Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsARC_09g0006860 | OGI:09032520 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr09:11835180-11841599 | ||||||||
Gene Symbol | RLCK263, OsRLCK263 | ||||||||||
DNA seq | 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||||||||||
Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g51810 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FZB8] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsARC_09g0006860 | OsARC_09g0006860.01 | Chr09 | 11835180 | 11841599 | + | NAM | ||
CDS seq | ATGGCGCCGTTGCTCTTTGCTGTTTTGGTGTTAGCCACAGCGCTTCATGGCGTCGTCGGCCAAGAAGCCGGCTTTCTAAGCATCGACTGCGGCCTGGAGATCAGCACCAGCAGCTACAAGGCCGATGACACCGGCATCATCTACGTCTCCGACGGCTCGTACGTTGACACCGGCGAGAACCGCCGGATATCGGATGAGGAAGAGGGCTGGCAGCGTCGTTACACGACGCTCAGGAGCTTCCCCTCCGGCGTCAGGAACTGCTACGCGCTGCCGACCGTTGCTGGGGCCAAGTACCTTGTTCGCGTGGTGTCCGTCTACGGCAACTATGACGGCAAGAACAGCTCGTCGGCGGTGCAGTTCGACATGCACCTTGGGGCGAACCACTGGGTCACCGTGAATAACCCGACGGGGGCGTTCAATGAGGCGATGTTCGTGGCGTGGGCGAGCTGGGCGCCGGTGTGCCTCGTCAACACCGGCAGCGGCACGCCGTTCGTCAACACGGTGGAGCTGAGGATGCTCAGTAGCGAGCTCTACCCAACAAACCTTACCACTGCCTCGACCATCAAGGAGAGTTCTGACTATGCTGTGCCCTTGCCCATTATAGAGACTGCCATCGAGGTGATCAGTAACAAAACAGCCATTGAGCAAGCCTCCGTCGGGACAGTAAGCAACGACGCAAAGCTCATCATTACAAGGCAATACAGAGCACCCATGGAGTACAAGGTGTTCATGCACTTTGCAGACTTTCAGAACACCGAGCAACGGCAGTTCAACGTCTCCATCAACGAGCAGGAGTCCTTCCTAGTTAGGCCATCGTACCTGGTCGCCAATACCCTGCACATTTTGTGCAAGGCGAACGGCGGTGTGTGCACCATGACTCTTACGGCTAACTCTGACTCCATGTTGGGGCCGATGCTCAACGCGTTTGAGGTTTACACTATCATCTCTCGTGACAATCCAACGACATTCCCTAGAGACTTCGACACCATCATGGCAATTAAAATTGAGTATGGAATAATAAAGAACTGGATGGGTGATCCATGTTTTCCAGCACAATTTGCTTGGGATGGCGTGAAATGTAGCAATGTGAGTGGTAACAACACTGCGAGGATAATATCTTTGGATCTCTCCCACAGCAACTTGCAGGGGAAGATATCTAGTAACTTTACACTGCTCACGGCACTTGAGTATTTTTATGATTCTGACGGAGATATGTGCCAGAAAATTGTCAATCCATCTCAAGCAAGAAACAAATCAAAACGAGCAGTTATCTTAACTATTGTTGTGGTACTGGTTCCTATCATGGCAATTGCTGCTCTTATTCTTGTGTATTTGATCTGGAGACAAAAAAGAAAACCCAACAATGATCCTCCTAGAGAGATAAAACAAGAGAATGCTTCAACGAGTAGAAATGATGATCAGGACGTCCTTAAAAAAGTTGAGAATCGCCCATTCACATATAACGAGCTTGAGAAGCTAACTAATAATTTTGAACAATTCATTGGACAAGGAGGTTTCGGACCTGTCTACTATGGTTGCTTAGAAGATGGTACCGAGGTTGCTGTCAAGATGCATTCAGATTCATCGTCTCATGGGCTTGCTGAATTTTTCGCCGAGGTTAAAAGTTTGACAAAGGTGCGTCACAGGAATCTAGTTTGTTTGGTTGGTTACTGTTGCGAGAAGGATCATTTAGCACTTGTTTATGAGTACATGGCTCAAGGCAGTCTTTACGATCATCTCAGAGGTAATAATGGTGTTAGTGAAGACTTAAATTGGAGAACACGTGTTCGAGTAGCGGTCGAAGCTGCACAAGGTTGCAATCTGCCAATAATTCATAGGGATGTCAAGACCAGTAACATCTTCCTGGTTGCTGATGCACGACTCAGAGGTGCTTACGAGGTCAGTTCAATGTGGAAGGTTGTGGACACTGCATTGTTGTGTACCACTGATATTGGTGCTCAACGTCCAACGATGGCTACTGTGGTTGTGCTACTGAAGGAGAGCCTCGCGTTGGAGGACACTCGTGCAGATAGTGCCTTCAGTTGA
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Protein seq | MAPLLFAVLVLATALHGVVGQEAGFLSIDCGLEISTSSYKADDTGIIYVSDGSYVDTGENRRISDEEEGWQRRYTTLRSFPSGVRNCYALPTVAGAKYLVRVVSVYGNYDGKNSSSAVQFDMHLGANHWVTVNNPTGAFNEAMFVAWASWAPVCLVNTGSGTPFVNTVELRMLSSELYPTNLTTASTIKESSDYAVPLPIIETAIEVISNKTAIEQASVGTVSNDAKLIITRQYRAPMEYKVFMHFADFQNTEQRQFNVSINEQESFLVRPSYLVANTLHILCKANGGVCTMTLTANSDSMLGPMLNAFEVYTIISRDNPTTFPRDFDTIMAIKIEYGIIKNWMGDPCFPAQFAWDGVKCSNVSGNNTARIISLDLSHSNLQGKISSNFTLLTALEYFYDSDGDMCQKIVNPSQARNKSKRAVILTIVVVLVPIMAIAALILVYLIWRQKRKPNNDPPREIKQENASTSRNDDQDVLKKVENRPFTYNELEKLTNNFEQFIGQGGFGPVYYGCLEDGTEVAVKMHSDSSSHGLAEFFAEVKSLTKVRHRNLVCLVGYCCEKDHLALVYEYMAQGSLYDHLRGNNGVSEDLNWRTRVRVAVEAAQGCNLPIIHRDVKTSNIFLVADARLRGAYEVSSMWKVVDTALLCTTDIGAQRPTMATVVVLLKESLALEDTRADSAFS
More
|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.0 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0358100 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g17880 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0358100 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0006780 | SBH | 0.0 | 2.636994 | 0.000000 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0006790 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0006990 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0006890 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0006950 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0191000 | SBH | 0 | 0 | 0 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_09g0006990 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0167200 | RBH | 0 | 0 | 0.01962 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0006890 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0006720 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0006710 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0006600 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0006670 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G007200 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0007080 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |