Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_04G005140 OGI:04028100 | 12/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:7893013-7902839
Gene Symbol -
DNA seq

TCACGTTTCAAAAGTAGCAAATTTACTCTGTGGAGTTTTCCATTTACTCCTAGTGTCCCACATCTGCTCATTCAAAAGTAACGAATTTACTCCCAAGAATGCCCCCACATCTATTGCATCATTTCTAGATGGCTGTAAAATAATTACTATCAGTTTACAACGCTAGTTATTCCTTTACCAGTGTTATAAACTGTCACGCCCAGAAATTCACGAACCAGAATTTCTAAGCTGAATGTGCATTAAATCCCTATCCAGGACCAGCCAGGGTACACAAACGATAATGGTTGACATACAGATCCACGTCTTACAAAAATAGAAAAAATTACAAAATGCAGCGGAAAAGATAAAAGCGAGCTAGACCGGGAAGCTTGACTTCAGCAGCAGGCGGCTCCACTCCACAGGCAATCCTTGACGGCAGCGACGAAACCAACTTCGACAAAACAGCTCCCACTAGGAAGATCTTCAGCTCTGGTGTGGGGGAAAAGACAGCAAGACTGAATACTACCCACTGTACTCAGCAAGTCATACCGGAAGAGAAGGTATGATGCAGGATATATCCAAAGGAGGCTAAGGGTTCTTTTGCATAAAGCAGGCATTTCAAAGCAGTAGTTGAAAACAGTAAAACAATTGTAGCAATTAAGCAGTATTAACCAAATCACTGTCCAACGCTACACCACGTTGCAACAGGCCCAACCAACCACCTGAACTACACCAGTTCATTACACTAAACAAGGGGTGAGACTAATCACGGTGAATCTGGTTGATCGCCCATAACCGCGGGCACGGCTATTCGAATAGTTTTACTCTGGCCAGAGGTGTACAACTGTACCCACAAGACATGATTCCACACATGTCGCCATGCCCTGAAGTATCACCATGATACTGCAAAGGGGGAAATCGTGACAAGACCCTCCGCATAACCCTCCCCTAACCATCCACACCACGCTAAGGTTTCACCCCCACCCCTCAAAAGGCAGTGGGCAGTTCCCTCTTGCGCCGCGGTGAATCCGGCAGCTGGACAACCGGACACCCCGGCCAACCCAACTCCATCACGCCCACCCTCGCCACTGGTGCCTAGGAAAGAGTCGAGTTATACCTCAGATCAAGCAGTTACCCACTCCCGCTTGTGGTAAGCACGGTAAGTCTCCCAGGGTTTCCCGTGAACCGGTCCTTAACTACCATGGGTGCGACCAGCAAAACCATGCACCCACAGCCCACCATTCAGTGTATTTTAATTAACTAACACCATTGCGGTGGCACCAATCCAAAGCTATGCTAGTAGACAAAGTCTATGTAATAATGTGATCCCCATTTGTGTACTAGTTGAGCTAAGCATGGCTAAGCATTTCCTAAGCCAACATCTAGTCATTTTGATACCCAAGTTATCAATGGCATATGGTAAACAATATATGGCTGAGTAATAGGACCCATCCCACATGACATTGTAAAAGAATGCAATATTTAATAGAAATGCGGGATATTTGTAAATTGGGTACAATATGATCAAACGTATTGCATGACTTGCCTTGCTCTCGAACTGATGAGCCCTCAGCAACGTCTTCGAGAAACCGCGGATCGACGAAACGGCCAAAATCTACGCGACAAACAAAGCACACAAGCAAAACATGCTATAAGACTACTGAAACAGGAAACAAAACCATTTTTAATGCATTTTTCTTGATTTACTGAGACTTGAATGGACTTAAACGGAGCTCGGATGAATTACTTATGAATTTTAGAAGATAAACTGTGTTTTTACTAATAAAAAGAAAAGTCCTTAATTATTTATTGCGCAATAAATGCCCAGGGCTGACGTCAGCGAGGGGAGGGGGCGGCGCCGACAAGCGGGGCCCACGGGCCAGCGGCTCAAAGGGGGTGGTCCGCCGTGGACCGGGTCCACGGGGCCGGGGTGGTGGTGTACCACGTGGCGCCGACGTGGTGTCACACCCTAAAAATTTAAAAAAATATAAATTGTTGTTTAAATGGAATTTCTAGAATTTATTTTAAAAGTCTTGAGAAGAAAATCTAATTTTAATTAATAAATTCCAATATAAAAAGTGGCCAGATAAAATTTCATTAAATACTTTGCTTAATTCTATAATTCCTAGATTTTTCTGGGATTTATTTGAGCTAAGGAAGTATTTTTAATAAATGGAATTGCATTAAAGAAATAATTTAAATTGAAAAAGTTTTAAAAAGTCTTCTTTTGGCTTTGGGCCGAAAGTCGGCCCAAAACCTTCTCTCTCTCCTCCCGGCCCAAGTCGGCCCAGTCCGCAGCCGCAGCCGCCCGCGCGCGCGCCCGCTGCCGCTGACAGGTGGGTCCCACCTGTCAGTCGTCGTCTACCTTCGGCCGCCGCCGCCCGAAACCCTAGTTTCGCGCCGCCGCCGTTTCCCTTCCAAATCCGGCCGTCCCTTTCCTTCTCCGGCCGAATTGGTTGAGGGGAAATGATCTCCGGGATCTCCTCTACCTTTTTCCCTTTGGAATCTTCGGTTAAATCGCTTTGGAAAGCGTCGGATTCGAGTTCGTCTCGGATTCGTTCTTCCCGAGCTTTCCTTCCTCGTCGCCGGTCGCCGTGGGCCTCCGCCGTCGCCTCCGAGCCCCTTTAAAAGGATCCCCATGCCCTTCTCTACCCGCCGCCACCCTCGCCTTCGCCTCTCGTCGCCGGAGTTGTCCTAGCGCCGTGCGCCCTAGCTTCGCTGTCGTCGCCGCCGCTCCAGCCGTGCTCCGCCGTCGCTCCAGCCGTCGCCGTCACTCGGGAAGGCCGCCGTCGTGGTCGCCGTCGCGTCGCCGTCCTCGTCCGCCTCTTCGTTGCCGTCGGAACCCACCGGAGCCTCGTCGCCGTCCACAACCCGAAGAGCCCCGCCGTTTCCTCCTCGTCGCCAGCGCCGTCCGTTGCCTCTCCGCCGTCGTTGTGGTCATCGGTGAGTTCGCCGTACCGTCCGCTACCCGTTGGTGCCCACCGTTCGCGTCCTCGTGCCGTCGTTCGCCGGCGAGCGTGCGCCGCCCGAGCCGTCTCCTCCGCCGAGCCGCCGCCGCCGTCGGTGACGTCATCGCTGACGTCGCCATCGCCCTCTCCCGTGAGCCGCCGTGGACCCGATCAATCTCGGCCGTCCGATTTGGATCGGATCGATCTCGGCCGTCCGTTCGCGTGGACCGTCGCCCGTGCGCCCGGTCTACCCAAACCCTAGCGCCGCTGACGCAATAAATCCCCTTTTCCTTTTCAAAAATAATTCAATATTGCGTCATAAATCAATTTTAAGCCGATTTAAGTGTTTTAATCCGATTTAATCTTTAAAAATTCATAACTAATTCATCTTAGCTCCGATTTAGTTGGTTCAAGTCTCTAAATTTTTCTAAAATTGAGATCTACACATTAAAAATATCCACATGTACTGTTAATGCTTGTTTATGTGCTGTTTAGGTGATTTTGTTTCTTTTTGCTTAGATTCCGTCGTTTCCGGAGAGTCCGTTTTCGCCGGAGAAGAGTTTGAAGAGTTCCAAGGCCAGCAAGGCAAGTCACACAGATCCCAAACAACCCTTTGAGCATGTTGATCCTATTTAAAGCTATTGTTTCTTTTCAACTATTGCATTTATTTTCGAATGTCATTGGGTGGAATTAACCTATTCTTTGTTATGGCCCTTTTGTTCTTGTTTACCTTATTCCTTGATACCCTGGGTTATTATAATTTGACTAGTTGAGCTTTATTTATATTGGTTCAACTAGATATTAGGTGTAATTGCTTAGCCCTGCTTAGAAACATTAGCTCACTTTTGGGATAACTAATGATTCACTATTATTTCATGATGGTTTAATGATAGTGCACGATGGTCAATCGTGATTAGTTAATTAATTAATGTGCCAACTAAAACCTGGTAATGGTGGGTTGTGAGCACATGGTTTTGAAGGTCGTGCTCATGACAATTAAGGACCGGTTCACGAGTTTCGGTTGTGAAACATTAACCGTGCCAACCACAAGCCAGCATGGGCAACGGCTTTATCTTTTGTATAGCATAGTTCATTGCGGAGCACCAGACTGAGAAGTGGCGGAGATAAGCCCACGGGGGTCGCTGGGGAGTCCATGCCTTGTTTATAAGGGGGTGATTATGATCCAGGAAGGTGCACTGCAGTGGATTGTGTTGTATAAGGGGTATTATCACAACTCCTTTCCGAGGTACCATGGTGGTATTGAGGCACATGGTGACATGATGTGGGGTTGTGTCTTGTGGGTACAGTGGTACACCTCTGATCAGAGTAAAACTATTCGAATAGCCGTGCCCGCGGTTATGGGCGGGTCTAACAATGTCTTTCGTGATTAGTCTCACCCTTCTCACCATAGTTAATGATGCTAAAACTGGTAATAATTTGATTAGCTCCTGGTTTGGAATGGAATATTCCTGGTTTGGAGATAGAGCTGTGCAGCCGGGATGGTTGTTCAGATTGGTTGGGCCTATACAACAGGGGATTTTGTATAGCGTTGGATTAATACTGCTTAATTAATATTTAACTGTTTTAAATTCTCAAATGTTTGCTAAATGCTGCTTTTGCAAATGGAACCCTATTATGCCATCCTTTGTTATCCTGTGAACTTGCATATTTGCTGCGTGGCTTGCTGAGTATGTCATATACTCACCTTGCAATCATTCATCAGAGGAAGAGTTCTACAGTGAGGCTGATGGAGGGGAGGATTAGGTGTAGCCCTGGTCAAGCTGCCTGTGGAGTGGAGTCGTCCGCGCCGTTTATTTTTTTTCCGCTGCTTAGATCTTTATTGATTGAGAGGAACTATCTACCTCTGTAATAACATTTTATACGCTTAATAATTAGAGTAATGATTGTACTCTATTATCAATTTGTTATTGTGTGCCTCGGCTGATTCCTGGACGAGGGTTTACACACATGTAAGCGTTTGGAATTTTGGATAGAAATTCCGGGCGTGACACGTGGCACCACGTGGCTGGCCACGCGGGCCATGGGATGGACGGCCACGATCGGCCGAGGGCC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CDS seq

ATGTCGGGCAGCACCTTAACCAGCAAGGAGGTGTTCACTTGGACCAAGAGCAACAATCGGCGGCTGCTCCACACCGGCGACATTGACAGAACAAGCAAGTTCTACATTTGCACATCGTGCTCCATGTGGCTGATGTGGGACACTAGGAGTAAATGGAAAACTCCACAGAGTAAATTTGCTACTTTTGAAACGTGA

Protein seq

MSGSTLTSKEVFTWTKSNNRRLLHTGDIDRTSKFYICTSCSMWLMWDTRSKWKTPQSKFATFET

Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_04G005140 OsN22_04G005140_01 Chr04 7893013 7902839 - NAM
CDS seq

ATGTCGGGCAGCACCTTAACCAGCAAGGAGGTGTTCACTTGGACCAAGAGCAACAATCGGCGGCTGCTCCACACCGGCGACATTGACAGAACAAGCAAGTTCTACATTTGCACATCGTGCTCCATGTGGCTGATGTGGGACACTAGGAGTAAATGGAAAACTCCACAGAGTAAATTTGCTACTTTTGAAACGTGA

Protein seq

MSGSTLTSKEVFTWTKSNNRRLLHTGDIDRTSKFYICTSCSMWLMWDTRSKWKTPQSKFATFET

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0006890 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0007520 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0004980 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0006950 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0005020 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0128100 RBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0005050 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0004850 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0005220 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0004970 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0004800 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0005120 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0004960 RBH 0.0 0.0 0.0
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