Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsARC_03g0026480 | OGI:03068250 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr03:25027256-25048263 | ||||||||
| Gene Symbol | TPR90, OsTPR090, TPR090, OsTPR90, DLN94, OsDLN94 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Putative B3 domain-containing protein Os03g0621600 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q851V5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_03g0026480 | OsARC_03g0026480.01 | Chr03 | 25027256 | 25048263 | + | NAM | ||
| CDS seq | ATGGCGGAGGAGCTCCCCTTCCCCGCTAACATCGAAGTGATGCGCCACACGCCGCGGTTCAAGCTCATGCAGGCGGCATTCCACGGCGACCTCCGCGGCTTGAAGCGGCAGGCGAAGATTCTGGATATGGGGAGGGGCCGCCTGAGGAAGGCCGTAGAGGATGTGAGGGTGGAAGGCGTGCCGGGCGAGGAAGGTACAGGGGTGCTGCATATGGCTGCCTCCCATGGCCACATGGAGATGTGCAAGTACCTGGTCGAAACGCTTCAGGTGGATGTGGATGATGCGGATGACAAAGGTAGAACATCTCTACTTAAGGCGGTACATTCTGGGCATCGGGGAATTGCCAAGTATCTTCTTAATCATGACGCCAATCCAGACCTAGCCATGTGCTGTGGGCTTACCCCTCTACATTCTGCCGCTGGATTAGGTGATTGTGAGTCCGTAAAACTATTGCTTGCAAAAGGAGCTTATGTTGACCCAATGTCTACTTTTGGGACACCACTTCATCTTGCTGCTAAAGAAGGGCAGGATGGCACCATGAAGATATTGTTGGACAACAATGCAGATTGCAACAAGATGGTAAACGGTATAACACCTCTCCTCCTTGCTATGAAAGCTGCATCAGCAAAATGTATGGAGCTGCTGGTTGAGGCTGGAGCTGATGCTACTTACTCTGATGTCATCTGGAATTATATGTCAACTACTTTTATGGATGATGAAGATAGTGGTTCATCTGTGTTCTCGGATTCTGAACCAGAAGAGATTGATGCCAATCACCATATTCCCGTCAATGACAAACCTGTGAATCGAAGGAAAATTGCAGAGTTTAAGTCGTTAGGGCTTGAGGCAGTTGAGAAGAAGGATTATCTTTCTGCAGCAGGATTCTACAGTGAGGCCATGGACCTTGACCCTGATGATGCAACCCTGCTGTCCAATAGGAGCCTTTGCTGGCTTTATCTGGGTGAAGGAGGCAAGGCTTTGGTGGATGCTCATAAATGCAGAAAAATGCGGCCTGACTGGCCAAAGGCCTGCTACCGTCAGGGTGCAGCTTTAATGTTACTGAAGGACTATGTGAGCGCGTGTGAAGCACTTTTTGATGGATTCAAGTTGGATCCTGAGGACGTTGAGATTGAAAATGCATTACGGGAAGCTCTAGAGTTCTTGAAGTCTCTTCCTTCCTTCTTTCCCTCTGCTCATCTACTGCTCTCACTTGCTCTCTTCTTCTTCTTGTGCATTCAGAGTAACCACAGGATGAGCAAGTCTGGTTGTGAGAGATGCAGAGGACGGGGTTTTTGGGATACGGATGATCAGGACACGTATTTCTTCAAGGTTATGATTGGTGGTTTCCGACGTCAAATGACCATACCATACAAGTTTGCAGAAAATTTCAGAGATCAGATCCAAGGAACAATCAAACTGAAGGCACGTAATGGTAACACTTGCAGTGTCCTTGTTGACAAATGTTCAAATAAGTTAGTCCTTACAAAAGGGTGGGCTGAATTTGCCAACTCTCATGACATTAAGATGGGTGACTTCCTGGTATTCAGATACACTGGCAATTCTCAGTTTGAAGTTAAAATCTTTGATCCAAGTGGTTGTGTGAAAGCAGCATCACACAATGCTGTGAACATTGGCCAGCATGCCCAAAACATGCAAGGAGACCCTATTGAAATTTTAAGCTGCTCTGATGAACATCTGCGAGCGCAATCGCTAACAACCGAAAGGCAAAATCAACCTGAAAAGGATGTCATTGACAATTGTAACAAGAAGATGAAGACAGAGCATGCTTCTTCTTCAGAAGATGATCAGGAAACACCTACTGCTGAGGTGCACAGGATGAAAGTAGAAGAGATGGTCCGAGCTATTCATTCCAACCACCCAGTTTTTGTGGCTGTCATGAAAAAAAGCAACGTCACTCGACAACCTTGCTATGTGGCAATCTCCAGGAAATATGCCAATGAATATTTTCCAGGAGGGGACCAAATGCTAACGCTTCAACGACATGGCAAGAGGTGGCAAGTGAAGTTTTGTATCAGCAAACGCAAATTGAGAATGCTTTCAAAGGGGTGGAGAAAATTCACAAGAGACAACGAGCTGCAGGTCGGTGATACATGCCTGTTTGAACTGCTAAAGAACGAGAACCCGTTCGCAATGAACACTTCCAAGAATTTTACTCCTACAGGATTACATCACAGGGGCTCAGTTGAAAATTATCTCCATGGCTTATCTGAAGAAGTAGCTGGAGTTACACTGTGTGGTCAGAAGATGAGGAAGCTGAACACAAGATCCACGGCTAGGGATGATCAAGAAAAGTATTTCTTCAAGGTCATGATTGGTGACTTCCATAAGAGAATGACCATACCTGATAAATTTGCACGCCACTTCAAAGGGGTGATATCAAAAACTATTAAGCTAGAGCCTCGCAGCGGTTACACTTTCGATGTTCAAGTTACAAAGAAGTTGAATATATTAGTTTTGGGATCTGGATGGGAGTCATTTGTTAATGCTCATGACTTAAACATGGGTGACTTCCTGGTGTTCAAATACAATGGGGACTTTCTGTTGCAAGTGTTAATCTTTGATCCTAGCGGTTGCGAGAAATCGACTTCATGTTCTATGGAAAATGCTATTGATCATGTTGGACAAGGGTGGAAAGAACACAATGATATCTCAACAAGTTATCATGATCAACCAAAAGGAAATAAACATTGGATGCAAAAGGATAGCTCATCTAAAGGGAATAAGATTGGCAATACCAGGTCATCAAACACCCCATCTAAGTTTTCAGGTTGCATTCTCCCTCGTGGAACCTGTCTTCCTGTGGTTCAGGAGAAGAAGATGAAAGAAAAGATCCAAGCTATACATTCCAAAACCCCAATGTATGGGAATGTCATGACAAAATGCAATGTTTCTGGAAGCCCTTGTGTTCTTGAAATAACTCAACTATATGATGATGCGTATCTTCCATTCAATAATGGCCAAGAGCTGATGCTTCGACACCGAGACAAGAGTTGGAAAGTGCGGTTTTACAGATTCAAGAACAAATCTAGAAAGCTCACTCAAGGTTGGAAAAGATTTGTGCACGACAACTACCTGCGGATGGGAGATCTATGTCTCTTTGAGATATTAAAGAATAAATACACAATGAATATGAGAAGGCCTGGTGCGAGATGCAGGGAAGGACATGCACATTTCAACGGGAACCACATAGATGGGCAATATAAGAATTTCTTCAAGGTTATGATTGGTCGCTTTCGTGAGAGAATGATCATACCAAACGAATTTCTTCAATATTTCAGGGGTAAAATACCAAGAACTATAAAGCTGCAATTACGCGATGGTTGCACTTATGATGTTCAAGTCACTAAGAATTTGGGCAAAATATCCCTTCAATCAGGATGGAAGGCATTTGTGACTGCTCATGACTTGCAAATGGGAGATTTTCTAGTATTCAGTTATGATGGGATCTCCAAATTGAAGGTTCTGATCTTTGGTCCAAGTGGCTGTGAGAAAGTGCATTCACGCTCTACATTAAAAAATGCTACACATTGTGGTGAGAAGTGGGAAGAACCCCTGCACATTTCAAGCAATTCGCATGATCTTCCTGTGAAATCACCACAAAATGTAAGCAAATCTGAGAAACAATGGGATAGCTCAGAACAAGAAAACGACACCGCGAATATCGAAGAAGTTGCATTGCAAGGAGATGATCTCCAAGGGCATCCGGTTCTGAATTGCATCCTCCCAAAGCACACCCGCCTTACAGATATGCAGAAGCAGCAGCTGGAAAGCAAAGTTGGAGCTATTCATTCTGAAATCCCCATCTATGGGTGCATCCTTAGGAAGAGTCGCGTCCACGGAAAATCTCAAACCGTAGACATATGTCGAGAATATGCAGATGTATATCTTCCATTCAAGGAGTTAAACATGACGCTTCAACGTCATGGCAAAAATTGGGAGGTGCTATGTCGCACTAAGGATACAAGAACCAAAAGGCTCTCGACAGGGTGGAGTCGGTTTGCACAGGAAAACAATTTGCAGGTGGGAGATATCTGCCTCTTTGAGCTACTGAAGAAGAAGGAATACTCGATGAATGTTCATATCATTCCCAAAAAATGA
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| Protein seq | MAEELPFPANIEVMRHTPRFKLMQAAFHGDLRGLKRQAKILDMGRGRLRKAVEDVRVEGVPGEEGTGVLHMAASHGHMEMCKYLVETLQVDVDDADDKGRTSLLKAVHSGHRGIAKYLLNHDANPDLAMCCGLTPLHSAAGLGDCESVKLLLAKGAYVDPMSTFGTPLHLAAKEGQDGTMKILLDNNADCNKMVNGITPLLLAMKAASAKCMELLVEAGADATYSDVIWNYMSTTFMDDEDSGSSVFSDSEPEEIDANHHIPVNDKPVNRRKIAEFKSLGLEAVEKKDYLSAAGFYSEAMDLDPDDATLLSNRSLCWLYLGEGGKALVDAHKCRKMRPDWPKACYRQGAALMLLKDYVSACEALFDGFKLDPEDVEIENALREALEFLKSLPSFFPSAHLLLSLALFFFLCIQSNHRMSKSGCERCRGRGFWDTDDQDTYFFKVMIGGFRRQMTIPYKFAENFRDQIQGTIKLKARNGNTCSVLVDKCSNKLVLTKGWAEFANSHDIKMGDFLVFRYTGNSQFEVKIFDPSGCVKAASHNAVNIGQHAQNMQGDPIEILSCSDEHLRAQSLTTERQNQPEKDVIDNCNKKMKTEHASSSEDDQETPTAEVHRMKVEEMVRAIHSNHPVFVAVMKKSNVTRQPCYVAISRKYANEYFPGGDQMLTLQRHGKRWQVKFCISKRKLRMLSKGWRKFTRDNELQVGDTCLFELLKNENPFAMNTSKNFTPTGLHHRGSVENYLHGLSEEVAGVTLCGQKMRKLNTRSTARDDQEKYFFKVMIGDFHKRMTIPDKFARHFKGVISKTIKLEPRSGYTFDVQVTKKLNILVLGSGWESFVNAHDLNMGDFLVFKYNGDFLLQVLIFDPSGCEKSTSCSMENAIDHVGQGWKEHNDISTSYHDQPKGNKHWMQKDSSSKGNKIGNTRSSNTPSKFSGCILPRGTCLPVVQEKKMKEKIQAIHSKTPMYGNVMTKCNVSGSPCVLEITQLYDDAYLPFNNGQELMLRHRDKSWKVRFYRFKNKSRKLTQGWKRFVHDNYLRMGDLCLFEILKNKYTMNMRRPGARCREGHAHFNGNHIDGQYKNFFKVMIGRFRERMIIPNEFLQYFRGKIPRTIKLQLRDGCTYDVQVTKNLGKISLQSGWKAFVTAHDLQMGDFLVFSYDGISKLKVLIFGPSGCEKVHSRSTLKNATHCGEKWEEPLHISSNSHDLPVKSPQNVSKSEKQWDSSEQENDTANIEEVALQGDDLQGHPVLNCILPKHTRLTDMQKQQLESKVGAIHSEIPIYGCILRKSRVHGKSQTVDICREYADVYLPFKELNMTLQRHGKNWEVLCRTKDTRTKRLSTGWSRFAQENNLQVGDICLFELLKKKEYSMNVHIIPKK
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.066784 | 0.0 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_03g0621650 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os03g42370 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os03g0621600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_03g0026670 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.132890 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_03g0026400 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_03g0026460 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_03g0026500 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_03g0026270 | RBH | 0.0 | 2.149392 | 2.067425 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_03G0415900 | RBH | 0.6618315 | 1.0365865 | 9.5188445 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_03g0026050 | RBH | 0.000000 | 0.101696 | 0.503630 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_03G0419800 | RBH | 0.2117125 | 0.186491 | 2.972017 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_03g0026310 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_03g0026330 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_03g0026440 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_03g0026180 | RBH | 0.000000 | 0.150316 | 0.364655 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_03g0026110 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_03G026140 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_03g0026080 | RBH | 1.148217 | 2.000087 | 7.727885 |
