Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsN22_11G017780 | OGI:11010520 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:23115120-23148397 | ||||||||
Gene Symbol | XA21, Xa21*, Xa21, OsXA21, XA3, Xa-3, Xa3 (Xa4b, Xa6, Xa9, Xa w), Xa3, Xaw, Xa4-b, XA26, Xa26(t), Xa26(t)*, Xa26, RKb, MRKb, MRKB, TRKb, Xa3/Xa26 | ||||||||||
DNA seq | 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||||||||||
Function | Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R2D5] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsN22_11G017780 | OsN22_11G017780_01 | Chr11 | 23115120 | 23148397 | - | NAM | ||
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|
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsN22_11G017780 | OsN22_11G017780_03 | Chr11 | 23143871 | 23144101 | - | IsoSeq | ||
CDS seq | ATGGCACTGAAGTATGTCTCACTTGTAATTTGGACATCTGAGAGCAAA |
|||||||
Protein seq | MALKYVSLVIWTSESK |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
A3 | Chr11 | 23147779 | 23148198 | - | OsN22_11G017780_01 | OsN22_11G017780_02,OsN22_11G017780_01 | All |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.712022 | 0.345214 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0559200 | RBH | 0.222809 | 0.083266 | 1.098986 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g36160 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.170626 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0569600 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0017790 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.416277 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0017960 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0017730 | SBH | 0.0 | 0.732895 | 2.030220 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0017420 | RBH | 0.0 | 0.033064 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0017780 | RBH | 0.347210 | 0.0 | 0.746363 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0327400 | RBH | 0.0125645 | 0.364583 | 0 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024900 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0336200 | SBH | 0.3060335 | 0.03045 | 0 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0018090 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0018220 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0017340 | RBH | 0.0 | 1.023452 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0017510 | RBH | 0.125744 | 0.0 | 0.043038 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0017710 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G017770 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.331573 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0017920 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |