Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsGoSa_01g0036660 | OGI:01103130 | 16/16 | GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:35640784-35664921 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK46, OsRLCK46 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MNPSQASLSVYAGFTNIDCGYVDGVSYTDSMTNLTYVTDHEFVAGGINHVVVPKLISGSTDEQEKTLRSFPDGQRNCYTIPSTSGKKYLIRATFTYGNYDGLRSSENGSLFLFGLHVGVNFWTTVNLTNWDSSSTVWKEVITVAPDKSISVCLINLGSGTPFISTLELRKLGDAMYPFVNASTSVSYFSRLRFGSSDEYITRFPTDPSDRFWESWVFYNNTFPWVNMSSNGKVAALPNIDTFGLPQDILGNASTINGNYSWLNITIGASNSLATDLELLPVFHFVELGNNGSKRIFDIYNVDEPKPLFTNFRPPDFLSSMFNNWFLHKGRRATFQLRKTADSQLPPLINAYEVYSRVQVENFTTASSDVDSMKTIKEKYMVIKNWNGDPCSPREYVWNGLTCTYPNGGQNPRIIEINLSGSGLQGELEISFMKMSSLKKLDLSHNNLTGTIPDYQVNSLTVIDLSNNQLNGSIPDSILQRYKAGLLELRLEGNPICTKVRASYCGNKKNTRTRILLISVLVPVTSLLVVLFIFWRLCWKGKSRKSEDDYDMYEEETPLHIDIRRFTYAELKLITNNFQSIIGKGGFGTVYHGILENNDEVAVKVLVETSIAESKDFLPEVQTLSKVHHKNLVALVGYCQNKKCLALVYDFMPRGNLQQLLRGGYDSLNWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPSTVHRDVKTPNILLDKNLVAKISDFGLSRAFNAAHTHISTVAAGTLGYLDPEYHATFQLTVKTDVYSFGIVLLEIVTGQPPVFMDPQTVHLPNWVRQKIANGSVHDVVDKKLLDQYDATHLQTVIDLAMNCLENASIDRPSMTEVVSVLKVCLPISSERQSATSTPRKKNVMDAEIPRQFQLMISGASTTSYEGSSFQSGYTGFLSIDCGYTDSADYVDKNTTLTYVSDKGYVEGGKNFSILAQYMKDATNKQEETLRSFPDGQRNCYTLPTNRSKKYLIRATFTYGNYDGRNSSESGSPFLFGLHIGINFWTMVNLTKLPSSDTVWKELIMVAPDNFISVCLINNGSGIPFISTLDLRPLQDTMYPFVNVSVAVSYFSRLRFGQVNDVITRYPEDVYDRFWEGAFHTRSYPWIDLSTTQEVKRLPGDEKFMVPTTILQKASTIDSKYSWLNITVRGADNLLGSGDLELLPIFHFAEIASTTRLFDIYSDGEELFTSFSPSPFQVDSMYQNGRFLRRVNSTFTLRKQPTSQLPPPLINAFEVYSLVRIATASDDGEQNSGLNSDIFVYTLYSRAKWIEPFVNCDLAGKSKEHDDYDIYEEDTPLHTDTRRFTYTELKTITNNFQSIIGKGGFGMVYHGILDNGEEVAVKVLRETSITLSKDFLPEVQILSKVQHKNLVTFLGYCHNKKCLALVYDFMARGNLQEVLRGGQEYSLSWEERLHIALDAAHGLEYLHESCTPPIVHRDVKTANILLDKNLVAMISDFGLSRSYTPAHTHISTVAAGTVGYLDPEYHATFHLTVKADVYSFGIVLLEIITGQPSVLVDSEPVHLPNWVHQKIAEGSIHDAVDSRLRHQYDATSVQSVIDLAMSCVENTSIDRPSMTDIVIKLKECLPAGTGEMQLVSRSYKQKEAMDADIVRQFQLPISGVSIESIEGNSSGTTELRYPSGRSAMALGLPNNFSHLDDSGFTNIDCGFVDGESYTDSTTNLTYVPDHEFVEGGTHHVVVPKLISGSTDEQEKTLRSFPDGQRNCYTIPSTSGKKYLIRATFTYRNYDGLRSSENGSLFLFGLHVGVNFWTTVNLTKQNSSDTIWKEVLTVAPDEFISVCLVNFGSGTPFISALELRQLDDPMYPFLNLSVSVSYFTRQRFGAVDDFITRYPTDLFDRFWEAAQLYSYPWLNLTTNQTVNKLPGNDNFQVSTLILQKASTINSSFSWLNISVRAGDNLNGQSLELLPIFHFAEIEKNRSKRTFQIYSDGVELHQAFSPSYLQVDSVYPRDRTNSSELPPLINAFEAYSLVRMENLTTDTIDVSSMKQVKMQYNVQRRSWNGDPCSPKEYTWEGVKCNYYDGKQNPRIILVNLSASRLSGWINPSFRNMSLEILDLSHNNLSGTIPYNQVNSLKSLNLSYNQLSGSIPDYLFERYKAGLLELRLEGNPMCSNISESYCATQADKAKKNTSTLGNSPAYTDTRRFTYTELRTITNNFQSIVGKGGFGTVYHGILGNGEEVAVKVQTLSKVHHKNLVTFLGYCQNKKCLALVYDFMSRGNLQEVLRGGQDYSLSWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPAIVHRDVKTANILLDENLVAMISDFGLSRSYTPAHTHISTIAAGTVGYLDPEYHATFQLTVKADIYSFGIVLLEIITGQPSVLVDPEPVHLPNWVRQKIARGSIHDAVDSRLMHQYDATSVQSVIDLAMNCVGNVSIDRPSMTDIVIKLKECLLAGTGEKQLVSGSYKQKGALDADIARQFQLLISGVPIVSNECISSGITELSYYSGRSTVEQVGAGEKQLVSRSYKQKDAMNADMAREFQLLISGVSIESNEGASSGTTKLSYPLGRMKMAVPVLHIEKR |
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| Function | Senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase [UniProtKB/Swiss-Prot:O64483] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsGoSa_01g0036660 | OsGoSa_01g0036660.01 | Chr01 | 35640784 | 35664921 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MNPSQASLSVYAGFTNIDCGYVDGVSYTDSMTNLTYVTDHEFVAGGINHVVVPKLISGSTDEQEKTLRSFPDGQRNCYTIPSTSGKKYLIRATFTYGNYDGLRSSENGSLFLFGLHVGVNFWTTVNLTNWDSSSTVWKEVITVAPDKSISVCLINLGSGTPFISTLELRKLGDAMYPFVNASTSVSYFSRLRFGSSDEYITRFPTDPSDRFWESWVFYNNTFPWVNMSSNGKVAALPNIDTFGLPQDILGNASTINGNYSWLNITIGASNSLATDLELLPVFHFVELGNNGSKRIFDIYNVDEPKPLFTNFRPPDFLSSMFNNWFLHKGRRATFQLRKTADSQLPPLINAYEVYSRVQVENFTTASSDVDSMKTIKEKYMVIKNWNGDPCSPREYVWNGLTCTYPNGGQNPRIIEINLSGSGLQGELEISFMKMSSLKKLDLSHNNLTGTIPDYQVNSLTVIDLSNNQLNGSIPDSILQRYKAGLLELRLEGNPICTKVRASYCGNKKNTRTRILLISVLVPVTSLLVVLFIFWRLCWKGKSRKSEDDYDMYEEETPLHIDIRRFTYAELKLITNNFQSIIGKGGFGTVYHGILENNDEVAVKVLVETSIAESKDFLPEVQTLSKVHHKNLVALVGYCQNKKCLALVYDFMPRGNLQQLLRGGYDSLNWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPSTVHRDVKTPNILLDKNLVAKISDFGLSRAFNAAHTHISTVAAGTLGYLDPEYHATFQLTVKTDVYSFGIVLLEIVTGQPPVFMDPQTVHLPNWVRQKIANGSVHDVVDKKLLDQYDATHLQTVIDLAMNCLENASIDRPSMTEVVSVLKVCLPISSERQSATSTPRKKNVMDAEIPRQFQLMISGASTTSYEGSSFQSGYTGFLSIDCGYTDSADYVDKNTTLTYVSDKGYVEGGKNFSILAQYMKDATNKQEETLRSFPDGQRNCYTLPTNRSKKYLIRATFTYGNYDGRNSSESGSPFLFGLHIGINFWTMVNLTKLPSSDTVWKELIMVAPDNFISVCLINNGSGIPFISTLDLRPLQDTMYPFVNVSVAVSYFSRLRFGQVNDVITRYPEDVYDRFWEGAFHTRSYPWIDLSTTQEVKRLPGDEKFMVPTTILQKASTIDSKYSWLNITVRGADNLLGSGDLELLPIFHFAEIASTTRLFDIYSDGEELFTSFSPSPFQVDSMYQNGRFLRRVNSTFTLRKQPTSQLPPPLINAFEVYSLVRIATASDDGEQNSGLNSDIFVYTLYSRAKWIEPFVNCDLAGKSKEHDDYDIYEEDTPLHTDTRRFTYTELKTITNNFQSIIGKGGFGMVYHGILDNGEEVAVKVLRETSITLSKDFLPEVQILSKVQHKNLVTFLGYCHNKKCLALVYDFMARGNLQEVLRGGQEYSLSWEERLHIALDAAHGLEYLHESCTPPIVHRDVKTANILLDKNLVAMISDFGLSRSYTPAHTHISTVAAGTVGYLDPEYHATFHLTVKADVYSFGIVLLEIITGQPSVLVDSEPVHLPNWVHQKIAEGSIHDAVDSRLRHQYDATSVQSVIDLAMSCVENTSIDRPSMTDIVIKLKECLPAGTGEMQLVSRSYKQKEAMDADIVRQFQLPISGVSIESIEGNSSGTTELRYPSGRSAMALGLPNNFSHLDDSGFTNIDCGFVDGESYTDSTTNLTYVPDHEFVEGGTHHVVVPKLISGSTDEQEKTLRSFPDGQRNCYTIPSTSGKKYLIRATFTYRNYDGLRSSENGSLFLFGLHVGVNFWTTVNLTKQNSSDTIWKEVLTVAPDEFISVCLVNFGSGTPFISALELRQLDDPMYPFLNLSVSVSYFTRQRFGAVDDFITRYPTDLFDRFWEAAQLYSYPWLNLTTNQTVNKLPGNDNFQVSTLILQKASTINSSFSWLNISVRAGDNLNGQSLELLPIFHFAEIEKNRSKRTFQIYSDGVELHQAFSPSYLQVDSVYPRDRTNSSELPPLINAFEAYSLVRMENLTTDTIDVSSMKQVKMQYNVQRRSWNGDPCSPKEYTWEGVKCNYYDGKQNPRIILVNLSASRLSGWINPSFRNMSLEILDLSHNNLSGTIPYNQVNSLKSLNLSYNQLSGSIPDYLFERYKAGLLELRLEGNPMCSNISESYCATQADKAKKNTSTLGNSPAYTDTRRFTYTELRTITNNFQSIVGKGGFGTVYHGILGNGEEVAVKVQTLSKVHHKNLVTFLGYCQNKKCLALVYDFMSRGNLQEVLRGGQDYSLSWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPAIVHRDVKTANILLDENLVAMISDFGLSRSYTPAHTHISTIAAGTVGYLDPEYHATFQLTVKADIYSFGIVLLEIITGQPSVLVDPEPVHLPNWVRQKIARGSIHDAVDSRLMHQYDATSVQSVIDLAMNCVGNVSIDRPSMTDIVIKLKECLLAGTGEKQLVSGSYKQKGALDADIARQFQLLISGVPIVSNECISSGITELSYYSGRSTVEQVGAGEKQLVSRSYKQKDAMNADMAREFQLLISGVSIESNEGASSGTTKLSYPLGRMKMAVPVLHIEKR
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.469056 | 0.000000 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0810600 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.231799 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g59560 | RBH | 0.000000 | 0.076943 | 0.052928 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0810600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0037580 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.486313 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0037020 | RBH | 0.079515 | 5.297422 | 0.482515 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0037420 | RBH | 0.126419 | 13.190196 | 1.515276 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0036850 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0036530 | RBH | 0.283848 | 0.0 | 1.695162 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0569100 | SBH | 0.4095195 | 3.1655185 | 1.536893 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0036250 | SBH | 0.000000 | 0.058991 | 0.154543 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0566300 | RBH | 0.0027115 | 6.5650455 | 0.003733 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0036370 | RBH | 0.028537 | 0.015554 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0036490 | RBH | 0.050741 | 5.263038 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_05g0019880 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0036740 | RBH | 0.006472 | 0.131972 | 0.249838 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0036520 | RBH | 0.101131 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G037090 | SBH | 0.0 | 0.387387 | 0.082232 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0036760 | RBH | 0.0 | 47.709988 | 0.742623 |
