Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLiXu_09g0006590 OGI:09032520 | 16/16 LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr09:11345571-11352442
Gene Symbol RLCK263, OsRLCK263, OsRPK3, RPK3
DNA seq

atggcggcctcggctttattcgctgcattcatgttagccgctgcgattcatggcgccgccagtcaagaaggtttcgttcacttcttctcattagattatctgaattaagatcaagaattcaagagctcactacttgtctacttcagaagttcagataggtcaccaggttctctaacttttatgcagctggatttctgagcatcgactgtggtctggaggccaactacagcggctacagggaggccgagaccggcatcgtctacgtctccgacggtgcctacgtcgacgctggcgagaaccaccgggtggccgccgaccaggacagcgagctcgtccgcgccgacctgaccgtcaggagcttcccctccggcgtgcggaactgctacgcgctgcccaccgtcgccggtgccaagtacctggtccgggtggtggccgtctacggcaactacgacggcaagaacagctcgtcgacgctggagttcgacctgtacatcggggtgaactactgggacaccgtgtacgccgacggcgcccaggtgtacgaggcggtgttcgtggcgtgggcgagctgggcgccggtgtgcctcgtcaacaccggccgtggtacgccgtttgtgtcctcgctgaatctgaggccgctccctgacgcgctttacccggctgtcatggccaaccagtccatggccatgtatagccggcgcagcttaggggcaaatgcaatagtgcggtatgttctttccttgatccacatatttatagtatatctattattatagaaaagtatttatattagacgaatacatatataattacgggatgcatatatttcgataatagaatagtagtatacgttgcagagctagaatagcaacgcaggatgataaattaaaatgtgttcaagggtggatccaggccttgggtcacctaggtagtggtcaaaagcttaggattggagggctgttctttatggctggcctaactctctatgggctggcttgagcctcgggtcaatcttgggtctaacactaaatgtgttgaataaattttagattgatttgaaagagcctttgttttagagcccatttagaccttagaatgtccattgactaggctaggctgacacaatatagccttgtttgtttcaagctgaaattgttgtcccacatcaatcccaacaagatcctatggctgtagacatcgagttactataatgtgttgttagacctattcaaacatcgagtctcatttgggttacatgctgagcatgttagacaatactaagggtgatggagaatatcatggtggttggccaaagagagttagcactggccaactggctaggactgtagccaacaaaaaatgttgtgattggaggtggcgattggcgtgtacttatgggtgaagtacatcccgggatgggtatgcggagaacttccgcatctttgaatggataggatatcttatagaacacattattaatttacagatggaagaaaattgcatatttgttgctaacaccactagcagctagcaagtccatggtacatgctgacatggtgaggggttggggccaagtgtcagcactagctttgttggtctgaaagaaccccccttctccttctcgacccctctcttcaaatcatgtttttggaatcagattacgcatgaaaatggacaaagcaagctacttcatttctcctaattttgtttatatttttagactaagttttgatcttggggatagtatgtgagaaatagtatgtgcaatctcttatccaagatacaatctagctatgataactaatgcagaatcgcaagggaggatttaattaaaaaatcgacacctataatataagtataggtgttggttctattaaaaaccggcacctatagtattggcaccagtttttctttagaaccgacacctattgtgcttaaaggtgctagttttatatttttttcatcgtccggtttaattgaaccggcacctataaggccagtctatatgagggtatgagggtttttgtagtagtgcaaccttaagatatgaactgttttatatgccctaatattccttaacccttgtgaagggggatgctctacatttcatgtagggtagttttatcatcgttaagaatataccgtgaggtactacattttttattataaaatttggtatatataggtactaggtatctcgaggtaccaaaattttttaggcaaaatttgctacgggacactaaaaaaatgtataattagctatgggacacaagaaagatgtgaatttgccggagaacacttcaaaagtatggtaatttgctacaagacactgaaagcattaaaatataatatccacacaattgatgagagagaaacacataatgacagttttgcccttagggtaagataataagggcaaaactgtcaTtttgtgtggtttgcctcttatcaattgtgtggatattatatttttaattcttccagtgttctgtagcaaattaccatacttttgaagtgtcctatagctaattacacattttttagtgtcccgtagcaaattttgccaattttttaagtacctcaagtaatttccttaagaaccgtaaaatttctctgtcatatatgtatttttttacaagtaattcatcttggaatcgaacaataggtatcccaatgatcaatatgatcggttctggtggcagatgcatgctaacccaacgtgggcgaacatttccactacattagccattaaaccatatcctagcattgttgtacccttgcccgttatccagaccgccgttgaagcaggaggcaacaacacaaagctcaacatcacatggcaggacagcagtactctccgtgaattcatggtgttcctgcactttgccgactttcagaacagacagctgcggcagttcaacattacctttaatgaggaccggctggaccagtacagcccgccttacttggctgcagatgccttgggcaatagtgtttggtatagggccactgatggcaggtacaacatcactcttgtggccaccacagcatctgtgttgccgccaatgatcaatgcattcgagatctacactctcatcacacatgacaatccactgacatttccaaaagattgtaagtcttctgctgttataatactcttctgattcatttactttaatttgtttcagatttgtgcacacctttttctcctaaaacatgcattggtcatcttaaaaaattgtgtttctcggttaagacttagaggtgttttacaggtggttaggggcacatttagaaattaatatgtctaaatctatctagtagaggcgttcataaggcattttctaagttgcctatcgtatgaaggcatcttattggagatgtttttacctccctagaagcattcttagatggttaatttgtgttgtctagctaaatataaataatacaaatcatttagaggcaagtcttgatttggcaaagaaaatttcagtagagacaaaaacacactactataatagaaaaatgcatgtacaagatgtttatccttattcTtttttcttttttcccatggtagttgacaccatcatggctattaaacttgagtatggggtaaagaagaactggatgggtgatccgtgttttccaacacaattttcttggaatggagtaaaatgcagcaatgcaagtggcaacactaggataacatctctgtaagtaatatttgaaagatcatctatctactcgtattgtgctagaacattggtgtcttttttacctttgtgttacatcatttgaaaattggcatgcagggatctctccaacagcaacttgcgtggggtgatatctaacaactttacattgctcacggcactcgagtatttgtaagtacacatttttttattgattccattataactattgtcctatatatcactaatcctttctttaaattattacaagccagaccaatggccaggtgatacaaaggtgtcacgaaccatgctggcacttagtagaatctatagctcttcttatattttgttttatgtggagtttgttttgaaaaaaattacctatataattagcagaaaaaatgtccttaatttgagatgtttaagtgggtagatctcattgcatattgtcaacaaaaaaaacatagttgcctaaaaaaatattttctgcttaaagaaaaaaaacaaatgcaggttgctaatatctaaacttcaccacaggaatttgtcaggcaaccaattgaatggacctattccagactccctctgtaaaaacaatgcaggatcatttgttttcaggtttgggtttttcttgttgatggtcccctctaaattaaattgattttcttattatgcatctgaattgtagaatacttttccagtgatatttgatctggtgaccattgaccattattttccacatgaaagtagaatatgaactgattctgttatgtgatttcagttttgatggagatatgtgcaacaaaacaacaaatctgtctccctctctacacaaaccaaacagtacaataatcttagccgttgcagtagcggttcttgcgatggtaattgctgtgcttgttcttgcatatttcgtctggagacaaagaacgaagcctaaaagtgcgtatgttgtgctcttgttcatttgttatgattattaccttaatatattgattactatggtttatactatatttactttggctgtttgccacaattcatatttcttttgtacaataagtatttattcaaccaaatcatctagatgcagctcccagagaacggaaacttgagactgctccagcaaataaaacaaatcatggtgaccccttgcgaaaagttgagaaccgccgattcacatacaaggagcttgaaaaacatacccataactttgagaagtttattggacaaggaggttttggaaacgtgtactatggtaatttagaagatggcactgaggttgctgtcaagatgcgttctgaa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CDS seq

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Protein seq

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Function Probable LRR receptor-like protein kinase At1g51890 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGG6]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLiXu_09g0006590 OsLiXu_09g0006590.01 Chr09 11345571 11352442 + NAM
CDS seq

atggcggcctcggctttattcgctgcattcatgttagccgctgcgattcatggcgccgccagtcaagaagctggatttctgagcatcgactgtggtctggaggccaactacagcggctacagggaggccgagaccggcatcgtctacgtctccgacggtgcctacgtcgacgctggcgagaaccaccgggtggccgccgaccaggacagcgagctcgtccgcgccgacctgaccgtcaggagcttcccctccggcgtgcggaactgctacgcgctgcccaccgtcgccggtgccaagtacctggtccgggtggtggccgtctacggcaactacgacggcaagaacagctcgtcgacgctggagttcgacctgtacatcggggtgaactactgggacaccgtgtacgccgacggcgcccaggtgtacgaggcggtgttcgtggcgtgggcgagctgggcgccggtgtgcctcgtcaacaccggccgtggtacgccgtttgtgtcctcgctgaatctgaggccgctccctgacgcgctttacccggctgtcatggccaaccagtccatggccatgtatagccggcgcagcttaggggcaaatgcaataatgcatgctaacccaacgtgggcgaacatttccactacattagccattaaaccatatcctagcattgttgtacccttgcccgttatccagaccgccgttgaagcaggaggcaacaacacaaagctcaacatcacatggcaggacagcagtactctccgtgaattcatggtgttcctgcactttgccgactttcagaacagacagctgcggcagttcaacattacctttaatgaggaccggctggaccagtacagcccgccttacttggctgcagatgccttgggcaatagtgtttggtatagggccactgatggcaggtacaacatcactcttgtggccaccacagcatctgtgttgccgccaatgatcaatgcattcgagatctacactctcatcacacatgacaatccactgacatttccaaaagattttgacaccatcatggctattaaacttgagtatggggtaaagaagaactggatgggtgatccgtgttttccaacacaattttcttggaatggagtaaaatgcagcaatgcaagtggcaacactaggataacatctctggatctctccaacagcaacttgcgtggggtgatatctaacaactttacattgctcacggcactcgattttgatggagatatgtgcaacaaaacaacaaatctgtctccctctctacacaaaccaaacagtacaataatcttagccgttgcagtagcggttcttgcgatggtaattgctgtgcttgttcttgcatatttcgtctggagacaaagaacgaagcctaaaactcccagagaacggaaacttgagactgctccagcaaataaaacaaatcatggtgaccccttgcgaaaagttgagaaccgccgattcacatacaaggagcttgaaaaacatacccataactttgagaagtttattggacaaggaggttttggaaacgtgtactatggtaatttagaagatggcactgaggttgctgtcaagatgcgttctgaaatatcgtctcatgggcttgatgaatttttcgctgaggttcaaagcttgacaaaggtgcaccataggaatctagtatctttggttggttactgctgggaggagaaccatttagcactggtttatgagtacatggttcaaggcagtctctgtgatcatcttagaggtaaaaatggagttaatgaaatcttgaattggagaacacgcatgcgagttgtggttgaagctgcacaaggcttggattatctgcataagggttgcaatttgccaataattcatcgggatgtgaagaccagcaacattcttttgggtcaaaatttgcaagctaaaatagcagattttggactttccaagacttatcttagcgatacacaaactcacatatcaattactgcagctgggtcacctggttacatcgacccggaactaggaggtgcctacgaggtcagctccatgtggaaggtgttggaaaccgcattacagtgcactgcagatgttgcttctcaaaggccaacgatggccactgtggttgtgcagctcaaagagagcctagcattagagcaagctcgtgcagacaacgattttggggcaagcacccccagtgattcaacagtttcagtgtcagcatttggtccatcggcaagataa

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_09g0358100 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os09g17910 SBH 0.0 0.0 0.051018
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os09g0358100 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_09g0006780 SBH 0.0 2.636994 0.000000
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_09g0006790 SBH 0.0 0.000000 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_09g0007290 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_09g0006960 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_09g0006940 RBH 0.0 0.000000 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_09G0190800 RBH 0.005127 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_09g0007030 SBH 0.0 0.124300 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_09G0167000 RBH 0.0065795 0 0.008893
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_09g0006860 SBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_09g0007160 SBH 0.135025 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_09g0006700 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_09g0006610 SBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_09g0006660 RBH 0.0 0.349867 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_09G007190 SBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_09g0007030 SBH 0.0 0.0 0.0
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