Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLaMu_07g0001890 OGI:07004740 | 16/16 LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr07:1496593-1549266
Gene Symbol RLK, YK35, RLCK226, OsRLCK226
DNA seq

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Function L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XUN6]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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atgcctgtcgtgaatcgctggtgcttccttccaatactccttttcatcttcatattactgctagttatcattctgccatccttggctacaaccctaggagacggccaatttgtttactacggcttcgctaacagtaatctcatcgtccatggagctgccacggtgtcgccagagggcttgctcgagctgaccaatggtacggtcaatcagaaaggccatgccttccatccgactcctttctggctccgcaagtcgcccaactccgcggtacagtccttctccgcctccttggtgtttggcatcgtctctcccttgttgcatgccagcacagagggcatggccttctttcttggcccaagctctaatttttctgatgcgttaccggcacagtacctaggactgttcaactacagtaacaacggcaacttgagcaaccatgtttttgctgttgagatcgacactgcacaaaacaacgagtttatggacatagatggcaaccatgtcggcatcgacatctgcgatcttcactcggcaacatcttcttctgcaggctactacgatgacatcactggttccttccgaaacttgagtctgattagtggcgaggccatgcaaatttggatcaactacgatggagaggcaacgtggattgatgtggctttagctccattcaaaatggccagacccaccaagacactcctgtcaatgtcctataacctctcagccgtgctcacagacgttgcatacgttggtttatcagctgcaacaggtcaaatagaatcaaggcactatatcctaggctggagctttagtatgaacggaccagccccgcctttcttcacagctcatctaccaaatctacctaaagctcgtgtagatggaaaagctactaagctcatcttgctgccactaatttttcctctagcaactcccacatttgtctttttggtgatcttggccatcttcttctttatgcgaagaaggctgaggtatgctgagttgcgagaagattgggaaattgagtttggaccgcataggttctcatttaaggacctatatttagccactgaagggtttaagaatagtcatctcttgggcactggaggatttggaagggtgtacaagggtcttctttccaagtctaagtcacaaattgcagtgaagagggtgtcccatgagtcgagacaaggcataagggaatttgttgctgaggttgttagcatcggccgccttcgacaccggaatattgtgcagctacttggctattgccggcgtaaaggtgagcttcttttggtttacgactatatgccaaatggtagccttgataattatttgtatggtcatagtaaccgtcctattctagactggattcaacggtttcgaataatcaagggtgttgcatctggtttatggtaccttcatggagagtgggagcaagttgtcatccacagagacatcaaagccagtaatgtgcttcttgatgaagagatgaatgcgcgcttaggtgattttggccttgcaagattatatgaccatggcactgacatgcaaacaacacgcctggttggaactataggatatcttgcccctgagttgttacaaaatggtaaggcttcacccctaactgacgtgttcgcctttggcatatttgttcttgaggttacttgtggacgaagacccattgaacacaagatgaatagtgatcagctcaaattagtagactgggtgattgattgttggaatgagagatcacttcttgaggcaatggatccaaagctccaaaatgagtatgatgctgatgaagcatgcctagctttgaaactaggattgctttgctcacaccaatcacctgctgcaaggccaagcatgtggcatgtcatgcagtatcttaaccatgacttgccatttcccgagttggcgccaatggacatggtgcagaaccgtcaggtggactcacccgttacatattgccaatcagtggtgagcgatggcaccatcactggcctctccgaagggagcacaaagctcatcttgtgcttcctacttctgttcctaaccctcaatctttcagcttccagcaccggtggtgaccatgaaagattcatgtacgccggcttcactggtgccaatctcaccatggacggctcagcaaaaatcataccaaccggcctgcttgcactgacaaaggacacgttcagggctcaaggccacgcgttgcacccggctccactccgcttcggccagtctaatggaatggtgacatctttctctgtttcatttgtgtttggtattctctcttcatttgttgacataaggggccatggtttcgccttcttcatagctcccaccaataatttctcctccgccttcccaatccagttcctgggccttctcaatgataaaaacaacggtagtttgagcaaccatctctttgccatcgaatttgataccatccgaaacgatgagtttggggacatcgacaacaaccatgttggcattgacataaatagtctgaattctatgcaatcctatcatgctggcttctacgatgacaagggtggcacattcacaaacttgagcctcatcggaggagggccaattcaagtttggatagagtacgacgggtacaccacattaactaatgtgaccatagctcctcttggcatggctagacctataaggccactactctcagttacctgtgacctttctacagtgtttacaaatcaatcatatcttggtttctcatcctcaacaggcttaagcacaggtcatcactacgttcttggttggagctttggtatgaacagtcccgctccaatcattgactctaccaagctacccaagctacccgaaccacctaatagtggtccaagaactcaatccattctattaatccttccactaatagggtcaattctattggtattaattattggcattgtggttctacttgtgaggagacaactcgtgtacaaggaggtacgcgaagattgggaagttgaatatggtccacgccggtttgcttaccaggatctatttcgcgcaactagaggatttaagaacaataacttggtaggaataggtgggtttggaaaggtgtacagaggggttcttccaatatcgaaattacaagttgctgttaagagggtatcatatggctcaaagcagggtattaaagaatttatagctgaagtagttagtatagggaatctccaacaccgcaacattgtacaattatttggatattgccggcgcaagaatgaactccttttggtttcttgcgggcaaaagcctatcaggcaaaactcggaaggtaaacatctcatcttggttgattgggtggttgagaattggcataagggatcacttcttgatacaatggatagaaggctccaaggtaactacaatatcgatgaagcctgccttgcactgaagctaggattattatgctcacacccattttcaaacgcaaggcccaatatgcggcaagttctgcaatacctcgatggcgatgtgcagttgccagaactaaatcgtcctgccatggagcatttagcctgcttcctcctcttcctaacatccttcaccacggtcagtattggacaggaccagttcatctacaacggcttctccggcagcaaccttatccttgatggcacagccatggtaacaccaaacggaatccttgagcttaccaatggcgcaagtacctacgaaacaagctacgccctctacccgactccatggcaatttctgaaggtaccattacagtccttctcagtcaactttgtgctcttcatggctccttctattagatgtcccgacagcatggctttcatgatatttccgagcaagggcctcaagaatgatcagagggagagcaatcttgcagtcaattttttaagttgccaagacaaaaggtttctggagaacaacgagaacgacatcagcatttctatcaacagtagtttcagcagaccgctagagacccatcctgctggcttctatgatgacaagaacggcattttcaatgacttgccccttgttggcggcaaggcagtgcaaatatgggtggactatgatggagaggccacacagatgaatgtgaccatagctcctctcaagctaaccaaacctttgagaccaacgctgtcagcaatcctcaacatctcaacaattttagatgaaggtgtatcatatattggcttctcttccggtgctaataatgtcggtgcattgaattatgttcttggctggagctttggaatgaacagtcctgctccgacaatagatatcatcaagttaccaaagttacctcgatttggcccaaaagtccggtctaaaactttgaagatagtcctaccgatagtcatcaccacagtcatcctacttgtgggagcagcagtcacagcattagtgtggaggcgaaagaggtatgctgaactatatgaagattgggaggttgaatttgggccatatcgcttctcgtacaaatatttgtttgatgcaactgaaggatttaacaatgagaaaattctaggtgttggaggatttgggaaggtgtataaaggtgtgcttccagactctaaattggaggttgctatcaagagggtgtctcatgaatcgaagcaaggaataaaggagtttatcgctgaaattgttagtatcggccgcatccgacaccgcaatcttgttcaattacttggctattgcagaagaaaagatgaactattattggtctatgactatatgccaaatggaagcctagacaagtatttacactgtaaagagggcaagtacacgctagattgggccaaaagatttcaaatcattagaggtgttgcatctggattattctatctccatgagaagtgggagaaagttgtcatccaccgagatatcaaagcaagcaatgtgcttcttgatgctgaaatgaacggtcatctaggagactttggccttgcaagactatatgagcatggcaatgacccacaaacaacacatgtggctggtacctttggatatatagcaccagagatggcgcgcaccggtaaggcatcccctctaacagacgtatatgcatttgccatttttgttcttgaggtaacatgtgggcgaagacctattaacaattacacgcatgatagcccgacaatattagttgattgggttgttgagcattggcaaaaaggatcactgacaagcacactggacgtcagattacaaggagaccacaatgcagatgaggtgaatcttgttttaaagctagggctgttgtgtgcaaatccaatttgtaccagaaggcccggtatgcgtcaagtcatgcaatacctcgacaatgagatgccacttcctcggttgatgcccacaaacttgagttatagcatgttgggatatttgcaaaacgacggtttcgaccagtacaaatctgtgccatctacagtttgcagcaacaacctgacatcgagcctcacgagtggaagatga

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Protein seq

MPVVNRWCFLPILLFIFILLLVIILPSLATTLGDGQFVYYGFANSNLIVHGAATVSPEGLLELTNGTVNQKGHAFHPTPFWLRKSPNSAVQSFSASLVFGIVSPLLHASTEGMAFFLGPSSNFSDALPAQYLGLFNYSNNGNLSNHVFAVEIDTAQNNEFMDIDGNHVGIDICDLHSATSSSAGYYDDITGSFRNLSLISGEAMQIWINYDGEATWIDVALAPFKMARPTKTLLSMSYNLSAVLTDVAYVGLSAATGQIESRHYILGWSFSMNGPAPPFFTAHLPNLPKARVDGKATKLILLPLIFPLATPTFVFLVILAIFFFMRRRLRYAELREDWEIEFGPHRFSFKDLYLATEGFKNSHLLGTGGFGRVYKGLLSKSKSQIAVKRVSHESRQGIREFVAEVVSIGRLRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDNYLYGHSNRPILDWIQRFRIIKGVASGLWYLHGEWEQVVIHRDIKASNVLLDEEMNARLGDFGLARLYDHGTDMQTTRLVGTIGYLAPELLQNGKASPLTDVFAFGIFVLEVTCGRRPIEHKMNSDQLKLVDWVIDCWNERSLLEAMDPKLQNEYDADEACLALKLGLLCSHQSPAARPSMWHVMQYLNHDLPFPELAPMDMVQNRQVDSPVTYCQSVVSDGTITGLSEGSTKLILCFLLLFLTLNLSASSTGGDHERFMYAGFTGANLTMDGSAKIIPTGLLALTKDTFRAQGHALHPAPLRFGQSNGMVTSFSVSFVFGILSSFVDIRGHGFAFFIAPTNNFSSAFPIQFLGLLNDKNNGSLSNHLFAIEFDTIRNDEFGDIDNNHVGIDINSLNSMQSYHAGFYDDKGGTFTNLSLIGGGPIQVWIEYDGYTTLTNVTIAPLGMARPIRPLLSVTCDLSTVFTNQSYLGFSSSTGLSTGHHYVLGWSFGMNSPAPIIDSTKLPKLPEPPNSGPRTQSILLILPLIGSILLVLIIGIVVLLVRRQLVYKEVREDWEVEYGPRRFAYQDLFRATRGFKNNNLVGIGGFGKVYRGVLPISKLQVAVKRVSYGSKQGIKEFIAEVVSIGNLQHRNIVQLFGYCRRKNELLLVSCGQKPIRQNSEGKHLILVDWVVENWHKGSLLDTMDRRLQGNYNIDEACLALKLGLLCSHPFSNARPNMRQVLQYLDGDVQLPELNRPAMEHLACFLLFLTSFTTVSIGQDQFIYNGFSGSNLILDGTAMVTPNGILELTNGASTYETSYALYPTPWQFLKVPLQSFSVNFVLFMAPSIRCPDSMAFMIFPSKGLKNDQRESNLAVNFLSCQDKRFLENNENDISISINSSFSRPLETHPAGFYDDKNGIFNDLPLVGGKAVQIWVDYDGEATQMNVTIAPLKLTKPLRPTLSAILNISTILDEGVSYIGFSSGANNVGALNYVLGWSFGMNSPAPTIDIIKLPKLPRFGPKVRSKTLKIVLPIVITTVILLVGAAVTALVWRRKRYAELYEDWEVEFGPYRFSYKYLFDATEGFNNEKILGVGGFGKVYKGVLPDSKLEVAIKRVSHESKQGIKEFIAEIVSIGRIRHRNLVQLLGYCRRKDELLLVYDYMPNGSLDKYLHCKEGKYTLDWAKRFQIIRGVASGLFYLHEKWEKVVIHRDIKASNVLLDAEMNGHLGDFGLARLYEHGNDPQTTHVAGTFGYIAPEMARTGKASPLTDVYAFAIFVLEVTCGRRPINNYTHDSPTILVDWVVEHWQKGSLTSTLDVRLQGDHNADEVNLVLKLGLLCANPICTRRPGMRQVMQYLDNEMPLPRLMPTNLSYSMLGYLQNDGFDQYKSVPSTVCSNNLTSSLTSGR

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLaMu_07g0001890 OsLaMu_07g0001890.03 Chr07 1541580 1543858 - IsoSeq
CDS seq

atgtctttggttttggcatcttccttcttgaggtttcttgcgggcaaaagcctatcaggcaaaactcggaaggtaaacatctcatcttggttgattgggtggttgagaattggcataagggatcacttcttgatacaatggatagaaggctccaaggtaactacaatatcgatgaagcctgccttg

Protein seq

MSLVLASSFLRFLAGKSLSGKTRKVNISSWLIGWLRIGIRDHFLIQWIEGSKVTTISMKPAL

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.073340 0.000000 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_07g0130400 RBH 0.319421 0.302988 1.819054
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os07g03820 RBH 0.161949 0.298464 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os07g0262800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_07g0020590 RBH 0.0 0.0 1.944079
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_07g0001920 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_07g0009640 RBH 0.200641 1.055119 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_07g0001820 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_07g0001920 RBH 0.396331 0.0 0.252515
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_07G0027500 RBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_07g0001950 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_07G0023800 SBH 0.226334 1.6050545 0.026653
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_07g0009510 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_07g0010410 RBH 0.805792 0.689577 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_07g0001930 SBH 1.135415 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_07g0009660 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_07g0001940 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_07G020110 RBH 0.140949 0.0 1.207232
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_07g0001860 RBH 0.650098 0.000000 1.028160
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