Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_01G026710 OGI:01080540 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:25946236-25971124
Gene Symbol GELP18, OsGELP18, OsGELP18a, OsGELP18b, GELP19, OsGELP19, GELP20, OsGELP20, OsGELP20a, OsGELP20b, OsGELP20c, GELP21, OsGELP21, OsGELP21a, OsGELP21b, OsGELP21c
DNA seq

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Function GDSL esterase/lipase At1g28600 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q94F40]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_01G026710 OsN22_01G026710_02 Chr01 25955774 25958242 + IsoSeq
CDS seq

ATGTGGAATAATTCGCGCGCGCGTGGTGTGCATGGGTACGCCTCGTCGCGCCGCGCCGCAGCTGAAGCGATGGGGCTGCCGTTCGTGCGGCCGTACTGGGGCGGGCAGACCGCGGGGAACTTCGCCAGCGGGGCCAACTTCGCGGTGGGCGGCGCCACGGCGCTCAGCCCGGACTTCTTCCGGGAGAGAGGGGTGCCCATGGACGACGACACCGTGCACCTCGACATGGAGATGGAGTGGTTCCGTGATCTGCTCGGCATGCTCTGCACCGGCGGCGACATGGACGGTTGCAAGGGCATGATGAATCAATCTCTTTTCTTGGTTGGAGAAATCGGAGGCAATGATTACAACCTTCCTCTTATGAGCGGCATGTCCATTGAAAAGATTCGCAACTTCACTCCTAGTGTCATTGCCAAAAATTCTTCCATAATCACCGAATTGATTGGACTTGGGGCCAAGACACTAGTTGTTCCCGGTAACATCCCAATTGGATGTATTCCAATGTACCTCATGCAATTTGAGAGTGATAAGAAGGAAGATTATGAGCCAAAGATAGGTTGCCTTAGGTGGATGAATGAGTTCTCGCAATACCACAACAAACTTCTTGTAGATGAATTGGAAAACTTGCGCAAGCTTCATCTTGATGTGACCATCATCTATGCCGATTACTATGGAGCTGCCATGGAAGTTTTCCTTTCCCCTGAACGATTTGGAATTGAGGATCCTTTGGTCGCTTGCTGTGGTGGAAGAGGACCTTATGGTGTATCTGCATCTGTACGCTGTGGATATGGCGAATACAAAGTGTGTGATGACCCAGCAAAATATGCATCGTGGGATGGCTTCCATCCATCAGAAGCTGCATACAAGGGCATTGCAATTGGCCTGCTACAGGGTTCATACACTCAACCTCCAATTGTTAGCATCACTAATTCTTGTCCGCAGATAATTGGCCTTGGTTCCTCTGTTGAACACAAGGCCATGTACGAC

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Protein seq

MWNNSRARGVHGYASSRRAAAEAMGLPFVRPYWGGQTAGNFASGANFAVGGATALSPDFFRERGVPMDDDTVHLDMEMEWFRDLLGMLCTGGDMDGCKGMMNQSLFLVGEIGGNDYNLPLMSGMSIEKIRNFTPSVIAKNSSIITELIGLGAKTLVVPGNIPIGCIPMYLMQFESDKKEDYEPKIGCLRWMNEFSQYHNKLLVDELENLRKLHLDVTIIYADYYGAAMEVFLSPERFGIEDPLVACCGGRGPYGVSASVRCGYGEYKVCDDPAKYASWDGFHPSEAAYKGIAIGLLQGSYTQPPIVSITNSCPQIIGLGSSVEHKAMYD

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.336520 0.476939 0.929988

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0650100 RBH 0.333986 0.0 0.397315
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g46080 RBH 0.931226 1.229322 0.744269
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0649900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0027350 RBH 0.0 4.367940 6.923158
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0026830 RBH 0.203569 1.455687 0.704922
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0027300 RBH 0.436857 0.0 7.933193
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0026540 RBH 0.000000 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0026290 RBH 3.381404 0.000000 7.553514
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0440400 RBH 2.385898 1.1622905 0.5338585
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0025960 RBH 0.0 0.000000 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0429200 RBH 7.143577 3.1961245 0.477725
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0026220 RBH 0.108131 0.145926 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0026140 RBH 0.000000 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0026470 SBH 0.000000 19.097023 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0026510 RBH 0.427600 0.0 0.260124
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0026350 SBH 1.150223 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G026730 RBH 0.252214 0.000000 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0026470 RBH 0.277112 18.012470 5.902811
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