Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_08G006840 OGI:08018730 | 14/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr08:6687533-6700126
Gene Symbol -
DNA seq

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CDS seq

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Protein seq

MATTGAGPRAADDDGGGEAARGDDVRRTVASGTGRASLGAAGSWRRRELGSTRRRRAADGDAGLGAAGSGVSVRQRRRRGLGGASGRRAADSDERIRRATSIDEINI

Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_08G006840 OsN22_08G006840_01 Chr08 6687533 6700126 - NAM
CDS seq

ATGGCGACGACGGGGGCGGGGCCTCGTGCGGCGGACGACGACGGCGGGGGCGAGGCGGCGCGAGGCGACGACGTGCGGCGGACGGTGGCGAGCGGAACCGGCCGCGCCAGCCTTGGGGCGGCCGGGTCATGGCGACGGCGGGAACTCGGCAGCACGAGGCGACGGCGTGCGGCGGACGGCGACGCCGGTCTCGGGGCGGCCGGATCCGGGGTCAGCGTGAGGCAACGGCGACGAAGGGGGCTCGGCGGCGCGAGTGGACGACGTGCGGCGGACAGCGACGAGCGGATCCGGCGTGCGACATCCATTGATGAGATAAACATCTGA

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Protein seq

MATTGAGPRAADDDGGGEAARGDDVRRTVASGTGRASLGAAGSWRRRELGSTRRRRAADGDAGLGAAGSGVSVRQRRRRGLGGASGRRAADSDERIRRATSIDEINI

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.000000 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g12040 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0007070 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0007060 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0007240 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0007010 RBH 0.164400 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_08g0006980 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_08G0106700 RBH 0.0035505 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0006850 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_08G0102000 RBH 0 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_08g0006640 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0006750 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_08g0007080 RBH 0.0 0.0 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0006660 RBH 0.0 0.0 0.0
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