Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKYG_10g0003450 OGI:10013860 | 16/16 KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr10:4733414-4743527
Gene Symbol RLCK378, OsRLCK378
DNA seq

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CATGACTACGTTCTTTTGACGTAAAGACACTATTATTGTATGTGTTGTTCTGCTCTGCTGATCATTAGTTTCCTTTGCTCACTTGATATTTTCTCTAGAGTGATGTGTGATCGT

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CDS seq

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Function Wall-associated receptor kinase 2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMP1]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_10g0003450 OsKYG_10g0003450.01 Chr10 4733414 4743527 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_10g0003450 OsKYG_10g0003450.02 Chr10 4737798 4738897 - IsoSeq
CDS seq

ATGTTTATAGTTTTGGAGTTGTTCTCTTGGAGCTCATTACAAGGAAGAAGGCCTCACACTCCGACAAAAATAGCTTACTTCGGAATTTTCTTGATGCTTACACAAGTGGGAAGA

Protein seq

MFIVLELFSWSSLQGRRPHTPTKIAYFGIFLMLTQVGR

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_10g0162836 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os10g07556 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os10g0162836 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_10g0003480 RBH 0.0 4.538057 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_10g0003440 RBH 0.0 1.227633 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_10g0003360 RBH 0.000000 0.000000 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_10g0003670 RBH 0.0 0.051210 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_10g0003390 RBH 0.0 25.566597 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_10G0067400 RBH 0.4557845 95.154453 0.0324195
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_10g0003580 RBH 0.0 1.117110 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_10G0074900 RBH 0.119091 15.243549 0.010911
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_10g0003420 RBH 0.0 0.218853 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_10g0003580 RBH 0.0 3.513774 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_10g0003330 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_10g0003660 RBH 0.394088 12.960301 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_10G003490 RBH 0.0 2.832500 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_10g0003630 RBH 0.0 158.876358 0.0
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