Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_06g0022210 OGI:06070230 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr06:25704536-25708448
Gene Symbol -
DNA seq

tttgataccttgatttcagttgcactatcaattcttcttgattcttctttgtatttggatttcttgctatcagcaggaactctctctctctctctccaaaatgggcactgaattaactgttacaggatggttcttgtcgcctattatacgggaaatgcaagatactgcacagtcctacataagggggcaattcagttgggagaaggatcaagaaaatgaccttgagcgtcttgatactatccttacagagatcttggccatcgtggacgtcatcgagaagcgggagatcaaggatgggaatcagaggaagctgctccggaagctcaaggatgccatttacagcgccgttgatgtgcttgatagcttccagtacatggtcctcaagtctaaaatcgacagccaagctatggtgagtcgcgttacctcatcctgtgtttacttgggtaagcgcgtagtaggtactgataagttccggaggaagctaaccgatatgttgaaaaaattggatgaggttaaaacaactgcagataccttgttcaaattggttagttttgatagcgctactgcaaagctgctcccagtcacacaggcacgtgtaacgtcccctttgaaggaagagaaccacatatatggtagaaaagatgatcttgataggctgagagatttgttgcttatgcaaagtgatagtagtgcacctggacctagtaactcatgtgttcctgtcatatccatcattggtgttggtgggattgggaagacaagcctagcacaattagctttcagagatgaaaggatacgtgcgagctttggtctcaggatctgggtttgtgtatccaatatttatgatgagacaacattggcaagggatattttagaatctgtaacaggtgaaaattattgcagtgttactaaattggatgaattgaagaatgttcttcaagaaaagataagttaaaagaacttttttcttgtattggatgatgtttggtatgatgagaacaggacaaattgggagaatgaattagtatggaacggagttttatcaacattgaatactggactgggaggatccaaaattctggtgacgactcgaaccaacaaagccagtgaactcctacgtgctggagcctgtttacaattagggggattgaatagagatgattactggatgttattcaaaagctgtgcctttggtgagaaacatccaggactgtttcaagaacttaaggaaataggaatgcagattgctgaaagattgaatggtttgcccttagcagcgaaggtaatcggtcgcctattgaatgttgatttagattcaagtcattggaagaaagtgctagagagtgacatatcaggtgatgttatgaaggttctcaggttgagttaccaacacttgcccatccacttgcaactatgcttcagcttctgcagcttattcccgaagagctggcgttttgatcccaggaggcttacagacatgtggatttcacagggttttgttcagaaggaggatgagtctgacaatgacatgaatgttgaagatgttgcgaagggctactttaatgatcttgtacaaagatcattcttcgagagatctttgttagaccttccaatagagtatgtcatgcatgacttgatcaatgaccttgccaggaatgtttcaaaggacgagtataccagaattgagagtgagaagcaaaaggagatcccaccaaacattcgccatttatctatatctgcacatttgtgggccggtatgaagaaaacagagatgaaaaacctgcgcacgttacttgtttggagcaaatcatggccttgctggaaattgtcccttccaaatgatgtgttcaagaaatccaaatacatccaagtgctagatttgactggttgttgcctggagaggttgccaacatcagtgaaaaatttgaagcatttgcgctatcttgcttttagggttcctgaaaaaccattgcccacagcattggtccaactttatcacctagaggttctagtcacaagaggtcactcttgtcggggaagtggatgtttccaacttccaacaaacatgaagaagaacctactcaaattgagaaaagcttaccttttcaatgtagggggtgccacaatatctggttttggtggacaaactcttctgcatggcccaggggaattccatgtcaagaaggagagtgggcacagacttggagagttaaaggagatgaacaatatccgaggaagattaagtgttaggtttcttgagaacgtggaacatcagcaacaggctgttgatgcccacctagattgtaaagagcacatcaaacacttgcagctagagtggagtgaccttccaaggcctattacttctgagttggatccttatgtgcttgaggcccttagacctcaccctgatcttgagcggctgaatatcacaggttacaagggagagaggtcaccttcttggtttgagacaaattggatgaaagcactgacttctatagtccttcagaactgcatgggttgggtgcaattgccccctcttggacagcttcctctactggaggatctggtactgagaaacatgcatgctgttaagcagataggtcaagaattctatgggaatggtgacacaaagggctttccaaagttggaagaaatagtatttgatggcatgcccaactgggagaaatggtctggaattgaagatggttcattgcttccatgtctcacaagactttacatagctaagtgccctaagcttcaagaagcaccacccttaaatgcaagaccaaaagttgaagtggtgataacatctgattccctaccaagttcgtgtctatttgactccctaatggcatcggcatcttatctgatcttacttgtcaactgctgcagcttcttgagtagcctgaatactgaccaacttagtcatgtcgaggagttgaacgtgaagagctgcacagatcaaatgccagcttgtggatttatcggacttagctcccttaaggtgctcagaatcagcaactgttcagcgttactatcgtcagtttgtgtggaagcaggtgaagaacttgacacatgttttttccctcagtcactaagtgaacttgaaatagttgattgcaatattcagtccagtttgctaccaagatacttgcaaggcctaactaacctctccaccctgatgattaatagctgtgattctatggatttgctatctcttgcctatggaccccatcaccttacttctctagaagccataatcattaaagactgtattttcctatcctcattggatggatttgaaaatctgattgctctgagaaagttagtggtagcagattgtaaaaatttctgtttcttgccagctgatctgaatgcattaatatctctcaaaacattagccatatatgggtgccctaagatgaaatttctcccccagaatggcgtgccagcttctctacagttaattttgctgtcactgttgcatccagagttagacagacagcttcaaaggagggaaggtactgaatgggacaagattgctcatgttcctgaaaagaaactagaggtatgcactgcttattatttatttccatcgtattctggtgggggttcgttgttcatagcgccttactgtatgtagtgttgtctcatgtaaatcatatgtgtggttgttgctcaagctgcattattatcagtgattcagtgttatgaatcatgatctacaaataagtgtcaagtatctttgctatttgatttgcaaattcttctggagatatttttggcaaaaatatcatgaagtttcataatggcacgcctaactgtcttagcatatagtttctggacagttgacagaactcagtcttgtactaatactaatgcttaacctcttggctcttgcaggtagagctaa

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Function Putative disease resistance RPP13-like protein 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LRR4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_06g0022210 OsARC_06g0022210.01 Chr06 25704536 25708448 + NAM
CDS seq

atgggcactgaattaactgttacaggatggttcttgtcgcctattatacgggaaatgcaagatactgcacagtcctacataagggggcaattcagttgggagaaggatcaagaaaatgaccttgagcgtcttgatactatccttacagagatcttggccatcgtggacgtcatcgagaagcgggagatcaaggatgggaatcagaggaagctgctccggaagctcaaggatgccatttacagcgccgttgatgtgcttgatagcttccagtacatggtcctcaagtctaaaatcgacagccaagctatggtgagtcgcgttacctcatcctgtgtttacttgggtaagcgcgtagtaggtactgataagttccggaggaagctaaccgatatgttgaaaaaattggatgaggttaaaacaactgcagataccttgttcaaattggttagttttgatagcgctactgcaaagctgctcccagtcacacaggcacgtgtaacgtcccctttgaaggaagagaaccacatatatggtagaaaagatgatcttgataggctgagagatttgttgcttatgcaaagtgatagtagtgcacctggacctagtaactcatgtgttcctgtcatatccatcattggtgttggtgggattgggaagacaagcctagcacaattagctttcagagatgaaaggatacgtgcgagctttggtctcaggatctgggtttgtgtatccaatatttatgatgagacaacattggcaagggatattttagaatctgtaacaggtgaaaattattgcagtgttactaaattggatgaattgaagaataacttttttcttgtattggatgatgtttggtatgatgagaacaggacaaattgggagaatgaattagtatggaacggagttttatcaacattgaatactggactgggaggatccaaaattctggtgacgactcgaaccaacaaagccagtgaactcctacgtgctggagcctgtttacaattagggggattgaatagagatgattactggatgttattcaaaagctgtgcctttggtgagaaacatccaggactgtttcaagaacttaaggaaataggaatgcagattgctgaaagattgaatggtttgcccttagcagcgaaggtaatcggtcgcctattgaatgttgatttagattcaagtcattggaagaaagtgctagagagtgacatatcaggtgatgttatgaaggttctcaggttgagttaccaacacttgcccatccacttgcaactatgcttcagcttctgcagcttattcccgaagagctggcgttttgatcccaggaggcttacagacatgtggatttcacagggttttgttcagaaggaggatgagtctgacaatgacatgaatgttgaagatgttgcgaagggctactttaatgatcttgtacaaagatcattcttcgagagatctttgttagaccttccaatagagtatgtcatgcatgacttgatcaatgaccttgccaggaatgtttcaaaggacgagtataccagaattgagagtgagaagcaaaaggagatcccaccaaacattcgccatttatctatatctgcacatttgtgggccggtatgaagaaaacagagatgaaaaacctgcgcacgttacttgtttggagcaaatcatggccttgctggaaattgtcccttccaaatgatgtgttcaagaaatccaaatacatccaagtgctagatttgactggttgttgcctggagaggttgccaacatcagtgaaaaatttgaagcatttgcgctatcttgcttttagggttcctgaaaaaccattgcccacagcattggtccaactttatcacctagaggttctagtcacaagaggtcactcttgtcggggaagtggatgtttccaacttccaacaaacatgaagaagaacctactcaaattgagaaaagcttaccttttcaatgtagggggtgccacaatatctggttttggtggacaaactcttctgcatggcccaggggaattccatgtcaagaaggagagtgggcacagacttggagagttaaaggagatgaacaatatccgaggaagattaagtgttaggtttcttgagaacgtggaacatcagcaacaggctgttgatgcccacctagattgtaaagagcacatcaaacacttgcagctagagtggagtgaccttccaaggcctattacttctgagttggatccttatgtgcttgaggcccttagacctcaccctgatcttgagcggctgaatatcacaggttacaagggagagaggtcaccttcttggtttgagacaaattggatgaaagcactgacttctatagtccttcagaactgcatgggttgggtgcaattgccccctcttggacagcttcctctactggaggatctggtactgagaaacatgcatgctgttaagcagataggtcaagaattctatgggaatggtgacacaaagggctttccaaagttggaagaaatagtatttgatggcatgcccaactgggagaaatggtctggaattgaagatggttcattgcttccatgtctcacaagactttacatagctaagtgccctaagcttcaagaagcaccacccttaaatgcaagaccaaaagttgaagtggtgataacatctgattccctaccaagttcgtgtctatttgactccctaatggcatcggcatcttatctgatcttacttgtcaactgctgcagcttcttgagtagcctgaatactgaccaacttagtcatgtcgaggagttgaacgtgaagagctgcacagatcaaatgccagcttgtggatttatcggacttagctcccttaaggtgctcagaatcagcaactgttcagcgttactatcgtcagtttgtgtggaagcaggtgaagaacttgacacatgttttttccctcagtcactaagtgaacttgaaatagttgattgcaatattcagtccagtttgctaccaagatacttgcaaggcctaactaacctctccaccctgatgattaatagctgtgattctatggatttgctatctcttgcctatggaccccatcaccttacttctctagaagccataatcattaaagactgtattttcctatcctcattggatggatttgaaaatctgattgctctgagaaagttagtggtagcagattgtaaaaatttctgtttcttgccagctgatctgaatgcattaatatctctcaaaacattagccatatatgggtgccctaagatgaaatttctcccccagaatggcgtgccagcttctctacagttaattttgctgtcactgttgcatccagagttagacagacagcttcaaaggagggaaggtactgaatgggacaagattgctcatgttcctgaaaagaaactagagagctaa

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.127732 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0619000 RBH 0.568805 0.744070 1.235759
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g41480 RBH 0.380811 0.501021 0.314929
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0619000 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0022540 RBH 0.244692 6.053720 1.994734
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_06g0022390 RBH 0.080377 1.099353 0.459222
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0022490 RBH 0.332107 3.414849 2.675934
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0022290 SBH 0.038255 0.053408 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0022600 RBH 3.860051 4.622609 5.386287
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0390500 RBH 2.2855215 8.394294 0.893366
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0022050 RBH 0.109274 0.474388 0.095391
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0370400 RBH 3.3927325 7.103971 7.148452
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0022520 RBH 0.085495 0.123839 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0022430 RBH 0.332512 4.253272 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0022140 RBH 0.000000 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_06g0022810 RBH 0.308639 0.246364 0.178181
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0022410 RBH 0.091282 2.634610 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G022160 RBH 0.119358 0.488207 0.710469
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0022370 RBH 1.058499 7.328276 0.606848
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