Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_09g0005910 OGI:09029200 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr09:10687517-10700710
Gene Symbol -
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Function Putative disease resistance protein RGA1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA42]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_09g0005910 OsARC_09g0005910.01 Chr09 10687517 10700710 + NAM
CDS seq

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.103949 0.172123 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_09g0328066 RBH 0.489638 0.000000 1.877579
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os09g15850 RBH 0.797892 0.201996 0.559283
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os09g0328066 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_09g0005820 RBH 0.258353 6.941268 0.191661
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_09g0005890 SBH 0.163359 1.195246 0.684426
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_09g0006030 RBH 1.090265 5.044453 2.085904
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_09g0006090 RBH 3.981910 5.575424 5.239952
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_09G0172400 SBH 2.3586895 15.660743 0.492101
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_09g0006250 RBH 0.425158 0.228033 0.524411
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_09G0149300 RBH 3.2189195 6.4806275 6.141966
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_09g0006030 SBH 0.509214 0.157011 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_09g0005910 RBH 0.464224 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_09g0005880 RBH 4.269138 11.507568 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_09g0005760 RBH 0.442855 0.0 0.526122
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_09g0005850 RBH 0.251985 6.508630 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_09G006160 SBH 1.063518 0.790360 0.459857
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_09g0006050 SBH 1.074023 17.879021 1.658418
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