Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsAzu_10g0004500 | OGI:10018660 | 16/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr10:5948642-5955587 | ||||||||
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| Function | Wall-associated receptor kinase 5 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMN7] | ||||||||||
Transcripts
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| OsAzu_10g0004500 | OsAzu_10g0004500.02 | Chr10 | 5948840 | 5955587 | - | NAM | ||
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| Protein seq | MGHLNTMLPLLSFVLLGIAQVKRSFALSPVLSYGHLITPYPEGMTRRLEKRFLLDHGTNPSPSNASLPSTSTLARCPKRCGKLSFDYPFGIGQGCFRHVDFSLTCDMATQPPKLFLNNGSTEVLGDIGVDGLNIYFIHFNLIPITSTHVIPINSGGDVYNFSWKNPGDSFTFARQGMTFVVTSCDLDVYMVDQEKSTPILLGTIACPSKEIAEMVYRQDSEGPGWYTIDSLPARTVQLQFVRHKTGNTQKYFNLTMLWDRINITVKANLAWNIVDQTRCLNNMEDDRKNHACISNHSSCVSSQYIDVGYACRCNDGYVGNPYIMDGCKLDDGYNPRPQKHNCSRQCGTIVVPFPFGLEEGCAAREVFQLSCLGKPNSVLQYNDFIGVQYINVSEGLVGIKYNSSFVEILFNMFSQFRFSSQGVVSNIFGKGPNLYVDPTESASVQWAVANLTCQQAQQNTSTYACVSTNSSCSRVISTMQGYVGYRCTCLPGYDGNPYIPDGCKGIIIGLTIGFGVLILSSIVIAIIRRWKRDVHKKIRRKYFQKNQGLLLEQLISSDESASEKTKIFSIEELKRATNNFDSTRILGHGGHGTIYKGILSNQHVVAIKKAKVIKEGEINDFINEVAILSLINHRNIVKLFGCCLETEVPLLVYDFIPNGSLFELLHHDSSSTFPLSWGDRLRIAAEAAGALCYLHSAASISIFHRDVKSSNILLDANYTAKVSDFGASRSVPVDQSHVVTNVEGTFGYLDPEYYQTGQLNEKSDVYSFGVVLLELLLRMQPIFTTMSGMKQNLCTYFLSEIKTRPIIDLVDPPVLDKANEEDIRQVASLAEMCIKLKGEERPTMRQVEITLQLLRTEKMTPSHVSPDRNQEIESLLTQGAIDQVIHALVNVDRANVASQRSQTSCYSLEKEFLSSASLPR
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| SE | Chr10 | 5950089 | 5950539 | - | OsAzu_10g0004500.02 | OsAzu_10g0004500.02,OsAzu_10g0004500.01 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_10g0178800 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os10g10030 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os10g0178800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_10g0004440 | RBH | 0.0 | 0.672909 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_10g0004380 | RBH | 0.0 | 0.696360 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_10g0004750 | RBH | 0.0 | 0.018485 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_10g0004470 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_10G0093100 | RBH | 0.0043835 | 0.283388 | 0.045518 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_10g0004640 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_10G0103800 | RBH | 0 | 0.106557 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_10g0004510 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_10g0004520 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_10g0004620 | RBH | 0.0 | 1.977530 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_10g0004390 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_10g0004700 | RBH | 0.0 | 0.868569 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_10G004610 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_10g0004630 | RBH | 0.0 | 2.477620 | 0.0 |
