Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsCMeo_04g0006880 | OGI:04040990 | 5/16 | CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:11922485-11935830 | ||||||||
| Gene Symbol | PI63, Pi63, Pikahei-1(t), RGA3, RGA1-NB, XA1, Xa1(Xe), Xe, Xa1, Xa-1, RGAf | ||||||||||
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| Protein seq | MEEIEGNLLESSIGWLADTIVENLDNDKFGAWISQVGLADDTEKLRSEVERVEVVVGAVKGRAIANKPLARSLGRLREVLYDADDAVDELEYYRLQHQLQGASSSGGKKRSKAWEDFDITEKENGKAVKARCIHCHTVVKCGSDKGTSVLHNHLKSDNCKKKREAIGPPPDPSSAGEGAPNAPGNSVGRKRMRMDGTSTLHEAVSTHPWNRGELSNMIQHMTHQLQEAVNGVMRLCGYASLNQRCESTPLAPNAITSSYPLEPKMYGRDAEMESIKNLIMGNKSNDITVLPIVGIGGIGKTTLSQHVYNDPEIGNQFEIKIWVHVSDKFDVVRITREILGCVSNRSYQGISNFNMLQQDLEKHMKSKKFLIVLDDVWDVTTEDCWNKLLGPLRPNHVNASEVTGNMIIVTTRILTVAQRCGTAGSINLEALEDGDIWSLFKAYAFSTDQHGSNQNLENLGRKTIKELKGNPLAAKTVGSLLRRNLTEDHWINIIENKEWQSLKHTDGIMHVLKFSYDYLPNQLQQSFSYCSLFPKGYSFSKAQLIKIWIAQGFVEKSSEKFEHKGWEYLTELVNSGFFQQAESWWSSSVVFVMHDLMHDLARLVSQTECATIDGSECRELAPSIRHLSIVTNSAYCKYQNGKLSRNEEFEKSLMKVMSRSKLRTLVLIGQYNHHFFKSFQDAFREAQHLRLLHITAAYADLDSFLSSLANTTHLRYLRFKNKESHGAFHLLLERVTHEALPHALSKCYHLQVLDIGSYGSPLIPDDINNLVSLRHLAQKGVCSSIASIGEMASLQKLTNFKVENSIGFEITQLQCMSEPVEPGVSRLENVTTQQEASGASLKSNHCLEGLHLFWKGVRNGYDSDGNRYDSGGSSENECDGNMISEPSMHSETEGERLQMSDSNGAPSLDHILDIASEELEGLEPHHNLKYLRISWYNGTKAPTWLSTSLTYLQTLRLENCAEWHTLSLEGLSLLRKLVLIEMKNASVLSIRSPQDIILIGMQNLHTCSCTSMVDFNSSLRILKIKRCPVLKVFPLFENCRNLGCSWLPHLSNLTIDDCPDFTVPHPFPPSTTVSEFFINGISTLPTMRSNEGIFYIRSNSFSDKLTAMDKTVLPYHNLSRFVTTLHISQCRNLRYISLEGLRQLIHLKRLKIDECQNLFSSDVPQEPTSTREDMVAGIGNRNDRPSLELVSITECGITGKWLSQILQHVQGVQELTLRNCLAVTRLSMGEEEKCQLELLLDLEASSSRHPSDASISSAEDGLLRIPLNLVSSLKKIHCSCSDKSRNFSLSSVHNGKNDDQASVHDYSLQTALPCFIGKPVRLKKLLVQNNASLECLQLQCCTALEELEIRECSQLTKIEVSQSLCNLRFLKVYKCPSLSPSFLWFPGRVDELFPRLERLEIDDPRILSTSFFKYLGSLKRLELEKHRRGEERLLDEQEKALQHLSSLQELKFACSEFIDFPAGLHRLPSLKRLEIWHCTRITRLPEEGLPPSLEELDINLCSKELTYQCRMLPSNLNHIITIVSQESINDISIFTVQQFAARRFLLELLQIDKSSTVSRHPSHQYAARSHHQVADLEKVNSHAPCHAAKWPTGKYETGDEKQRKLVKYPTSARACPMDLCAGESDYAARPWAFFSAFICGINSFEVP |
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| Function | Putative disease resistance RPP13-like protein 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LRR4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsCMeo_04g0006880 | OsCMeo_04g0006880.01 | Chr04 | 11922485 | 11935830 | - | NAM | ||
| CDS seq | atggaggagatagaaggtaatttgctggagtcctcgattggatggctggcggataccatagtggagaacctggacaacgacaagtttggcgcgtggattagccaggtcgggctcgccgatgacaccgaaaagctccggtctgaggtcgagagggtggaggtggtggtcggtgctgtcaaggggagggcgatcgcgaacaaaccgctggcccgatcactcggtcgtctaagggaggtgctgtacgacgccgacgacgcggtcgacgagctcgaatactacaggctccagcatcagctccaaggagcgagtagcagtggtggcaaaaaacgatccaaggcttgggaggacttcgatatcacggaaaaggaaaacggaaaggcggtgaaggccagatgtatccactgtcacacggtggtcaagtgcggttccgacaaagggacgtcagttttacacaaccatctgaagagtgacaattgtaagaagaaacgtgaagcaattggtccgccaccagacccttccagtgccggtgagggtgcaccaaatgcacctggtaattcagttggcagaaaaaggatgaggatggatggcacttcaacactccacgaggcagttagcacgcatccttggaacaggggtgaactctccaacatgatccaacatatgactcatcagttacaagaggctgtaaatggggttatgaggctatgtgggtatgcaagtttaaatcagaggtgtgagagtacacccctggccccaaatgcaataacatcatcttatcctcttgagcccaaaatgtatgggagagatgcagagatggaatccatcaaaaatctaatcatgggaaataaatccaatgacataaccgtcctaccaattgtaggcataggagggatagggaaaaccactctgtcccaacatgtttataatgatccggaaatcggaaatcagtttgagatcaagatatgggtccatgtatctgataaatttgatgtggttaggatcacaagggagattttagggtgtgtctccaaccgaagttaccaaggaataagcaactttaacatgcttcagcaggatcttgagaaacacatgaaatctaagaagtttctgattgttttggatgatgtctgggatgtcactacagaagactgttggaacaaactactgggtcctttaagacctaatcatgtgaatgcatcagaagtgacaggtaatatgatcattgtgacaactcgaatactgactgtcgctcaaaggtgtggaacggcaggatcaataaatttagaagctctggaagatggtgatatatggtcactatttaaagcatatgcatttagtactgatcaacatggtagtaatcaaaatttagagaatcttgggaggaaaacaattaaggagctaaaaggcaaccccttggcagcaaaaactgtgggctccctactacgaagaaatcttactgaagaccattggatcaacattatagagaacaaagaatggcaatccctgaaacatactgatggcatcatgcatgtgctgaagttcagttatgattatctacctaaccagctacagcaatctttctcttattgttctcttttccccaagggttactctttcagtaaagcacaactgataaaaatatggattgctcaaggatttgtggaaaaatccagtgagaagttcgagcacaaaggatgggaatatctaactgagttggtgaactcgggtttctttcagcaagctgaaagttggtggtcttcatcagtagtttttgttatgcatgatcttatgcatgatttagcacgactggtttcacaaacagaatgtgcaactatagatggatcagagtgcagagagttagcaccgagtatacgtcatttgtcgatagtaactaattctgcatactgcaagtatcaaaatggaaaattatctcgtaatgaggaatttgagaaaagtttgatgaaagttatgtcaaggagtaagttgaggacattggtactaattgggcaatataaccatcatttttttaaatccttccaagatgctttcagggaggctcagcatttgcgactgctgcatatcactgcagcttatgctgatcttgattccttcctttccagtttggcgaacactacccatctcaggtatctaagatttaagaacaaagagtcccatggagcttttcatcttctcttagaaagagtgacccacgaagctttgccccatgctctgagcaagtgctaccatcttcaagtactagatattggttcatatggaagtccccttatacctgatgacataaataatcttgtcagcctgcggcatcttgcccaaaagggagtgtgttcttccattgctagcataggagaaatggcctcacttcagaagctaacaaatttcaaggttgagaattctattggctttgagataacacaacttcaatgcatgagcgagcccgtagaaccgggtgtgtctcgacttgaaaacgttacaactcagcaagaggccagtggagcaagcctgaaaagcaaccattgcttggagggactacatttgttctggaagggtgtacggaatggatatgacagtgacgggaatagatacgacagtggtgggagctctgaaaatgaatgcgatggtaacatgatatccgaaccttctatgcactcagaaacagaaggggagagattgcaaatgagtgatagcaatggtgcccctagtttagatcatattctagacatagcaagtgaggagcttgaaggtcttgaaccccatcacaacctcaagtatctacggatatcttggtacaatggaactaaagccccaacttggctttccacttcacttacctatctgcaaacacttcgtctagaaaattgtgcagaatggcatacactttctttagaagggctatcattgcttagaaagcttgtgttgatcgagatgaagaatgcatcggtgctctcaatccgttcaccgcaggatattattttaattggaatgcaaaacttgcatacgtgctcttgcacttccatggtggacttcaactccagtttaaggatcctgaagattaaaaggtgcccggttctgaaggtctttccgttgtttgagaactgccgtaacttggggtgctcatggttgccccacctcagcaacctcaccatcgatgattgtcctgatttcactgtgcctcatccttttcccccttcaactactgtttcagagttcttcatcaatggaatttcaacacttccaacgatgaggtcaaacgaaggaatattttatattaggagtaactcattttctgataagctgacagcgatggataaaacagtgttgccctaccacaaccttagtaggtttgtaactactttgcatatatcacaatgccgaaatctgagatatatttcgttggaaggactcaggcaactgatccatttgaagaggctgaagatagacgagtgtcaaaatcttttctcttcagatgttccgcaagagcctacttctacccgtgaagacatggtagctggaattggaaatcgcaatgaccgcccatctcttgaacttgtcagtattacagaatgtggaataacggggaagtggctatctcagatactgcaacatgtgcagggcgtacaggaattgacattaagaaattgcctggcggtaacgagactatcgatgggagaggaggaaaagtgtcaactagagcttttgttagatcttgaggcttcctcgtcaagacatccaagtgacgcttcgataagctcagctgaagacggactcctgcgaattccgttaaatctcgtctcctctctgaagaagattcattgcagttgttcagacaaatctcgcaatttcagcttgtcttctgtgcataacggcaaaaatgatgaccaggcgagcgtacatgattattccctacaaacggcgctaccctgttttatagggaagcccgtccgcctcaaaaaattactagtgcagaacaacgcaagtttggaatgtctgcagttgcaatgctgcacggcacttgaagagttggagattcgagaatgttcacagctcaccaaaatagaggtctcgcaatccctctgcaatctcaggtttttgaaagtatacaaatgccccagcttgtccccatcttttctttggtttccagggcgggttgatgagttattccctcgattggaaagactagagatcgatgatcccagaatcctttctacatcgttcttcaagtaccttggctccctcaaacgcctagagcttgaaaaacacagacgcggagaggagagactattggatgagcaagagaaagcgcttcagcacctctcgtccctgcaagagctcaaatttgcgtgcagcgaattcatagattttcctgccggattacaccgccttccctcactcaagaggttggagatttggcattgtactcgcatcacaaggttgccagaagagggcctcccaccatctctggaagaactcgatatcaatttatgcagcaaagagctaacttaccaatgcagaatgctaccaagcaatctgaaccacatcatcactattgttagccaagaaagcatcaatgacatcagcattttcaccgttcaacaatttgcagcccgtcgattcttgttggagttgttgcagatcgataaatcttccactgtgtctcgacatccatctcatcaatatgcagctcgatctcaccaccaagtggcggacctagagaaagtaaattcgcatgcgccgtgccacgccgccaaatggccaacaggaaagtacgagactggagatgagaaacagagaaaactagtgaagtaccctacaagcgcacgtgcatgcccgatggatttgtgtgctggtgagtcagactatgccgctaggccttgggcttttttttctgcatttatatgtggaataaattcatttgaggtcccttaa
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| Protein seq | MEEIEGNLLESSIGWLADTIVENLDNDKFGAWISQVGLADDTEKLRSEVERVEVVVGAVKGRAIANKPLARSLGRLREVLYDADDAVDELEYYRLQHQLQGASSSGGKKRSKAWEDFDITEKENGKAVKARCIHCHTVVKCGSDKGTSVLHNHLKSDNCKKKREAIGPPPDPSSAGEGAPNAPGNSVGRKRMRMDGTSTLHEAVSTHPWNRGELSNMIQHMTHQLQEAVNGVMRLCGYASLNQRCESTPLAPNAITSSYPLEPKMYGRDAEMESIKNLIMGNKSNDITVLPIVGIGGIGKTTLSQHVYNDPEIGNQFEIKIWVHVSDKFDVVRITREILGCVSNRSYQGISNFNMLQQDLEKHMKSKKFLIVLDDVWDVTTEDCWNKLLGPLRPNHVNASEVTGNMIIVTTRILTVAQRCGTAGSINLEALEDGDIWSLFKAYAFSTDQHGSNQNLENLGRKTIKELKGNPLAAKTVGSLLRRNLTEDHWINIIENKEWQSLKHTDGIMHVLKFSYDYLPNQLQQSFSYCSLFPKGYSFSKAQLIKIWIAQGFVEKSSEKFEHKGWEYLTELVNSGFFQQAESWWSSSVVFVMHDLMHDLARLVSQTECATIDGSECRELAPSIRHLSIVTNSAYCKYQNGKLSRNEEFEKSLMKVMSRSKLRTLVLIGQYNHHFFKSFQDAFREAQHLRLLHITAAYADLDSFLSSLANTTHLRYLRFKNKESHGAFHLLLERVTHEALPHALSKCYHLQVLDIGSYGSPLIPDDINNLVSLRHLAQKGVCSSIASIGEMASLQKLTNFKVENSIGFEITQLQCMSEPVEPGVSRLENVTTQQEASGASLKSNHCLEGLHLFWKGVRNGYDSDGNRYDSGGSSENECDGNMISEPSMHSETEGERLQMSDSNGAPSLDHILDIASEELEGLEPHHNLKYLRISWYNGTKAPTWLSTSLTYLQTLRLENCAEWHTLSLEGLSLLRKLVLIEMKNASVLSIRSPQDIILIGMQNLHTCSCTSMVDFNSSLRILKIKRCPVLKVFPLFENCRNLGCSWLPHLSNLTIDDCPDFTVPHPFPPSTTVSEFFINGISTLPTMRSNEGIFYIRSNSFSDKLTAMDKTVLPYHNLSRFVTTLHISQCRNLRYISLEGLRQLIHLKRLKIDECQNLFSSDVPQEPTSTREDMVAGIGNRNDRPSLELVSITECGITGKWLSQILQHVQGVQELTLRNCLAVTRLSMGEEEKCQLELLLDLEASSSRHPSDASISSAEDGLLRIPLNLVSSLKKIHCSCSDKSRNFSLSSVHNGKNDDQASVHDYSLQTALPCFIGKPVRLKKLLVQNNASLECLQLQCCTALEELEIRECSQLTKIEVSQSLCNLRFLKVYKCPSLSPSFLWFPGRVDELFPRLERLEIDDPRILSTSFFKYLGSLKRLELEKHRRGEERLLDEQEKALQHLSSLQELKFACSEFIDFPAGLHRLPSLKRLEIWHCTRITRLPEEGLPPSLEELDINLCSKELTYQCRMLPSNLNHIITIVSQESINDISIFTVQQFAARRFLLELLQIDKSSTVSRHPSHQYAARSHHQVADLEKVNSHAPCHAAKWPTGKYETGDEKQRKLVKYPTSARACPMDLCAGESDYAARPWAFFSAFICGINSFEVP
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0620950 | SBH | 0.579718 | 0.477920 | 1.161857 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g22090 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0620950 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0006470 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0007080 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0006500 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0027430 | SBH | 0.803315 | 0.589062 | 0.756611 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | NA | NA | NA | NA | NA |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0207700 | SBH | 1.133257 | 5.3772125 | 8.63377 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0007410 | SBH | 0.0 | 0.144886 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0003850 | SBH | 0.082051 | 1.345492 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0007730 | SBH | 0.0 | 3.601985 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0007660 | SBH | 0.0 | 1.220624 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0027240 | SBH | 0.0 | 0.769665 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G003880 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
