Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsN22_12G008830 | OGI:12026680 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr12:9620681-9631618 | ||||||||
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Function | Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R8L1] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsN22_12G008830 | OsN22_12G008830_01 | Chr12 | 9620681 | 9631618 | - | NAM | ||
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.336031 | 0.323068 | 0.415770 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_12g0272800 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os12g17480 | RBH | 0.061014 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os12g0272800 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_12g0009030 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_12g0009200 | RBH | 0.030515 | 0.000000 | 0.348653 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_12g0009150 | SBH | 0.709560 | 3.923890 | 4.931050 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_12g0008980 | SBH | 0.0 | 0.206512 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_12g0008810 | RBH | 0.831184 | 1.238415 | 1.715209 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_12G0137800 | RBH | 0.0730815 | 1.0353395 | 0.643265 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_12g0008840 | RBH | 0.059240 | 0.050789 | 0.263348 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_12G0151300 | RBH | 0.116274 | 2.3399135 | 0.2849305 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_12g0008780 | RBH | 0.055553 | 0.034081 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_12g0009020 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_12g0008970 | RBH | 1.369920 | 1.180681 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_12g0008950 | RBH | 0.142618 | 0.0 | 0.236559 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_12g0009090 | RBH | 0.181501 | 1.909350 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_12G008820 | RBH | 0.333200 | 1.206500 | 0.120301 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_12g0008750 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.750651 |