Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_01g0037460 OGI:01104550 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:35211129-35223393
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGD7]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_01g0037460 OsARC_01g0037460.01 Chr01 35211129 35223393 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_01g0037460 OsARC_01g0037460.02 Chr01 35222844 35223138 - IsoSeq
CDS seq

GTGGGTGAAGGTGCGGTGCTCGCTCTCGCCTGCCTTTCCCGAGTTCGT

Protein seq

VGEGAVLALACLSRVR

No AS event found.

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.148359 0.398436 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0818700 RBH 12.825672 7.128095 6.478358
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g60280 RBH 7.389201 6.163492 1.330213
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0818700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0038190 RBH 0.849756 17.877546 6.296455
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0037660 RBH 0.919378 8.692753 5.077617
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0038070 RBH 6.270092 20.618416 14.957815
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_05g0020980 RBH 2.240922 0.499889 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0037140 RBH 20.824051 33.624878 38.672276
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0576700 RBH 20.3235165 60.5722005 6.044853
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0036840 RBH 2.318073 2.420932 3.026834
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0572900 RBH 8.713385 43.6028345 2.387677
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0037080 RBH 1.735568 1.102579 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0037100 RBH 2.335505 21.069380 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0037330 RBH 21.543453 30.620211 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0037400 RBH 4.821440 2.908548 3.678123
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0037160 RBH 0.920515 6.858920 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G037690 RBH 2.116384 4.373876 6.949629
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0037370 RBH 9.268299 43.375332 12.217502
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