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Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_08G000540 OGI:08001040 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr08:435516-448956
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Protein Rf1, mitochondrial [UniProtKB/Swiss-Prot:Q76C99]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_08G000540 OsN22_08G000540_01 Chr08 435516 448956 - NAM
CDS seq

ATGGGAGTCCGCGGCGGTGGAAGCGCGCTGGGACGGGCTGGGACCTCCAGCTCCAAGCGCACGAAGCAAGGAGGACGGGGTGGGGCCAAGCGCACGAAGCAAGGAGGGAGGCAGAGAGCGACCGAGCCCGGGGATGCACACCAGGTGTTCGACAGATTGCTCAAGCGAGGCGACCGTGCCTCCATCTTCGACCTCAACCGCGCCCTCTCCGACGTCGCGCGTGCCAGCCCCGCCGTCGCCATCTCCCTCTTCAACCGCATGCCCAGAGCCGGCGCCACCAGTGCGGCTCCCAATATCGCCACCTACGGCATCGTCATTGGCTGCTGCCGCCGCCTCGGCCGCTTGGACCTCGCTTTCGCCACCGTCGGCCGTGTCATCACGACGGGGTTGAGGATGAGCCCAATCCTCTTCAGTCCTCTTCTCAAGGGCCTCTGTGACCGCAGGAGGACGAGCGATGCGATGGACATTGTGCTGCGACGAATGCCCGAGCTAGGTTGCAAGCCAGATCTCTTCTCCTACACCATTCTTCTCAAGGGTCTCTGTGATGACAAGACAAGTCAACAAGCTCTCGACTTGCTCCATATCATGGCTGATCATAAAGGGCGCTGCCCACTCGATGTGGTGGCGTATACCACTGTCATCAATGGCTTGCTTAGGGAGGGTCAGCTGGACAAAGCTTATTCCCTGTTTGATGCAATGCTGGATCGAGGGCCATCACCAGATGTTGTGACTTACAGCTCGATTATCAGTGCCCTATCCAAGACTCAAGCAATGGACAAGGCCACACAAGTCTTTACTAGGATGGTTAAGAACGGTGTTATGCCTGATTGCATCATGTATACTAGTCTTGTGCATGGATATTGCTCTTCAGGAAAGCCCAAAGAGGCCATTGGGATTTTCAAAAAGATGTGCAGACATGGTGTTGAACCCGATGTCGTTACTTATACTGCGCTGATGGACTATCTATGCAAGAATGGGAAAAGCACAGAAGCTAGAAAGATTTTTGATTCTTTGGTCAAGAGGGGACACAAGCCTGATAGCACTACCTATGGTACTCTGCTTCATGGCTATGCTACTGAAGGAGCTCTTGTTGAGATGCATGATCTTTTGGATTTGATGATGAAGAAAGGTATGCAACTTGGTCATCATATCTTTAACATGATAATGGGCGCATATGCTAAACATAACAAGGTAGATGAGGCCTTGCTTGTATTTAGCAATATGAGGCAGCAAGGATTGAACCCTGATATAGTCAACTATGGAACAGTATTAGACATACTTTGTACAGCAGGCAGAGTGGATGATGCTTTGTCTCAATTCAACAGCCTCAAATCTGAAGGACTTGCTCCTAACATTGTTGTTTTTACCACCCTAATTCATGGCCTGTGTACCTGTGACAAATGGGACAAGGTTGAGGAGCTAGCTTTCGAAATGATCGATTGCGGCATCTGTCTTGACACAATTTTCTTCAATGCAATAATGGGCAACCTATGCAAAAAAGGAAGGGTTATAGAAGCCAAAAACTTGTTTGACTTGATGGTGCGCATAGGTATTGAACCTAATACTAATACATACAATACACTCATTGATGGATATTGCTTAGATGGTAAGATGGATGAAGCAATGAAACTACTTGGATTTATGGTGTTCAATGGGGTAAAACCTAGTGACGTTACCTATAATACCATTATTAATGGTTACTCTCAAAATGGTAGGATAGAGGATGGACTAACTCTTTTGAGAGAGATGGATGGCAAGGGTGTGAATCCTGGCATTGTTACATATGAGATGCTGCTGCAAGGGTTATTCCAGGCTGGAAGAACTGTAGCTGCAAAAGAACTCTATCTCAGGATGATTAAGTGGGATACGATTGAGAATAGAAATGATGACGTTGAGGATTTGTTTGCTGCTCTCTCGACCAATGGTTTAGTGACGAATGTTGTGACCTACTGGTTAATGATAGAAAATGTTGTAAAACAAGGGTTGCTAGAAGAATTGGATGATTTATTTCTTCATATGGAGAAGAGTGGCTGTACTAAGTTACTTCACAAAGAGCAGCTCGGCCCGGCGGCGGCGGCCATGTCCCGCCGCGTCCTCAGCGCCCCGGACGGCGCCAAGGTCTCCCGCTTCAACCTCATGAAGCTGCAAGGTCGACAAGAAGCGGCTGCTGCTGGCACTGAGAGCCACCACGCCCACCACGCGTTCGATGAATTGCTTCACCGACCCACCACCAGCAGCATCGTCGACCTGAACCGCGCCCTCTCCGACGCCGCGCGTCACAGCCCAGCCGTCGCCATCTCCCTCTTCCGCCGCATGGTGATGGTGGCCCGACCCAAGGTGCCTCCTAACTTAATCACCTACAGCGTCGTCATTGACTGCTGCAGCCGCGTCGGCCACTTGGACCTCGCTTTCGCCGCCCTCGGCCGTGTCATTAGGTCCGGATGGACGGCGGAAGCAATCACCTTCAGTCCTCTGCTCAAGGCTCTCTGCGACAAAAAAAGGACCAGCGAAGCAATGGACATTGCGCTGCGACGAATGCCTGTGCTGGGTTGCACACCCAATGTCTTCTCCTACACCATCCTTCTCAAGGGCCTCTGTGATGAAAACCGGAGTCAACAAGCTCTCCACCTGCTCCACACCATGATGGTGGCTGATGATACCAGAGGAGGATACCCACCCGACGTGGTTTCATACAACACAGTCATCAACGGCTTGCTTAGAGAGGGTCGTCAGCTGGACACAGCTTATCACCTATTTGATCAAATGCTGGATCAGGGGTTGTCGCCTGATGTTGTGACTTACAACTCGATTATCTCTGCCCTTTCCAAGGCTCGAGCAATGGACAAGGCCGCTGTGGTCCTTGCTAGGATGGTTAAGAATGGTGCTATGCCTAATCGCATCACGCACAATAGTCTTTTGCATGGATATTGCTCATCAGGAAAGCCCAATGACGCTATTGGGGTTTTCAAAAGGATGTGCAGGGATGGTGTTGAACCAGATGTATTCACTTATAACACGTTGATGGGCTATCTCTGCAAGAATGGAAGATCCATGGAAGCTAGAAAGATCTTTGACTCTATGGTCAAGAGGGGCCACAAGCCTAACAGTGCTACCTACGGTACTCTGCTTCATGGGTATGCTACTGAAGGATCTCTTGTTGAGATGCATCATCTATTGGATATGATGGTACGAAACGGTATTCAACCTGATCACTACATCTTTAACATATTAATAGGCACATACACTAAACATGGAAAAGTAGATGATGCCATGCTTTTATTTAGCAAAATGAGGAGGCAAGGATTGAATCCTGATACAGTCACCTACGGAATAGTAATGGACGCGCTCTGCATGGTAGGTAAAGTGGATGATGCTATGGCCCAATTTGGCAGGCTCATCTCTGAAGGACTAACTCCTGATGCTGTTGTTTTTAGAACCTTAATTCATGGCCTTTGTGCCCGTGATAAATGGGACAAGGCTGAGGAGTTAGCTGTTGAAATGATCGGTCGAGGCATCTGTCCCAACAACATTTTCTTCAACACATTGTTGAACCACCTATGCAAAGAAGGAATGGTTGCAAGAGCCAAAAACATATTTGACTTGATGGTACGTGTAGATGTGCAGCGTGATGTCATTACATACAACACACTCATAGATGGATATTGCTTACATGGTAAGGTGGATGAAGCAGCAAAGTTACTTGAAGGTATGGTGTTAGATGGGGTGAAACCTAACGAAGTTACCTATAATACCATGATTAATGGTTACTGTAAGAACGGTAGGATAGAGGATGCATTTTCTCTTTTCAGACAGATGGCAAGCAAGGGTGTTAATCCTGGCATTGTTACCTATAGCACAATCCTCCACGGGTTGTTTCAGGCTAGAAGAACTGCAGCCGCAAAAGAACTCTATCTTTGGATGATTAAAAGTGGGATAAAGTTTGATATCGGCACATACAACATAATACTTCTAGGACTTTGCCAAAACAATTGCACTGATGATGCTCTCCGAATTTTTCAGAACCTATATTTGATTGATTTCCACCTAGAGAATAGGACTTTTAACATTATGATTGATGCGTTACTTAAAGGTGGCAGGCATGATGAAGCTAAGGATCTGTTTGCTTCTCTCTTGGCTAGAGGTTTAGTGCCGAATGTTGTGACCTACTTGTTGATGATGAAAAGTTTGATTGAACAAGGGTTGCTAGAAGAGTTGGATGATTTATTTCTTTCTTTGGAGAAGAATGGTTGTACAGCTAACTCCCACTTGCTAAATGCGTTAGTTGGAAAGTTACTACAGAAAGGGGAGGTACACAAGGCTGGGGTTTATCTCTCCAAAATTGATGAAAATAACTTCTCCCTTGAAGCTTCCACGGCTGAGTCGCTGGTTTTGCTGGTTTCAAGTGGCAAATACGATCAACATATAAATGCTATCCCTGAAAAGTATCGTCCTGTTGTGAAAACCAGGGCTGTTTGA

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Protein seq

MGVRGGGSALGRAGTSSSKRTKQGGRGGAKRTKQGGRQRATEPGDAHQVFDRLLKRGDRASIFDLNRALSDVARASPAVAISLFNRMPRAGATSAAPNIATYGIVIGCCRRLGRLDLAFATVGRVITTGLRMSPILFSPLLKGLCDRRRTSDAMDIVLRRMPELGCKPDLFSYTILLKGLCDDKTSQQALDLLHIMADHKGRCPLDVVAYTTVINGLLREGQLDKAYSLFDAMLDRGPSPDVVTYSSIISALSKTQAMDKATQVFTRMVKNGVMPDCIMYTSLVHGYCSSGKPKEAIGIFKKMCRHGVEPDVVTYTALMDYLCKNGKSTEARKIFDSLVKRGHKPDSTTYGTLLHGYATEGALVEMHDLLDLMMKKGMQLGHHIFNMIMGAYAKHNKVDEALLVFSNMRQQGLNPDIVNYGTVLDILCTAGRVDDALSQFNSLKSEGLAPNIVVFTTLIHGLCTCDKWDKVEELAFEMIDCGICLDTIFFNAIMGNLCKKGRVIEAKNLFDLMVRIGIEPNTNTYNTLIDGYCLDGKMDEAMKLLGFMVFNGVKPSDVTYNTIINGYSQNGRIEDGLTLLREMDGKGVNPGIVTYEMLLQGLFQAGRTVAAKELYLRMIKWDTIENRNDDVEDLFAALSTNGLVTNVVTYWLMIENVVKQGLLEELDDLFLHMEKSGCTKLLHKEQLGPAAAAMSRRVLSAPDGAKVSRFNLMKLQGRQEAAAAGTESHHAHHAFDELLHRPTTSSIVDLNRALSDAARHSPAVAISLFRRMVMVARPKVPPNLITYSVVIDCCSRVGHLDLAFAALGRVIRSGWTAEAITFSPLLKALCDKKRTSEAMDIALRRMPVLGCTPNVFSYTILLKGLCDENRSQQALHLLHTMMVADDTRGGYPPDVVSYNTVINGLLREGRQLDTAYHLFDQMLDQGLSPDVVTYNSIISALSKARAMDKAAVVLARMVKNGAMPNRITHNSLLHGYCSSGKPNDAIGVFKRMCRDGVEPDVFTYNTLMGYLCKNGRSMEARKIFDSMVKRGHKPNSATYGTLLHGYATEGSLVEMHHLLDMMVRNGIQPDHYIFNILIGTYTKHGKVDDAMLLFSKMRRQGLNPDTVTYGIVMDALCMVGKVDDAMAQFGRLISEGLTPDAVVFRTLIHGLCARDKWDKAEELAVEMIGRGICPNNIFFNTLLNHLCKEGMVARAKNIFDLMVRVDVQRDVITYNTLIDGYCLHGKVDEAAKLLEGMVLDGVKPNEVTYNTMINGYCKNGRIEDAFSLFRQMASKGVNPGIVTYSTILHGLFQARRTAAAKELYLWMIKSGIKFDIGTYNIILLGLCQNNCTDDALRIFQNLYLIDFHLENRTFNIMIDALLKGGRHDEAKDLFASLLARGLVPNVVTYLLMMKSLIEQGLLEELDDLFLSLEKNGCTANSHLLNALVGKLLQKGEVHKAGVYLSKIDENNFSLEASTAESLVLLVSSGKYDQHINAIPEKYRPVVKTRAV

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.034128 0.191041 0.115861

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_08g0107700 RBH 0.0 0.0 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g01640 RBH 0.0 0.0 0.086555
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os08g0107800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0000540 RBH 0.144536 1.140030 0.000000
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0000550 RBH 0.0 0.157942 0.422831
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0000560 RBH 0.274900 0.485085 0.778541
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0000530 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_08g0000520 RBH 1.176220 2.586586 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_08G0006500 RBH 1.222288 2.276152 0.955963
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0000480 RBH 0.0 0.0 0.050865
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_08G0006900 RBH 1.073596 1.524857 6.533917
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_08g0000590 RBH 0.000000 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0000520 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0000540 RBH 1.764591 4.627967 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_08g0000530 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_08g0000530 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_10G016100 SBH 0.161260 0.0 0.258236
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0000540 RBH 0.000000 1.718111 0.170857
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