Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_07g0017730 OGI:07020720 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr07:20490247-20517218
Gene Symbol RLCK233, OsRLCK233
DNA seq

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Function Cysteine-rich receptor-like protein kinase 15 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8W4G6]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_07g0017730 OsCMeo_07g0017730.01 Chr07 20490247 20517218 + NAM
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atgctgatcgtttccctcctaatgcttctcctctctaccccgaatctgttggtagctaaacagcttcccttctgcagcaacgcgaacaccatcacacacatgccagagggcacctacaagaccaacctgctccagctcgccaaaaacctgatcaccaatgtcaaccagacgcagctgcactctgccaacggcacagccggggcggccggtcctgacacagtatacggcgccgtgctctgccggggggactcctccgccgagagctgcgctacccgcctccagagagtgcttgacacggccagcatcaatggaactagtggcgatgactctggctactttcagaaccagaagaatgtcaccttgtacgaccatgatttccaggccctgctaagcttctccgacaaggatttcatctccagcttcagcaacgcgccggagtgcactgtgagcgcttacctgaaccctccgccggatgctgatcgcgcgcagttcagccagcttttctctgagctcatggagaagatcgctgcagccgtggtgagtagacggccggtcaactacttgacgggcagggggtggttcgacctcaagagccagacggtgtatgcgctggcgcagtgcacggacggcatgccgccggagaattgccggagttgcctggacggcatcatcgacgaagggaagaagatggtcggcggtggcctgacgggtggcgcggtgctcgggatgcgatgcagcctgtggtaccagacggatgtcaagttcttcgccggcgacccagaggtgtcgctgcacatgcctacaccaagcaagttttggatctgggttgtaattggatcgttctccctcatgataaaagaagctacacaaaacttctcaagggaaaacaaacttgggcaaggtggttttggagctgtttataagggcttgttgccgggtggtcttgaagtagcagtcaaaagactttcagcatgttctgtacaaggtttattggagttcaaaaatgaaattcagctgatagcaaagcttcaacacaaaaatcttgtcaagttactcggctgttgtattgagggagagcatgaaaagatgctcgtctacgaatacttgcaaaacagaagcttggacgtcttcatatttgactttgtgaaaggagcacaattaacctggtcaaagcgtctacgcataattgatgggatagctcaagggattctatatcttcacaatcattcacgagtatgtgttgttcatagggatttaaaagcaagcaatattctcttggacagtgacatgactccaaaaatttcggattttgggatggccagaatatttggttcaaatatgattgaatcaaacaccaccagaatagtaggcacacatggttacatatctcccgaatatgctttcgatggggtttgctcgatcaagtcagacgtcttcagtttcggcgtcttggtcttggaaatcataagtggaaagaggactgctggtttctatccctatgatggcaaactttgcaatctcatttcatacgcttggcaactctggagatctggacaggggcatgagctggtctgttgccgtataggaaacaaccataaagtgatacaaaggtgcattcaggtggcactattatgtgttcaagagagggcagatgataggccttctatcgatcaggtggtcacgatgctaaacagcgaggaaatgacattgcccaaaccaaaccaaccagcttacttctatgtccgatccagtggctcagatgattcatcatgcaataacagtataagtatcacattggcaagacaaactgtaagacagtggacagtaatcagcataaacatggacggtagagcatttcagcccccgggtccccggtgcacgcccgtactcggagagcgacggccggcctccctcgccgacggcgacgttggacgacgggtggcggcgcggccacgattcgccgcgcaggggaggagaggattcgccgcgtggcggctaggtcgcgctcgcgccgcccttgggagtggttgggctgggccgcgccgccgtgtgctctggtgggccaatttcagaacgaggaggattttggatggcaacatgagcatggcatcagctggaggtgcagctcgtcttaatcctgatgcccccctataa

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Protein seq

MLIVSLLMLLLSTPNLLVAKQLPFCSNANTITHMPEGTYKTNLLQLAKNLITNVNQTQLHSANGTAGAAGPDTVYGAVLCRGDSSAESCATRLQRVLDTASINGTSGDDSGYFQNQKNVTLYDHDFQALLSFSDKDFISSFSNAPECTVSAYLNPPPDADRAQFSQLFSELMEKIAAAVVSRRPVNYLTGRGWFDLKSQTVYALAQCTDGMPPENCRSCLDGIIDEGKKMVGGGLTGGAVLGMRCSLWYQTDVKFFAGDPEVSLHMPTPSKFWIWVVIGSFSLMIKEATQNFSRENKLGQGGFGAVYKGLLPGGLEVAVKRLSACSVQGLLEFKNEIQLIAKLQHKNLVKLLGCCIEGEHEKMLVYEYLQNRSLDVFIFDFVKGAQLTWSKRLRIIDGIAQGILYLHNHSRVCVVHRDLKASNILLDSDMTPKISDFGMARIFGSNMIESNTTRIVGTHGYISPEYAFDGVCSIKSDVFSFGVLVLEIISGKRTAGFYPYDGKLCNLISYAWQLWRSGQGHELVCCRIGNNHKVIQRCIQVALLCVQERADDRPSIDQVVTMLNSEEMTLPKPNQPAYFYVRSSGSDDSSCNNSISITLARQTVRQWTVISINMDGRAFQPPGPRCTPVLGERRPASLADGDVGRRVAARPRFAAQGRRGFAAWRLGRARAALGSGWAGPRRRVLWWANFRTRRILDGNMSMASAGGAARLNPDAPL

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_07g0017730 OsCMeo_07g0017730.03 Chr07 20505835 20509645 + IsoSeq
CDS seq

atgtcaaccagacgcagctgcactctgccaacggcacagccggggcggccggtcctgacacagtatacggcgccgtgctctgccggggggactcctccgccgagagctgcgctacccgcctccagagagtgcttgacacggccagcatcaatggaactagtggcgatgactctggctactttcagaaccagaagaatgtcaccttgtacgaccatgatttccaggccc

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Protein seq

MSTRRSCTLPTAQPGRPVLTQYTAPCSAGGTPPPRAALPASRECLTRPASMELVAMTLATFRTRRMSPCTTMISRP

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
SE Chr07 20506694 20507487 + OsCMeo_07g0017730.03 OsCMeo_07g0017730.03,OsCMeo_07g0017730.01 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.491561 0.368260 1.156908

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_07g0534500 RBH 0.100122 0.120605 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os07g34980 RBH 0.082129 0.085179 0.062274
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os07g0534300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_07g0017860 SBH 0.142134 0.000000 1.056033
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_07g0017740 RBH 0.102085 0.522861 1.282435
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_07g0017750 RBH 1.472558 6.916603 0.532785
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_07g0017650 RBH 0.106772 0.028095 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_07g0017760 RBH 0.412422 3.766631 2.356876
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_07G0341800 RBH 0.079884 0.365327 0.2162935
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_07g0018260 RBH 0.217382 0.298519 0.167195
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_07G0356400 RBH 2.6708465 8.169351 4.3288805
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_07g0008050 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_07g0017680 RBH 0.099510 2.096761 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_07g0008050 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_07g0017880 RBH 0.418212 0.293664 1.245275
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_07g0008100 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_07G017640 RBH 0.433335 0.000000 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_07g0017510 RBH 0.587724 0.454863 0.385640
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