Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsIR64_02g0025660 | OGI:02071730 | 16/16 | IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:26609643-26640552 | ||||||||
Gene Symbol | OsWee1, Wee1, WAK14, OsWAK14, WAK15, OsWAK15, OsRLCK76, RLCK76, WAK16, OsWAK16, OsRLCK77, RLCK77, - | ||||||||||
DNA seq | 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More
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Protein seq | MRSSFVAACAISLVLVCSAATTPRALAAVYGDGGGLLSIPSNDSLAHCPSSCGDVDDIVYPFGIGPGCFREGFELKCNTSTKTPKLYMKDGTTQILYVGDDDLWAPMHFNITMKPGTDTYNISWVSPRKGVTISQRNTFYIIGCNIDVTLFEYGTRDAVGYCVSRCDGEKVPTEGPCNGKGCCSIKLSRDLRGFRSTLVQVDATAAQSYQLQLRHGVMAFMSYNDYYVDNATDLFLSWTNTSNIQEALVQFAIMDQPSCEIARMKNTSYACSTGSNCLNMSSGGYTCECANYDLYYYYAEQSPYLLEGCIIRDYNPKRKEHCRRSCGNMAIPFPFGLEEGCFASERFRLNCTTGNITLFNPRDARYNVTDVSIEEGTMVVSNLLNDTEYGGEDIISQVYGGAEIKWAVANLTCDAAVKKDATYACRSIHSNCLNVTHGNIFMGYRCKCLPGFRGNPYIQDGCEGITTGISCGIGSIIIALGAIILANKWKKSIQKRIRRAYFKKNQGLLLEQLISDESATNKTRIFFLEELEEATNNFDATRVLGRGGHGTVYKGILSDQNQFINEVAILSQIIHRNVVKLFGCCLESEVPLLVYEFIPNGTLHDRLHTDVSVKSSLSWDDRIRIASEAAGALAYLHSAAAIPIFHRDVKSSNILLDGNFTTKVSETHVVTIVQGTFSYLDPEYYHTGQLTEKSDVYSFGVILVELLTRKKPIFINDVGTKQSLSHYFVDRLREGSLIEIIDSHVLEEAHREDIDDIASLTEACLKLRGGDRPTMKEVEMRLQFLRTKRLRKFQLLPVPGSVGEIQHLLSPDAGKSQAQNNYTSAVCASSFVLVWLAATSPASGAVYGVGGGLLSIPSNDSLAHCPSRCGNVNISYPFGIGPGCFRQGFHVTCDNTTHHPKLFLGNSTTEITYLSQYSLQVSIGFNVTMIPGRSTYTMSWESPAKGFNISYDNYLFVVGCGVEVYLFDIDTNRTIGVCISTCIGDRKIMEGELANADYCNGLGCCSIDMLEGSVRGFRLKLIHHDNIKSQSEVVPSTVKVFVAEEYVFDPNDLYSSWINTSNIYSNASLDFAVVDQPSCEIASVDKGSYACGANSFCRNASFGYNCNCNNRFSGNLGANPYVLDGCIEGYNPNPTRRNCKRSCGNLHIPYPFGLEEGCFASKKFQLSCTSDNFTILDRGRTKFHVSMVSINEGYLTVSNMLNGTSQEDEKLVVVHTIDGQLMYPADITQDLFEFSEEFDMNMKWAIANLTCKTALQRSMTYACISNNSECLNATGGKMPLGYRCKCSAGFEGNPYVKGEDGCTDIDECFQPNSCNGICKNLPGSHSCTPCPHGKEFDRTKGRCITSAKKRNLILGIAVGISCGLGSIVLAFCATMLANKWKKGIQKRIRKAYFKKNQGLLLEQLISDESATNKTKIFSLEELEEATNNFDATRVLGRGGHGTVYKGILSDQRVVAIKKSKIVEQTEIDQFINEVAILSQIIHRNVVKLFGCCLESEVPLLVYEFISNGTLYDLLHTDASAKCLLSWDDRIRIAVEAAGALAYLHSAAAIPIFHRDVKSSNILLDDSFTTKVSDFGASRSVSLDETHVVTIVQGTFGYLDPDYYHTGQLTEKSDVYSFGVILVELLTRKKPIFINDVGTKQSLSHYFVEGLQEGSLTEIMDPQVVEEANKEEINDIASLTEVCLKPRGGDRPTMKEVEMRLQFLRTKRLKKSQLTAGSDGEIKDLICPNASKSHAQNSSVGASDLTSEGISSCYSLEQEFSSSINIPPTQAMTQAAGMSVLLMCLLGAALPRPAATGVGDGGITYIPSAAYLQAHCPSRCGDAEFFYPFGTSPGCFRQGFGLTCDNTTVPPRLFWGDTTTQILSTDPTDRNFIYASIAFNITMVPGVSVYRMSWESPANGFYIDSDTAMYVVGCGVEVYLFDKDSNVSIGSCKTMCMGNKTSMEKALAAVVGGCNGLGCCRIDLPAYIRGFEVTASRVDEKTARSESWPPTVYVFLSEDYNFNTTDLYSPWTSKRVFTSLEAFVMDQPSCESALANKASYACSTNSLCQNMSGGGYMCYCHPVSSSGANPYVLDGCIGEYNPSPRGNCTKWCGNMSIPFPFGLEEGCSALRKFRLNCTSDNLTILDRIEVTYLVTNISVNDGYFVVRNLRNSSRYNDEDMKSTNGNRREMEPDSLLRDLFDLSQEYDMMMWWAVTNMTCQEAIQRNDTYACRSVQSACQDVAHEGIPLGYRCKCTPGYEGNPYVHDGCTDVNECQLLNSCNGPCQNFPGGYNCTSCPHGKEFDAAKKECVASVKLLGSIILALSATALAAKWKKSIQKRIREGHFKKNKSLLLEQLILDKSAADRTKIFSLEELEKATNNFDATRILGGGGHGTVYKGILTDQRVVAIKKSNIAKQAEIEQFINEVAVLSQIIHRNVVKLFGCCLETEVPLLVYEFISNGTLYNVLHNDESVKGQLRWDDRIRIAMEAAGALAYLHAAAIMPIFHRDVKSSNVLLDDNLNTKVSDFGASRSVSLDQTHVVTAVQGTFGYLDPEYYHTGKLTGKSDVYSFGVILVELLTRKKPIFDNDQGVKQSLSHYFIERFQEGTLMEIVDSTIVEEANKEEIDGIASLILACLKLKGEERPTMKEVDMRLQFLRTKRLLKCQHFPISTGEIRSFCPQVNRNSHPENNLSNAVNFPNEGISGCYRLQQEYANEYKETMDDASQYKIDRTRI |
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Function | Wall-associated receptor kinase 5 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMN7] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsIR64_02g0025660 | OsIR64_02g0025660.03 | Chr02 | 26610913 | 26614355 | - | NAM | ||
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More
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|||||||
Protein seq | MSSSLLMAAFGVSFVLVCSAATPAASAAVYGVSGGLLSIPSNDSLAHCRSRCGNVGIHYPFGIAPGCFREGFELICRNITNSTPKLFLGDGTTEIVYLDNDRGRYNLVFVHIYFNITVKPGTDTYNISWVAPTEGITIFYYSTFYVTGCNLEATLFKYGTKDLIGSCMSRCDGEKAPIGGPCNGMGCCFIQLTRDLRGFQSTIILRSDGIPVAQTDPVHPAIMAFLSWSDDYRSNTSDLYLGWTNTSNVVGTLLSFSTIDQPSCERARMNNTSYACSPGSNCQDVSSRGYYCYCSGYEQGNPYLLDGCTDYNPKYKEHCSTSCGDMKIPFPFGVEEGCFANEWFRLNCTEGNLTVCELGEAQYHVTAVSLDDGTLTVGNMMNDTNYEKEAIIVQTTDTGDYSFSGPVEDRFDLSMEYAIVIRWAVTNLTCEVAVQKNTTYVPQ
More
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsIR64_02g0025660 | OsIR64_02g0025660.01 | Chr02 | 26614263 | 26640552 | - | NAM | ||
CDS seq | ATGAGGTCGAGCTTTGTGGCAGCTTGTGCCATTTCCTTAGTGCTAGTGTGCTCGGCTGCTACTACGCCTCGAGCATTAGCTGCAGTCTATGGAGATGGCGGAGGGCTCTTGTCTATCCCTTCTAATGATTCCCTCGCTCACTGCCCCTCTAGCTGCGGGGATGTTGATGACATCGTCTATCCCTTTGGGATTGGGCCGGGCTGCTTCCGGGAAGGCTTTGAGCTTAAGTGCAACACCAGCACCAAAACTCCTAAGCTCTATATGAAAGATGGCACCACCCAGATCTTATATGTAGGTGACGATGATCTTTGGGCACCCATGCACTTCAACATTACAATGAAGCCAGGTACTGATACCTACAACATATCCTGGGTGTCTCCCAGGAAGGGAGTTACTATTTCTCAGCGTAACACCTTCTATATTATTGGTTGTAATATTGATGTCACCTTGTTCGAGTATGGTACGAGAGACGCTGTTGGTTACTGCGTGAGTAGATGCGATGGTGAAAAGGTACCAACAGAAGGGCCTTGTAACGGGAAAGGATGTTGCTCCATCAAGTTATCAAGGGATCTGCGGGGATTTCGGTCAACACTAGTCCAAGTTGATGCTACTGCAGCACAATCATATCAGCTGCAGCTGCGCCATGGTGTTATGGCTTTCATGTCATACAATGACTATTATGTAGATAATGCGACTGATCTTTTCTTGAGTTGGACGAACACAAGCAATATCCAGGAAGCATTAGTTCAGTTTGCAATCATGGACCAACCAAGTTGTGAAATTGCTCGAATGAAAAATACGAGTTATGCTTGTAGCACCGGCAGCAACTGCCTAAATATGTCATCTGGAGGTTACACCTGTGAGTGCGCCAATTATGATCTTTATTATTATTATGCAGAACAAAGTCCTTACCTTTTGGAAGGATGCATCATCCGAGATTACAACCCCAAGCGGAAAGAACACTGTCGGAGATCATGCGGAAACATGGCAATTCCCTTCCCTTTTGGTCTTGAAGAAGGTTGTTTCGCAAGTGAAAGGTTCCGACTTAATTGTACAACAGGTAACATCACACTTTTCAACCCACGGGACGCACGTTATAATGTGACTGATGTGTCAATTGAAGAGGGGACAATGGTGGTTAGCAACTTGTTGAACGACACAGAATATGGGGGAGAGGACATAATATCCCAGGTGTATGGTGGTGCAGAAATAAAGTGGGCAGTAGCCAATTTAACGTGTGATGCCGCAGTAAAAAAAGATGCTACATATGCATGCCGCAGTATCCACAGCAATTGCCTAAACGTCACCCATGGGAACATATTCATGGGATATCGTTGCAAGTGCCTTCCCGGTTTTCGAGGGAATCCATATATCCAAGATGGATGTGAAGGTATTACAACTGGTATTAGTTGTGGCATTGGTTCCATAATTATTGCATTAGGTGCAATTATTCTAGCCAATAAGTGGAAGAAAAGCATCCAAAAGAGAATTAGAAGAGCATACTTCAAGAAAAATCAGGGCCTACTCTTGGAACAACTAATCTCAGATGAAAGCGCCACAAATAAAACAAGGATATTTTTCTTGGAGGAACTAGAAGAGGCAACCAACAACTTTGATGCTACTCGTGTTCTTGGTCGTGGAGGACATGGCACAGTTTATAAAGGGATTCTATCTGACCAGAATCAGTTTATCAATGAGGTTGCTATTTTATCTCAAATTATACATCGCAATGTAGTGAAGCTTTTTGGTTGCTGTCTCGAATCTGAGGTGCCCTTACTGGTATATGAGTTCATACCAAATGGTACATTGCATGATCGTCTTCATACTGATGTTAGTGTTAAATCCTCATTGTCATGGGATGATCGAATTAGGATTGCTTCAGAAGCAGCAGGGGCACTTGCTTATCTGCATTCGGCTGCTGCAATACCTATTTTCCATCGAGATGTGAAATCTTCCAATATACTCTTGGATGGCAACTTTACTACAAAGGTCTCTGAGACTCATGTGGTGACTATTGTCCAAGGTACATTTAGTTATTTAGACCCAGAGTATTACCACACTGGACAACTAACTGAAAAGAGTGATGTATATAGTTTTGGAGTGATTCTGGTGGAACTTTTGACAAGAAAGAAACCGATTTTCATCAATGATGTAGGCACAAAACAAAGTTTGTCTCATTATTTCGTTGACAGACTCCGTGAGGGATCTCTTATCGAAATAATAGATTCTCACGTTCTTGAAGAGGCTCACAGGGAAGACATTGATGATATTGCCTCACTTACAGAGGCATGTTTGAAACTCAGAGGAGGAGATAGACCTACTATGAAAGAAGTAGAGATGAGGCTGCAATTCCTGAGAACTAAGAGGCTAAGAAAATTCCAACTTCTCCCAGTCCCAGGAAGTGTTGGAGAGATTCAGCACCTTTTAAGCCCAGATGCTGGTAAATCCCAAGCACAGAACAACTATACCAGTGCAGTTTGTGCCAGTTCTTTTGTGCTGGTGTGGTTGGCTGCTACGTCCCCAGCATCGGGTGCAGTCTATGGAGTTGGCGGAGGGCTCTTGTCTATCCCTTCGAATGACTCCCTCGCTCACTGCCCTTCCCGTTGCGGGAATGTAAACATCTCTTATCCATTCGGGATTGGACCTGGTTGCTTCCGGCAAGGCTTCCATGTCACCTGCGACAACACCACCCATCATCCCAAGCTCTTCCTGGGCAATAGTACAACCGAGATAACATACCTAAGTCAGTACAGTTTACAAGTCTCTATTGGCTTCAACGTTACCATGATTCCAGGTAGGAGTACCTACACCATGTCCTGGGAGTCGCCTGCCAAGGGTTTCAACATTAGTTATGATAATTATTTGTTTGTTGTTGGCTGCGGGGTGGAGGTCTACTTGTTTGATATCGATACAAACCGGACCATCGGTGTTTGCATTAGCACGTGCATAGGCGACAGAAAAATAATGGAAGGAGAATTAGCAAATGCAGATTACTGTAATGGATTGGGCTGTTGCAGCATCGATATGTTGGAAGGCAGTGTACGAGGCTTTAGGCTCAAGCTAATCCACCATGACAACATCAAATCACAATCAGAAGTGGTGCCCTCCACTGTGAAGGTTTTCGTAGCCGAAGAATATGTATTTGATCCGAATGATCTTTACTCAAGTTGGATAAATACCAGCAATATTTACAGCAATGCGTCGCTTGACTTTGCTGTCGTTGATCAACCAAGTTGTGAAATTGCATCCGTGGACAAGGGAAGTTATGCATGTGGTGCTAATAGCTTTTGCAGAAATGCATCATTCGGTTACAACTGCAACTGCAATAATCGTTTTAGCGGCAACCTGGGGGCCAACCCCTACGTTCTGGACGGCTGCATTGAAGGTTACAATCCCAATCCTACTAGAAGAAACTGTAAGAGGTCATGTGGAAACTTGCACATCCCATACCCTTTTGGGCTTGAAGAAGGCTGCTTTGCAAGCAAGAAGTTTCAACTTAGTTGTACATCAGACAACTTTACCATTCTCGATAGGGGAAGAACCAAATTTCATGTGTCTATGGTGTCAATAAATGAGGGGTACCTGACTGTTAGCAATATGCTCAATGGTACAAGTCAAGAGGACGAAAAACTGGTTGTAGTTCACACCATTGATGGTCAGCTCATGTACCCAGCGGACATCACGCAAGATCTTTTTGAGTTCTCTGAAGAATTCGACATGAATATGAAATGGGCAATCGCCAATCTAACCTGCAAAACAGCCTTGCAGAGGAGCATGACATATGCATGCATCAGCAACAACAGCGAATGTCTTAATGCCACAGGCGGGAAGATGCCTCTTGGGTATCGTTGCAAATGCTCTGCTGGCTTCGAGGGCAATCCATACGTCAAAGGCGAAGATGGCTGCACAGATATTGACGAGTGCTTTCAGCCAAATTCATGTAATGGAATATGCAAAAATTTACCTGGTAGCCATAGTTGTACCCCTTGCCCACATGGTAAGGAGTTTGACCGTACAAAAGGAAGATGTATTACATCGGCTAAGAAGCGCAATCTTATTCTTGGTATTGCAGTTGGAATCAGTTGTGGCCTTGGCTCCATAGTTCTTGCATTTTGTGCAACTATGCTTGCCAATAAGTGGAAGAAAGGTATCCAGAAGAGAATCCGAAAAGCATATTTCAAGAAAAACCAAGGACTACTGTTAGAGCAACTAATCTCAGATGAAAGTGCCACAAACAAAACAAAGATATTTTCTTTGGAGGAATTAGAGGAGGCAACCAACAACTTTGATGCTACACGTGTTCTTGGTCGTGGAGGACATGGCACAGTTTACAAAGGGATTCTATCTGACCAGCGCGTGGTGGCAATTAAAAAATCAAAAATTGTAGAGCAAACTGAGATAGATCAGTTTATCAACGAGGTTGCCATATTGTCTCAAATCATCCACCGCAATGTGGTAAAGTTGTTCGGTTGTTGCCTTGAATCAGAGGTGCCATTACTGGTATATGAGTTCATATCTAATGGAACATTATACGACCTTCTCCATACCGATGCTAGTGCTAAATGCTTGTTGTCATGGGATGATCGTATTAGGATTGCTGTAGAAGCTGCAGGGGCACTTGCATATCTACACTCAGCTGCTGCAATACCAATTTTCCATAGAGATGTGAAGTCTTCCAACATACTCTTAGATGACAGCTTCACTACAAAGGTTTCTGATTTTGGTGCTTCAAGATCTGTTTCACTTGATGAGACACATGTGGTGACTATTGTCCAAGGCACATTTGGTTATCTAGATCCAGACTACTACCATACTGGGCAGTTAACTGAAAAGAGTGATGTATACAGTTTTGGAGTGATACTTGTGGAACTTTTGACAAGGAAAAAACCAATTTTTATCAATGATGTAGGTACAAAACAAAGCTTGTCTCACTATTTTGTCGAAGGACTTCAAGAGGGATCTCTCACTGAAATAATGGATCCTCAGGTTGTCGAAGAGGC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|||||||
Protein seq | MRSSFVAACAISLVLVCSAATTPRALAAVYGDGGGLLSIPSNDSLAHCPSSCGDVDDIVYPFGIGPGCFREGFELKCNTSTKTPKLYMKDGTTQILYVGDDDLWAPMHFNITMKPGTDTYNISWVSPRKGVTISQRNTFYIIGCNIDVTLFEYGTRDAVGYCVSRCDGEKVPTEGPCNGKGCCSIKLSRDLRGFRSTLVQVDATAAQSYQLQLRHGVMAFMSYNDYYVDNATDLFLSWTNTSNIQEALVQFAIMDQPSCEIARMKNTSYACSTGSNCLNMSSGGYTCECANYDLYYYYAEQSPYLLEGCIIRDYNPKRKEHCRRSCGNMAIPFPFGLEEGCFASERFRLNCTTGNITLFNPRDARYNVTDVSIEEGTMVVSNLLNDTEYGGEDIISQVYGGAEIKWAVANLTCDAAVKKDATYACRSIHSNCLNVTHGNIFMGYRCKCLPGFRGNPYIQDGCEGITTGISCGIGSIIIALGAIILANKWKKSIQKRIRRAYFKKNQGLLLEQLISDESATNKTRIFFLEELEEATNNFDATRVLGRGGHGTVYKGILSDQNQFINEVAILSQIIHRNVVKLFGCCLESEVPLLVYEFIPNGTLHDRLHTDVSVKSSLSWDDRIRIASEAAGALAYLHSAAAIPIFHRDVKSSNILLDGNFTTKVSETHVVTIVQGTFSYLDPEYYHTGQLTEKSDVYSFGVILVELLTRKKPIFINDVGTKQSLSHYFVDRLREGSLIEIIDSHVLEEAHREDIDDIASLTEACLKLRGGDRPTMKEVEMRLQFLRTKRLRKFQLLPVPGSVGEIQHLLSPDAGKSQAQNNYTSAVCASSFVLVWLAATSPASGAVYGVGGGLLSIPSNDSLAHCPSRCGNVNISYPFGIGPGCFRQGFHVTCDNTTHHPKLFLGNSTTEITYLSQYSLQVSIGFNVTMIPGRSTYTMSWESPAKGFNISYDNYLFVVGCGVEVYLFDIDTNRTIGVCISTCIGDRKIMEGELANADYCNGLGCCSIDMLEGSVRGFRLKLIHHDNIKSQSEVVPSTVKVFVAEEYVFDPNDLYSSWINTSNIYSNASLDFAVVDQPSCEIASVDKGSYACGANSFCRNASFGYNCNCNNRFSGNLGANPYVLDGCIEGYNPNPTRRNCKRSCGNLHIPYPFGLEEGCFASKKFQLSCTSDNFTILDRGRTKFHVSMVSINEGYLTVSNMLNGTSQEDEKLVVVHTIDGQLMYPADITQDLFEFSEEFDMNMKWAIANLTCKTALQRSMTYACISNNSECLNATGGKMPLGYRCKCSAGFEGNPYVKGEDGCTDIDECFQPNSCNGICKNLPGSHSCTPCPHGKEFDRTKGRCITSAKKRNLILGIAVGISCGLGSIVLAFCATMLANKWKKGIQKRIRKAYFKKNQGLLLEQLISDESATNKTKIFSLEELEEATNNFDATRVLGRGGHGTVYKGILSDQRVVAIKKSKIVEQTEIDQFINEVAILSQIIHRNVVKLFGCCLESEVPLLVYEFISNGTLYDLLHTDASAKCLLSWDDRIRIAVEAAGALAYLHSAAAIPIFHRDVKSSNILLDDSFTTKVSDFGASRSVSLDETHVVTIVQGTFGYLDPDYYHTGQLTEKSDVYSFGVILVELLTRKKPIFINDVGTKQSLSHYFVEGLQEGSLTEIMDPQVVEEANKEEINDIASLTEVCLKPRGGDRPTMKEVEMRLQFLRTKRLKKSQLTAGSDGEIKDLICPNASKSHAQNSSVGASDLTSEGISSCYSLEQEFSSSINIPPTQAMTQAAGMSVLLMCLLGAALPRPAATGVGDGGITYIPSAAYLQAHCPSRCGDAEFFYPFGTSPGCFRQGFGLTCDNTTVPPRLFWGDTTTQILSTDPTDRNFIYASIAFNITMVPGVSVYRMSWESPANGFYIDSDTAMYVVGCGVEVYLFDKDSNVSIGSCKTMCMGNKTSMEKALAAVVGGCNGLGCCRIDLPAYIRGFEVTASRVDEKTARSESWPPTVYVFLSEDYNFNTTDLYSPWTSKRVFTSLEAFVMDQPSCESALANKASYACSTNSLCQNMSGGGYMCYCHPVSSSGANPYVLDGCIGEYNPSPRGNCTKWCGNMSIPFPFGLEEGCSALRKFRLNCTSDNLTILDRIEVTYLVTNISVNDGYFVVRNLRNSSRYNDEDMKSTNGNRREMEPDSLLRDLFDLSQEYDMMMWWAVTNMTCQEAIQRNDTYACRSVQSACQDVAHEGIPLGYRCKCTPGYEGNPYVHDGCTDVNECQLLNSCNGPCQNFPGGYNCTSCPHGKEFDAAKKECVASVKLLGSIILALSATALAAKWKKSIQKRIREGHFKKNKSLLLEQLILDKSAADRTKIFSLEELEKATNNFDATRILGGGGHGTVYKGILTDQRVVAIKKSNIAKQAEIEQFINEVAVLSQIIHRNVVKLFGCCLETEVPLLVYEFISNGTLYNVLHNDESVKGQLRWDDRIRIAMEAAGALAYLHAAAIMPIFHRDVKSSNVLLDDNLNTKVSDFGASRSVSLDQTHVVTAVQGTFGYLDPEYYHTGKLTGKSDVYSFGVILVELLTRKKPIFDNDQGVKQSLSHYFIERFQEGTLMEIVDSTIVEEANKEEIDGIASLILACLKLKGEERPTMKEVDMRLQFLRTKRLLKCQHFPISTGEIRSFCPQVNRNSHPENNLSNAVNFPNEGISGCYRLQQEYANEYKETMDDASQYKIDRTRI
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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CDS seq | ATGGGATATCGTTGCAAGTGTTCTCCCGGTTTTGAAGGAAACCCATACATCGAGGATGGCTGCACAGACATCAATGAATGCTTACTGCCAAACTATTGCAACGGCACGTGTCAAAATTTACTTGGAAATTATACATGCACAAGCTGCCCGCATAGAAAGGAGTTTGATCCAATCAAAAAGAAGTGTGTTACATCAGCAAAGCAACGCAATCTTCTTTTAGGTATTGCAATTGGAATTGGTTGTGGTCTTGGCTCCATAGTTATCGTGTTGGGGGCAATGATACTTGCCAATAAGTGGAGGAAAGGCATCCAAAAGAGAATACGGAGAGCATATTTCAAGAAAAATCAAGGCCTACTCTTGGAGCAACTAATCTCAAATGAAAGCGCCACAAACAAAACGAAGATATTTTCCTTGGAAGAACTAGAGGAGGCAACCAACAACTTTGATGGAACTCGTGTTCTTGGACGTGGAGGACATGGCACAGTTTACAAAGGGATTCTATCTGACCAGCGTGTGGTGGCCATTAAAAAAACAAAAATCGTTGAGCAAACTGAGATAGATCAATTTATCAACGAGGTTGTTATCTTATCTCAAATTATCCACCGCAATGTGGTAAAGATTTTTGGTTGTTGTCTTGAATCGGAGGTGCCACTGCTGGTTTATGAATTCATATCGAATGGCACACTGCATGACCACCTTCATACCGATCTTAGTGTTAGATGCTCGCTGTCATGGGATGATCGCATTAGGATTGCTGTAGAAGCAGCAGGGGCACTTTCCTATCTGCATTCAGCTGCTGCAATACCAATTTTTCATAGAGACGTGAAATCTTCCAATATTCTCTTAGATGGCAGCTTTACTACAAAGGTCTCTGATTTTGGTGCTTCAAGATCTGTTTCACTTGATGAAACTCATGTGGTGACTATTGTCCAAGGCACATTCGGTTATCTAGACCCAGAGTATTATCATACTGGACAACTAACTGAAAAAAGTGATGTATATAGTTTTGGAGTGATACTTGTGGAACTTCTAATAAGAAAGAAACCAATTTTCATTAATGAGGCAGGTGCAAAACAAAGCTTGTCTCATTACTTCGTTGAAGGACTTCAAGAGGGCTCTCTAATGGAAATAATAGATCCTCAGGTTGTTGAAGAGGCAAACAAGGAAGAGATCGATGAAATTGCCTCGCTTACAATGGCATGCTTGAAAGTTAAAGGAGTAGATAGACCTACTATGAAAGAAGTAGAGATGAGGCTGCAGTTCCTGAAAACTAAGAGGCTAAGAAAATTCCAACTGCTCCCAGGAAATGATGGAGAAATCGAGCACCTTTTAAGCCCAAATACTAGTAACTCTTATGCACAGAATATTTATACAAATGCTGGTAATTTAACATCTGAAGGAATCCCAGGTTCTGGTTGCTACAGTGTGGAGCAAGAATTATCATCTTTAATTAATTACGATCCATATCCTAGAAGAGGAAATTGTGAGCGATCTTGTGGAAAATTGTCCATTCCTTACCCTTTTGGGCTCGAAGAAGGTTGTTTTGCAAACAAGAAGTTTCGACTTAGCTGTGCACTGGGCAACTTCACCATTCTCGATAGGGGAAGAACGAAATATCATGTGGCTTTGATTTCAGTAAACGAGGGGTACTTGAATGTCAGCAACATGCTGAATGATACAAGTCCAGAGGGTGACGAGTTGATTGTAGTTCACACTGTTGACGGTGAGCCCATGTATCCGGGGGACACCGTGCAAGGTCTTTTTGAGTTCTCTTAA
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|||||||
Protein seq | MGYRCKCSPGFEGNPYIEDGCTDINECLLPNYCNGTCQNLLGNYTCTSCPHRKEFDPIKKKCVTSAKQRNLLLGIAIGIGCGLGSIVIVLGAMILANKWRKGIQKRIRRAYFKKNQGLLLEQLISNESATNKTKIFSLEELEEATNNFDGTRVLGRGGHGTVYKGILSDQRVVAIKKTKIVEQTEIDQFINEVVILSQIIHRNVVKIFGCCLESEVPLLVYEFISNGTLHDHLHTDLSVRCSLSWDDRIRIAVEAAGALSYLHSAAAIPIFHRDVKSSNILLDGSFTTKVSDFGASRSVSLDETHVVTIVQGTFGYLDPEYYHTGQLTEKSDVYSFGVILVELLIRKKPIFINEAGAKQSLSHYFVEGLQEGSLMEIIDPQVVEEANKEEIDEIASLTMACLKVKGVDRPTMKEVEMRLQFLKTKRLRKFQLLPGNDGEIEHLLSPNTSNSYAQNIYTNAGNLTSEGIPGSGCYSVEQELSSLINYDPYPRRGNCERSCGKLSIPYPFGLEEGCFANKKFRLSCALGNFTILDRGRTKYHVALISVNEGYLNVSNMLNDTSPEGDELIVVHTVDGEPMYPGDTVQGLFEFS
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.123555 | 0.0 | 0.054398 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0632100 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g42160 | RBH | 0.206847 | 0.082306 | 0.000000 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0633066 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0026150 | RBH | 0.303051 | 0.0 | 0.610362 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0026270 | RBH | 0.135362 | 0.0 | 1.260907 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0026160 | SBH | 0.113933 | 0.000000 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0025680 | RBH | 0.034686 | 0.000000 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0025790 | RBH | 1.948071 | 0.0 | 0.463558 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0412800 | RBH | 0.4262375 | 1.155202 | 0.2772525 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0024490 | RBH | 0.211626 | 0.093554 | 0.346981 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0441400 | RBH | 0.7424955 | 3.3441015 | 0.7209015 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0026010 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0025660 | RBH | 0.404916 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0026020 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0025870 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0025490 | RBH | 0.130379 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G026050 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0025920 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |