Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsN22_09G003180 | OGI:09015000 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr09:5462269-5478992 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g51820 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGG3] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsN22_09G003180 | OsN22_09G003180_01 | Chr09 | 5462269 | 5478992 | - | NAM | ||
CDS seq | ATGGTGCAAAGCGTGGAAGAGGACGTGTACGAGGCGCCATCGGCAGTGATGCAGACGGCGATCACACCGCACAATGCCTCCGGCAGCATACAACTCAGATGGGAGGTCAAACCGAATACCAACTACCCGTCGCCGGGGTGCATGTTCATAATGCACTTCTCTGAGCTGCAACTTCTCCAGGAGAACACTATTCGCACATTTAACATCAGCATCAACAATAAGATTATAGGTAACATTACACCCGATTATCTCTACGCCGATGCCTCCCTCAACAATGAGCCCTTACGGGGATCAATCCAGTACAATATCACCTTGCACGCCACCGCCAACTCAACGATGCCACCCATCATCAATGCCCTAGAAGTTTTCTCCATCATCTCCACCACCACCGTTCCCACGAACGCTAAGGATGTATCTGCCATCACGACCATCAAGAAGCAATATGAGGTGAAGGAGAATTGGATGGGTGACCCATGCGTCCCAAAGACTATGGCATGGGATTGGTTGACCTGTGGCTACGCCGTTTCCAGCCCTCCAACAATCACAGGCGTGAATCTCTCATACAACAACTTGACAGGATCAATTCCTGAGGCCCTGTCACTATTATCCTCACTGACAGTTCTAGATTTGTCGGGAAACCAGCTCAGTGGATCAATTCCCTCTGAATTACTCAAAAGAGCCCAAGATAAGTCCCTCCAACTAAGATATGAAAATAATCCAGGCCTTTGCATCAATGGAACTTGCCCGTCTCCAGAAGGGGATCCCAAACTAGCTATCTACATCTCTGTCCCGGTAGTTGCAGTCACAGTGATACTAGTGTTTGTTTTATTTTGCTTGCTAAGACGAAAAAAGAAAGGTTCAGTGAACAATACTGTCAATCCACATAATGAGCTAATAACCCATTCCTACGGAAGCGACAGCTATGGACATGGTTCGATGCAGCTCGAAAACCGTCGGTTCACATATAAGGATCTGCAGAAGATAACAAATAACTTTGAGCAAGTGCTTGGAAAAGGAGGGTTTGGTTATGTCTACTATGGTATCTTGGAGGAGGGCAGTCAAGTGGCTGTCAAATTGCGGTCTCAATCGTCGAATCAAGGTGTAAAGGAGTTCCTTGGAGAGGCTCAGATTTTGACCCGGATTCATCACAAAAATCTTGTCTCCATGATTGGTTACTGCATGGACGGGGATTATATGGCACTTGTTTACGAGTACATGTCTGAAGGAACTCTTGAAGAGCATATTGCAGGAAGAGATCACAACAAGAGAAACTTAACTTGGATTGAGAGACTTCGAATTGCACATGAATCTGCACAAGGGCTAGAGTACCTGCACAAAGGATGCAGCCCTCCCCTCATTCACAGAGATGTGAAAGCAACCAACATCTTACTTAATTTGAAATTGGAGGCTAAGATTGCTGATTTTGGCTTGTCCAAGGCTTTCAACCGTGACAGTGACACACATGTATCAGCAAGTATACTTGCTGGAACACCTGGATATATTGATCCTGAGTATCACGCAACAATGATGCCAACAGCCAAAAGTGATGTATACGGCTTTGGTGTGGTGCTTTTAGAGCTAGTCACAGGGAAGAATCCCATCCTACGTACACCGGAGCCAATAAGCCTTATCCATTGGGTGCAACAACGCCTGCAATGTGGAAACATCGAGGGTGTGGTGGACACACGCATGCATGGTGTCTATGATATCAATAGTGTCTGGAAGGTTGCAGAGATAGCACTAAAGTGCACCGCACAGGCATCAACACAACGGCCTACGATGACTGACGTTGTGGTACAACTGCAAGAATGCCTAGACCTCGAGTATGGTCATGCAAGTAGTGTTCCTGAGTTATCAATTGACCATGTCAGCAAAACTAGAACCATATTAGAAATGGATCACCTAGAGAGGATGGCCGCAAGGTCATGTTTACATCTTCTCATCATCCTCGCCGCCGGCGTGTTACAGGCAGCTCGCGCGCAGCCCGACAGCAACGGTTTCATAAGCATAGACTGCGGCCTGTCAGGGACGGCCGGCTACGTGGACAACGCCACCAAGCTGTCCTACTCGCCGGACGCCGCCTTCACCGACGCCGGCACCAACAACAACATATCGGTGGAGTACTTCTCGCCGGCGAACTCCAGGATCTTCGACAACGTTCGAAGCTTCCCCTCCGGTGCCGCGCCGCGGAGCTGCTACACGCTCAGGCCGCCGGTGTTCGATCTCTACGCCGGCGTCAACTTCTGGAGGACGGTGAACATCACGGATGCGGCAGCCTCGATCACGGCGGAGGCCATCATCGTTGTGCCGGAGGACCCGATGCAGGTCTGTCTCCTCAACACTGGCGCCGGGACGCCCTTCATCTCCGGCCTTGACCTGAGGCCGCTGAAGAATTCTCTCTACCCGCAAGCGAATGCGACGCAAGGCCTGGTCATGGTCGACAGGGTAAACTATGGCCCCACTGATACGTTCATCAGGTACCCAGATGATCCGCGCGACAGAGGATGGCGGCCTTTGATCGACACGACGAGATACGTGGAGGTATCGACAACGAAGACAGTGCAGAACGTGGCAAAGGACTTGTTCGAGGCGCCGTCGGCGGTGATGCAGACGGCGATCACGCCGCGCAACGCCTCCGATAGCATCGAAGTCTACTGGACCGCCGATCCGAGCGCCGCCTCCGCCGGCGACCCTCCGCCAGGGTACATCGCCATTATGCACTTCTCCGAGCTGCAGCTTGTCCAGGGAAACGCCGTTCGCGCGTTCAATATCAGCCTGAATGATGAGTGGCTGGACCGCATGATGCCGGACTACCTCTACGCCGATGCCGACTACAGCACCGTGCCCTTCCGGGGCTCAAACCGGTACAACCTCACGTTCCGTGCCACCGCCAACTCGACGCTGCCACCCATCATCAACGCCCTGGAGATTTTCTCGGTCATCCCTACCACCAACGTGCCCACATACGCCAAAGATGTATCTGGTATCACGGCGATCAAGAAGCAGTATGAGGTGAAGCAGAACTGGATGGGTGACCCATGTGTTCCAAAGACACTAGCATGGGACTGGTTGACCTGTAGCTACGCTATTTCCAGCTCTCCAACAATCACAGGCGTATATGAAAATAATCTAGACCTTTGCATCAATGACACTTGTCCCTCTCCAAATGGGAAGCCCAAACTAGCTATCTACATCTCTGTCCCTGTAGTTGCAGTCACGGTGATACTAGTACGAAAAACCAAAGGCTCAGTGAACAATATTGTCAATCCACATAGTGAGCCAACAAGCCATTCCCATGGAAGTGACAGCTATGGACATGGTTCGATTCAGCTTGAAAACCGTCGATTCACATATAAGGATCTGCAGATGATAACAAACAACTTTGAGCAAGTGCTTGGCAAAGGAGGGTTTGGGTATGTCTACTATGGTATTTTGGAGGAGGGCACTCAAGTGGCTGTCAAATTGCGGTCTCAATCGTCGAATCAAGGTGTAAAAGAGTTCCTTAGAGAGGCTCAGATTTTGACCCGGATACATCATAAGAATCTTGTCTCGATGATTGGTTACTGCAAGGATGGAGAGTACATGGCACTTGTTTATGAGTACATGTCTGAAGGAACCCTGGAAGAACATATTGCAGGAAGAGATCGCAACAAGAGGAACTTAACCTGGACAGAGAGACTCCGAATTGCACTTGAATCTGCACAAGGGCTAGAGTACCTGCACAAAGGGTGCAGCCCACCCCTCATTCACAGGGATGTCAAGGCAACCAACATCTTACTTAACATGAAACTGGAGGCTAAGATCGCTGATTTTGGCTTGTCTAAGGCATTCAACCATGATAGTGACACACATGTATCAACAAGTATACTTGTTGGAACACCTGGATACATTGATCCTGAGTATCACGCAACAATGATGCCAACAACCAAAAGTGATGTATACGGGTTTGGTATGGTGCTTTTAGAGCTAGTCACAGGGAAGTCACCCATCCTCCGTACCCCGGAGCCAATCAGTCTTATCCATTGGGCGCAACAACGCTTGCAATGTGGAAACATTGATGCTGTGGTGGATGCACGCATGCACGGTGTCTATGATGTCAACAGTGTCTGGAAGGTTACAGAGATAGCACTAAAGTGCACCGCACAGGCTTCGGCACATCGGCCTATGATGACTGATGTTGTGGCAAAACTGCAAGAATGCCTAGACCTCGAGCATGGTCGCGCTGGCAGTGTTTCCGAGCTCTCAGTCGACCATGTCAGCAAAACTAACACCATATTTGAAATGGGTCACCTAGAGAAGATTCCACTACCAACCATGTCTAGCAGTCCATCGACACGATAA
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|||||||
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More
|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0349100 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g09220 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0349100 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0002990 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0003000 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0003040 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0002870 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0003090 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0081400 | RBH | 0 | 0 | 0.331896 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_09g0002980 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0084300 | RBH | 0.0061445 | 0 | 0.021443 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0003010 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0003040 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0003040 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0002950 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0003050 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0003080 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |