Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKYG_12g0012940 OGI:12048010 | 16/16 KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr12:17520663-17530556
Gene Symbol RGA2
DNA seq

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Function Putative disease resistance protein RGA1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA42]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_12g0012940 OsKYG_12g0012940.01 Chr12 17520663 17530556 + NAM
CDS seq

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Protein seq

MAALSVFASSILSKVTTFAVEYALDDIKLACTVRSEMEKLRNSLKAICAVLKDAERKQSTSSSLKHWLENLKDVVYDIDDVLDDVGTRALQQKVGKGEIRTYFAQLCIFPFELGRKIRRVRERLNEISALKRNFDLKEEPIDTPSDRVVQRETYSIVDERKIVGRDKAKNDIVKVISEAAESNSDTLSVLPLIGMGGVGKTALAKLVFNDKRTKEKFDKMLWACVANVSDLKHIVDIIIQSDSGESNKQLTLEALQKKLHELLGDKRYLLVLDDISHDNINDWEELMNLLPSGRSGSMILITTRLSKIASVLKTLEPYEVPKLSHEECMKVFARYAFKGEKAKDTELLKIGESIVQKCDGLPLAVRTLGSLLSMEDISKWQEVKETNIPNTDIFLSTFPKDYEIFRELLIMYWMAMGLLNTASGSKEAIRTGERYFSELAGKSLFQDYVFSHDGTISHCKMHSFVHDLAISVSPNEHATISCENFSASKRVKHLVWDQKEFSKDLKFPKQLRRAGKARTFASRHNYGTISWQPLHAYVLVFSKVEFEELPSSIGNLKHLRYLDLQWNMKIKYVPNSLCKLVNLQTLQLAWCKELEELPRDVKKLVSLRYLILTSKQHYLPNDALMGWTSMVFLQISACPMLTSLTEGFGSLSVLRELFVFNCPNLPSLPSSMNRLVTLQKLVIHNCDELNLMEPKEAMGGMKSLIELVGLPKFETFPDSFASAASTLEYLKVSDCKEFKKLPDFIQRFSSLKKIEIPERRQYSKMTVLSVLASSILSKVTTFAVEYALDDIKFAWNVKSELEKLKNSLGAICAVLKDAERKQSTHSSLKHWLENLKDVVYDIDDVLDDVGTRVLQQKVRKGEICTYFAQLTIFPFELGRKIRKVRERLNEIAALKRDFELKEEPIDTPSDQFAQRETHSLIGEQNIFGRDKAKNDIVKMISEAAESNSNTLSVLPLIGMGGVGKTALAKLVFNDKSTKDKFDKMLWASVSNAGESNNQLTLEALTKKLHELLRDKRYLLVLDDISNDNVNWEELINLLPSGRSGCMILITTRLTKIASELKTLEPYEVPKLPHEECRKIFVRYAFRGEKAKDRELLKIGESIVQKCDGLPLAARTLGSLLFRKDISMWQEVKENNLLSTGKGKDDILSVLKLSDALPSDLKTCFSWLSTFPKDYDIFRELIIMYWMAMGLLNPASRTKEAIRVGEKYFNELAGRSLFQDYVFNHDGSISHCKMHSLVHDLAISVSQNEHAIVGCENFTATERVKNLVWDHKDFTTELKFPTQLRRARKARTFACRHNYGTVSKSFLEDLLATFTLLRVLVFSEVEFEELPSSIGNLKHLRYLDLQWNMKIKFLPNSLCKLVNLQTLQLAWCKELEELPKDVKRLVSLRYLILTSKQQYLPKDALGGWTSMVFLQINACPMLTSLTEGFGSLSALRELFVFNCPKLPSLPSSMNRLVTLQKLVIHNCDELDLMESEEAMGGLNSLESIELAGLPKFKTFPDSFASASSSLQYLKVSDCPQFEELPDFIKRFSSLKKIEIPKSRAPSPSTGTWA

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0489800 SBH 0.071512 0.0 0.173627
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g29280 RBH 0.137758 0.0 0.063871
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0489800 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0013040 RBH 0.245534 3.250876 1.154927
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0013160 RBH 0.0 0.000000 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0013080 SBH 0.164126 4.344239 5.772913
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0012830 SBH 0.059502 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0012560 SBH 0.655090 1.292716 1.410530
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0241700 SBH 1.1415525 5.387933 0.916849
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_12g0012750 SBH 0.0 0.0 0.096704
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0261000 RBH 0.427013 3.092329 3.2352155
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0012580 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_12g0012980 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0012800 RBH 0.0 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0012710 SBH 0.0 0.0 0.132076
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0012990 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G012680 RBH 0.000000 0.000000 0.173978
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0012560 SBH 0.099196 3.278061 0.491494
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