Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_04G002170 OGI:04007930 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:3227032-3236093
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_04G002170 OsN22_04G002170_01 Chr04 3227032 3236093 + NAM
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 1.634565 0.225727

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0153000 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g06900 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0153000 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0001880 RBH 0.0 0.0 0.464620
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0002140 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0002020 RBH 0.0 5.724475 0.215322
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0002060 RBH 0.0 0.056285 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0002040 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0051200 SBH 0.3224055 0.430289 3.1295085
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0002090 RBH 0.0 0.000000 0.029854
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0055300 RBH 0.0684345 0.013392 0.034687
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0002050 RBH 0.0 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0002290 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0002140 RBH 0.0 7.728011 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0001970 RBH 0.0 0.043697 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0002010 RBH 0.0 9.592282 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G001810 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0002080 RBH 0.0 0.000000 0.373656
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