Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsNaBo_01g0026480 OGI:01080540 | 16/16 NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:26769691-26794577
Gene Symbol GELP18, OsGELP18, OsGELP18a, OsGELP18b, GELP19, OsGELP19, GELP20, OsGELP20, OsGELP20a, OsGELP20b, OsGELP20c, GELP21, OsGELP21, OsGELP21a, OsGELP21b, OsGELP21c
DNA seq

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Function GDSL esterase/lipase At1g28600 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q94F40]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNaBo_01g0026480 OsNaBo_01g0026480.01 Chr01 26769691 26794577 + NAM
CDS seq

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Protein seq

MGLPFLRPYWGGQTAGDFASGANFAVGGATALGPDFFRERGVPTDDGVVHLEMEMGWFRDLLDMLCAGDMDGCKGMMNQSLFLVGEIGGNDYNYPLMSGVPIEKIRSFTPSVIAKISSTITELIGLGAKTLVVPGNLPIGCIPTYLMQFESDKKEDYEPEIGCLRWMNEFSQYHNKLFIDELENLRKLHPDVAIIYTDYYGAAMEIFLSPEQFGIEDPLVACCGGGGPYGVSASAGCGYGEYKVCDDPSKYASWDGFHPSEAAYKGIAIGLLQGPYTQPPIASITDSCLQIIGLGSSAERKVIYDMMVSSTSGGLSPPAVVLAVAVVLSAAASRALAAPCYPRVFCFGDSLTDTGNIAFLYGNDSRRPSLWPPYGETFFHRATGRSSNGRLIIDFIAEAMGLPFVRPYWGGQTAGNFASGANFAVGGATALSPDFFRERGVPMDDDTVHLDMEMEWFRDLLGMLCTGGDMDGCKGMMNQSLFLVGEIGGNDYNLPLMSGMSIEKIRNFTPSVIAKNSSIITELIGLGAKTLVVPGNIPIGCIPMYLMQFESDKKEDYEPKIGCLRWMNEFSQYHNKLLVDELENLRKLHLDVTIIYADYYGAAMEVFLSPERFGIEDPLVACCGGRGPYGVSASVRCGYGEYKVCDDPAKYASWDGFHPSEAAYKGIAIGLLQGSYTQPPIVSITNSCPQIIGLGSSVEHKAMYDLGNRQMATERKNGFLYLREKRRAAAVVLAAVAVLLSASQALAAPCYPRVFSFGDSLTDTGNIAFLYGNDSRRPTLWPPYGETFFHRATGRASNGRLIIDFIDLEIARVALAAADALGLPFVRPYWSGRTAGDFAHGANFAVGGATALSPDFYRERGVHVRDTVHLDMEMNWFRDLLGLLCPDDLADCNDMMNQSLFLVGEIGGNDYNHPLICGELIRLGAKTLVVPGNLPIGCIPYYLMIFKSGKKEDYEPETGIENPLAACCGGGGPYGVSETARCGHGEYKVCDDPQLYGSWDDYHPSEAVFKAIAIGLLRGSYTQAPLACPQITELGSSVEYKVLYDL

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.654104 7.074429 0.962583

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0650100 RBH 0.333986 0.0 0.397315
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g46120 RBH 0.000000 0.353778 0.213710
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0649400 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0027360 RBH 0.0 0.0 1.586856
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0026840 SBH 0.259659 0.0 1.883463
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0027300 RBH 0.436857 0.0 7.933193
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0026540 RBH 0.000000 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0026290 RBH 3.381404 0.000000 7.553514
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0440300 RBH 10.460499 8.50375 0.653802
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0025970 RBH 0.086698 0.197365 0.445620
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0429200 RBH 7.143577 3.1961245 0.477725
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0026220 SBH 0.108131 0.145926 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0026120 SBH 0.460061 39.808311 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0026450 RBH 3.212515 6.024920 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0026510 RBH 0.427600 0.0 0.260124
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0026350 SBH 1.150223 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G026720 RBH 0.280848 0.000000 0.649896
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0026500 RBH 1.870623 9.602602 11.271278
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