Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_11G017780 OGI:11010520 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:23115120-23148397
Gene Symbol XA21, Xa21*, Xa21, OsXA21, XA3, Xa-3, Xa3 (Xa4b, Xa6, Xa9, Xa w), Xa3, Xaw, Xa4-b, XA26, Xa26(t), Xa26(t)*, Xa26, RKb, MRKb, MRKB, TRKb, Xa3/Xa26
DNA seq

TCACATGATGGATGCCATCGAGAGAGACTCTTTGATGTCATGCAGTTCACTGATGACATCTCCGGTTTGCATTCTACTCGATGGCAATTCCTGAGAGCAAGACAACCCAAGTCTAAGCAGTGAAACAAGGCACTCATTGATTTCTTTGCATGGAGAAATATCTGGAGTCTGAACCCAACTCTTCGAATCCAAAACGAGCTTCCTGTCAACAACATCCATCAGTCTACCATGTAGACCCGGTTCAACATACTGACGGAGGCTCAATCCAGGTCCGAATGTAGGGCCTGTTTGGTTGGTGCCCTGAGCAAGGTGCCTGAGAAAAATATAAGCCTGTGTGGAAGAAAAACTTGAGGTTATACTTGCCTGGCCAGGCATCCTATGAAATGTGTTGTTTGGTTGGTGACTTTGGCCTGAGAAATTGAATCAAGTGAAAGCAAACAGAGAAAGAATAAAATATTCAGAACTCAAGTATTTAGTACAAGCAACCAGTACTACATGTTGACACATGGCATGACTATTCCAATTTGAACCAACTTTTCCTCTTAACCTAGTTGCCTGACTCAGGCCACCATATTCCTACGCCTGAGCCTGAGCTCACTCGCCTGTGTCAGGCTACTTCTTAGAATGCCAACCAAACAAATGCATGGAGACAATCCGGCAGGCTTCAGGCCAGGCAAGTTTGCTCCAGGGCAGCAACCAAACACGCTCGTAGTATCGGTTGGTCGCTTTCCGCTTACTGTTTCCAACACTAGAATTCCGTAACTATAAATATCTCCATGTGTGGACGCAATGTTCCCGACACCATACTCTGTTCCAGTAGGAAAAAAACTGTATCTTTTAAACATGTACAATTTGAAATTTAATTACTACTCCCTCCATTCTATAATATAAGGCACAACCACTTTTCTTAGATGTTCCATAATACAAGGCATACATGCAAGCATGCAATTAAATATGACATCTTCTCCATTAAATTATTACTTTTTTAAATCTTCCACTCTTATGTTATTTAATCCTATTGAATGCATGTATTATATTTATTAGGATGATTCAAACTACAAGATGATAATAATTATTTCTTAGTCTTCGGGTTAAGAGTAGCTGTGCCTTATATTTTGGAATGGAGGGAGTATAACGATATAATATAGGGTTGCATCGCTGAAACTGATATAATAATCTGCATTAAATTACATGTGAGATATTGGAAATAACAAATAAATTAAATATTTAATAATCTAATTTGTAGAATTATATATTCAAATAAAGTTTCTATAATTGAACTATAGGTTAAACCAAGCAATGAAATAATTCTTGAATATATAGTTCTTTGAGGGATATGAACTTCTCCGTAAAGAAATAATTCATAAATATATAGTTCTTTGATGTTATGAAAAGTTAGCGTAGTACTTCTCCATCCAAGAGAGTTATACCTATTACATATTTTAGTTTTTTCAAATGCGTTATTCCTATTTGTATTCTTTATGCATCCAAAACTAAAATAGAGAGGTAAATTAAATGTTTGATTAGAATCCGGGGAGTTATCTTAATACTCATTGGTTGCATGGGTGCATACACTCCTTGATCTTTGTTACATGAATGATGAGTTAATTTCTCCTTCGTCTTAGTGATAAAAGTAATAGTTGTAACTTTTGTGGAAGGAGGGAATATTGTAAAATTTTTCTCAAACTAAACGATTCAAAATCCTCCATTAGTGGGGTAGAAAAAAATCCACAAGTTGGTTTGAGTGTGTAACTCTAGAAAAGTCTGTAGCTACGAAATTGATTTAGTAACTTGATAGATAATATGGAAAATTACATTAACTTATGTGCAATTTATTCCAACTAATTACTTCAATTCTCCATTAATATCTCTAGGATCAAACATTATTTCATACAGCACTAGAGAGTAGAAAGGCAAAAAAAAAAAAAAAACAGTTTAGGCTTAACCTGGTGCTGTGTAACCAATTGTCCCTCTGAATCCCATCGAGCTTGTTGACTGTTGCATCAATGAGCTTTCCTCAACTAGAATTCTTGCAAGTCCAAAGTCTCCAACATGGGCTACCATGTCAGCATCTAACAACACATTACTTGATTTAATATCACAATGTACAACAGATTCAGGTCCAAGGCAGTGAAGATAGTCCAATGCACAGGCGACATCAAGTAGTATGTTCACTCTTTGATGCAAATTTAAGTGCCTCTGCTCTGCTTGATCACAATTTGTTTCAGGGTGTAGCCAATCTTCTAGACTGCCGTTGGGCATGAAGTCATACACAATTGCTTTGAAATCATTCCCTTTGTTATCAATGCTTGAGCAAATAGTAACTATCTTGACAAGATTCCGATGACGCATATTTCGTAGTGCTTCACATTCGGCAGTGAAACTCTTGACTGCCTTAGGAGTTTCAAGCTTTAGTACCTTGACTGCAACAGAACTTGTATTTTCACCATGTTGGCTATCAAGTTCTCCTTTGTAAACAGAGCCAAAGGATCCAGAACCCAACAAATTGGCTGGTGAAAAACCATCTGTTGCTTTTACCAGCTGCTTGTAAGTGATCATTGGGTGGCCTTGGATGGATGTTGTAGCAGGGACTTCTTTCTTTCTTCTCTTATGACAAGTTAGAAGCATGTAGAGTAATGAAAAGATCGCAAGTGTCGAAACGAGACAGATAATAAGAGCTAGCAGTAGAATTTGATATTTCTTTTTCTTTGTTGATTTTAAGGAACACTGCGGAAGACGTAGTTCAGGTATGCCACCGCAAATATTGGCATTGCCTTGGATGTAAATTTCAGTAGCATTTGCAAAAACACCATTGGTTGGCACTTCACCTTGAAAGCTGTTGAATGAAAGGTTCAGCGAGTGGAGCAGAGGCATGTCCCCTAAGGACTTGGGTATCTGACCTGACAAATTGTTCCCTGAGAGATCAAGTGTGTCAAGACCTGCCAACTGAGTCAGAGCAATTGGGATGTTGCCATTTAAGAAATTGTTTTGCAGGGAGAGATGCTGTAGAAGTTGGCATCCACTAATGGTGCTGGGGATTTCACCCGATAATTTGTTCGAATCCGCATGGAATTCAACAATATTTTTGAGTTCCCCTATTTCTTTTGGTACTGATCCCTCCAATTTATTATGGGACACATCCAAAGTTTCAGAGAGTGTGGGAATGCTAAATATTTCAGTGGGAATTGCTCCTATAAAGTTATTGTGGGCAAGATTTAGTTCAAACAACCTGGTCATGTTTCCAAGTGTGCTTGGTATTGTGCCACTGAAGGCATTACCATAGAGCTCCAAGTTAGTTATTTGTGTAAGATTACCGATGGTCAATGGCAGATAACCACTTAATTTGTTGTTGAATAGAATGAGACGATGCAAATTTTTAAGCTTGCTGAAGGAAGATGGAAGAGATCCTGTCAAGGAGTTGTTAAAGAGAACAAGGGATTCTAGATTAACGAGATTACCAATATCTCTAGGCAAGCTTCCTGAAATTTTATTGGCTCCAATAGAGAGATATACTAGTGATGAGGAAAGATTGGAAACAGAGTCAGGAAGAACACCACCAAACTTGCAGGCACCCATTTCTACGTGTTGGAGATTGGAGCAATTCGTCAATGCCGTCATGAATTTCCAATCGTTTGGTCCTTCAGCTTCCAGAAGAGTTTCCGCAAGAACCAGCGTGCCGAGATTTCTCAGCCTCCCGATTTCCTCAGGAACAACACCGCTAAAAGAATTAACACCAAAGGTAAGCATGGAGATGTTGGAAGCATTAGCTACTGATGCAGGGATATGTCCATGAAACTGGTTGTTATCCATGTATACCTCTTGGAGATGGGGAAGTGTACTGAATGCATTTGCAGGAAGCATACCACTCAGCATGTTGTACTGGACACCGAACACGGTGAGAGAGGAGATGTTCCAAATAGGATCCGGGATCACTCCACTTAAATTGTTAGAGCTTAAGTGCAGGGAAGACAATCTGGACAATCGACCCAGAGATGAAGGGATTGCTCCAGACAGCGTGTTGTCAGACAGAGCAAGCTCCAAGAGGCTGTTGAGATTGCCCAAGCACGAAGGGATTGTTCCAGACAGTGTGTTCTTGTTCAGATAGAGAGAGGAGTGTTAGATCTTATCATATCTTATCATTCTCTGTATGGATATGCACGGATGCATGTTGGTTCGGATAGATAGAGGATAGGACTCTAATCCCTTGTAATTAGGATCACCGAACCAACACATCTGCATGCATATATATCTGTAAACTCAGCGCGTTTTTGCGTATAGTGAATCAACACGAAACCCTGCGTCCACCGTGACGCTTTCCTGCATACACCTGAGTTTTATATGGTAGCAGAGCCTCAAAGTCCGGCGTGATCTGCAAGTTCGGCATGATGGCAGGTTCCTCGTCAAGCACTGCCTCCACCAATCCTCTCTTTGGCGTTCAAGTTTCAGAGAAACTGACCAAAGAAAACTATGCGCTCTGGTCGGCGCAAGTCCTGGCCGCGATACGCGGCGCCCGTCTTGATGGCCACATCACCGGCGCCACCGCCGCTCCATCCATGGAGATCGAGAAGACGGCGAGCGACAAGACGACGGAGAAGATCGTCAACCCCGCCTACCAGGAGTGGTTTGCCTCGGACCAACAGGTCCTAGGCTTCCTTCTCTCCACGCTGTCATGAGACATTCTCACCCAAGTGGCGACGGCATCCACGGCGGCGCAGGCATGGCAGTAGGTGTGCGCCATGTTCACTGCACAAACCAAAGCCCGGTCGCTCAACGTCCGGCTTACTCTCACCAATACCCAGAAAGGTAACATGAGAATATCTGAGTATTGTGGCAAGATGAAAGCACTAGTAGATGAAATCGCTAGTTCAGGGAAACCCCTTGATGAGGAAGATTTACTCGCTTATGTTCTAAATGGGCTAGATGATGATTTTGAACCTGTTGTATCTGCTATTGTGGCACGCAATGAGTCGACCACAATGGCGGAAGTGTACTCTCAGCTT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Protein seq

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Function Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R2D5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

MASRLESERMNPIIQKSTAEVMQRRIIGCFSVSVSPSHLTIYLGRFPMNVKSVVLGCIFMKRTLTKDWCETTRSSSNATADELALLSFKSMFASDGSLASWNKSIHYCSWPGVVCSRRHPERVISLRLGSSRLSGLLSPFLGNLSFLKILDLHDNRLVGSIPPELGRLSRLRLLNLSTNSLQGNIPVALVGCTNLSLLHLSDNQFQGEFPTEIGASLKNLVLLNVEKNGFSGEIPRSLADLPLLEELNLRVNRFSGEIPPALGNLTNLWILDLDYNRLSGAIPSSLGKMSGLSRLTLSSNNLTGLIPSSIWNNMSALMAFTVQQNSLSGTIPPNAFSNFPSLQLIGMDHNKFHGSIPTSIANASHLWLVQLGANFLSGIVPPEIGGLRNLKILQLSETFLEARSPNDWKFITALTNCSQFSVLYLASCSFGGVLPDSLSNLSSLTNLFLDTNKISGSIPEDIDNLINLQAFNLDNNNFTGHLPSSIGRLQNLHLLSIGNNKIGGPIPLTLGNLTELYILQLRSNAFSGLNLSNNNLEGSIPQQIGNLKNLVNLDARSNKLSGEIPTTLGECQLLQNIYLQNNMLTGSLPSLLSQLKGLQTLDLSSNNLSGQIPTFLSNLTMLGYLNLSFNDFVGEVPTLGVFLNASAISIQGNGKLCGGVPDLHLPRCTSQAPHRRQKFLVIPIVVSLVATLLLLLLFYKLLARYKKIKSKIPSTTCMEGHPLISYSQLARATDSFSATNLLGSGSFGSVYKGELDKQSGQSKDIIAVKVLKLQTPGALKSFTAECEALRNLRHRNLVKIITACSSIDNSGNDFKAIVFDFMPSGNLEGWLHPATNNPKYLNLLQRVGILLDVANALDYLHCHGPTPVVHCDLKPSNVLLDAEMVAHVGDFGLAKILFEGNSLLQQSTSSMGLRGTIGYVPPEYGAGNTVWTQGDIYSYGILVLETVTGKRPTDKKFIQGLSLREYVELGLHGKMMDVVDTQLSLHLENELRTTDEYKVMIDCLVSLLRLGLYCSQEIPSNRMSTGDIIKELNAIKQTLFTGGVAGDELALLSFKSSLLHQGGLSLASWNTSGHGQHCTWVGVVCGRRRRHPHRVVKLLLRSSNLSGIISPSLGNLSFLRELDLSDNYLSGEIPPELSRLSRLQLLELSGNSIQGSIPAAIGACTKLTSLDLSHNQLRGMIPREIGASLKHLSNLYLHTNGLSGEIPSALGNLTSLQYFDLSCNRLSGAIPSSLGQLSSSLLTMNLRQNNLSGMIPNSIWNLSSLRAFSVSENKLGGMIPTNAFKTLHLLEVIDMDTNRFHGKIPASVANASHLTRLQIDGNLFSGIITSGFGRLRNLTTLYLWRNLFQTREQEDWGFISDLTNCSKLQTLDLGENNLGGVLPNSFSNLSTSLSFLALDLNKITGSIPKDIGNLIGLQHLYLCNNNFRGSLPSSLGRLRNLGILVAYENNLSGSIPLAIGNLTELNILLLGTNKFSGWIPYTLSNLTNLLSLGLSTNNLSGPIPSELFNIQTLSIMINVSKNNLEGSIPQEIGHLKNLVEFHAESNRLSGKIPNTLGDCQLLRYLYLQNNLLSGSIPSALGQLKGLETLDLSSNNLSGQIPTSLADITMLHSLNLSFNSFMGEVPTIGAFADASGISIQGNAKLCGGIPDLHLPRCCPLLENRKHFPVLPISVSLVAALAILSSLYLLITWHKRTKKGAPSRTSMKGHPLVSYSQLVKATDGFAPTNLLGSGSFGSVYKGKLNIQDHVAVKVLKLENPKALKSFTAECEALRNMRHRNLVKIVTICSSIDNRGNDFKAIVYDFMPNGSLPEALESASKSDHTLLDVACALDYLHRHGPEPVVHCDVKSSNVLLDSDMVAHVGDFGLARILVDGTSLIQQSTSSMGFRGTIGYAAPEYGVGHIASTHGDIYSYGILVLEIVTGKRPTDSTFRPDLGLRQYVELGLHGRVTDVVDTKLILDSENWLNSTNNSPCRRITECIVSLLRLGLSCSQDLPLSRTPTGDIIDELNAIKQNLSGFDDDAAAAAVPTGGAAADELALLSFRSSLVSQGGSSLASWNTTSGHGQHCTWAGVACGGRRDRVVELRLRSFNLSGTISPSLGNLSFLAKLHLGGNHLSGEIPPELGRLGRLRWLNLSGNSLQGSIPAAIGGCLRLIEMDLTINQLRGKIPLQIGASMKNLAYLYLEGNRLSGQIPRSLAELPSIQELSLGSNGLSGEILPALGNLTGLSFLSLLLELALSDNTLSGAIPSSLGRLSRLSSLHLSSNNLSGVIPDPIWNISSLTVFGVQYNMLSGMLPANAFSTLPHLQEVYMDNNQFHGHIPASVANASNISMLTFGVNSFSGVVPEEIGRLRNLGTLVLAETLLEAEGPNDWKFMTALTNCSNLQHVEMGACKFGGVLPDSVSNLSSSLVYLSIGANKISGSLPRDIGNLVNLESLVLFNNSLTGSLPSSFSKLKNLHRLILFNNKLSGYLPLTIGNLTQITNLELYGNAFSGTIPSTLGNMTRLFELNLAHNNFIGAIPTEIFSIPTLSETLDVSHNKLEGSVPKEIGELKNIVEFHADSNKLSGEIPSTISGCQLLQHLSLQNNFLNGNIPIALTQLAGLDTLDLSGNNLSGQIPKSLGDMPLLHSLNLSFNSFQGEVPTNGVFANATEIYIQGNANICGGIPELRLPQCSLKSTKKKKYQILLLALIICLVSTLAIFSLLYMLLTCHKRRKKEVPATTSIQGHPMITYKQLVKATDGFSPANLLGSGSFGSVYKGELDSQHGENTSSVAVKVLKLETPKAVKSFTAECEALRNMRHRNLVKIVTICSSIDNKGNDFKAIVYDFMPNGSLEDWLHPETNCDQAEQRHLNLHQRVNILLDVACALDYLHCLGPESVVHCDIKSSNVLLDADMVAHVGDFGLARILVEESSLMQQSTSSMGFRGTIGYTAPVSGKRPTDTTSVFGCCPGANLPGLKPAGLSPCICLAYIFLRHLAQGTNQTGPTFGPGLSLRQYVEPGLHGRLMDVVDRKLVLDSKSWVQTPDISPCKEINECLVSLLRLGLSCSQELPSSRMQTGDVISELHDIKESLSMASIM

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_11G017780 OsN22_11G017780_03 Chr11 23143871 23144101 - IsoSeq
CDS seq

ATGGCACTGAAGTATGTCTCACTTGTAATTTGGACATCTGAGAGCAAA

Protein seq

MALKYVSLVIWTSESK

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr11 23147779 23148198 - OsN22_11G017780_01 OsN22_11G017780_02,OsN22_11G017780_01 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.712022 0.345214

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0559200 RBH 0.222809 0.083266 1.098986
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g36160 SBH 0.0 0.0 0.170626
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0569600 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0017790 RBH 0.000000 0.0 0.416277
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0017960 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0017730 SBH 0.0 0.732895 2.030220
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0017420 RBH 0.0 0.033064 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0017780 RBH 0.347210 0.0 0.746363
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0327400 RBH 0.0125645 0.364583 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0024900 RBH 0.0 0.0 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0336200 SBH 0.3060335 0.03045 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0018090 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0018220 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0017340 RBH 0.0 1.023452 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0017510 RBH 0.125744 0.0 0.043038
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0017710 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G017770 RBH 0.0 0.000000 0.331573
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0017920 RBH 0.0 0.0 0.0
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