Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_01g0007200 | OGI:01018400 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:5634708-5643914 | ||||||||
| Gene Symbol | FTL8, FT-L 8, OsFTL8, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| CDS seq | atgtcagaccttgttatccgatgccacaaagtgaaggatatgaaatcaaacatgatggaaagtttattcagtttttctgctcctagttgtttctaccagcttgaagagatgtcgtcggcgaacagcctggtgctggggcgggtgatcggcgacgtggtggacctgttctcgccggaggtgacgctccgggtgatgtacaacggcgtgcgggtcgtcaacggcgaggacctccggccgtcggcggtgtcggcgaggcccagcgtcgaggtcggaggggatctccaccagttctacacgatcgtgatggtggatccagatgctccaaacccaagcaatccgacgttgagagagtacttacactggttggtgacagatattcctggaacaactgatgcgaactatgggcgcgaggtggtgtgctacgagagcccccggccagcggcggggatccaccgggtggcggtggtgctgttccggcagatggcgcgcggcggcgtggaccagccgccgctgctccgccacaacttctccacccgcggcttcgccgacgaccacgccctcggcgcccccgtcgccgccgccttcttcacctgcaagcccgagggcggcaccggcggccgccgcttccggccaccgtcacggcatagctag
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| Protein seq | MSDLVIRCHKVKDMKSNMMESLFSFSAPSCFYQLEEMSSANSLVLGRVIGDVVDLFSPEVTLRVMYNGVRVVNGEDLRPSAVSARPSVEVGGDLHQFYTIVMVDPDAPNPSNPTLREYLHWLVTDIPGTTDANYGREVVCYESPRPAAGIHRVAVVLFRQMARGGVDQPPLLRHNFSTRGFADDHALGAPVAAAFFTCKPEGGTGGRRFRPPSRHS |
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| Function | Protein HEADING DATE 3A [UniProtKB/Swiss-Prot:Q93WI9] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_01g0007200 | OsKeNa_01g0007200.01 | Chr01 | 5634708 | 5643914 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgtcagaccttgttatccgatgccacaaagtgaaggatatgaaatcaaacatgatggaaagtttattcagtttttctgctcctagttgtttctaccagcttgaagagatgtcgtcggcgaacagcctggtgctggggcgggtgatcggcgacgtggtggacctgttctcgccggaggtgacgctccgggtgatgtacaacggcgtgcgggtcgtcaacggcgaggacctccggccgtcggcggtgtcggcgaggcccagcgtcgaggtcggaggggatctccaccagttctacacgatcgtgatggtggatccagatgctccaaacccaagcaatccgacgttgagagagtacttacactggttggtgacagatattcctggaacaactgatgcgaactatgggcgcgaggtggtgtgctacgagagcccccggccagcggcggggatccaccgggtggcggtggtgctgttccggcagatggcgcgcggcggcgtggaccagccgccgctgctccgccacaacttctccacccgcggcttcgccgacgaccacgccctcggcgcccccgtcgccgccgccttcttcacctgcaagcccgagggcggcaccggcggccgccgcttccggccaccgtcacggcatagctag
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| Protein seq | MSDLVIRCHKVKDMKSNMMESLFSFSAPSCFYQLEEMSSANSLVLGRVIGDVVDLFSPEVTLRVMYNGVRVVNGEDLRPSAVSARPSVEVGGDLHQFYTIVMVDPDAPNPSNPTLREYLHWLVTDIPGTTDANYGREVVCYESPRPAAGIHRVAVVLFRQMARGGVDQPPLLRHNFSTRGFADDHALGAPVAAAFFTCKPEGGTGGRRFRPPSRHS
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0202700 | RBH | 0.504115 | 0.0 | 0.617080 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g10590 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0202700 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0007560 | RBH | 0.0 | 0.0 | 1.167969 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0009960 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0007530 | RBH | 0.655761 | 0.0 | 0.000000 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0007050 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0007200 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0092600 | RBH | 0.003994 | 0.3490865 | 0.5671825 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0007120 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.342266 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0092700 | RBH | 0.254022 | 1.6736065 | 6.4538475 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0006970 | RBH | 0.041723 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0007160 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0007170 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0007180 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0007090 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G007180 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0006990 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
