Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsKYG_01g0036430 | OGI:01103130 | 16/16 | KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:35941966-35966102 | ||||||||
Gene Symbol | RLCK46, OsRLCK46 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g19210 [UniProtKB/Swiss-Prot:O65924] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKYG_01g0036430 | OsKYG_01g0036430.01 | Chr01 | 35941966 | 35966102 | - | NAM | ||
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Protein seq | MNPSQASLSVYAGFTNIDCGYVDGVSYTDSMTNLTYVTDHEFVAGGINHVVVPKLISGSTDEQEKTLRSFPDGQRNCYTIPSTSGKKYLIRATFTYGNYDGLRSSENGSLFLFGLHVGVNFWTTVNLTNWDSSSTVWKEVITVAPDKSISVCLINLGSGTPFISTLELRKLGDAMYPFVNASTSVSYFSRLRFGSSDEYITRFPTDPSDRFWESWVFYNNTFPWVNMSSNGKVAALPNIDTFGLPQDILGNASTINGNYSWLNITIGASNSLATDLELLPVFHFVELGNNGSKRIFDIYNVDEPKPLFTNFRPPDFLSSMFNNWFLHKGRRATFQLRKTADSQLPPLINAYEVYSRVQVENFTTASSDVDSMKTIKEKYMVIKNWNGDPCSPREYVWNGLTCTYPNGGQNPRIIEINLSGSGLQGELEISFMKMSSLKKLDLSHNNLTGTIPDYQVNSLTVIDLSNNQLNGSIPDSILQRYKAGLLELRLEGNPICTKVRASYCGNKKNTRTRILLISVLVPVTSLLVVLFIFWRLCWKGKSRKSEDDYDMYEEETPLHIDIRRFTYAELKLITNNFQSIIGKGGFGTVYHGILENNDEVAVKVLVETSIAESKDFLPEVQTLSKVHHKNLVALVGYCQNKKCLALVYDFMPRGNLQQLLRGGYDSLNWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPSTVHRDVKTPNILLDKNLVAKISDFGLSRAFNAAHTHISTVAAGTLGYLDPEYHATFQLTVKTDVYSFGIVLLEIVTGQPPVFMDPQTVHLPNWVRQKIANGSVHDVVDKKLLDQYDATHLQTVIDLAMNCLENASIDRPSMTEVVSVLKVCLPISSERQSATSTPRKKNVMDAEIPRQFQLMISGASTTSYEGSSFQSGYTGFLSIDCGYTDSADYVDKNTTLTYVSDKGYVEGGKNFSILAQYMKDATNKQEETLRSFPDGQRNCYTLPTNRSKKYLIRATFTYGNYDGRNSSESGSPFLFGLHIGINFWTMVNLTKLPSSDTVWKELIMVAPDNFISVCLINNGSGIPFISTLDLRPLQDTMYPFVNVSVAVSYFSRLRFGQVNDVITRYPEDVYDRFWEGAFHTRSYPWIDLSTTQEVKRLPGDEKFMVPTTILQKASTIDSKYSWLNITVRGADNLLGSGDLELLPIFHFAEIASTTRLFDIYSDGEELFTSFSPSPFQVDSMYQNGRFLRRVNSTFTLRKQPTSQLPPPLINAFEVYSLVRIATASDDGEQNSGLNSDIFVYTLYSRAKWIEPFVNCDLAGKSKEHDDYDIYEEDTPLHTDTRRFTYTELKTITNNFQSIIGKGGFGMVYHGILDNGEEVAVKVLRETSITLSKDFLPEVQILSKVQHKNLVTFLGYCHNKKCLALVYDFMARGNLQEVLRGGQEYSLSWEERLHIALDAAHGLEYLHESCTPPIVHRDVKTANILLDKNLVAMISDFGLSRSYTPAHTHISTVAAGTVGYLDPEYHATFHLTVKADVYSFGIVLLEIITGQPSVLVDSEPVHLPNWVHQKIAEGSIHDAVDSRLRHQYDATSVQSVIDLAMSCVENTSIDRPSMTDIVIKLKECLPAGTGEMQLVSRSYKQKEAMDADIVRQFQLPISGVSIESIEGNSSGTTELRYPSGRSAMALGLPNNFSHLDDSGFTNIDCGFVDGESYTDSTTNLTYVPDHEFVEGGTHHVVVPKLISGSTDEQEKTLRSFPDGQRNCYTIPSTSGKKYLIRATFTYRNYDGLRSSENGSLFLFGLHVGVNFWTTVNLTKQNSSDTIWKEVLTVAPDEFISVCLVNFGSGTPFISALELRQLDDPMYPFLNLSVSVSYFTRQRFGAVDDFITRYPTDLFDRFWEAAQLYSYPWLNLTTNQTVNKLPGNDNFQVSTLILQKASTINSSFSWLNISVRAGDNLNGQSLELLPIFHFAEIEKNRSKRTFQIYSDGVELHQAFSPSYLQVDSVYPRDRYLHESGTTFTLRKTNSSELPPLINAFEAYSLVRMENLTTDTIDVSSMKQVKMQYNVQRRSWNGDPCSPKEYTWEGVKCNYYDGKQNPRIILVNLSASRLSGWINPSFRNMSLEILDLSHNNLSGTIPYNQVNSLKSLNLSYNQLSGSIPDYLFERYKAGLLELRLEGNPMCSNISESYCATQADKAKKNTSTLGNSPAYTDTRRFTYTELRTITNNFQSIVGKGGFGTVYHGILGNGEEVAVKVQTLSKVHHKNLVTFLGYCQNKKCLALVYDFMSRGNLQEVLRGGQDYSLSWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPAIVHRDVKTANILLDENLVAMISDFGLSRSYTPAHTHISTIAAGTVGYLDPEYHATFQLTVKADIYSFGIVLLEIITGQPSVLVDPEPVHLPNWVRQKIARGSIHDAVDSRLMHQYDATSVQSVIDLAMNCVGNVSIDRPSMTDIVIKLKECLLAGTGEKQLVSGSYKQKGALDADIARQFQLLISGVPIVSNECISSGITELSYYSGRSTVEQVGAGEKQLVSRSYKQKDAMNADMAREFQLLISGVSIESNEGASSGTTKLSYPLGRMKMAVPVLHIEKR
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.023443 | 0.938542 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0810800 | RBH | 0.000000 | 0.039566 | 0.085246 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g59570 | RBH | 0.052066 | 0.026553 | 0.038168 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0810800 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0037580 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.486313 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0037020 | RBH | 0.079515 | 5.297422 | 0.482515 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0037460 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0036850 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0036560 | RBH | 0.0 | 2.403229 | 0.563428 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0570000 | RBH | 0.593437 | 14.7712325 | 3.906639 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0036250 | SBH | 0.000000 | 0.058991 | 0.154543 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0566100 | RBH | 0.9547055 | 1.559824 | 2.760558 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0036450 | SBH | 0.025067 | 0.034110 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_05g0019810 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0036720 | RBH | 0.0 | 37.811909 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0036740 | RBH | 0.006472 | 0.131972 | 0.249838 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0036580 | RBH | 0.0 | 19.080910 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G037060 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0036780 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.000000 |