Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_08g0021140 OGI:08071300 | 12/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr08:25756447-25769587
Gene Symbol RLCK254, OsRLCK254, WAK75, OsWAK75, WAK76, OsWAK76
DNA seq

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Protein seq

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Function Wall-associated receptor kinase 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMN8]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_08g0021140 OsARC_08g0021140.01 Chr08 25756447 25769587 + NAM
CDS seq

ATGCATGTTTTTGCCATAGCCACACTGCACTTGCTGCAGTTTCTAGCAGCAATACCCCTGATACTTTCATATAACATAGCATTGCCTGGTTGCACTGACACATGCGGAAACACAACCATACCTTACCCATTCGGTATTGGCGACGAACGGTGCTTCCGCGAGGGCTTCAAACTAGTGTGCGACCCAGCTTATGATCCCCCCAAGCTCTTCATGAACGGCCCTGGATATGAAGTTCACAAGATAAAGCTGGCACGTAGAGTTCTGCACCTTGATACCGGCATCACCCAAATGTTGGGGGGAGACAGCTACAACCAGAAATGGATCCTCGACTTGGATGACAAACTCTTCCGGGTATCGGCAGACATGAATGTTTTCATCACCCTGGGTTGTGGTTTCCACTTCTTCATAGGTAGTTCTCCTGCAGCAGCAGGAGACAATGCTACTAGCAGCAGCAACTGCGTTTCGAATTGCCGCCCAGGTTACCCCATACTGGCAACGGATGGCACATGCTATGGCATTGGCTGCTGCAACGCATCGGTGGTTGAAGACCACAACTCCTACACGATCAAGCTTCTCTCCCTGCAGTCTAGTCCAAGGGCGGTGCCGTTCAACGCGAGCATGGTGGTGGTGAAGGGGGAGTGGTGGAGGAGGGCAGACAATGCCATGCTGCTGCAGCAAGAGGTCCTGTCAAGGCTGGGTGCCATCGCTGGGGCGCCGGATGCTGCAAGGAATGTGGGTGTCCGGACTGTGGTTAACTGGATGCTGGGTAACTCATCGTGCGTGGAAGCTAAGAAGTTGAGTGATTTTGGGTGTCTCAGTGACAACAATATTAATGAATGCATGCTGCCAAATCCACCCCTATGCTTTGGGAAATGCATAAATACAGTAGGATCATATGAGTGTATCTGTCCAGGTGGCACATCTGGTAACGCCCATATACAAAATGGATGTGTTTCAAGCAAACTTAAATTTTCAGGACTCATCATTGGAATAGGACTTGGTGGCAGTCTAATCATCGTGGTACTAATTCTTACTGGAATTGTCGTAAGGCGAAAGTTCAAGTCTCGAAGGGCCAAAAAACTGAAGGAATTCTTCTTCAAGCAAAACCGAGGATTGTTGCTTCATCAACTTGTAGACAAGGATATCGCTGAAAGGATGATCTTCAGCTTAGAAGAGCTTGAGAAGGCGACAAACAATTTTGACGAGTCTCGAAAGCTTGGTGGTGGTGGCCATGGAACCGTCTATAAAGGGATTTTGTCTGACCAACGTGTTGTTGCTATCAAGAAGTCAAGATATGCTATTAAGAGAGAAATTGATGGATTTATTAACGAGGTTGCCATACTTTCCCAAGTAAATCACAGGAATGTAGTGAAGCTTTTTGGATGTTGTCTTGAGACAGAAGTTCCATTGTTAGTCTATGAGTTCATTCCAAATGGAACACTTCATGAATATCTTCATGTCAACTCTGCACAATCAGTCCCATGGAAGGAACGGCTGAGGATAGCACTTGAAATAGCTAGGTCTCTTGCTTATCTACATTCAGCTGCTTCGGTATCAATCATCCACAGAGATATCAAGACCACCAACATTCTACTTGATGATAGGTTCATAGCAAAAGTATCCGACTTCGGAGCTTCTCGAGGTATCCCAATTGATCAAAATATTGTAACTACTACTATCCAGGGAACTTTTGGATACTTAGATCCAGAGTACTACCGTAAAAGCCGACTTACGGAGAAAAGTGATGTATACAGCTTTGGTGTCATACTTGCGGAGCTAATAACACGAAGAAGGCCAACTTCCTACATATCACCAGAAGGCTTCAATCTAACCGAACAATTTATCTTGCTAGTTAGTGAGGACAGGCTCTTGGAAATAGTAGACAGTCAAATCACTAAGGAGCAGGGAGAAGAAGAAGCCAGAGAAGTGGCAGAAATTGCTGTTATGTGCTTAAACTTAAAGGGTGAAGACAGGCCGACAATGCGGCAGGTTGAGGTGAAACTTGAAGGGTTGCAGGGTGCTGTAAACACTATCAGAGGTCGACGTGCAGTTCAGTTGAATTCTCCATTGACTGAAGAGAGCGATTCCAACATCGTTGCTGTTGGTGACGCTGGTTATCACAACTCAAGCAGGCGGCTCAGTATGGAGGAGGAATTCTGGTCATCTATGAGCTTTCCTCCCGCCCCCCTGCTGCAGCTGCTGTTGTTTGTCGCGGGGAACGGCAGCAGCTGCACCACCAGCTGCGGCAACGTGAGCTTCGAGTACCCGTTCGGCGTGGAGGCCGGGTGCTACCACCCGGGGTTCGATCTCACCTGCAACCACTCGCTGTTCCTGGGCCAAGAAAGCAGCACCATGCATCAGGTGCTCGAGATCTCCATCCCCAACGGCACCGTGCGCATCAACAGCAGCCGCATGGTGTTTGCGTCTGCCGTTTTAGAGAACAGCACCACCATGCGGTGGGAGGTGGGTAAATCCTACTTCCTGTCGGATTTAAACATTATAGCGTTGGTAGGATGCAACGCCCAGGTCTCCCTCCGCGATTGGGGCGATACACTCGTCAACTCCTGCATCACGTCGTGCCCTCTATCACTCGACTCCGGTAATGGCTCCTGCTCAGGAATTGGCTGCTGTGAGGCAAGCATTGCTATGCACATACCGGTCTACAGCATTAGCGCCAACCAAGTGGTGGACCCGGGTGCAGGACCTGACCCTAATGAACCAAATTTTTTCGTGTACATAGTAGATCAGGCGTCGTTTTATTTCGACACCAACATGGTTACTAAGGGCATCAGCAATACTCCTGAAGCGCTCCCAGCCATGTTAAACTGGCTTATACTCAGCAATTCATCAGCGTGCTCGGCATCGACCAATGCTTCTGCACCTTCGTCTGCCCCCGAATGTTGCAGCGCCAACAGCTTCTGCAAAGGTTACAACGATATCGATGAATGCAAATCTCCACACATCTACCCCTGTTACGGCGACTGCAAAAATACACGAGGAGGGTATGATTGCCAGTGCCATCATGGATACAAGGGAAACGCTTCGATACTGAATGGATGTCAAGATATTAACGAGTGTGCGGAACCAGAAAAATACTCATGCTATGGTGGACTCTGCATAAATACGCCAGGAGCTTTTGTTTGCCGCTGCCACGACGGAAGCTACGGTGATCCCTTCACAAAAGGAGGGTGCCGTTCATCTAAAGGTTTGACCATTGGTCTAATAGTCAGCGGTGGTTCAGTCCTTCTACTTCTAGGGCTTGCTGCTCCCTTCATAGTTCGCAAGGTCAAGCTACAAAGGGTAAAGAAAATGAGGGATAAATTCTTTATGCAAAACCATGGGTTATTATTACAACAGTTAATATCACGAAACACAGACTTCGCCGAAAGAATGATCATTACCTTACAAGAGCTTGAGATTGCTACAAACAATTTTGACAAATCTCGTGAGGTTGGTACTGGAGGACATGGGGTCGTGTATAAAGGGATTATAGATCTACATGTTGTGGCCATCAAGAAATCAAAGATTGTTGTGCAAAGAGAAATAGATGAATTCATAAATGAAGTCGCAATTCTTTCCCAAGTGAACCATAGAAATGTGGTAAAGCTCCTCGGATGTTGCCTTGAGACAGAAGTTCCATTATTAGTTTATGAGTTCATTTCAAATGGAACCCTTTACCATCATCTTCATGTTGAAGGATCTATATCATTACCTTGGGATGATAGATTAAGGATAGCTCTTGAAGTTGCTAGAGCTCTTTCATATCTGCATTCATCGGCATCAATGCCAATATTTTATAGAGATATTAAATCTTCCAATATACTTCTTGATGACAACCTAACAGCAAAGGTATCCGACTTTAGAGCTTCAAGATATATCTCAATCAATGAAACAGGAATAACTACTGCAGTTCAAGGAACGATTGGCTACTTGGATCCTATGTACTATTATACGGGACGACTTACGAGCAAGAGTGATGTTTTTAGTTTTGGTGTTCTTCTTATGGAGCTACTTACTCGAAAGAAACCCATCGGTGGTACATTTGATAATGGCGATGGTCTTGTTTCACATGTTATCTCACTTCTCTCAAAAGGTAATCTTTATAATATAATAGATTCTCAAGTTAAAGAAGAGGAAGATGGAGAAGTCCTAGAAGTGGCAACACTAGCCACAACATGTACTAAGTTTAAAGGAGAAGAGCGGCCTACGATGAGAGAAGTAGAGATGGCACTGGAAAGCATAGTTTCAAAGAAAAGCTCCTTCTGTAACAAGAACAGTCAATCAAGTAGTAGATCCGATGAAAATCGAATTTTAGCTCTTTACATGTCGATCGAAGGAGTTACCAAGGACAAAACAATTACAATTACAGAAAGCAGCACGGAAGGGGAAATACCATTGTCGTCAAGGTTTTCTCGATAA

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Protein seq

MHVFAIATLHLLQFLAAIPLILSYNIALPGCTDTCGNTTIPYPFGIGDERCFREGFKLVCDPAYDPPKLFMNGPGYEVHKIKLARRVLHLDTGITQMLGGDSYNQKWILDLDDKLFRVSADMNVFITLGCGFHFFIGSSPAAAGDNATSSSNCVSNCRPGYPILATDGTCYGIGCCNASVVEDHNSYTIKLLSLQSSPRAVPFNASMVVVKGEWWRRADNAMLLQQEVLSRLGAIAGAPDAARNVGVRTVVNWMLGNSSCVEAKKLSDFGCLSDNNINECMLPNPPLCFGKCINTVGSYECICPGGTSGNAHIQNGCVSSKLKFSGLIIGIGLGGSLIIVVLILTGIVVRRKFKSRRAKKLKEFFFKQNRGLLLHQLVDKDIAERMIFSLEELEKATNNFDESRKLGGGGHGTVYKGILSDQRVVAIKKSRYAIKREIDGFINEVAILSQVNHRNVVKLFGCCLETEVPLLVYEFIPNGTLHEYLHVNSAQSVPWKERLRIALEIARSLAYLHSAASVSIIHRDIKTTNILLDDRFIAKVSDFGASRGIPIDQNIVTTTIQGTFGYLDPEYYRKSRLTEKSDVYSFGVILAELITRRRPTSYISPEGFNLTEQFILLVSEDRLLEIVDSQITKEQGEEEAREVAEIAVMCLNLKGEDRPTMRQVEVKLEGLQGAVNTIRGRRAVQLNSPLTEESDSNIVAVGDAGYHNSSRRLSMEEEFWSSMSFPPAPLLQLLLFVAGNGSSCTTSCGNVSFEYPFGVEAGCYHPGFDLTCNHSLFLGQESSTMHQVLEISIPNGTVRINSSRMVFASAVLENSTTMRWEVGKSYFLSDLNIIALVGCNAQVSLRDWGDTLVNSCITSCPLSLDSGNGSCSGIGCCEASIAMHIPVYSISANQVVDPGAGPDPNEPNFFVYIVDQASFYFDTNMVTKGISNTPEALPAMLNWLILSNSSACSASTNASAPSSAPECCSANSFCKGYNDIDECKSPHIYPCYGDCKNTRGGYDCQCHHGYKGNASILNGCQDINECAEPEKYSCYGGLCINTPGAFVCRCHDGSYGDPFTKGGCRSSKGLTIGLIVSGGSVLLLLGLAAPFIVRKVKLQRVKKMRDKFFMQNHGLLLQQLISRNTDFAERMIITLQELEIATNNFDKSREVGTGGHGVVYKGIIDLHVVAIKKSKIVVQREIDEFINEVAILSQVNHRNVVKLLGCCLETEVPLLVYEFISNGTLYHHLHVEGSISLPWDDRLRIALEVARALSYLHSSASMPIFYRDIKSSNILLDDNLTAKVSDFRASRYISINETGITTAVQGTIGYLDPMYYYTGRLTSKSDVFSFGVLLMELLTRKKPIGGTFDNGDGLVSHVISLLSKGNLYNIIDSQVKEEEDGEVLEVATLATTCTKFKGEERPTMREVEMALESIVSKKSSFCNKNSQSSSRSDENRILALYMSIEGVTKDKTITITESSTEGEIPLSSRFSR

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_08g0501600 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g39220 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os08g0378300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0021150 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0021050 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0020940 RBH 0.0 0.0 0.260669
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_09g0014440 SBH 0.240474 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_08g0021000 RBH 0.0 0.0 0.355024
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_08G0395300 RBH 0.197004 0.399153 0.0395695
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0020890 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_08G0415300 RBH 0.01355 0.049102 0.166083
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_08g0020220 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0020500 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0020340 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_08g0021190 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_08g0020550 RBH 0.0 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_08G020700 RBH 0.0 0.0 0.075115
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0020870 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
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