Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLima_08g0002100 OGI:08040680 | 16/16 LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr08:1755025-1765198
Gene Symbol -
DNA seq

ggtctcttacttatcctatccttatccgattcctctcgtcaccacttcccgtcgccagtccaccccatccccgcctccgccgctgtccatctccctcgccgcctccgtcgcctgtccagcgccatcgccttctacgctccctcgccgcactcgcccttcctcgctgccttctccaccgccagcgcccctcagtcgacgtccgcctccccgcctcccccgatatcggcggcttccctccgtcgaagcccttcctcatcgccctCccctccttctcctccgcccgcgtctcagcgccggcttgtgagcccccaccgttgccgtcctcctcccccgcccccttgtccagcgagtcgcgtgacgtagtcgcccctccacccgtctccgccggcgcgcgacgagtcctcttcgccgcgtcgcctccccgcgccaccaccgccacgttctcctccccatggaccgacgcacccttctccactccaccgctgtcgccatcgacctagccgcccccttctctgaagtctgaacatgcccttggcaactgatttaacccagtgtaagcaatactctattagttagtaggagtactactaactgggtcatattaatcacagttcaccaattctattgtcttgaattgcagttttttttggttaattttcaattttttccctcttcagtgttcagatactatgcaaggaatcgagaggagacagccgagcttcaggtacattctgaatcctcaaatctttccatacttttcttaccaatattcagttatacggtatcagaaagacaacgaagagaagttggtaaagagtatcatcttctaatgcgagattactcatttactctgttgcttcagccttcattatagtgctcacctaagcagcatcttaatataccaaccactactgttatgattttgcagataaaggttgtttgttcttgaatccattgtattgtatattgattatttgattgaatggttgactgatccaccagatgaatggactatttgaggactgcatgttggctgcagccgttgcttcctgtttgatatggcttcgatattgcttccatgcattctgacctatctcacattctgcatatgtgcttgaaagctaatgcttggttctgttttatttagtgcctcggtttgatttagtacaataaattaagcgctcaattgttaaatagtctttcaaaatgattatgcagtcccttttcttttctagacgtgcatgaatctatggttggcttaaaaattatagttgaatgggcacaacattaatgttcactgtgtacaaaaaactgtggttgtattttgaattttgtacatgatccacgacaggtaatctgcattggttatttggtatatttgtggagcatattatagatcaagatatatgtgaaataatagcattttaaaattaaaatttgtccagatcaccatatttgcatgaatatttttccttcaaagttggtccaTtttgttcagacaggacaacattgcacttaattttttttttcatattatggttcaagtgcagatattgtggattgccataacactatcaccttccaagtgcaaattagcactgagatttctggattgatcagtcgttgtgagtatggaattttgattctatgttcttctatgattaccaggctctggaaggatgtaatctatgatatatacaggtggtgatcatagcatgatagcaatcaaattCcacagtgttggtaggaatcaaatttcacaggttgtttgttcttgaatccatagtattgtatattgattatttgattgaatggttgggagcagggttagtttgcaagacggtggcatgcgcgaagggtggcatgcgcgaaggggatccgcatgccggcgaaggggttatcggtgttcaggtgcgacattgtagcagacgcacgtcggtgacgtcaacagctgactgcgctgagtcatcccgaagcgtaaggtttcatataccgctccttctcaaatggattgaaatatgaactatgaatattatctcaaaaaggcatcaatgtttgggatccataaaatacccaagtagtatataaattatttaataaGggtaagagagcatagtaaggtaattgtggtaaatgtatgacagatgatccatttatgtcgtggttggtagcagtggacgatctttaatgttgttcagttcggagttgatcaaaattccggctaagtcctgtcgaaatgtttttacttccttctgcataatgtaaagggagtgcattttaaatggtttttcgtattgggaagcagtggtgcaaaatatgaatagaggttgttgtagttacctgtagttgaatttttgggagataagatccggtccaatgctccatgaacttaagggtgtacaggccgcacgagacgctacaagaatttagtcgttaggataacatgtttctgtaattgaataatgtgaatatcatgtggaagagtttgagtcacccacccgtctccttgctttggcaatttttggactttgttgtactcccattaggtaatattgaaatcaggccaatcgtgttttaactgtgggtgctgattctctgtcccgtgtaatcccctctcgatagctagcagctgggaagttttgtgcaacgttggtacggttaaaatatagcaaaaccgatttgaattatacaagtggaagtgtatcgcttaccacacgccttagatcgggttgatctttactgattggctttgcgagcgaatctagtatttgcacctcacgtcgcttggcgttaagaacggctaggtaccagtgtgtatctttaatattaattgggaggaaaatctgcagatgttcaacagtaagattgagtcataaattgaattacccattacatagatagcttaaataagtattaccatgtcaaatgctagatagtcgcgtgccatatctctaatccatcgtttatctcgaggtttgcttgcttcaacatgcgctccctctacatttagtagacctgttgtaatggccatctctaggaaggccttgccatctcccctgattcctttctctttatagcggaggcattcgatgtatgcatccatgacctgaatttgagtttagttgagttacataacaaatatagttataaaagaatagtaggcttgttaaataggcgaacttatatcatcattcaagaaagctggttgtgttagtactttcaTttttttccgtttaacctccacttcttcaatatgcaccatcactttgttatcctcggtgttattaatgtaggtaatgaaagggtattcttttttagtcaactctacataggtacgacaaattagtaatagatctatataaatgttaaatggttaggcattaccttctgaattttttaacggtgtctggccatttgtttttgtcttcttttgaccacttaaggcgttctttggtgggcttttgtctatgatttgttgggtaagatcttccttctcgatgtacactagaaaagggtaagtcaaatcagtaacacacaaacatagaatataagttaaaaattatggatgatgtagaaagttcatacattcagatatttcatacggtgtttggttgttttgtttcctctttttttcacaccgtaattcgtctgtgtctggcatgtaagcttCtttattcgtttgcgcttgaaaaggaggaaagttagtaccattgacatgagcatatgtaaatatgaaatagcatagtacctatcgttttctttgtctgtgcttgggttcttattatgtccttctttttaccccttgtttcgtagatgaagtcagtccgattagttggtttgtatgttcttcctgtaggacctgtaagcctcttcttgctttgattgctctggttactgttgtcctattaggtaataaagtacacgtcagtattatgataagatgtagtaacgttagcaagagaaataaaatttagtttaccttcgtttcactagtcatgtttacattttggtttatataggactcttcgttatgatttgatacatgctccccgggatcattttgttcttgttcaacatcctgcaatagcgtcaacctttttttagcggtgtatatacataagtaataatgattaacagtctagcatatgatgtttacctcaaacacatgcgtactatcttttcgctttgggcaTtttgaatcattttccatgcaatctagtatcaatgatcgcatacgtggccaaaaatcctttgtgaaatcgttgaaattatcttgtaaagtttggatgctttcttgtaacctttcttgtaaagtgatgtcggctgattgttcagtggatgttatagagtgtatctgaatagcacaagtgagaaaaggatgtcaaacatattttgttaaatagagttcgtattaaaaccccataatatatacctcttcagaagtgccttgaaaatcttcattgctacgtgtttctgagtcattgtcgtgcgctttttcatcggggatttcattgcaatgtatagttcccctaatgtcgtcgacaacctatttttagtgaaaaaggggtattagagattttacagacagttgatataattagtacatagtattaaaaatgagatagttaccttcccttgtccaaaaaggtaagaaattcgctttttttttgtcccagtactgaattagtggcctttgacggctagaatgatatattgtcgcagccaatttatctattcgcactttttcccaataccaaatctgcaagcatttgaacattagataatgagtattgctatgaaaatttgttcatgacaattttgtaaacatactaaaTtttgaaacaaacctgtaagaggcatacgttcccctcaatgtttgttgtcttctctctaaattttattatgcctttcagtaactgattcagtgttagactagaccagtttagttccctcattttgtcaacgtcgtcgacgagattgagatattctgagcgcacata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CDS seq

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Protein seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLima_08g0002100 OsLima_08g0002100.01 Chr08 1755025 1765198 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g03750 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0002170 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0002220 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0002220 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0002200 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_08g0002040 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0001920 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_08G0029100 RBH 0 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0002100 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0002010 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_08g0002100 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_08g0002020 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_08G012030 SBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0013770 SBH 0.0 0.0 0.0
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