Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLiXu_Ung0050870 | OGI:99050730 | 1/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | ChrUN-Ctg389:104914-115306 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK266, OsRLCK266, OsSIRK1 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IOS1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C8I6] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_Ung0050870 | OsLiXu_Ung0050870.01 | ChrUN-Ctg389 | 104914 | 115306 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgcgattcggtcatgatcgaacatttattgacgtcgtcgaatatcggccaggtttcctaagcatcgattgcggtctggacggcaacactagctcctaccaagactctcacggcatcttctacgagcccgacggcgcatacgtcgatgccggagagaaccaccggctgtctgcggattacgagagcattatccatcgtcgtgctgaccagacggtcaggagcttccccaccggggagaggaactgctacgctctccccaccgtcctcGgggccaagtacctggtccggatgacattcttctacggcaactacgacggtaaggagacctggtcctggccgacgttgcacttcgatctgtaccttggggtggaccgctggaccacagtgcacgccgacagcacgaaaacgtacgaggcgctgttcgtggcgtgggcgagctggacgccggtgtgccttgtcaacactggcagcggcacgccgttcgtgaacgcggtggagctgaggatgctcggcagtgacctctacccggacctcacggccaacgagtccatgaacttcgttgaacgggtcaacatgggctcaaacaattcactcatacagtaccatgatgatctgtatgaccgttactggtggccgatgtcgcggtcttacccgatgtggaagaatatttctactgtgtcgaccatttccaactacattatacccttacccgttatccagaccgccatcgaggcagtcagcaaaaacacgacgctcgagtacaattggcgagacaacgaaggttcccactattataagacatacatgtactttgcggactttcagaacagccagctcagacagttcaacatatccttcaacacgctcacaaatgatcagtacagtccattgttcctatccccctctgtcgtggtcaacaaacatgaatggtacaagtccgacgatggcacatatacgattactcttaaggccaccgcggagtccatactgccgccaatgatcaacgccttagaggtctacactcgcatctcccataccaatccaaagacattgccaacagactttgacactatcatggcaattaaattcgagtatGggataaagaaggattggacaggcgatccgtgtttccctgtagaacctggctgggatggcgtgaaatgcagcaatgctatagataacactatgagaataatatctttgttcgattccaatgaagacatgtgccatccacatcagcgaataaagaaagcaaagagagcagtcaccatagctatctcggtagtgatacctgtgatggcaattggtgctcttgttcttgcatattttatctggagacagaaaaaaaatcccaaagtttcttctacttaccctcctagagaaccaaaccttgagattactccaacaagtagaaacgatattggggatgccctacaaaaagttgagaatcgccgattcacatacaaggagcttgagaagttaacaaacaaatttgagaagttaattggacaaggtggttttggacttgtctactacggtcgtttagaagatggtactgaggttgctatcaagatgcgttctgagtcatcatctcatgggcttgatcaattttttgcggaggttcaaagtttgacaaaggtgcatcacaggaatctagtttcattggttggttattgtcgggagaaggatcatttatcactcgtttatgagtacatggctcgaggcagcctctatgatcatctgagaggtaataaggatgttcatgaaactttgaattggagaacacgccttcgagttgcagttgaagctgcacaaggattggattatttacataaaggctgcagtctaccaataattcaccgagatgtgaagacccagaacattctattaggtcaaaatttacaagctaaaattgcggactttggactttgcaagacttatcttagcgagacacagactcacatatcaatcactccagctggttcagtgggttacatggaccctgaactcggcggtgcctatgatgttagctcaatgtggaaagtggtggacaccgcgttatcatgcacggctgatattggtgctcaacggctaacgatggctgctgtggttgtgcaactgaaggagagccttgaattggaggaagctcatgtggatagtggcctcaggggaagtgcaagcacagtgagtgacactacgttttctccatcagcaagatga
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More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0361100 | SBH | 2.755226 | 2.592065 | 6.849056 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g19140 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0361100 | SBH | None | None | None |
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| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0006790 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0007290 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0006960 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0007320 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0198900 | SBH | 0.0077135 | 0.0075195 | 0.012407 |
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| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0006970 | SBH | 0.852587 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0006610 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0007010 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G007410 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0007380 | SBH | 0.0 | 3.695226 | 0.0 |
