Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsIR64_09g0007390 | OGI:09034650 | 8/16 | IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr09:12663327-12675548 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK263, OsRLCK263, OsRPK3, RPK3, RLCK268, OsRLCK268 | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g51810 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FZB8] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsIR64_09g0007390 | OsIR64_09g0007390.01 | Chr09 | 12663344 | 12675548 | + | NAM | ||
| CDS seq | ATGGCCTTCATCGTGCCTTTCTTCGCGGCATTCGTGTTAGCAGTGTCTCCGGCGGTCGGACAGCGGCCAGGTTTCGTGAGTATCGACTGTGGGCTAGAGGCCAACTATAGCGGCGGATACACCGACGACGGAAATTACGGCATCGTGTACGAACCCGACGGCGCATACGTCGATGGAGGCCAGAACGGCAGGGTCGCCGCCCAGTATGAGAGCGGGCGTATACGTGCCGACCTGACCCTACGGAGTTTTCCCTCCGGCGTACGGAACTGCTACACTCTGCCCACCGTCGCCGGTGCAAAGTACCTGATCAGGGTGGTGGCCTTCTACGGCAACTACGACGGCAAGAACAGCTCATCGACGTTGCAGTTCGACCTGCACCTTGGGGTCAACTTCTGGAGCACCGTAATTCCCAACGAAGACGAGACGTACGAGGCGCTGTTCGTGGCCTGGGGAAACCTGGCGCCGGTGTGCCTTGTCAACACCGGTCAGGGCACGCCGTTCGTTTCCACGGTTGAGCTGAGGCCACTCGTGGATACGCTCTATCCGGACCACGTCAAGGCCAACCAGTCTATAGCCATATATGACCGACGCATCATGGGGACCACAAATGGTTATGTTACTGCGTATCCTTTCGATCCATACGATCGGTTCTGGTGGGCAGAGAACAGTAACCCATTGTGGGGTTATCTTAACTCCACACGGAACATCCAACCGGAATCTAGAACGGAGGTGCCCTCCGCGGTACTCCAAAAGGCCGTCCAGGTGGCTGGGAACGGCACGATGCTCAACATAACATGGCAATACTACACGCCCGCTCTCCAGTTCACGGTGTTCCTGCATTTCGCTGACTTCCAGAAAAGCCAGCCCCGTCAGTTCAACATCTACTTCAACAGCCATGACAAGCCGTATCTGTACAACCCACCGTACCTGGCCGCTGGGGTCGTTTACAGCCCCAGCTGGTACAGTGACATCGATGGAGAGTTCAATGTCACTCTTGTGGCTACTGCCAAGTCGGTGCTGCCCCCGATGCTCAATGCATACGAGATCTACACCCTCGTCACCCATAACACTCCCATGACCTTTTCCAAAGACGTTGATGCCATCATGGCTATTAAAGTTGAGTACGGGCGATCTCTCCAACAGTAA
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| Protein seq | MAFIVPFFAAFVLAVSPAVGQRPGFVSIDCGLEANYSGGYTDDGNYGIVYEPDGAYVDGGQNGRVAAQYESGRIRADLTLRSFPSGVRNCYTLPTVAGAKYLIRVVAFYGNYDGKNSSSTLQFDLHLGVNFWSTVIPNEDETYEALFVAWGNLAPVCLVNTGQGTPFVSTVELRPLVDTLYPDHVKANQSIAIYDRRIMGTTNGYVTAYPFDPYDRFWWAENSNPLWGYLNSTRNIQPESRTEVPSAVLQKAVQVAGNGTMLNITWQYYTPALQFTVFLHFADFQKSQPRQFNIYFNSHDKPYLYNPPYLAAGVVYSPSWYSDIDGEFNVTLVATAKSVLPPMLNAYEIYTLVTHNTPMTFSKDVDAIMAIKVEYGRSLQQ
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsIR64_09g0007390 | OsIR64_09g0007390.02 | Chr09 | 12663327 | 12675548 | + | IsoSeq | ||
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|||||||
| Protein seq | MEGGGNCHAVHRTCRCSKANDGKRGCRTEGQFSARSTTTSCRRYVIYIWSVGKMKKLYACTSIYTCLRC |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| RI | Chr09 | 12673150 | 12673651 | + | OsIR64_09g0007390.01 | OsIR64_09g0007390.01,OsIR64_09g0007390.02 | All |
| A5 | Chr09 | 12670358 | 12670546 | + | OsIR64_09g0007390.02 | OsIR64_09g0007390.02,OsIR64_09g0007390.01 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 1.368243 | 0.0 | 1.112859 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0356800 | SBH | 0.085395 | 0.363344 | 0.417431 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g19500 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.129089 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0356800 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0007260 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0007240 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0007470 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0007280 | RBH | 0.026806 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0007320 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0201500 | RBH | 0 | 0 | 0.0070865 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0180300 | RBH | 0 | 0 | 0.0071475 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0007330 | RBH | 0.036881 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0007160 | RBH | 0.135025 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0007080 | RBH | 2.983018 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0007080 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0007010 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G007670 | RBH | 0.585660 | 0.0 | 0.000000 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0007470 | RBH | 0.220328 | 0.0 | 0.000000 |
