Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLiXu_Ung0064220 | OGI:99060330 | 1/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | ChrUN-Ctg481:184808-190359 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | ctatgcagacagtttctgtagcgacgtgagatgtttgatgtcctcctgtgattcgttcatctcgaacctgtttattttcaattccttaagagacacgagctgacccaaccaatttggcagctgggcctggttataccatcgctccagagtcaatgattctagagaggagagggctctgatgatctctgctgagatagtccaatcattgcaatcattgataattaagcctttgaggtccgggaggtggtgaagcaacctccactcatgaagagaaaccttgcagttgatactcaaagtagtcactagaggagaggagcaggatgcgatgatatctgccgcactttcttcccatgaggatatgacaccatcacttccccaaatgttccatttctcggctcttagtgggcatggtgtaagtctcagcttggtgcaccgaaatatgctcaactcaggaagtatagggaacataaactcgctcacaccatccccaccactgcagtatattgtgttccacacttgcaggctttccatatcacgcatgacaaatttcttcagtcgaggaaagggccttcggccaccgcagaagtccccatcaatttttgtgacgctcttcattttttcaagagttaactctttcaaattaggtaattgaccaagtggtggtaggctgatgcagcagggcatatccatcatggtaagaggaacaagattagggagataaggagcaatgcccattagccatgctggaaacttggtgcagttataaccatgtatctcaaactccattaaatttgttggtggaataatctctcctagcaattcaatatcctccacaaacctcacagcatctttggcccactcaagattcaactcttctattctttgcttttccaaaagttttattatctggacctcattgatggacctcacattttcaagactgcttatctccaacttaggtggatttacatcctgaagcagaacaaggttgctgccagagccattggcatttgcttggaccacaaagtgcggcaatgagactgaactttcgttcaatagacaaaacatggacttccccaaataaatgcgagtatctgcatgcagaaacttcaggttatcaatgttatggatgcttggtggtatcttgtccagaaagctgcagcctgagacatctagtgtatgcagccttttgaggctaccaaaacagtcaggtaaactcctaagatattcgttgtgagacaaatcaaggtgctcaaggttcgaaagggtattaatacactcgaagaaactgacatatgttgatttgtcatgacactttttattaagcaagtccgataagttcaaatactggagtttcttgagattaccaatggcttctaccttccttctaatatacacgtcattttcgaaaatgttgtagcaatgtgataaatttagaacttggaggttggtaagtccacccaaggcttctggtatacccttaacctgaagacaatgtgataaatcaaaatgcatcaaactattgagatttccaaatgacgttggtagtttttctaatttcttgaaacctgataagtttaaatacttaagatagttgaagctacacaaagcttcaggtagtctttcgatatcagaagattctgatgacagattcaagtattcaagtttggtaagtttacccaaaacttccattgccgaccccccaagaatgtatgagcagcttgataagttcaaatattccaatttcctaaggttacccaaagctcctggcagctctccaatatttttgcagtttgataaatttaaatattcaacattggtgagactctccaaggattccgatacacctctaaccctagtgcaatgtgacaaatccagatgaaccaattttgttagcttgccaaatgacactggcaatcttattattcttgaacaatctgataaatcaagatacatcaagtcctccatttctcccataaattctggcaatgcctggattccagaagatccccgaagactaagatacattagtttcaagagcttggtgataccatcaggaatcgtttcatgttgaactcctgtggcattaagatacctcaactgcttcaattgaccaatagaatctggcaatctctgtatagagcactcacttaaatccaacagacgcaggtacttagcagatgaaaatgaatcattgtgaagtctattatctatgctgcatcccataaaacgcagtgcccttaatgtttccaatggcttgctaaattcagtacgcaaagcatagcggcaatttcttccactagtgtctccttgcaaaccatcattctgtatttcatcaaacatgactgatcttgccaagtcgtggaccagatcatgcatggttaacaatataaaattgtcgtgataatctccagcagtctgtaacataaagcaattagtaatcagcgtgaggacttcatattcctgtcatttcatgttttagaatctgtaatgaaggccaataacatgttgcatacaatgaaagcaacagacaatgtagacttccaaaaataatggtaggagaatcaatcgaaccgttcaacttttctcatctcatagatcatatttatttatgataccacctcacttattggtagtagaattaaaGgggtataactgtttcctatggttagctacaacatttttgggggatcacttgcatcgatataacttataaattaatggctaagatttcttctattgattataatattggtagcagaatactaacagtaagggtaaaagtacagtaaaaaataccgaggaagaacaagttttttagctcatgttgtagtgattaagaaaacataattataggaactaaccatgtttggtatgcgcaagcagggtgagattcatgatgattaagtgtgctacaataattcatccaacaagggaattggtgctggttgttgagaagagaaaaaggaaagagtaactaaggacccagctggttgttgctggtttgacacaacaaaggagttgggatgttgcagaaatagaacatggcttactttatgtgctatatatactattaaaaaggaacgaagcaagtagcttgatgaaaatgaagctagaaggatcgtttgccgcacacagtagcacatgttaacatcagaatattttttatttcccaaaaggatggagtagagttcagttcagttgagtagagtttggacaaagttaagactagttgtccattaaactcagtaaactggacaattcagtcgagccttggaggttgtttggttgctaaccatattttaccaacatttttctcaagaaaagttaccatatatacttggctatattacagttaggcaagcctaaagagaatatatgttgccatattttctttaagtaagtgatgcgtgggacctaatttatcataactgtgactgtaaccaaacagctattaaattggttaaacttatctaactttagacatgagaaattgtgaccgataaatataaaagtctcatacaacatatttctatattccataaatttatatgtttttcataccatagggcaaaatggacttttctataagaatttaacggtcaactaacggaaggggtatgaaggaatccaaactaaaattcagggtatataaggaaatgagcaaaattcagggtcatataagtattgtgcagagtttgaggggtacactgggaattttctcttttatctttcatatattaatctaaccatctcaacctcacatcattacttatagatatgtgccttatgttacttatatctagttacttaggatatattaacattctaagaagtgtttctacaaaggttaaaatgcctcaagaaatttcggtatcatgcaaattgtgaagggccgaaaagatgctctacaagataaatttaataatatatgctaaaaatgcctccatatattctaagtaacaaaagtgcctctacataaggtttttgttgtagtggcagtgcaagttataaattagaaagtactccctccgtttcacaatgtaagactttctagcattgttaatgaatctactatacacatatatgtctaggttcattaacatgtatatgcatatggacaatactagaaagtcttacattgtgaaacggacgaaatatatgtgataattgaggcaactcttagtgttaatagagaatcccacaacttaatgacatttcttttaacttcttggtaccttcttataccctagtgttaaggtacccatagatcttataaatgaccaatgaagagaacttttaaagtccttcataagttaccattaggtgacacaaattatattaacactaaattatggtaccctagagcaccataatatggtttcctcctaataactaagcaagagttataaaaactccataaattaaggtgagagatgatagaactggccactaatgggaatacggagtaacttacatatagtgacttcggacgctgaagaaaggacatccccaacagttgagtaacatacatctcaccaagttgtctgcaggaatatacctttgatggtttgataaagttgagagaaatccattggtgaattaaatcatccttaactatcttttgacctttaggaaatattgcacaatatccaaaacataacttcaagcttggctgcattttgacataacttaacttcaaggatgcaagcacatgatgtggtgaagatgcatcttctgaggtagattcattccaaatatcattgtctttcactgattcccattcgtcaagccttttggaatgtaataatacccaagggattgagcagctaatgccacaccgccacatttccttgcaatctcccttcctgtctgttccaaccgttctttgtcacctctatcttcaaaagcacttttttgttttattatgttccaacacatgccatctgtcaagggctctagcttgtagggttcaacattagaaaatctcctagcaatgtcttcatcacgtgtggtaactatgacgatcaccttggctcccgtcctgacctttagcttaagcttcaatttatctaatttgaaaccattattctcccaaagatcatccaaaactattagaatattcctattggtaggtgccacctctgaatcactcatgctaagatccattttgggtagttctgaaattatagagctctcaattttatttaaatcaaacacctgggacacatagacccacacaagagaatactctctaaatttcgtatcactgaaaactaactgcactaaggttgtcttgccaatacctcccatgccatatattgcaaggataatgaaatcttggtcaagatcttatcagataagtaaaataatatcctctgcttgtcttgagcccttccaacgatgactgattcttccacgtttggagatgtggcccgatcatcatagagtacttgtacagtggagctgctctctggcattaaattgaaatccttgttttgtttcgcgattttctcaagttgcaccctcatcttcttcatatttttggccat
More
|
||||||||||
| CDS seq | atggccaaaaatatgaagaagatgagggtgcaacttgagaaaatcgcgaaacaaaacaaggatttcaatttaatgccagagagcagctccactgtacaagtactctatgatgatcgggccacatctccaaacgtggaagaatcagtcatcgttggaagggctcaagacaagcagaggatattattttacttatctgataagatcttgaccaagatttcattatccttgcaatatatggcatgggagttagttttcagtgatacgaaatttagagagtattctcttgtgtgggtctatgtgtcccaggtgtttgatttaaataaaattgagagctctataatttcagaactacccaaaatggatcttagcatgagtgattcagaggtggcacctaccaataggaatattctaatagttttggatgatctttgggagaataatggtttcaaattagataaattgaagcttaagctaaaggtcaggacgggagccaaggtgatcgtcatagttaccacacgtgatgaagacattgctaggagattttctaatgttgaaccctacaagctagagcccttgacagatggcatgtgttggaacataataaaacaaaaaagtgcttttgaagatagaggtgacaaagaacggttggaacagacaggaagggagattgcaaggaaatgtggcggtgtggcattagctgctcaatcccttgggcttgacgaatgggaatcagtgaaagacaatgatatttggaatgaatctacctcagaagatgcatcttcaccacatcatgtgcttgcatccttgaagttaagttatgtcaaaatgcagccaagcttgaagttatgttttggatattgtgcaatatttcctaaaggtcaaaagatagttaaggatgatttaattcaccaatggatttctctcaactttatcaaaccatcaaaggtatattcctgcagacaacttggtgagatgtatgttactcaactgttggggatgtcctttcttcagcgtccgaagtcactatatactgctggagattatcacgacaattttatattgttaaccatgcatgatctggtccacgacttggcaagatcagtcatgtttgatgaaatacagaatgatggtttgcaaggagacactagtggaagaaattgccgctatgctttgcgtactgaatttagcaagccattggaaacattaagggcactgcgttttatgggatgcagcatagataatagacttcacaatgattcattttcatctgctaagtacctgcgtctgttggatttaagtgagtgctctatacagagattgccagattctattggtcaattgaagcagttgaggtatcttaatgccacaggagttcaacatgaaacgattcctgatggtatcaccaagctcttgaaactaatgtatcttagtcttcggggatcttctggaatccaggcattgccagaatttatgggagaaatggaggacttgatgtatcttgatttatcagattgttcaagaataataagattgccagtgtcatttggcaagctaacaaaattggttcatctggatttgtcacattgcactagggttagaggtgtatcggaatccttggagagtctcaccaatgttgaatatttaaatttatcaaactgcaaaaatattggagagctgccaggagctttgggtaaccttaggaaattggaatatttgaacttatcaagctgctcatacattcttggggggtcggcaatggaagttttgggtaaacttaccaaacttgaatacttgaatctgtcatcagaatcttctgatatcgaaagactacctgaagctttgtgtagcttcaactatcttaagtatttaaacttatcaggtttcaagaaattagaaaaactaccaacgtcatttggaaatctcaatagtttgatgcattttgatttatcacattgtcttcaggttaagggtataccagaagccttgggtggacttaccaacctccaagttctaaatttatcacattgctacaacattttcgaaaatgacgtgtatattagaaggaaggtagaagccattggtaatctcaagaaactccagtatttgaacttatcggacttgcttaataaaaagtgtcatgacaaatcaacatatgtcagtttcttcgagtgtattaataccctttcgaaccttgagcaccttgatttgtctcacaacgaatatcttaggagtttacctgactgttttggtagcctcaaaaggctgcatacactagatgtctcaggctgcagctttctggacaagataccaccaagcatccataacattgataacctgaagtttctgcatgcagatactcgcatttatttggggaagtccatgttttgtctattgaacgaaagttcagtctcattgccgcactttgtggtccaagcaaatgccaatggctctggcagcaaccttgttctgcttcaggatgtaaatccacctaagttggagataagcagtcttgaaaatgtgaggtccatcaatgaggtccagataataaaacttttggaaaagcaaagaatagaagagttgaatcttgagtgggccaaagatgctgtgaggtttgtggaggatattgaattgctaggagagattattccaccaacaaatttaatggagtttgagatacatggttataactgcaccaagtttccagcatggctaatgggcattgctccttatctccctaatcttgttcctcttaccatgatggatatgccctgctgcatcagcctaccaccacttggtcaattacctaatttgaaagagttaactcttgaaaaaatgaagagcgtcacaaaaattgatggggacttctgcggtggccgaaggccctttcctcgactgaagaaatttgtcatgcgtgatatggaaagcctgcaagtgtggaacacaatatactgcagtggtggggatggtgtgagcgagtttatgttccctatacttcctgagttgagcatatttcggtgcaccaagctgagacttacaccatgcccactaagagccgagaaatggaacatttggggaagtgatggtgtcatatcctcatgggaagaaagtgcggcagatatcatcgcatcctgctcctctcctctagtgactactttgagtatcaactgcaaggtttctcttcatgagtggaggttgcttcaccacctcccggacctcaaaggcttaattatcaatgattgcaatgattggactatctcagcagagatcatcagagccctctcctctctagaatcattgactctggagcgatggtataaccaggcccagctgccaaattggttgggtcagctcgtgtctcttaaggaattgaaaataaacaggttcgagatgaacgaatcacaggaggacatcaaacatctcacgtcgctacagaaactgtctgcatag
More
|
||||||||||
| Protein seq | MAKNMKKMRVQLEKIAKQNKDFNLMPESSSTVQVLYDDRATSPNVEESVIVGRAQDKQRILFYLSDKILTKISLSLQYMAWELVFSDTKFREYSLVWVYVSQVFDLNKIESSIISELPKMDLSMSDSEVAPTNRNILIVLDDLWENNGFKLDKLKLKLKVRTGAKVIVIVTTRDEDIARRFSNVEPYKLEPLTDGMCWNIIKQKSAFEDRGDKERLEQTGREIARKCGGVALAAQSLGLDEWESVKDNDIWNESTSEDASSPHHVLASLKLSYVKMQPSLKLCFGYCAIFPKGQKIVKDDLIHQWISLNFIKPSKVYSCRQLGEMYVTQLLGMSFLQRPKSLYTAGDYHDNFILLTMHDLVHDLARSVMFDEIQNDGLQGDTSGRNCRYALRTEFSKPLETLRALRFMGCSIDNRLHNDSFSSAKYLRLLDLSECSIQRLPDSIGQLKQLRYLNATGVQHETIPDGITKLLKLMYLSLRGSSGIQALPEFMGEMEDLMYLDLSDCSRIIRLPVSFGKLTKLVHLDLSHCTRVRGVSESLESLTNVEYLNLSNCKNIGELPGALGNLRKLEYLNLSSCSYILGGSAMEVLGKLTKLEYLNLSSESSDIERLPEALCSFNYLKYLNLSGFKKLEKLPTSFGNLNSLMHFDLSHCLQVKGIPEALGGLTNLQVLNLSHCYNIFENDVYIRRKVEAIGNLKKLQYLNLSDLLNKKCHDKSTYVSFFECINTLSNLEHLDLSHNEYLRSLPDCFGSLKRLHTLDVSGCSFLDKIPPSIHNIDNLKFLHADTRIYLGKSMFCLLNESSVSLPHFVVQANANGSGSNLVLLQDVNPPKLEISSLENVRSINEVQIIKLLEKQRIEELNLEWAKDAVRFVEDIELLGEIIPPTNLMEFEIHGYNCTKFPAWLMGIAPYLPNLVPLTMMDMPCCISLPPLGQLPNLKELTLEKMKSVTKIDGDFCGGRRPFPRLKKFVMRDMESLQVWNTIYCSGGDGVSEFMFPILPELSIFRCTKLRLTPCPLRAEKWNIWGSDGVISSWEESAADIIASCSSPLVTTLSINCKVSLHEWRLLHHLPDLKGLIINDCNDWTISAEIIRALSSLESLTLERWYNQAQLPNWLGQLVSLKELKINRFEMNESQEDIKHLTSLQKLSA |
||||||||||
| Function | Disease resistance protein RGA2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XBQ9] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_Ung0064220 | OsLiXu_Ung0064220.01 | ChrUN-Ctg481 | 184808 | 190359 | - | NAM | ||
| CDS seq | atggccaaaaatatgaagaagatgagggtgcaacttgagaaaatcgcgaaacaaaacaaggatttcaatttaatgccagagagcagctccactgtacaagtactctatgatgatcgggccacatctccaaacgtggaagaatcagtcatcgttggaagggctcaagacaagcagaggatattattttacttatctgataagatcttgaccaagatttcattatccttgcaatatatggcatgggagttagttttcagtgatacgaaatttagagagtattctcttgtgtgggtctatgtgtcccaggtgtttgatttaaataaaattgagagctctataatttcagaactacccaaaatggatcttagcatgagtgattcagaggtggcacctaccaataggaatattctaatagttttggatgatctttgggagaataatggtttcaaattagataaattgaagcttaagctaaaggtcaggacgggagccaaggtgatcgtcatagttaccacacgtgatgaagacattgctaggagattttctaatgttgaaccctacaagctagagcccttgacagatggcatgtgttggaacataataaaacaaaaaagtgcttttgaagatagaggtgacaaagaacggttggaacagacaggaagggagattgcaaggaaatgtggcggtgtggcattagctgctcaatcccttgggcttgacgaatgggaatcagtgaaagacaatgatatttggaatgaatctacctcagaagatgcatcttcaccacatcatgtgcttgcatccttgaagttaagttatgtcaaaatgcagccaagcttgaagttatgttttggatattgtgcaatatttcctaaaggtcaaaagatagttaaggatgatttaattcaccaatggatttctctcaactttatcaaaccatcaaaggtatattcctgcagacaacttggtgagatgtatgttactcaactgttggggatgtcctttcttcagcgtccgaagtcactatatactgctggagattatcacgacaattttatattgttaaccatgcatgatctggtccacgacttggcaagatcagtcatgtttgatgaaatacagaatgatggtttgcaaggagacactagtggaagaaattgccgctatgctttgcgtactgaatttagcaagccattggaaacattaagggcactgcgttttatgggatgcagcatagataatagacttcacaatgattcattttcatctgctaagtacctgcgtctgttggatttaagtgagtgctctatacagagattgccagattctattggtcaattgaagcagttgaggtatcttaatgccacaggagttcaacatgaaacgattcctgatggtatcaccaagctcttgaaactaatgtatcttagtcttcggggatcttctggaatccaggcattgccagaatttatgggagaaatggaggacttgatgtatcttgatttatcagattgttcaagaataataagattgccagtgtcatttggcaagctaacaaaattggttcatctggatttgtcacattgcactagggttagaggtgtatcggaatccttggagagtctcaccaatgttgaatatttaaatttatcaaactgcaaaaatattggagagctgccaggagctttgggtaaccttaggaaattggaatatttgaacttatcaagctgctcatacattcttggggggtcggcaatggaagttttgggtaaacttaccaaacttgaatacttgaatctgtcatcagaatcttctgatatcgaaagactacctgaagctttgtgtagcttcaactatcttaagtatttaaacttatcaggtttcaagaaattagaaaaactaccaacgtcatttggaaatctcaatagtttgatgcattttgatttatcacattgtcttcaggttaagggtataccagaagccttgggtggacttaccaacctccaagttctaaatttatcacattgctacaacattttcgaaaatgacgtgtatattagaaggaaggtagaagccattggtaatctcaagaaactccagtatttgaacttatcggacttgcttaataaaaagtgtcatgacaaatcaacatatgtcagtttcttcgagtgtattaataccctttcgaaccttgagcaccttgatttgtctcacaacgaatatcttaggagtttacctgactgttttggtagcctcaaaaggctgcatacactagatgtctcaggctgcagctttctggacaagataccaccaagcatccataacattgataacctgaagtttctgcatgcagatactcgcatttatttggggaagtccatgttttgtctattgaacgaaagttcagtctcattgccgcactttgtggtccaagcaaatgccaatggctctggcagcaaccttgttctgcttcaggatgtaaatccacctaagttggagataagcagtcttgaaaatgtgaggtccatcaatgaggtccagataataaaacttttggaaaagcaaagaatagaagagttgaatcttgagtgggccaaagatgctgtgaggtttgtggaggatattgaattgctaggagagattattccaccaacaaatttaatggagtttgagatacatggttataactgcaccaagtttccagcatggctaatgggcattgctccttatctccctaatcttgttcctcttaccatgatggatatgccctgctgcatcagcctaccaccacttggtcaattacctaatttgaaagagttaactcttgaaaaaatgaagagcgtcacaaaaattgatggggacttctgcggtggccgaaggccctttcctcgactgaagaaatttgtcatgcgtgatatggaaagcctgcaagtgtggaacacaatatactgcagtggtggggatggtgtgagcgagtttatgttccctatacttcctgagttgagcatatttcggtgcaccaagctgagacttacaccatgcccactaagagccgagaaatggaacatttggggaagtgatggtgtcatatcctcatgggaagaaagtgcggcagatatcatcgcatcctgctcctctcctctagtgactactttgagtatcaactgcaaggtttctcttcatgagtggaggttgcttcaccacctcccggacctcaaaggcttaattatcaatgattgcaatgattggactatctcagcagagatcatcagagccctctcctctctagaatcattgactctggagcgatggtataaccaggcccagctgccaaattggttgggtcagctcgtgtctcttaaggaattgaaaataaacaggttcgagatgaacgaatcacaggaggacatcaaacatctcacgtcgctacagaaactgtctgcatag
More
|
|||||||
| Protein seq | MAKNMKKMRVQLEKIAKQNKDFNLMPESSSTVQVLYDDRATSPNVEESVIVGRAQDKQRILFYLSDKILTKISLSLQYMAWELVFSDTKFREYSLVWVYVSQVFDLNKIESSIISELPKMDLSMSDSEVAPTNRNILIVLDDLWENNGFKLDKLKLKLKVRTGAKVIVIVTTRDEDIARRFSNVEPYKLEPLTDGMCWNIIKQKSAFEDRGDKERLEQTGREIARKCGGVALAAQSLGLDEWESVKDNDIWNESTSEDASSPHHVLASLKLSYVKMQPSLKLCFGYCAIFPKGQKIVKDDLIHQWISLNFIKPSKVYSCRQLGEMYVTQLLGMSFLQRPKSLYTAGDYHDNFILLTMHDLVHDLARSVMFDEIQNDGLQGDTSGRNCRYALRTEFSKPLETLRALRFMGCSIDNRLHNDSFSSAKYLRLLDLSECSIQRLPDSIGQLKQLRYLNATGVQHETIPDGITKLLKLMYLSLRGSSGIQALPEFMGEMEDLMYLDLSDCSRIIRLPVSFGKLTKLVHLDLSHCTRVRGVSESLESLTNVEYLNLSNCKNIGELPGALGNLRKLEYLNLSSCSYILGGSAMEVLGKLTKLEYLNLSSESSDIERLPEALCSFNYLKYLNLSGFKKLEKLPTSFGNLNSLMHFDLSHCLQVKGIPEALGGLTNLQVLNLSHCYNIFENDVYIRRKVEAIGNLKKLQYLNLSDLLNKKCHDKSTYVSFFECINTLSNLEHLDLSHNEYLRSLPDCFGSLKRLHTLDVSGCSFLDKIPPSIHNIDNLKFLHADTRIYLGKSMFCLLNESSVSLPHFVVQANANGSGSNLVLLQDVNPPKLEISSLENVRSINEVQIIKLLEKQRIEELNLEWAKDAVRFVEDIELLGEIIPPTNLMEFEIHGYNCTKFPAWLMGIAPYLPNLVPLTMMDMPCCISLPPLGQLPNLKELTLEKMKSVTKIDGDFCGGRRPFPRLKKFVMRDMESLQVWNTIYCSGGDGVSEFMFPILPELSIFRCTKLRLTPCPLRAEKWNIWGSDGVISSWEESAADIIASCSSPLVTTLSINCKVSLHEWRLLHHLPDLKGLIINDCNDWTISAEIIRALSSLESLTLERWYNQAQLPNWLGQLVSLKELKINRFEMNESQEDIKHLTSLQKLSA
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0212000 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g10610 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0212000 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0007100 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0007080 | SBH | 0.030859 | 0.135391 | 0.760307 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006990 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0007010 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0092700 | SBH | 0.535219 | 12.828787 | 12.050672 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0092900 | SBH | 0.0229945 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0007010 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006970 | SBH | 1.186617 | 7.702504 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0007010 | RBH | 0.210385 | 0.0 | 0.077995 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G007020 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006840 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
