Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLiXu_09g0005340 | OGI:09027530 | 15/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr09:9813224-9824093 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | - | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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| CDS seq | atggcgtcgagcaacggagagcaacctccagaatcgccgaaggaagcaaatgctgcacctgtagcagccaagcttgccatggcgtcagggcgcgatggatgtgagaggctcaaggatctggtgagtagggaagacgatgctactacgatggttgtggccatggcgacaagcaagaacgtggacgacacaagacgacctccccctccccgtgtaattatggatccccagctcctcatggctgcacggaatggagcttgccagtctcttgagagccttctcctcggccatgaggtgcgttgtcaaaccttgcctgaatcccatctaatcatctacttgcccgaaccagatgagggagctccgactacagatccaattgaagatcaggctgaaggaatctctgcgactgatcagcaagcctctggtgctgtatattcgctctcgctcctggagggactgactcttgactcggacgagaactccgcgctgcatgtggtggcagcctccggtgacagccaggcgtatgtggagtgtacgaccaggcgaggcacctactcggcgcggccaacaacaacggcgacacgcccctgcactgcgccgctgcagctgggaaccactcctcgcgctggctgctgctgcgcctgcgccggtgcagcgagggtggatgaccaggagctcctagcaaggaggaagaacaaggtcggtgagacggctttgcacgcggcggtccgtgctgtccacagcaaagtggtggaggtcctcatgaaggaggatccgggactggccggcgttgatcggcacgacggcacgtcaccgctgtaccttgccgtttcgttgggacgctttgagattgcgtgggatctgcttgatatgagctctaggaaattatcttactccggaccagatggtcagaatgtcttgcacgtcgcagtacaacacccccaagggctgaatgctgaagggatcgccggcggcccagcgtggggtgaacttgcagaggcgccgtggagggcgcagggcgatggaggcggattggcggagactgccgccgcactgtctgtactgttagagaagtgcaagaatgtcgaggtcaatgtacagcaagaagaccaacaatggagtattcctcttctcttgcacctcactagtcaaagtgacaaaaatgggagcactcctcttcactttgctgcatcgttgaaaactagtattgaaggtttcacatcgagattatgtgaacattttcgcccgaaacaaagcccaacaacattgcttcttggactcaatgaatctgctatatatcagccagacaacagaggatcatatcctatacatgttgctgcctccaatgggatactcaaggttgtcataaccctgctcaaaaggtatccagattgtgccactttgcgtgacatccaaggaagaactttcttccatgttgccgtggagaagaagcggcgtaatatcgttgcatatgtgtgtgaaaggccaggattttctcctatcttgaatatgcaggacagccatggggatactgctctacaccttgctgtcaaagccggtgtgttttcaattttcagctcgttgttccggaataggcagtcgccaggaccacttcttcgaaaatacagcaagaaaagagacgaagtaatcgattcaaacgatatgacaagtgcggcacaggttctcggcatttcttcagcgcttatagcaaccgtgacatttgcagctgcattcacgttgcctggaggttacagagcagatgagcacactgatggtggtacaccaacacttgctgggagctacccttttgacgcgttcattatctcgaacagcctagcattcatttgctctttgctagctaccgtgagtctgctctactctgggatacaatcgagggacatctccatccggcgcaggtactacgcgttctctatgctcttgatgcagagttcaactacgagcttcactgttgccttcgccatgggaatgtacctggtgctagctcctgttactcttaatgcagcagtgtctgtctgcatcatagcatttgtttctctgctacctggaaatatggaaatcggggtatccctagctatcgcaaacacattgaggattagattgggaatttgggcagcgatgtcccaagcaaggccagttctcctgttcacgtggaaaagagtttggtcctgcataattatctttggattgcctggattgatgaagattcatagaaccaaaatggcttga
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
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Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0328600 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g15200 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0328600 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0005380 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0005420 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0005600 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0005440 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0005680 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0162600 | RBH | 0 | 0.003447 | 0.063305 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_09g0005840 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0140900 | RBH | 0.0080225 | 0.00798 | 0.0466665 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0005580 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0005480 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0005460 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_Ung0050120 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0005440 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G005670 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0005560 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
