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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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CDS seq

ATGGTGGTGGCGGCGGACATCACCGGCGGAGAGCACCGCGACCAAATGCCGGCTCAAGGCAGCGGCGGCGGCCGGCGGCAGCAGCAGCTAGCTGCGCCGGAAAAGCAGCTGAATTGCTTCGTTCACGTCGTCGCGATGGTGGAGAGGACGGGCAACGCCCTGGGCACGCTGGCCTTCACCTGGGCGACCGTCGTCCTTCTCGGCGGCTACCCAACCGTGCTCCGTCCTGAGGATGATTTCTGGTTCGCCACCACCATGGTTTTCCTCGAAGCTGCCAGGATGTTTAGCCGCGATAACAGGCTAGATTACCAGTTATTTTTCAGTACTAGAGGAGCTTTTAGACTTCTTGGCTGGAGCGGGTTGCTGACTGTGGTGGTATATTTTTCCGTTGTGCTGGTGATCATGTCACGCTCTCTCGGTTACATTGGTGCTAATGTATTGGTGGCTTTACTTGTGGATATGGCGATGCTACTTGCATTGGGTCAGTTGCTGTCTCCAGCAGCTCTAAAACTACTATGCGATCCGCTAGGACATGCTATATCGCTGTGGAGCCCATTACTTGCAATCCTATTGATCGGTCCGTGCATTACTGTGCCAATATCAAACTACTCTACCCGAGGATTCACTTATACAAACTCAAAGACCCAATGGATAATGTACCTAGTACTATCTGTGTTTGTCCTCCTAGCGACAATCAGCAGGCCGCGGCTCCCATGCATCAGAAAACTAGTAGACTGTTTTCTCAACACAAAACAGTTAGCTTGGCGTCAAATCATTCAAAACTTGTGCATGCTTGCTGCGATGGTGATGCTGGTGGTATTCATTTCCGGTGAGCTCAATCCATATTCGATGCTCGTGTACCAGCTTTGTGCTCTAGTGGTGGTGTCATTTGGCAACTTCCAGATTCCAGCAGCTGTTGTGCGTGTCGTCCTCGCACTGCTACGCCTTGTACCGCAGAACTACTTAGCAGATGATAGTGATGGCAAGAAGGATACCGAGAAAAACCTCAAGCCATCGCTAAACATCTTCTATGGGACGGTGCTTGGACAAGGGATTCTCTACATTGTGGCCTGCTTGCTGGAGGTATTTTCATTCATCCCTCGGAGATGCCTCATCCGCCGTGGCGGATTTGGTGGTCAGATGGGAGTGGAATATGCCAATTTGTACTATGCATATGCCTTTGAGAAATGCATGGGAGGGGCTGTGCTTGCTCCAAAGAAGATCAGCCTCATCACATTTGCCATGGATTCCCTCAACTCAGACTCTTCCAGGAAGAAGCTCTATGGGGTTCAGATGCTGCACAGCTTTCTCAAAAAGGAGCAGCTAAGGACTAAAACAATAACAAAGCTCACCAATGCCACGAAGACGGTAGCCTCGATGTTTGATATGCTGGGCTGGACAAGTGACGGGGATGAAGAAATCAGATTCTTCGCCGCAAAGGTCACTGCCGAGCTTGCTGGTAGCCTCCGAGTTGTTCAAATCCCTGGGGCAACACAGCTTCGGATCACAAAACGCTGGTCAGTTCCAGAGGAGGAGCCATCCACGGACCAAGATTTCCTCCCCATACAAGGACTGCTAATTCTTGAGAGGCTTGCTAACTTTGATCCTGGAAACTGCATGGAAATCAGCAGAACAACAGGCCTCATCTCAAAGATGATAGATTTTATAAGCTACAGAAATCATATGACAAGTACTAGTGAAGCCCACCAAATAATGCTGGCAAGTTTGTCACTTAAGGTGCTGAGAAGACTTGCAAGTACTGAAGGGAAGTTAGGTGTAACTCTGCGACAACAGATTTTGGAACATACCTTCGTATTGAGCAACCTTGCAGAGATCATGGATGACAATGGGAGCAGCCATGAACTGAAGCAGTTGGCTGCAGAAATCCTGAAAAACCTTGCCATGGATAGAAACACTAGTGAGGACATCGGGCACATCCGAGTGATTATCAGTAGTTTGATGCGTGAATTTCTCAGCCAAGATCCATCCTCAAGTAGAAATTCTAATCACTTGCTACGGAAAAATGCCGGTCAAGCACTGGCAATGCTGGCAATGGAGAGTACAGATAACTGTTTGATTATGTTAATGGAACCAGGGTATGTGTTCATTAGAGAACTTACAACTATGATCCATGATGACAGGTACAAATGTATAGCAGCAAGCCTGCTGTGGAATATGTGCGAGCATGCTCAGCCTGAGCTCAGCAACTCCGACCTGAAGGAACTGTCTTACATCTTGCGAGAGGTGCTGGAAGGAATAATGGATGTGGAAGGGGCAGAACTAGAGGTCCTTATTGGCCTTAGTTCACAAATATGTCAAGTCATTCCTGAAGACTTCACGCGAGAAGTTGAGCATGGCCAAATTAAGGAAAAATTAGTAAAGAGGCTTGTCGATGTGTTTAATGCACATATGAAACCCAGTGCTCATTGTCCTGGCATCAGGAGGGTGATTGTTCAACATGCCATATACTTGATGGAGTTCAATTCTCGCTATGCAAATGATTTCCACAAATGCTGGATGGTGGAAGCACTATCAATGGTGGAACGTACACCCTCGAGGTCTGAAAACTACAGGTTGTTTTCAGGCGACACAGGACTCATGGAGCACAACGCACCACTTTCTGCTCTTGTGGCCAGAGCAAAAGAGCTGATGGGTCGCGAATGGAGCGCCTGGATTCGAGTGGTAGACGACGACGACGTACAGGGCGAAGATGGCCGTGCCAGAGAAGCAGCTGAATCGCTTCGTTCACTTGGTTGCGATGACCGAGAGGTTGACCAGAAAATTCTTGGGACGCTGGCCTTCACCTGGGCGACCGTCGTCCTGCTCGGCGGCTACCCCACCGTGCTCCGTCCTGACGATGATTTCTGGTTCGCCACAACCATGGTTTTCCTGGAAGCCGCCAGGATGTTTAGCCGCGATAACAGAAAGGATTTCCAGCTATTTTTTAGTACTAGAGGAGCTTTTAGAATTCTTGGCTGGAATGGGCTGCTGAGTGCGATGTGGAGGCATATTAGTGGCTTTGGTAGTGGATATGTCAATGCTACATGGAATTGGCCAAATGCTGTCTCCAAGAGCTCTAAAACTACTATACGCTCCGCTACGCCGTGCTGTATCCCTGTGGAGCCCATTACTTGCAATCCTATTGATCGGTCCGTGTATTGTATATACGAAATCCACTTTCGAGAAATCATTCCCACAGACCCGAAGACCAAGTGGATATTATACCTAGTACTATCTTTGTTAGCCCTCCTTACGACAATCAGCAGGCTGCGGCTCCCATGTATTGTTAAACTAGTAGACAGTGTTCTGAGCAGCAAACAATTAGCTTGGCGTCAAACCGTTCTAAACTTGTGCATGCTTGCTGCGATAGTGATGATGATATTCACGTTCAGTGAGCTCCCTCTATTTTCGATGATTGTGTGCCAATTTGGTGCATTAGTCATGGTGTCATCTGGCAACTTCCAGATTCCAGCAGCTATTGTGCGTGTCATCCTCGCACTGCTACGCATTGTACCACAGAACTACTTTGCAGATGGTAGCAACGGCAAGCAGGATAGTGAGAGAAACCTCAAGCCATCTCTAAACATATTCTATGGGATGGTGCTTGGCCAAGGGATTCTCTACATTGTGGCCTGCCTGCTGGAGGTCTTTTCATTCATCCCTCGCAGATCCCTCATCCATCATGGTGGATTTGGACGTCAGCTGGGAGTGGAATATGTTAATTTGTACTATGCATATGCCTTCGAGAAATGCATGAGAGGACCTGTGCTTGCTCCAAAGAAGATTAGTCTCATCACCTTCGCCATGGATTCCCTCAACTCAGACTCATCCAGGAACAAGCTCTATGGGGTTCAGATACTGCGCAGCTTACTAAAAAGGGAGAAATTAAGGATTAAAACCATCATGAAACTCACCAATGGCACGAAGACAGTAGCTTCGTTGTTCGATTTACTGGGCTGGACAAGCAATGCTGATGCAGACGTCAGATTATGCGCCGGAAAGGTCACTGCCGATCTTGCTGGTAGTGTCCGAGTTGTTCAAATCCCTGAGGCAATGCAGCTCATAGCCTCACTTCTGGACATTGATCAACAACCAAAAAAAAGCAATCATTTTCTTTTCATTGAGAGCCAAGAGGGAAGAGAAGACTCACCAGTTCAGCAAGTTGGCATGGGTAAACATAAATCTGTGATACTTAAGTACTTGAAAAAGATGGCAATATACTGTTTGATTCCGGTGGATGAGGCATCTAACATTCATGAACAAAACCCACATATTCTCAGATGCTTGAGGTGGATCACAAGATGCTGGTCAATTCCAGAGGAGGTGCTGTCCACGGACCAAGATTCCCTCCCTGTGCAGGGATTGCTAATTCTTGAGAGGCTTGCCAATTTTGATCTTGGAAACTGCATGGAAATCAGTAGAGCCCCAGGTCTCATCTCAAAGATGATAGACTTTACAAGGTACACAAATTGTAGTGTCAACGAAGAACACCAAATAATGTTGGCGGGTTTGTCACTGAGGGTGCTGAGAGCACTTGCAAGCACTAAAGGGAAGTCAGGTGTTAGTCTGCGACAAGAGATTTTGGAGCATCCATTCCTATTGAGCAACCTTGCAGAGATCTTGGATGACCGTGAGAGCAGCCATGGACTGAAGCAGCTAGCAGCAGAAATCCTGAAAAACCTTGCCATGGATAGAAACACTAGTGAGGACATCGGGCGCATCAGATTGATCATCAGAAGTTTGATGCATGAATTTCTCAGCCGAGATGCATCCTCTAGTACAAATTCTAATCACTTGCTACAAAAAATTGCAGGTCAAGCACTTGCAATGCTGGCAATGGAGAGTGCCAATAACTGTTTGATTATGTTAATGGAACCAGGGTATGTGTTCATTAAGGAACTTACAACTCTGATCCATGACGAGAGGAACAAATATACAGCAGCAAGCATGCTGTGGAATATGTGTGAGCAAGCTCGGACTGAGCTCAACAACTCAGACCT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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 2.229766 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_07g0649300 RBH 0.000000 0.597205 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os07g45490 RBH 0.000000 0.405833 0.037420
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os07g0649300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_07g0025670 SBH 0.000000 4.986097 0.110220
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_07g0025740 RBH 0.0 0.0 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_07g0025560 SBH 0.049186 0.537736 0.329784
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_07g0025540 SBH 0.0 0.018999 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_07g0025790 SBH 0.316716 1.396034 1.156038
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_07G0447000 RBH 0.715319 0.8503115 1.0058345
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_07g0026230 SBH 0.077395 0.079161 0.137687
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_07G0458600 RBH 0 0.028731 1.2735835
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_07g0025560 SBH 0.016746 0.049124 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_07g0025750 RBH 0.0 34.963375 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_07g0025570 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_07g0025800 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_07g0025460 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_07G025440 SBH 0.037404 0.000000 0.074241
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_07g0025490 RBH 0.000000 0.000000 0.843773
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