Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_04G031440 OGI:04103020 | 15/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:34550693-34574328
Gene Symbol prx60, POX-1, prx61, OsPRX61, prx62, OsPRX62, prx63, OsPRX63, prx64
DNA seq

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Protein seq

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Function Cationic peroxidase SPC4 [UniProtKB/Swiss-Prot:P84516]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_04G031440 OsN22_04G031440_01 Chr04 34550693 34574028 - NAM
CDS seq

ATGGGTGCAGTGAGCAGAAGCGGCCGCGCAGTGGCCGTCCTGCAGCTTGTCTCCACCGTCGTCCTCCTCCTCTCGCCACCACCAGCAGCTGCATCTCGCCGTGACATGTCTGTGGACTTCCACGCTGCGTCGTGCCCGCAGCTGGAGACCATCGTGCGCTCCGCCGTGCAGGCGGCGCTCCAGCGGGAGATCGCCCTCGCCGCCGGTCTCCTCCGCATCTTCTTCCACGACTGCTTCCCACAGGGGTGCGACGCGTCGGTATATCTGAATGCCACCAACCCCAACACGGAGCAGTTTCCCCAGGGACCCAACGAGACGCTGCAGCCGCGGGCGCTGCAGCTGGTGGAGGACATCCGCGCCAAGGTGCACGCCGAATGCGGTCCCACTGTCTCCTGCGCCGACATCTCCGCCCTCGCCACCCGCGACGCCGTCGTCGTCTCCGGCGGCCCCTCTTACGCCGTGCCACTCGGCCAGCAAGACAGCCTCGCTCCGGCATCGGTGGATCTCGTCGGAGATCTCCCGGGCCCGAGCACCTCCAGAGTCCAGGCTCTCATCGACCTTTTCGCGACCAGGGGCCTGGGAGATCCTGCCGACCTGGTGGCGCTCTCCGGCGGCCACACCGTCGGGAGAGCACGCTGCGACTTCTTCCGTGACCGCGCGGGGCGCCAGGACGACACCTTCTCCAAGAAGCTGAAGTTGAACTGCACCAAGGACCCCAACCGGCTGCAGGAGCTTGACGTGATAACGCCCGACGCCTTCGACAACGCCTACTACATCGCGCTCACCACCGGCCAGGGTGTCTTCACTTCCGACATGGCGCTCATGAAGAACCAGACCACGGCGTCCATCGTCAGGCAGTTCGCGCAGGACAAGGCCGCCTTCTTCGACCAGTTTGCCAAGTCCATGGTCAAGCTCAGCAAGGTACCCAGGCCCGGCGGGAACGTCGGCGAGATCCGCCGCAGCTGCTTCCTTTCCAACTCCAACGGACCACGCCTCGACCTCGTCGTCGCCGCCGCCACCGACCAAGACCCCGCGGGCAGGACCGCGGGCGCATTGGCCGTCCTGCAGCTCGCCTCCATCGTCGCCGCTGCCGTCCTCCTCTCCTCCCCACCTGCGGCTGCTGCTGAGCCGTCTGTGGACTTCATTGACGTGGTGGCGTGCTCGCAGTCGCAGGTGGACTCCATCGGCTGTGACGCGTCGGTTTACTTGAGTGGCGCCAACTCGGAGCAGGGGATGCCGCCCAACGCCAACTCGCTGCAGCCGCGGGCGCTGCAGCTGGTGGAGGACATCCGCGCCAAGGTGCACGCCGCATGCGGGCCCACCGTCTCCTGCACCGACATCTCCGCGCTGGCCACCCGCGCGGCCGTCGTCCTCTCCGGCGGGCCCACCTACCCCGTTCCCCTCGGCCAGCTCGACAGCCTCGCCCCGGCCCCGCTGCGCCTCGTCAACCAGCTCCCGGGCCCGGGCACCTCCAGCGTCCAGGCTCTCATCGACCTGTTCGGGAGCAGGGGCATGGGAGACGCCGCCGACCTGGTGGCGCTCTCCGGCGGCCACACCGTGGGGAAGTCAAAGTGCGCCTTCGTGAGGCCCGTGGACGACGCCTTCTCCCGGAAGATGGCCGCCAACTGCAGCGCCAACCCCAACACGAAGCAGGACCTGGACGTCGTCACCCCCATCACCTTCGACAACGGCTACTACATAGCGCTCACCAGGAAGCAGGGGGTGTTCACCTCCGACATGGCGCTCATCCTGGACCCCCAAACTGCGGCCATCGTCAGGCGGTTCGCGCAGGACAAGGCCGCCTTCTTCACGCAGTTCGTTACGTCCATCGTCAAGCTGAGCAAGGCCCGGCGGGAACAAAGGCGAGATCCGCCGCAACTGCTTCAAGACCAACAGCGGAGCACGCCTCGTGGACGTCTGTCCGCACGGTTCATCTCTCTGCCCACCGACCATCTTCCAATCACTACGCCGCCCCTCGCCGACGGCCTCGCCTTCGACCTCTACAGCGACTCGTGCCCGCAGCTGGAGACCACCGTGCGCTCCGCCGTGCAGGCGGCGCTCCAGCAGGAGATCGCCCTCGCCGCCGGCCTCCTCCGCATCTTCTTCCACGACTGCTTCCCCCAGTCCGGTGGTCTGCCCTACGACGTGCCGCTCGGCCGCCTCGACAGCTTCGCGCCGGCTCCCAGCGACGCCGTCTTCCAGCTCCCGCAGCCCACCTCCGACGTCTCCACGCTGCTCAGCGCCTTCCAGACCCGCAACCTCGACAACGTCGACCTCCTGGGTATGGTTGTGCTACTGATCTCGGGCCTCTTTGCTGCCCGTTGCGCGGCCGTGGTGACCACCGGCGAACCCGTCGTCGCCGGCCTCTCCTGGGGGTTCTATGACACGTCGTGCCCGTCGGTGGAGGGCATCGTGAGGTGGCACGTCACCGAGGCCCTCCGCCGCGACATCGGCATCGCCGCCGGCCTCGTCCGCATCTTCTTCCACGACTGCTTCCCGCAGGCACGTCCTACTACCATTTTACTCCAGTAG

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Protein seq

MGAVSRSGRAVAVLQLVSTVVLLLSPPPAAASRRDMSVDFHAASCPQLETIVRSAVQAALQREIALAAGLLRIFFHDCFPQGCDASVYLNATNPNTEQFPQGPNETLQPRALQLVEDIRAKVHAECGPTVSCADISALATRDAVVVSGGPSYAVPLGQQDSLAPASVDLVGDLPGPSTSRVQALIDLFATRGLGDPADLVALSGGHTVGRARCDFFRDRAGRQDDTFSKKLKLNCTKDPNRLQELDVITPDAFDNAYYIALTTGQGVFTSDMALMKNQTTASIVRQFAQDKAAFFDQFAKSMVKLSKVPRPGGNVGEIRRSCFLSNSNGPRLDLVVAAATDQDPAGRTAGALAVLQLASIVAAAVLLSSPPAAAAEPSVDFIDVVACSQSQVDSIGCDASVYLSGANSEQGMPPNANSLQPRALQLVEDIRAKVHAACGPTVSCTDISALATRAAVVLSGGPTYPVPLGQLDSLAPAPLRLVNQLPGPGTSSVQALIDLFGSRGMGDAADLVALSGGHTVGKSKCAFVRPVDDAFSRKMAANCSANPNTKQDLDVVTPITFDNGYYIALTRKQGVFTSDMALILDPQTAAIVRRFAQDKAAFFTQFVTSIVKLSKARREQRRDPPQLLQDQQRSTPRGRLSARFISLPTDHLPITTPPLADGLAFDLYSDSCPQLETTVRSAVQAALQQEIALAAGLLRIFFHDCFPQSGGLPYDVPLGRLDSFAPAPSDAVFQLPQPTSDVSTLLSAFQTRNLDNVDLLGMVVLLISGLFAARCAAVVTTGEPVVAGLSWGFYDTSCPSVEGIVRWHVTEALRRDIGIAAGLVRIFFHDCFPQARPTTILLQ

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_04G031440 OsN22_04G031440_02 Chr04 34573125 34574328 - IsoSeq
CDS seq

GATGGCTGCAGCGAGGAGACTGCCCGTCCTGGAGCTGGTCTCCTTCGTCGCCGTCCTCCTTATCTCCTCACCAACAGCAGCAGCAGCCGAGTTGTCTGTGGACTTCCACGCGGCGTCGTGCCCGCCGCTGGAGGCCATCGTGCGCTCCTCAGTGCAAGCCGCGCTGCAGCAAGAGATCGCCCTCGCCGCCGGCCTCCTCCGCATCTTCTTCCACGACTGCCTCCCGCAGGGGTGCGATGCATCGGTGTATCTGAGGGGAGGCAGCAACTCAGAGCAGGGCATGGGCCCAAACCTGACGCTGCAGCCGCGGGCGCTGCAGCTCGTCGACGACATCCGCGCCAAGGTGCATGCAGCATGCGGCCCCACCGTCTCCTGCGCCGACATCTCCGCGCTCGCCAC

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Protein seq

DGCSEETARPGAGLLRRRPPYLLTNSSSSRVVCGLPRGVVPAAGGHRALLSASRAAARDRPRRRPPPHLLPRLPPAGVRCIGVSEGRQQLRAGHGPKPDAAAAGAAARRRHPRQGACSMRPHRLLRRHLRARH

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.298194 1.019661 1.026314

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0688300 SBH 0.000000 0.000000 1.606545
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g59260 RBH 0.0 0.0 0.295776
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0688300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0031890 RBH 0.248791 0.0 1.427324
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0032670 RBH 0.0 0.806758 4.572251
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0032240 RBH 0.838486 7.497466 6.097501
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0032090 RBH 0.000000 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0032370 RBH 0.0 0.0 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0556600 RBH 3.8202765 102.132744 96.613762
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0030980 SBH 0.069409 7.706303 0.188825
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0562400 RBH 7.883018 207.328659 6.447523
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0031460 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0031260 RBH 0.685717 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0031390 RBH 1.691352 16.330233 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0031960 RBH 0.317584 0.000000 0.913584
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0031940 SBH 0.400996 23.364229 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0031180 RBH 1.722616 16.841997 3.523848
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