDS seq

ATGGAAGGTATCCATGCAGGGACGGTGACGATGGCCTGCAGCTGGCTTGTTCTCACGGCCGCCATGGCTGTGCTAGCCTCTTGGTTGATCCGTTTGGTTTCACTAAAATGGAACAGCAGCCACCCATGCAAAGCTGATGAAGGCAGCAGGCTGCCGCCAGGGTCGAGGGGCCTTCCTCTTCTCGGCGAGTCGCTCGAGTTCTTCACTTCGAGCACCTCTCTTGAGCTGCCCGTCTTCTTTAAGCGCCGTCTTAATAGGTAA

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Protein seq

MEGIHAGTVTMACSWLVLTAAMAVLASWLIRLVSLKWNSSHPCKADEGSRLPPGSRGLPLLGESLEFFTSSTSLELPVFFKRRLNR

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os03g45619 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os03g0658800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_03g0028700 RBH 0.0 0.0 2.720849
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_03g0028400 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_03g0028510 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_03g0028590 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_03g0028240 RBH 0.0 0.0 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_03G0447300 RBH 53.632488 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_03g0027950 RBH 0.000000 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_03G0447300 RBH 51.2235835 0 0.01251
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_03g0028320 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_03g0028370 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_03g0028380 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_03g0028160 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_03g0028110 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_03G028090 RBH 0.000000 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_03g0028100 RBH 0.0 0.0 0.0
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