Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_07g0001860 OGI:07004740 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr07:1579508-1652089
Gene Symbol RLK, RLCK221, OsRLCK221, YK35, RLCK226, OsRLCK226, RLCK237, OsRLCK237
DNA seq

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Function L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XUN6]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_07g0001860 OsKeNa_07g0001860.02 Chr07 1579508 1614614 - NAM
CDS seq

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Protein seq

MNVRLGDFGLARLYDHGTDMQTTHLVGTIGYLAPELANTGKASPATDVFSFGIFVLEVTCRRRPIEHGMNSEYKFTLVDWVIDRWHEGSLLEAMDPKLQNNYDDDEACLALKLGLLCSHPSSIAIARPTMWHVMQYLNHDLPFPELMATDMVRNRCVDSPISYCQSVAFVRAMPVVNRWCFLPILFFISILLVIILPSLATTLGDGQFVYYGFANSNLIVDGAVTVLPEGLLELTNGTVNQKGHAFHPTPFRLRKSPNSAVQSFSASLVFGIVSPLLHASTEGMAFFLAPSSNFSDVLPAQYLGLFNYSNNGNLSNHIFAVEIDTAQNNEFMDIDGNHVGIDICDLHSATSSSAGYYDDITGSFRNLSLISGEAMQIWINYDGEATWIDVALAPFKMARPTKTLLSMSYNLSAVLTDVAYVGLSAATGQIESRHYILGWSFSMNGPAPPFFTAHLPNLPKARVDRKATQLILLPLIFPLATPTFVFLVILAIFFFVRRRLRYAELREDWEIEFGPHRFSFKDLYLATEGFKNSHLLGTGGFGRVYKGLLSKSKSQIAVKRVSHESRQGIREFVAEVVSIGRLRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDNYLYGHSNRSILDWIQRFRIIKGVASGLWYLHGEWEQVVIHRDIKASNVLLDEEINARLGDFGLARLYDHGTDMQTTRLVGTIGYLAPELLQKGKASPLTDVFAFGIFVLEVTCGRRPIEHKMNSDQLKLVDWVIDCWNERSLLEAMDPKLQNEYDADEACLALKLGLLCSHQSPAARPSMWHVMQYLNHDLPFPELAPMDMVQNRQVDSPVAYCQSVVSDGTISGLSERSMKQYTLPIILFLTISISLLAISASGDHDQFIYTGFTGSNLTLDGAAKITATGLLGLTNDTFRIKGHASHPAPLRFRKSPNGTVQSFSVSFVFGILSSFGDIRGHGFAFFIAPSNDFSTAFPIQFLGLLNDINNGSSTNHLFAIELDTIRNDEFGDIDNNHVGIDINSLNSVRSSYAGFYNDNNGALTNVSLIGDKPMQVWVEYDGNATQIDVTLAPLGIGRPKRPLLSVVHNLSTVLTDQAYLGFSSSTGLSTGHHYIVLPIASAIFVLAIGVAIVLLVRRHLRYKEVREDWEVEYGPHRFAYKDLFDATKGFKNKNLVGTGGFGRVYKGVLPNSRLEVAIKRVSYESKQGIKEFVAEVVSIGHLQHRNVVKLLGYCRRKGELLLVYDYMANGSLDKYLYRQEGKPTLNWGQRFQIIKDIASGLLYLHEEWDKVVIHRDVKASNVLLDKQLNGRLGDFGLARLYDHGTDPQTTHVVGTIGYLAPELVHRGKATTLTDVFSFGIFILEVTCGQKPIKEDSQGRQLILVDWVLQNWHKGSLLDTVDIKIQGNYDIGEACLVLKLGLMCSHPFPNVRPNVRQVMQYLDGDVPLPELKPEHFSFDMLALIQKQNEANIPHMEHLSLLLPLIALALNLAITMSEDQFVYSGFSGRNLTLDGAATVTDDGVLELTNRTVHIKGHAFYPTPWQFRKTPNGTVQSFSINFVFGMIPVYSNEKCTDGMTFVISPTSDMSSAQDSQYLGLLNKTSDGKASNHIFAVELDSSQNTEFHDIDDNHVGIDINNLTSVQSRPAGFYSDNKSIFNNLSLCSYKPMQVWVDYNEDTTQIKVTMAPIEVGKPLRPLLSEIHNLSLVLEEPSYIGFSASTGPINTLYCVLGLSLGINRPAPAIDLSKLPKLPRVSPKPRTKLLEIILPIATATFILIVGTTIVLLVRRRMRYAELHEDWEAEFGPHRFSYKDLFHATDGFKNRNLLGLGGFGKVYKGVLPTSKLHVAVKRVSHDSKQGMKEFIAEIVSIGRLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYEYMPNGSLDKYLYCEDSKPTLDWAQRFQIIKGVASGLFYLHDRWEKIVIHRDVKASNVLLDGEMNGRLGDFGLAKLYDHGADPQTTHVVGTMGYLAPELARTGKATPLTDVYAFGIFILEVTCGQRPIDNYADDNSQMLIDCVVEHWHKGSLTNMLDKRLLGDYDADEVCLVLKLGLLCAHPFCKSRPSMRQVMQYLDGDKPLPELMPTNLSYSMLAVMQIEGFEQYTSLPSIASSSDITSSISTHAAMNHLSYLLQFFFLFISNLSALATGEDQFIYSGFNGANLTLDGVASVTPDGLLKLTNGTLRLQGHAFHPTPFSFKKKPNGTVNSFAVSYIFAIYCLRPVICGHGIAFVVSVSKNFSTAMASQYLGLINDHNNGDPTNHFFAIELDTNQNDEFNDVNNNHVGIDINSLTSLNSSSVGYYTDSNGNFNNITLTSYKMMQVWLEYNGDNRQINVTLAPIKMAKPVKPLLSTYYDLSTVLTDMAYVGFSSSTGSFVARHYVLGWSFGINKPAPAIDISKLPKLPYEGEKTHSKVLEITLPIATATFVLAMIALIILLIRRRLRYAEIREDWEVEFGPHRFSYKDLFCATEGFKNKNLLGIGGFGRVYKGLLPTSKLEIAVKRISHDSNQGMKEFVAEIVSIGHLQHRNLVQLHGYCRRKSELILVYDYMSNGSLDKHLYGQENNSTLTWAQRFQIIKDIASGLLYLHEEWEKVILHRDIKPSNILLDDNMNGRLGDFGLARLYDHGTDPQTTHVVGTIGYLAPELARTSKATPLTDVFAFGMFVLEVTCGRKPIDHTAQDNQLMLVDWVLHCWHQGFLNDAVDIKLQGVYNIDEACLALKLGLLCAHPFINKRPSMRHVTQILNREMELPELTPTHMSFNMLSLMQNQGFDPETMTNQFLISNSTLSDLSEVRQTSHTKFFFLFLLVSFGINCASFTNTSDDQLLYLGFTSANLITDDTTVVTSNGLLELTNGTINRKGHAFYPSPLHFRKPHNNKVHSFAVSFVFAIRSSYPRMSLHGLAFVVSPSINFSNALAIQYLGLLNSKNRGSKSNHILAIEFDTILNIEFEDIDDNHVGIDINDLHSIKSHSAGYYDDRNSSFQNMSLISGDAMQAWVDYNGEDKKISVTMAPIKMAKPKRPLILISYDLSTVLKEPSYIGFSASTGLVDSRHYILGWSFGMNKPAPMINVNKLPKLPRQGPNPQPKLLAITLPIASATFVILFCGVFITIVRRRLRYVELKEDWEIEFGPHRFSYKDLFHATHGFDNKNLLGAGGFGKVYKGVLPSSKLEVAVKRVSHESRQGMKEFVAEVVSIGRIRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDAYLYNNELKPTLSWDQRFRIIKGIASGLFYLHDKWEKVVIHRDIKASNVLLDTEMNGRLGDFGLARLYDHGTDLQTTHVVGTMGYLAPELVCTGKASPLTDVFAFGAFLLEVTCGQRPVNHSSQDSPGVLVDWVLEHWQKGLLTNTVDARLQGDYNIDEACFVLKLGLLCSHPFTNMRPNMQQVMQYLDGDVPLPELTQMDMSFSIISMMQDEGFNPYTLSSYPPPGTSIVRCLTEQTKEQLGSLHVSLAVSLSDKDRKGIEDYAEDSCSLASYMIRVKPGLLPVQPSPKHLCTFWHLNSLVLHKLHMENQPVLFSAVFILYVSFLGPFCASSGEESFVYSGFASTGAANLTLDGSAMVTTTGLLQLTDSMPNIQGHAFYPTPLRFKKQSNGIVQSFSVAFMFGIISPYSDASTDGMAFVVAPNKGFPDAKAAQFLGLLNISSDNSTSNHMFAVEIDTAQNTELDDIDGYHVGIDINSLHSKKSQHIGFYNDQHGGLLKNLTLTGSNCKPVQVWVDYDGETTQINVTLAPIKVTKPTRPLLSVPFNLSTVLTDQAYIGFSAATGPLTSHYYVLGWSFAMNAPAPPIEISRLPRLPCPGDNRLQKILQILLPIVAVALIFIVVMILVRRQQRYAELREDWEVEFGPHRFSYKDLFNATEGFKSKHILGVGGFGKVYKGVLRTSKLEVAVKKVSHGSNQGMKEFISEVVSIGHLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDKYLYGEDNKPVTCGRWPISNSAHHGRKMLVDWVLQHWHQGSLPETVDPKLHGIYNVDEACLVLTLGLMCSHPIPGARPIMRQVMQYLDGDAPLPEFTPATLNSSLLAIMHNEGVDPYVAQYPWSGNSLGTMTPDIFMKIMLFGLLAVLAGCSDAVDQFVYSGFTGSNLTLDGGARVTPSGLLELTNGMVRLKGHAFHPTPLHLHESPNGTVQSFSISFVFAILCDYPDSCGHGLAFFIAPSKNFASAFWTQYLGLFNNKNNGDPNNHIFAIELDTVQNDDLQDISNNHIGININSLYSMKSRDAGFYDDKSGDFKNLTLISQKAMQVWVNYDREITQINVTMAPLNVEKPVKPLLSTTYNLSTVLTDSAYIGFSSSTGTVSGKHYVLGWSFGMNSPAPSIDIAKLPRLAVVFLLSAGTTIFLCMRRNLRYAELREDWEVEYGPRRFCYKDLFDATEGFKNKHLLGTGGFGSVYKGVLPISRLDIAVKRVSHDSTQGMKEFIAEIVSIGCLQHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDKYLYGKEGKPTLDWTQRFQIIKGVASGLLYLHEESEKVIIHRDIKASNVLLDNDTNARIGDFGLARLYDHGTDPETTRVVGTIGYLAPELARGGKATPLTDVFAFGMFILEVTCGQKPVMQNTEDDQLVLIDWVLEHWHKGSLADTVDIKLQGEYNIDEACLALNIGLLCSHPLISVRPNMRQVVQYLNKDIPLPESMPTHLSFYVMALIQNKGFSPCTITDPSSATSFGTISSTSLSEGR

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_07g0001860 OsKeNa_07g0001860.03 Chr07 1607291 1609560 - IsoSeq
CDS seq

atggcacgctccgccagaaagcccacgccatccatccggccccgttccgcctccgcggcggctcgtcgtcgtcgtcgacggcgacggcgacggcgacggcgacacggtccttctcggcgtccttcgtgttcgccatcctatgccccgacgccgacgcctgcggccacggcatcgtcttcttcgtcgcaccggccaaccacagcttctccggcgcgttccccagccagtacatcggcctcttcaacggcagcagcgacggcgacgccgggaaccacctcgtcggcgtcgagctcgacaccgaccagaacaacgagttccgtgatatcgacggcaaccacatcggcgtcgacatcaacagcctcacctccattaactcaaccagcgccggctactacgacgacaacgacggcggcaactccggcgaccatggcttccaca

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Protein seq

MARSARKPTPSIRPRSASAAARRRRRRRRRRRRRHGPSRRPSCSPSYAPTPTPAATASSSSSHRPTTASPARSPASTSASSTAAATATPGTTSSASSSTPTRTTSSVISTATTSASTSTASPPLTQPAPATTTTTTAATPATMAST

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.230921 0.095846 1.286250

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_07g0132500 RBH 0.0 0.0 0.042393
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os07g03810 RBH 0.448387 0.351246 0.213359
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os07g0130100 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_07g0001930 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_03g0036010 RBH 0.116522 0.0 1.513016
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_07g0001760 RBH 0.433948 0.0 0.622571
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_07g0009360 RBH 0.026981 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_07g0010410 RBH 6.252750 0.0 6.557066
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_07G0026900 RBH 0.050517 0.938392 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_07g0001950 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_07G0024400 RBH 1.236949 0.5785255 1.0078525
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_07g0001790 RBH 0.096715 0.031098 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_07g0001950 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_07g0001980 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_07g0002000 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_07g0001930 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_07G002040 RBH 0.000000 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_07g0001990 RBH 0.0 0.0 0.0
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