Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsCMeo_11g0013260 | OGI:11045580 | 16/16 | CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:15171912-15187490 | ||||||||
| Gene Symbol | SCP61, OsSCP61, OsSCP62, SCP62 | ||||||||||
| DNA seq | agagttgcttgtacttacggagccgagatgggaaaggaagcaagcgcgatggttgcgaggagaagcaccagccgccgtgattggaggaggtggtggtggtggctgctgcctctcgcctgctgcttcgtttgttgggttgcctcgtcggcggcgacggtggcgccggcggccggtgtcgccgtgacgagccttcctggattcgacggcccactgccattctccctcgagaccgggtatgtatactgtatacaatgcgcgcatgactgttgttccgatcgcgatatgcctcttcttttttttcttattgattcgcgatatgcagagatacgcgttacgggtctcaaaagcatcaatacgtcaatacggcgagtatatatatctataggacgcgactagaccgaaatcggtctcgcgatagctctatcgcgcgacgcgcgcccctgccagaaaaagcaaccgcgcgcccctaccaaaagaggaaagcgtgcaacgcacggctctcgcttcgcatggtatagctggcatgggcccggctaggacagagcgctgcgcgcctccttcccccctccaacccatcaaatccggacagccggcggcgtcaatccacacgcagccgccatggtgaaaaaaaaatcagaaaagcacgaacaggggagaggaagaggaaaccatcaacttggaagttgatgaggagaagaaagtatagtagatccaaaaaaaaaagatcacaggtacacataaagttcatcctctgtttttttgagatccatccaaaaaaccatagaaactgcactgacttacttcccaaactacactgacttacttccataatttgcatggacttactttcccaaactgcactgacttacttcctaaactatactgacttacttcgaaaaaaacagatatggacaatctattcagaagtacctcccaaactacactgacttacttcgaaaaaaacagacatgggcaatctattcaggtacttctgttggtatttgttttatgcaaagttactttctagtagtgtgtaagttacttctagaaatacactaacttacttctagaaaatcacaatatgtgctgaattacttcaaaaacaaaactgatttactttcagcaacacaaaactgtaattagttactctgcaaatgtgtcaacttacttcctagtaatgtgtgagttacttctaaacagtactaacttacttccagaatgacaatatgtactgaattacttgttaacagtactggatttcttcctagccattcctataaaatcattttaaatattagtttcaccaaaaactaaccaaattacaacttaacaactagtaggaagtaacatttatgtgtttagaagtaagtcagtacattttggaagtaacttagctgagatagagagggagtgaaatgagggagagctagagaggggaaatgaggggatagagctattatagggggagaaaacaaaccaagaggccgtttgtggagcacaaaaaatcgcacacatgggaagcgaaaactaccaaaatctctccacctctcccggcgcaaaaatcacacacaaatcgcgcacaaaaattgtgcagtgaaactaccaaaagtctctccacctctcccggcacaaaaatcgcacaaaaaaaaatcaatcgacctctccccagctgaaaaaaaaatggcaaccacctctatgcacgcctcaccttacagcacagccgccggatttggtggacagaaaaccacctaagccgcagcctccgcttccccccacaactgccggcgagatgtggagaaaaaaaccgctgcctccgtccgccgccggcgcgacgccatgaaaacaagcgcaccttcccgcctcccacaccgccgctgcggcaacgtctccgctgcctccaccgatgatttcgctagagattctcgccgcctccgcctctctccctctctccacccctctccctctcgagcgccacccaaaattttgaacagtgaaagccctctctctctcttgcggttggacagaaaagcggtgcgggtgcgctcgattgggacgccgacacgcggtcgggacacgcgcgcgcgccggatgaaagccacgtcgcccgcgcaccgatcgacggctcccatgcgtgtctcgcgatatgactaaacggagaggcctctccgtttagattatacgatatctatatgtagctatctatatattactccctcaattctataatacaaggcacaaccactttttttaagatgttccatagtataaggcatgcatgcatgcaattaattatggcatcttctccattaaattattacatttttaaatcctttactctcacattctctaattctattggatgcatgcattatatttattagagtgatccaaactacaagctgataataattatttcttggcctttagattaagggtggttgtgccttatattttagaatggagggaatatattataaaaaaatatgaggactataactgggtaaaacaatgagattaccgacaaaagatcgactagtactatattctttgcattgttggctgttgcaaacattcaacacatttagcaccagcttgtagcatcatccttaagttcatgtaaatgcaaaatattgacagttggggaagatgaatattggggatgtggtttttagtcccggtttataactccctttcgtccctggttgtaaactgggaccccgaatccgggacgtcccggttagtaacttcaatctgaactaaagatagtagcgccacgtggctagcgctaccatttatagtcccagttggtaacactaacccggactatagtttttttttctttttttccattgcttttttgttgcttgcatattgtttttttccaatgccacatattgaatgcaacaacatcaaaattaacatcacagatcgaatgcaacaacaaaatcatccacaaaatctacaacaaaatcattcacaattttttttctttattctcttctttccttgctcttgcttctcatcctcctcgccgacaatagatgggggagaggaggaggagggccccggcggcttggcaagccgcccgccaccaacgctgttccgcctgatgccgccgccgtcgtctttgccgacggagaggggaaggggatgagggggaggagaggagagggggaggagagatcttgctgtccgctggcgccttccgcctcgcatgccgccgacggaaaggggaaggggaggaggggaggcgtgtgaagcgggccgggaggaggagtggaggtggagcgacgaaggagataaggagggggaggaggaggaggaggcgtgcgaaagagttaaggaggaggagacgtgtgaaggagataagatgaggcggggaggcgtgtggctcggcgtgattttctcgatgtttcgtcccgattggtgtaaacaaccgggactaaagatattggggcctgacacgctacatcctgtagcctgacgtcttttctaactgagactaaaaatgatatttagtcccactaaagatcataaagtcccgttgcgctttttaactgggactaaaaatgatgatctttagtcccggttcgaataggaaccgggactaatgtggtttttgcatgacccacgaaagatcagttctccagttgtgatgttaagaatactaaaaagaaatatgacaaaaaattcacttacaacccaacatagttcacgataccgaccacgaccagcacccaacacgattgacaaagtgacaaataacaacacaggtgacaaaactgtttaacagaaatataagttattaaccttcacaaacaacagcggcgacagcattggcagaacaattgacactactatcagtagcaatacactactacttagacgaatttcctggacgagatccacgttagggtgcagatgaaccataactgaccgtgtctacaaaaatcaacatttattttctcatacagctttttaagagatccacatacaaaaatcaatatttgcaagcaaacgtcttaaggagccgcgtgcgaaaatgaatatttttttgcatgcagtcctcctgaagggccgcatgcgcatgcgggcccttaaaatggtccgcatgcaaaaatatctgctcttttttctccactcctctttctttccctcctcaccacttcaaatttttttcacccctctccgctctctccctctccagatatttctctctcctctcctcctctctcttcctctcctcaatctctctctctcccttcgagtgggcggccggcggacggcagcgccgccgcctgccatccccttcctcatctccgaggacaatgacaaggcggtggctaggggccgcgccgccgccaccatccctttcctcacctggagccaccgacaacgatgacgacgaggtggcaacaacgattgatggctggcggtaggactcttcctgcccgaattcggcgacgggagcggtgtccgcagcggctcccgtgatggcgagagcagacggtgaaacagcagcttagcagcaatggtcgatggcgggaggcagggcttctccctcccggatccggtggcagcggccatcccccgctcggcagcagtgggcgatggcgagcggcggggctccttccacccagatccggctgcggaagtggacggcgcaatggcggctcggtagcagcggttgacagcgggcggtagggctcctcctacccagattcgacggcgggaccggacggcgcgacactggcacgtcaccgacagcgggagcggccggcgtgattttttttttgcaatttttttggttttttatctttgcatgcggtccacatgagcatgcgaaaaattgatctggccgtatgcaaaaaggatttttcgtttgagcgaggctgagattgaaagctttgaattgccatcctattatcctataactagagcaagcttttggcctaaatcattctaaatctattcttgatagaacatgaaaaattgtcttaccatggtactacccaataatttcacatgtggtttttactcatgcaatacaacttcattaaaatacgttcaacttcaacttaatactccgtgtcaatttttactaccaccaactaagcacaaagtcacatacgtgctaacaaaaacctttttcactataataataaattaatactaactaaaaaagatatgtactcaccaagtactaacttcaaatttaactactctaactaatctagtaaaactaatttaaacctgtgctaacatcaaacatgtaacttagggattgggaatttaatatcacttgaggaagggcctccaccgccgctcctctcccgctatccgcaggtgtggtctcctcactccccatcccctgcagatgccgatctgccctctaactagtcctccctctacagatcaaaatgacccttgtcgagctgtggggaaggaatttaaagggttgtactgaatgcccattgttcgatatgggatatgctggggccagtcgagctactgtggttcgacagggcctgcggctgttagttgtgggcccagtagaactatcaaagttcgataagcccctattgtaccactcgtagtttgattggtctggctcgccgtgtttccaacggtcaatatggctcggtcgaacttgtgctgttcgacaagcctcctatcacgacacgagttcgattggcttctactttcacgattataatgaggcagaaattattgtttaccattttccatcaaataatattatttttaaaaaatccaatagcctcaacacattgacagagttatgcatcataaaaatgtgtgtgcaggcaataacgatcataatagttataaattattttattcacgtatacgtacatcatagtgctagtctttcacctatgtgagatgaacaccaatataatgatcttctccaaactacgaattgccacaatagcctccaaatgatagttccaatatattccaaaatgccgtattcgtagagctttatatgcatttctaatgaaatcaatgccacttttatttaatcatgtggctcaaagtagcacctaccattttttttctaaaccaaaatgggtggttagctgtatatgtttctccttcaatgattgtggttacaccctaggtacaaagaaataaaaacttattggctattcaattccaggcatccatatatatcatgtgtgcacacatatgactcttgcagatacgtggaggtgaacgagagtacgggcgtgcgtctcttctactactttgtccagtcagagaaggatcctgatgtagacccacttttattgtggctatcaggtgggcctggctgttctagtctctctggcctaacccacgagataggtaaattaactagcaggttatttttttcagattattgaaaaaattccaccgagttccttcggataaacaatatggtaaaccatgcttataggtcatgttacaataacgtttgttgtatttaacagattattcatgtgcatacatttataggaccattccaattcgccgcaaaacggtattacagtggaggattgccgaaaattatctatcaaccagagacttggactaaggttgcttacattatttaatggacgtggcaacaaagcaaattatttgtatctctgtctcaaatgaaaaaaaggcatgtgcccatatccaggttttaatggatgaattttgcatggttttgcaggtgagcaacataatttttgtggattctcccgtaggggcaggattctcatacgcggcaacacaggaaggctccaagactagcgataccaagacagtgaaacagcttgttattttcctcagaaaggtaactcggtgctgaccaatgccccagaatttcagatttttacaccacctatcttgtatggaattggtttaatatattttttgtttgccttatggttttcttcgagaacatccgcaggcttcgaatgccatttcagtaacatccaccatccgttacaaaatattatgtttttttaggttgcttagaaaatactacagttaggacgaaagatttcttttctgtcacttgagttatcaatttttaaagtttaaatatatatcttagatttcctttccaaacatctgattggtgatataaaattggaatcctagagatacttatattttgaaatggagagagaatgagaaagtgcttgtacggcacgtaattaagttgcactggttattactactgaaattgtaaatattatattttaaataatatgttgaataagttggcaatatttcggtgaacgaacacttggactttttttatttctgaagaaggaacaatttactttgttattatgttccaaaaatcaaaattattaattagaaatacttatatagaatggatccttatgtttctgctgttacattgctgatgttgggtccgcagcatttgctatcatgtaatatagaaatttagaattagtgagtatcagtaaacccagtttagatatcattttaaatttaataataccaaaacatataaataagagatatcaagttgtactttgattgtgcctcgattatcttttacatggtttaataattctaaagctcataattaataagtgtattgaactgcatttttggtttgggatcacaattatagccatttatggtttaataattccaaaatttgttaattatcaactatcgagttgtacttgattaagagtctcaattgtagtttttcatgttttaatcattctgaaattcgatattagtgagtatccacatatgtattcagtttggagccccaattatagaatttccatgatttaatagttccactgtgaataattaatcactaatttgttttcgccaaaggtatatttattttaaaacaaattctgatcctgttctatagtaaataataccatccaactaactaatggccttaattttcaaattaactactagtggaatataatataaaagatgtattcgtgtgtttgttattttctcgtgattattcaatatgatgccaattgaaatgaaatatgtgtaacttagcgatatataaaatataattaagaaaagattcacttactggccgtttaaagatgctgcctggacaggtggaaaatatttaagtgcatgctgaagattgagcgaggttgatttgtaatccctccgtccactgactaatgcgcgctcttcaaaactagtatttgactttaaatttattatatattataaacaaaagttgtaaatccaaaggttaatctaatcatattattttcataaaaaaatttaattcctaataaaataattattggtccaacatttaggttgagttcgttcatttactttcccactcatttctctttttccatgtgcacacttttcaaactactaaacagtgtattttttgcaaaaaaaaattatatagtaaagtttctttgaaaatcatattaatctattttttaaaaaatgataatacttaattaataatgtgctaataagtaactatgttttgcgtaagtgaaaggttagttttcaacctcaataaaagaactcagtcttaaaatttgaatcttgtgaacgccatattcagtgggacaaagagagtactattatgattttgtaagcttctaattaatgaaacgggaagtttagtcattcgtgcttcttcggtaaataggcaaaaaaaaaaggagttaaccaagaaggtctaattaagatacagagtgaaatattagttttacctcttgcagcacatctagcttgtactctatcctgctaaaatactggttctaaaaaggaaattaaatatcgttgtctaaagcaagataacaaataaaaaaaaaagaaaaacaggcaagaattgtactgttataagaaacaccgataaagtgcggttgtggcaattgcatggtttgttggttcggcaggaacggcaacagcagcagaaaatcaccatcttaattatagtcaataagccaggttgtgcacatatatgtcacaatcctgcaaggaattaatttagaagcaacataaggtacgccaaacaatgattgagctacaccagcggcctgcaagtgttcttaatttccaatcgccgccgatcagcatgagcaatcgatgactggagaagctcaggcacgatgaccggagaagctagttgcaggcaaagtctcacgcgccgcgttccacatctccttgagatcgcatctgttctgtatcattacaattgtagaatcattccgatctgtgctctctctcgtatgatgtagaattgctagatagaggataaaatatatacagtatcatgagaatttataacaggcccaatagataaaattttaacatctatggtcatgattgaacgatctaaataatcagcgaccagattcttgtagttaacgtgagagcttcctcagagcgcccgattagcatagactagtcgccaatccgtgcacgggctatttatttatacataacatgaatataaaatatttgacatacatattggacttagaaaaaaatttcaagttaataatgacgtgatgatgaccttatttttggattaaaattaatattgatacaacttcacaattattactttatatttaatttcaacttattaattgtgacatactggtaaacaaaaaacgggagacccaacattctttacatttttgtactattgttgaatgttgatattatatataaacatcaacattttttattgtgtttattattcaacttttataaaaattatattgctaaattatatttgctcgcgaaatcatgtagtcactaagacaatgaatattaattaaatgataaattatttgactaaactaatagtatagaacgatgtaaaaaactattaattatcatataaaattgacataaagattcaaagtctcaccacctctacatcaatagtaagcatatactatatactaaacttagattagtttgttggggcaaatgagcattttaaattgtcctacgcctgtgaataccttcatggattcttaactatagttatttgaccccatattaattataatattgcttagaatttaaaaattggagtattagatgtattattatgagataggtgtaggacatactgtatagttcttattttggatttgcatctctgaaatatgttgtaatccaaaattgttttggatgcatatcaattcccttttttactttccattcattgtcaggaattatttaattcattcttcatgccacttattataagtcaaatatgaaaattttaacctaataataacgactttatatttatttagaaaagtattctagaacaaaccttaagaaccataaagttaattagagtatctaaatattattaagactgtacaaatcgatggatcggaatacctatgtgcattgtaggtacgctgagtaggataccttcacatatgtggcgatcatggatggacttcttaggtacaaatgaacttgatgatctgtggacaaatatctgagcacctagatggttggcaagggctacaaaataatgttgaactttaaacctgcaaattggaaaatatgcaaaaaatatatttaaaattgactaacatttactatgtagaaatttaaatatccacatcattgaatgcgcaaaattttcattcaatttgctatgatctatgtaaaatataacgaaatgacttacaaaatttgtgaaagagaaatcaagactttcaatgtttcacatgctctatagtaaccgaagcaatacgtcccctccccaaaacaaaacattggtggataatatgtatcaaatatattagaactgtcatactacaccaagtgcattgtactaattcaaacctcttcaagtttgactaactttataaaaaatatagcaacattttcaacacgaaataaatatactatagaaatatatttaaggatagatttaatgatattaatttggtgttgtaggtgttagcatgttttctttaaaatcttggttagatgaaaaaagtttgacttaggacaaacgaaaaatgaagaaacgaagttttatatcttatacaatgtccgtgtacaacatgagcataaactttttttctaaccgtgtgttttgtgaactggtgtgcatcatatattatagcacgcaatacgcatgatttaactatattgtgtacttaggaaagacatttatcggcatctaattaatttttatataatttgactacatatttctaaatgtatttattttgcacaaaaatttaacaaataataacaatcaagttcagtgcaaacctgaaagcatgctatttccctttcttcagtcattcccatatcgagttgtggccggccattgcttttgcccatctgctttcttgggagatcgatatacactaagctgctatttccctttctttcttcagtcgttgatttgctccatggaattaatctgataccagcctttccttcttatctctgcaaattggtgtacaaactccctgcatccatcaaatcatgtgtactgaagatataatctctcgttaaatctcagttttgaatcaaattggcattgtcaaatacgtgagtttaatccctgttcttcgcggcatgcatcatatgcatgagtatgatttgatcaaatttgcttgatagcttgttaactgctacttatatctccgatgactctcggtccgttgcctagatacatgcatatacacacaatcacacggtttagctggattgctcaagctagatgggattcgactgatctttacctaaaaaagaaaacgtggcttctgcaatcgctgtcgccggccatcagactcgatccgttcacacgcatgctgttgcctttgccgatgggaatcgatgtcgtcattggattgctcgctgaagttccgtatgttctcggatgactacggcgtggtaggtagcgtcaatattgctgttgccacagccctaaaaatacaaacgctagattgatggtacggcgtggcaatcaattgattaattgtataactaactggtgcagccgtcagctatatgcaagctaggccaaggtgctaactacatcacctgagatcatgttagatattggttcgacatcaagatagattaggtggtggcctaaactacgattaataatccacggttgttatattaattaatctacggttatgatcttacaatccatcaaatcaacggttagatctttctgattaacgtgagagcttctaaaaagtgcccgattagtataggtatagatagatagatttcaccctattggatgtatcaggaggtaccacatttaccatttagtaactagcagctaataggaggtagcgaattctgcaacaaaaatattctggtactgtttgaaatgctgcaaattttatatagatgtaacaaataatgaaaattgtccaatttactcccctaatctacttcaatggatcacttaatcatctaaactattttttgcctcactttaatacaattgaaaatgtttcactttacttcttaataagattaatttatgttttggttcctctttatacaagatgtattttaatctgaaaagttataagctgcatatgaaaccattatcaaaagttaaaattattttcaaaatcttttcatgaatgtttgcgtgatctttaaaatctctgtgtttagttcagtattaggtggttccaacatatgtaaacagtgatagaaaagtataaaaaaaatgttaagacataagctgtactgcatctatttcggtatgtagagagaagagggaaaaaagagaaatatcgttacgaagtaaactgaactaatttcactcgttaggagtgtgaaatgagctgcagatagtttagggtgtttactactttcacgaaatagtccgagggagtaaacttgactttttcataaatataaacatcataaaaagaaaaaaaagttttataataaaataaaagtgtgatttatgttctctaggggaacaaaagttcgtgtatacatcagacatagtagtccttcgtgtcaaattatccccaatgtataattctattcaaatgctgaattttccagtgagaaagtcatgttactttccttcgatagcaaacacaatacccgcacaaggcacaacataacaatataagaaggcatgtgcaaaaggtctatcacaggtgtacacctacgaaaaaggcattcacacgcggccagctacatgcaaccatctgtggaaatagaggctttatagcagcgctatatcgactgcttgagacaagttgtttttgcatgtagctcgtgctttactgccatgtccattaaaatttattgttagactttcttccaatgaaaatttatcctttgttcaccttaattgggtttgtttgcagaatttgctattctagatttggcgcttgtagacaaaatttagattttgcaattctagtttccaaacctatatatatgtgcaacaatttctctcaagctatacagaccaacctgtgaattaagttaatcctgtaatctaagaagctctgaattaaaatgagtaaattctttatttgcccattgtagctgactatatggccattttcaagttttcttgcttattgtgtcgtaccatataaaagagtttccaaatacaatattaagtttgatattatgtgtatatagtaagtaaatcagtaatgatgcatcatacagttattatattcttaagaatttttaacactcttttcattattgcctttctactcccatccggttggaggacgctacacatgccagataaatgcatactagcagttacaatatttttttcataaattatttttgttggtatgcatcatgttaattatgaaaaaacaatattattatgacatttagtttctatttgaaatatggtgctgtgaatataaaacacatgttatgaggccatagaccattttctttttcatagctaaggtataagattcataattaactaatcaaggaattatctctcctggagatactgaatctttctctttgatgtacggagtctgtgaagcaaaactctgctttgattgagaataaatcacagcttgaaaatgcgaatgcagtagcaagttatgtacttttgatatgatgcgctatcacagcttaagactgagggttttttttttctcatattcatttattttgcccctcggtgtatagcagatcttccagtgctcattatattgttctaaaatatttgctttaatttatacagtggcttcatgatcatccccagttcttgctgaatccgctgtatattggaggtgactcatatagtggttatattgtacctacacttgcgctagcgattgatgaaagtaagcttcttgcattgtgaatggataatttccttagacatcctcacagtgttacacaacattaaatttgatcaccttgcagtttcggaatatatttcagtaaataataccatctctcatatgggtaatggtgatcaccatatatcaattactatcacaacaattactagtaagatttttcttttgttactaactaaatactattgttttggcaatcatctaaatgagagaaatccttatatgccactcaaaattagctcgttctcttatatgccactcaaaattagctctttccatctatgccattggttcgaatttatcctcttttttgccactaccatcactccatcgtctattcacaattaattccattgtagaaagatgcagttgcccttgaaagttgctatagaacaagttggttgtgaccgtgacgaagtttcagcgaggtcctgcttttttcctagtttggcaacttttgtttgatggatccagcattgttagagggcaatattggattttaggcagaagatgcacaaggaaacgaaaaagaggaattaaactatggacagataatggagtggtggtaacagcacaagagggtcgagaaatttaaaccagtggcatagatggaaagagctaatttcgaatggtatataagagaatgagccaatttcaagtgatatatatggaattctctccatctaaatattaggactgagatatataTtttttattcatgaattattaaaacaaatttgttgttcattttctgcgtggattaatattgtgtgtgtttccaactactaactacggaccatgtgtctatatttttcaggcaatgattcaggagataaaccaattttgaatctcatggtctgatcgatcttatcagataaatatcaatcatgaaattttatatttggaatcttaattacgtcaatagtctacataaattgcttgctaatgtgtagtaccaatgtggcctgcaattaacttttgccttccaccaatttctttaccttgtgtacatgacgcaggggtacgttgctggcaatccaaggaccgaacgccaatttgatgaaggtggtaaaattccatttctccatggcatgggacttatatccaatgaactttatgaggtaatccataatccagtaataacattatatgtttcctatagtacattcagcaaatatttgtaggcattaat
More
|
||||||||||
| CDS seq | atgggaaaggaagcaagcgcgatggttgcgaggagaagcaccagccgccgtgattggaggaggtggtggtggtggctgctgcctctcgcctgctgcttcgtttgttgggttgcctcgtcggcggcgacggtggcgccggcggccggtgtcgccgtgacgagccttcctggattcgacggcccactgccattctccctcgagaccggatacgtggaggtgaacgagagtacgggcgtgcgtctcttctactactttgtccagtcagagaaggatcctgatgtagacccacttttattgtggctatcaggtgggcctggctgttctagtctctctggcctaacccacgagataggaccattccaattcgccgcaaaacggtattacagtggaggattgccgaaaattatctatcaaccagagacttggactaaggtgagcaacataatttttgtggattctcccgtaggggcaggattctcatacgcggcaacacaggaaggctccaagactagcgataccaagacagtgaaacagcttgttattttcctcagaaagtggcttcatgatcatccccagttcttgctgaatccgctgtatattggaggtgactcatatagtggttatattgtacctacacttgcgctagcgattgatgaaagcaatgattcaggagataaaccaattttgaatctcatggggtacgttgctggcaatccaaggaccgaacgccaatttgatgaaggtggtaaaattccatttctccatggcatgggacttatatccaatgaactttatgaggtaatccataatccagtaataacattatatgtttcctatagtacattcagcaaatatttgtag
More
|
||||||||||
| Protein seq | MGKEASAMVARRSTSRRDWRRWWWWLLPLACCFVCWVASSAATVAPAAGVAVTSLPGFDGPLPFSLETGYVEVNESTGVRLFYYFVQSEKDPDVDPLLLWLSGGPGCSSLSGLTHEIGPFQFAAKRYYSGGLPKIIYQPETWTKVSNIIFVDSPVGAGFSYAATQEGSKTSDTKTVKQLVIFLRKWLHDHPQFLLNPLYIGGDSYSGYIVPTLALAIDESNDSGDKPILNLMGYVAGNPRTERQFDEGGKIPFLHGMGLISNELYEVIHNPVITLYVSYSTFSKYL |
||||||||||
| Function | Serine carboxypeptidase-like 19 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8VZU3] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsCMeo_11g0013260 | OsCMeo_11g0013260.01 | Chr11 | 15171912 | 15187490 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgggaaaggaagcaagcgcgatggttgcgaggagaagcaccagccgccgtgattggaggaggtggtggtggtggctgctgcctctcgcctgctgcttcgtttgttgggttgcctcgtcggcggcgacggtggcgccggcggccggtgtcgccgtgacgagccttcctggattcgacggcccactgccattctccctcgagaccggatacgtggaggtgaacgagagtacgggcgtgcgtctcttctactactttgtccagtcagagaaggatcctgatgtagacccacttttattgtggctatcaggtgggcctggctgttctagtctctctggcctaacccacgagataggaccattccaattcgccgcaaaacggtattacagtggaggattgccgaaaattatctatcaaccagagacttggactaaggtgagcaacataatttttgtggattctcccgtaggggcaggattctcatacgcggcaacacaggaaggctccaagactagcgataccaagacagtgaaacagcttgttattttcctcagaaagtggcttcatgatcatccccagttcttgctgaatccgctgtatattggaggtgactcatatagtggttatattgtacctacacttgcgctagcgattgatgaaagcaatgattcaggagataaaccaattttgaatctcatggggtacgttgctggcaatccaaggaccgaacgccaatttgatgaaggtggtaaaattccatttctccatggcatgggacttatatccaatgaactttatgaggtaatccataatccagtaataacattatatgtttcctatagtacattcagcaaatatttgtag
More
|
|||||||
| Protein seq | MGKEASAMVARRSTSRRDWRRWWWWLLPLACCFVCWVASSAATVAPAAGVAVTSLPGFDGPLPFSLETGYVEVNESTGVRLFYYFVQSEKDPDVDPLLLWLSGGPGCSSLSGLTHEIGPFQFAAKRYYSGGLPKIIYQPETWTKVSNIIFVDSPVGAGFSYAATQEGSKTSDTKTVKQLVIFLRKWLHDHPQFLLNPLYIGGDSYSGYIVPTLALAIDESNDSGDKPILNLMGYVAGNPRTERQFDEGGKIPFLHGMGLISNELYEVIHNPVITLYVSYSTFSKYL
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 0.0 | 14.813222 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0461000 | SBH | 1.093553 | 0.968793 | 4.674829 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g27329 | RBH | 0.855881 | 0.482030 | 1.190094 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0461000 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0013350 | SBH | 0.508802 | 0.0 | 14.436690 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0013290 | RBH | 0.0 | 0.0 | 1.414564 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0013220 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0013030 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0013280 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0242100 | RBH | 1.506474 | 0 | 0.18433 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0013290 | RBH | 0.101687 | 0.0 | 0.000000 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0257400 | RBH | 4.7071115 | 0 | 0.342257 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0013380 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0013470 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0013100 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0012870 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0013230 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G013090 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 2.597997 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0013220 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
